MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_014974	AGG	2	6	2213264	2213269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451409
48002	NC_014974	CTC	2	6	2213297	2213302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451409
48003	NC_014974	GGGT	2	8	2213378	2213385	0 %	25 %	75 %	0 %	320451409
48004	NC_014974	CAC	2	6	2213527	2213532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451410
48005	NC_014974	GCC	2	6	2213591	2213596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451410
48006	NC_014974	G	6	6	2213805	2213810	0 %	0 %	100 %	0 %	320451411
48007	NC_014974	CCA	2	6	2213852	2213857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451411
48008	NC_014974	CCG	2	6	2213874	2213879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451411
48009	NC_014974	C	7	7	2213887	2213893	0 %	0 %	0 %	100 %	320451411
48010	NC_014974	GCC	2	6	2213921	2213926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451411
48011	NC_014974	CAC	2	6	2213928	2213933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451411
48012	NC_014974	C	8	8	2213948	2213955	0 %	0 %	0 %	100 %	320451411
48013	NC_014974	GCG	2	6	2214088	2214093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451411
48014	NC_014974	CTC	2	6	2214187	2214192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48015	NC_014974	CCT	2	6	2214218	2214223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48016	NC_014974	C	6	6	2214248	2214253	0 %	0 %	0 %	100 %	320451412
48017	NC_014974	CCT	2	6	2214365	2214370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48018	NC_014974	CCT	2	6	2214386	2214391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48019	NC_014974	GCC	2	6	2214403	2214408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451412
48020	NC_014974	GCC	2	6	2214421	2214426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451412
48021	NC_014974	CTC	2	6	2214462	2214467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48022	NC_014974	GTC	2	6	2214483	2214488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451412
48023	NC_014974	CTC	2	6	2214489	2214494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48024	NC_014974	AGG	2	6	2214592	2214597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451412
48025	NC_014974	CCA	3	9	2214614	2214622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451412
48026	NC_014974	CCA	2	6	2214647	2214652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451412
48027	NC_014974	GCG	2	6	2214663	2214668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451412
48028	NC_014974	CTC	2	6	2214714	2214719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48029	NC_014974	G	6	6	2214776	2214781	0 %	0 %	100 %	0 %	320451412
48030	NC_014974	GAG	2	6	2214786	2214791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451412
48031	NC_014974	GGCCTC	2	12	2214873	2214884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451412
48032	NC_014974	CCT	2	6	2214899	2214904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48033	NC_014974	CCA	2	6	2214914	2214919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451412
48034	NC_014974	TCC	3	9	2214970	2214978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48035	NC_014974	TCC	2	6	2215003	2215008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451412
48036	NC_014974	GGC	2	6	2215068	2215073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451412
48037	NC_014974	GAAG	2	8	2215111	2215118	50 %	0 %	50 %	0 %	320451412
48038	NC_014974	AGC	2	6	2215120	2215125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451412
48039	NC_014974	GGCT	2	8	2215180	2215187	0 %	25 %	50 %	25 %	320451413
48040	NC_014974	CTT	2	6	2215206	2215211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451413
48041	NC_014974	CGC	2	6	2215239	2215244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451413
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48043	NC_014974	TGC	2	6	2215289	2215294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451413
48044	NC_014974	GGC	2	6	2215377	2215382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451413
48045	NC_014974	CTT	2	6	2215422	2215427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451413
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48049	NC_014974	CTC	2	6	2215669	2215674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451413
48050	NC_014974	C	6	6	2215744	2215749	0 %	0 %	0 %	100 %	320451413
48051	NC_014974	AGG	2	6	2215751	2215756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451413
48052	NC_014974	CCG	2	6	2215797	2215802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451413
48053	NC_014974	CTC	2	6	2216011	2216016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451413
48054	NC_014974	TCC	3	9	2216066	2216074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451413
48055	NC_014974	GCC	2	6	2216089	2216094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451413
48056	NC_014974	CCA	3	9	2216105	2216113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451413
