MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45003	NC_014974	CCT	2	6	2076691	2076696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45004	NC_014974	GCCC	2	8	2076729	2076736	0 %	0 %	25 %	75 %	320451256
45005	NC_014974	CAGG	2	8	2076740	2076747	25 %	0 %	50 %	25 %	320451256
45006	NC_014974	CCT	2	6	2076868	2076873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45007	NC_014974	CCT	2	6	2076916	2076921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45008	NC_014974	TCC	2	6	2077020	2077025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45009	NC_014974	AGG	2	6	2077141	2077146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451256
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45011	NC_014974	GGA	2	6	2077224	2077229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451256
45012	NC_014974	CCT	2	6	2077237	2077242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45013	NC_014974	ACC	2	6	2077263	2077268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451256
45014	NC_014974	CCT	2	6	2077300	2077305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
45015	NC_014974	GGAA	2	8	2077324	2077331	50 %	0 %	50 %	0 %	320451256
45016	NC_014974	CCA	2	6	2077360	2077365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451256
45017	NC_014974	GCC	2	6	2077526	2077531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451256
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45019	NC_014974	CCT	2	6	2077785	2077790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451257
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45022	NC_014974	AGG	2	6	2077856	2077861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451257
45023	NC_014974	GCG	2	6	2077904	2077909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451257
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45028	NC_014974	C	6	6	2078075	2078080	0 %	0 %	0 %	100 %	320451257
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45032	NC_014974	AGGC	2	8	2078223	2078230	25 %	0 %	50 %	25 %	320451257
45033	NC_014974	CTC	2	6	2078248	2078253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451257
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45044	NC_014974	TTCT	2	8	2078782	2078789	0 %	75 %	0 %	25 %	320451257
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45059	NC_014974	CCA	2	6	2079391	2079396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451259
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45117	NC_014974	C	6	6	2082015	2082020	0 %	0 %	0 %	100 %	320451262
45118	NC_014974	C	6	6	2082022	2082027	0 %	0 %	0 %	100 %	320451262
45119	NC_014974	GAG	2	6	2082030	2082035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451262
45120	NC_014974	CAC	2	6	2082042	2082047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451262
45121	NC_014974	GGC	2	6	2082102	2082107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451262
45122	NC_014974	CAC	2	6	2082114	2082119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451262
45123	NC_014974	GCC	2	6	2082169	2082174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451262
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45126	NC_014974	C	6	6	2082492	2082497	0 %	0 %	0 %	100 %	320451262
45127	NC_014974	ACC	2	6	2082520	2082525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451262
45128	NC_014974	CTG	2	6	2082582	2082587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451262
45129	NC_014974	GATGTC	2	12	2082612	2082623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320451262
45130	NC_014974	CGG	2	6	2082647	2082652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451262
45131	NC_014974	CTCC	2	8	2082678	2082685	0 %	25 %	0 %	75 %	320451262
45132	NC_014974	CGG	2	6	2082704	2082709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451262
45133	NC_014974	C	7	7	2082714	2082720	0 %	0 %	0 %	100 %	320451262
45134	NC_014974	GCC	2	6	2082721	2082726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451262
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45139	NC_014974	CGT	2	6	2082890	2082895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451262
45140	NC_014974	GTG	2	6	2082955	2082960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451262
45141	NC_014974	CGC	2	6	2082969	2082974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451262
45142	NC_014974	TCC	2	6	2083027	2083032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451262
45143	NC_014974	ATAGCC	2	12	2083051	2083062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320451262
45144	NC_014974	CCT	2	6	2083175	2083180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451263
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45146	NC_014974	GCC	2	6	2083210	2083215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451263
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45148	NC_014974	CCTTC	2	10	2083314	2083323	0 %	40 %	0 %	60 %	320451263
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45151	NC_014974	C	8	8	2083403	2083410	0 %	0 %	0 %	100 %	320451263
45152	NC_014974	GAG	2	6	2083536	2083541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451263
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45175	NC_014974	TGA	2	6	2084480	2084485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451264
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45179	NC_014974	TCGTC	2	10	2084657	2084666	0 %	40 %	20 %	40 %	320451264
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45188	NC_014974	CCTCCA	2	12	2085278	2085289	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320451264
