MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_014974	CGCCCA	2	12	2099250	2099261	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320451286
45502	NC_014974	CGGT	2	8	2099276	2099283	0 %	25 %	50 %	25 %	320451286
45503	NC_014974	TGA	2	6	2099400	2099405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451286
45504	NC_014974	TCCACC	2	12	2099480	2099491	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320451286
45505	NC_014974	TGA	2	6	2099505	2099510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451286
45506	NC_014974	TCC	2	6	2099540	2099545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451286
45507	NC_014974	CTT	2	6	2099721	2099726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451287
45508	NC_014974	CCT	2	6	2099946	2099951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451288
45509	NC_014974	GGT	2	6	2099965	2099970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451288
45510	NC_014974	CAC	2	6	2099971	2099976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451288
45511	NC_014974	CCA	2	6	2100003	2100008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451288
45512	NC_014974	GCT	2	6	2100036	2100041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451288
45513	NC_014974	C	6	6	2100093	2100098	0 %	0 %	0 %	100 %	320451288
45514	NC_014974	CGC	2	6	2100162	2100167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451288
45515	NC_014974	CTT	2	6	2100226	2100231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451288
45516	NC_014974	TGA	2	6	2100261	2100266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451288
45517	NC_014974	TCC	2	6	2100305	2100310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451288
45518	NC_014974	CAC	2	6	2100337	2100342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451288
45519	NC_014974	GCG	2	6	2100385	2100390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451288
45520	NC_014974	CCT	2	6	2100408	2100413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451288
45521	NC_014974	GTA	2	6	2100415	2100420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451288
45522	NC_014974	TTC	2	6	2100425	2100430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451288
45523	NC_014974	CGC	2	6	2100475	2100480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451289
45524	NC_014974	CTT	2	6	2100521	2100526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451289
45525	NC_014974	CTT	2	6	2100644	2100649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451289
45526	NC_014974	CTT	2	6	2100683	2100688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451289
45527	NC_014974	GCA	2	6	2100691	2100696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451289
45528	NC_014974	CCA	2	6	2100739	2100744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451289
45529	NC_014974	TTC	2	6	2100759	2100764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451289
45530	NC_014974	GTT	2	6	2100886	2100891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451290
45531	NC_014974	GAT	2	6	2100892	2100897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451290
45532	NC_014974	CGG	2	6	2100900	2100905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451290
45533	NC_014974	GTC	2	6	2100910	2100915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451290
45534	NC_014974	CCT	2	6	2100948	2100953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451290
45535	NC_014974	CAC	3	9	2100964	2100972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451290
45536	NC_014974	CAC	2	6	2100979	2100984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451290
45537	NC_014974	CCTT	2	8	2100989	2100996	0 %	50 %	0 %	50 %	320451290
45538	NC_014974	C	6	6	2101002	2101007	0 %	0 %	0 %	100 %	320451290
45539	NC_014974	CCT	2	6	2101017	2101022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451290
45540	NC_014974	GAT	2	6	2101036	2101041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451290
45541	NC_014974	AGGT	2	8	2101130	2101137	25 %	25 %	50 %	0 %	320451290
45542	NC_014974	CCA	2	6	2101211	2101216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451291
45543	NC_014974	C	6	6	2101228	2101233	0 %	0 %	0 %	100 %	320451291
45544	NC_014974	CCA	2	6	2101235	2101240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451291
45545	NC_014974	GCGCTT	2	12	2101257	2101268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451291
45546	NC_014974	GAT	2	6	2101287	2101292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451291
45547	NC_014974	CCA	2	6	2101295	2101300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451291
45548	NC_014974	CCA	2	6	2101397	2101402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451291
45549	NC_014974	TCT	2	6	2101415	2101420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451291
45550	NC_014974	CAC	3	9	2101434	2101442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451291
45551	NC_014974	CTT	2	6	2101455	2101460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451291
45552	NC_014974	CTC	3	9	2101472	2101480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451292
45553	NC_014974	GAG	2	6	2101495	2101500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451292
45554	NC_014974	GAAGC	2	10	2101567	2101576	40 %	0 %	40 %	20 %	320451292
45555	NC_014974	CTT	2	6	2101591	2101596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451292
45556	NC_014974	GA	3	6	2101626	2101631	50 %	0 %	50 %	0 %	320451292
45557	NC_014974	CTC	2	6	2101668	2101673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451293
45558	NC_014974	CTC	2	6	2101733	2101738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451293
45559	NC_014974	CGCC	2	8	2101744	2101751	0 %	0 %	25 %	75 %	320451293
45560	NC_014974	CCCGG	2	10	2101765	2101774	0 %	0 %	40 %	60 %	320451293
45561	NC_014974	CAC	2	6	2101778	2101783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451293
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45564	NC_014974	CGG	2	6	2101890	2101895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451293
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45567	NC_014974	CCA	2	6	2101963	2101968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451293
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45569	NC_014974	GCC	2	6	2102007	2102012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451293
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45572	NC_014974	CTT	2	6	2102081	2102086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451294
45573	NC_014974	GCG	4	12	2102102	2102113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451294
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45575	NC_014974	GGGC	2	8	2102142	2102149	0 %	0 %	75 %	25 %	320451294
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45577	NC_014974	GGT	2	6	2102216	2102221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451294
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45583	NC_014974	TCT	2	6	2102542	2102547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451294
45584	NC_014974	CCCCG	2	10	2102548	2102557	0 %	0 %	20 %	80 %	320451294
45585	NC_014974	TCGATG	2	12	2102619	2102630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320451294
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45587	NC_014974	AGG	2	6	2102694	2102699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451294
45588	NC_014974	CTT	2	6	2102711	2102716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451294
45589	NC_014974	TC	3	6	2102795	2102800	0 %	50 %	0 %	50 %	320451295
45590	NC_014974	CTT	2	6	2102829	2102834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451295
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45592	NC_014974	CCCGGG	2	12	2102852	2102863	0 %	0 %	50 %	50 %	320451295
45593	NC_014974	GCC	2	6	2102902	2102907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451295
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45597	NC_014974	C	6	6	2102993	2102998	0 %	0 %	0 %	100 %	320451295
45598	NC_014974	CCT	2	6	2103029	2103034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451295
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45600	NC_014974	CCA	2	6	2103205	2103210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451296
45601	NC_014974	TGC	2	6	2103237	2103242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451296
45602	NC_014974	CCA	2	6	2103271	2103276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451296
45603	NC_014974	TGG	2	6	2103289	2103294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451296
45604	NC_014974	GCG	2	6	2103296	2103301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451296
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45607	NC_014974	CTT	2	6	2103386	2103391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451296
45608	NC_014974	CTCAC	2	10	2103409	2103418	20 %	20 %	0 %	60 %	320451297
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45610	NC_014974	GAT	2	6	2103433	2103438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451297
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45612	NC_014974	CAC	2	6	2103537	2103542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451297
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45616	NC_014974	TGG	2	6	2103669	2103674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451297
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45722	NC_014974	GTCGGG	2	12	2108591	2108602	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320451303
45723	NC_014974	GTG	2	6	2108631	2108636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451303
45724	NC_014974	G	7	7	2108645	2108651	0 %	0 %	100 %	0 %	320451303
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45730	NC_014974	CGG	2	6	2108845	2108850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451303
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45732	NC_014974	GAT	2	6	2108975	2108980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451303
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