48057	NC_014974	CCT	2	6	2216118	2216123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451413
48058	NC_014974	GAG	2	6	2216140	2216145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451413
48059	NC_014974	TGGCC	2	10	2216160	2216169	0 %	20 %	40 %	40 %	320451413
48060	NC_014974	CTTCGC	2	12	2216187	2216198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320451413
48061	NC_014974	GGGT	2	8	2216212	2216219	0 %	25 %	75 %	0 %	320451413
48062	NC_014974	TCC	2	6	2216249	2216254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451413
48063	NC_014974	GGC	2	6	2216256	2216261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451413
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48067	NC_014974	CCCG	2	8	2216634	2216641	0 %	0 %	25 %	75 %	320451414
48068	NC_014974	CTC	2	6	2216686	2216691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451414
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48070	NC_014974	GGGT	2	8	2216780	2216787	0 %	25 %	75 %	0 %	320451414
48071	NC_014974	CTA	2	6	2216808	2216813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451414
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48073	NC_014974	CAT	2	6	2216880	2216885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451414
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48076	NC_014974	G	6	6	2217131	2217136	0 %	0 %	100 %	0 %	320451414
48077	NC_014974	CCG	2	6	2217185	2217190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451414
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48083	NC_014974	TGG	2	6	2217287	2217292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451414
48084	NC_014974	GAG	2	6	2217337	2217342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451414
48085	NC_014974	GAG	2	6	2217361	2217366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451414
48086	NC_014974	CAC	2	6	2217393	2217398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451414
48087	NC_014974	C	6	6	2217398	2217403	0 %	0 %	0 %	100 %	320451414
48088	NC_014974	CTA	2	6	2217447	2217452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451414
48089	NC_014974	C	7	7	2217468	2217474	0 %	0 %	0 %	100 %	320451414
48090	NC_014974	GAG	4	12	2217496	2217507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451414
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48099	NC_014974	GGT	4	12	2218161	2218172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451414
48100	NC_014974	AGG	2	6	2218190	2218195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451414
48101	NC_014974	AGG	2	6	2218205	2218210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451414
48102	NC_014974	GGCCGA	2	12	2218242	2218253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451414
48103	NC_014974	TGG	3	9	2218319	2218327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451414
48104	NC_014974	GGC	2	6	2218401	2218406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451414
48105	NC_014974	GCC	2	6	2218417	2218422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451414
48106	NC_014974	CCA	2	6	2218477	2218482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451415
48107	NC_014974	GC	3	6	2218520	2218525	0 %	0 %	50 %	50 %	320451415
48108	NC_014974	TCA	2	6	2218540	2218545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451415
48109	NC_014974	ATG	2	6	2218548	2218553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451415
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48111	NC_014974	GGC	2	6	2218586	2218591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451415
48112	NC_014974	GTG	2	6	2218620	2218625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451415
48113	NC_014974	GCG	2	6	2218631	2218636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451415
48114	NC_014974	CTA	2	6	2218649	2218654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451415
48115	NC_014974	CGG	2	6	2218695	2218700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451415
48116	NC_014974	CCT	2	6	2218720	2218725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451415
48117	NC_014974	TCC	2	6	2218738	2218743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451415
48118	NC_014974	G	6	6	2218771	2218776	0 %	0 %	100 %	0 %	320451415
48119	NC_014974	CGG	2	6	2218791	2218796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451415
48120	NC_014974	CGC	2	6	2218862	2218867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451415
48121	NC_014974	CTC	2	6	2218878	2218883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451415
48122	NC_014974	AGG	2	6	2218936	2218941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451415
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48125	NC_014974	C	6	6	2219100	2219105	0 %	0 %	0 %	100 %	320451415
48126	NC_014974	CCTT	2	8	2219191	2219198	0 %	50 %	0 %	50 %	320451415
48127	NC_014974	CT	4	8	2219205	2219212	0 %	50 %	0 %	50 %	320451415
48128	NC_014974	CGGG	2	8	2219227	2219234	0 %	0 %	75 %	25 %	320451415
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48135	NC_014974	TCCT	2	8	2219498	2219505	0 %	50 %	0 %	50 %	320451416
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48150	NC_014974	CGG	2	6	2220056	2220061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451416
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48227	NC_014974	CACC	2	8	2224331	2224338	25 %	0 %	0 %	75 %	320451421
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48229	NC_014974	AAG	2	6	2224371	2224376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451421
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48232	NC_014974	TGG	2	6	2224495	2224500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451421
48233	NC_014974	CCG	2	6	2224501	2224506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451421
48234	NC_014974	AGG	2	6	2224564	2224569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451421
48235	NC_014974	CTT	2	6	2224658	2224663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451422
48236	NC_014974	CCTTC	2	10	2224814	2224823	0 %	40 %	0 %	60 %	320451422
48237	NC_014974	CCA	2	6	2224844	2224849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451422
48238	NC_014974	TGA	2	6	2224864	2224869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451422
48239	NC_014974	CGC	3	9	2224871	2224879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451422
48240	NC_014974	TCC	2	6	2224900	2224905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451422
48241	NC_014974	TGG	2	6	2224945	2224950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451422
48242	NC_014974	GGT	2	6	2224973	2224978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451422
48243	NC_014974	GCCCT	2	10	2224998	2225007	0 %	20 %	20 %	60 %	320451422
48244	NC_014974	TGGG	2	8	2225067	2225074	0 %	25 %	75 %	0 %	320451422
48245	NC_014974	CAT	2	6	2225204	2225209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451422
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48248	NC_014974	TGA	2	6	2225299	2225304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451422
48249	NC_014974	CAT	2	6	2225333	2225338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451422
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48251	NC_014974	ATC	2	6	2225457	2225462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451422
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48253	NC_014974	G	7	7	2225517	2225523	0 %	0 %	100 %	0 %	320451422
48254	NC_014974	TGG	2	6	2225548	2225553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451422
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48256	NC_014974	TCT	2	6	2225656	2225661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451422
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48258	NC_014974	GGGC	2	8	2225753	2225760	0 %	0 %	75 %	25 %	320451422
48259	NC_014974	TCT	2	6	2225800	2225805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451422
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48343	NC_014974	CGGGTG	2	12	2229363	2229374	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320451426
48344	NC_014974	GCG	2	6	2229385	2229390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451426
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48347	NC_014974	CTA	2	6	2229446	2229451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451426
48348	NC_014974	G	6	6	2229548	2229553	0 %	0 %	100 %	0 %	320451426
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48350	NC_014974	GGGC	2	8	2229701	2229708	0 %	0 %	75 %	25 %	320451427
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48352	NC_014974	TGG	2	6	2229748	2229753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451427
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48452	NC_014974	GTGGGG	2	12	2233668	2233679	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320451432
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48455	NC_014974	GCCC	2	8	2233883	2233890	0 %	0 %	25 %	75 %	320451432
48456	NC_014974	CGC	2	6	2233910	2233915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451432
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48459	NC_014974	TCC	2	6	2233948	2233953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451432
48460	NC_014974	GAAG	2	8	2233964	2233971	50 %	0 %	50 %	0 %	320451432
48461	NC_014974	CGC	2	6	2234006	2234011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451432
48462	NC_014974	TGG	2	6	2234020	2234025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451432
48463	NC_014974	TCC	2	6	2234035	2234040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451432
48464	NC_014974	TCT	2	6	2235360	2235365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451433
48465	NC_014974	GAAG	2	8	2235403	2235410	50 %	0 %	50 %	0 %	320451433
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48468	NC_014974	GGA	3	9	2235601	2235609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451433
48469	NC_014974	CTT	2	6	2235629	2235634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451433
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