45189	NC_014974	CAC	2	6	2085336	2085341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451264
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45192	NC_014974	AACGT	2	10	2085415	2085424	40 %	20 %	20 %	20 %	320451264
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45197	NC_014974	GGAA	2	8	2085708	2085715	50 %	0 %	50 %	0 %	320451264
45198	NC_014974	CTG	2	6	2086136	2086141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451265
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45207	NC_014974	CAT	2	6	2086554	2086559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451266
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45214	NC_014974	CCA	2	6	2086802	2086807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451266
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45217	NC_014974	C	6	6	2087006	2087011	0 %	0 %	0 %	100 %	320451266
45218	NC_014974	TCC	2	6	2087074	2087079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451266
45219	NC_014974	GCT	2	6	2087084	2087089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451266
45220	NC_014974	CTC	2	6	2087124	2087129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451266
45221	NC_014974	CCT	2	6	2087233	2087238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451267
45222	NC_014974	CACCCG	2	12	2087261	2087272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320451267
45223	NC_014974	CAGG	2	8	2087299	2087306	25 %	0 %	50 %	25 %	320451267
45224	NC_014974	TCC	2	6	2087346	2087351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451267
45225	NC_014974	CGG	2	6	2087393	2087398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451267
45226	NC_014974	GCC	2	6	2087400	2087405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451267
45227	NC_014974	GGC	2	6	2087435	2087440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451267
45228	NC_014974	GGCCTC	2	12	2087462	2087473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451267
45229	NC_014974	CAC	3	9	2087489	2087497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451267
45230	NC_014974	C	6	6	2087616	2087621	0 %	0 %	0 %	100 %	320451267
45231	NC_014974	TCC	2	6	2087660	2087665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451267
45232	NC_014974	G	6	6	2087782	2087787	0 %	0 %	100 %	0 %	320451267
45233	NC_014974	GAAG	2	8	2087817	2087824	50 %	0 %	50 %	0 %	320451267
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45339	NC_014974	CTC	2	6	2091901	2091906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451273
45340	NC_014974	CAGGTC	2	12	2091913	2091924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320451273
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45343	NC_014974	GCAG	2	8	2091965	2091972	25 %	0 %	50 %	25 %	320451273
45344	NC_014974	TCC	2	6	2092121	2092126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451273
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45347	NC_014974	G	6	6	2092315	2092320	0 %	0 %	100 %	0 %	320451273
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45351	NC_014974	CAC	2	6	2092408	2092413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451273
45352	NC_014974	GAT	2	6	2092432	2092437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451273
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45464	NC_014974	CGC	2	6	2097232	2097237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451281
45465	NC_014974	CCA	2	6	2097283	2097288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451281
45466	NC_014974	CTT	2	6	2097338	2097343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451281
45467	NC_014974	GTG	2	6	2097489	2097494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451281
45468	NC_014974	C	7	7	2097500	2097506	0 %	0 %	0 %	100 %	320451281
45469	NC_014974	GCG	2	6	2097512	2097517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451281
45470	NC_014974	GCCCC	2	10	2097596	2097605	0 %	0 %	20 %	80 %	320451281
45471	NC_014974	TTG	2	6	2097621	2097626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451281
45472	NC_014974	CTT	2	6	2097694	2097699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451282
45473	NC_014974	GCC	2	6	2097776	2097781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451282
45474	NC_014974	CTC	2	6	2097843	2097848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451283
45475	NC_014974	TGG	2	6	2097908	2097913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451283
45476	NC_014974	AGG	2	6	2098042	2098047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451283
45477	NC_014974	CCA	2	6	2098112	2098117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451283
45478	NC_014974	GTA	2	6	2098131	2098136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451283
45479	NC_014974	CCT	2	6	2098163	2098168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451283
45480	NC_014974	CACC	2	8	2098208	2098215	25 %	0 %	0 %	75 %	320451283
45481	NC_014974	ACC	3	9	2098213	2098221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451283
45482	NC_014974	GAAGCG	2	12	2098230	2098241	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320451283
45483	NC_014974	ATC	2	6	2098282	2098287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451283
45484	NC_014974	GCCC	2	8	2098459	2098466	0 %	0 %	25 %	75 %	320451284
45485	NC_014974	TTG	2	6	2098489	2098494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451284
45486	NC_014974	CTTCAG	2	12	2098497	2098508	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320451284
45487	NC_014974	CCA	2	6	2098526	2098531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451284
45488	NC_014974	GAT	2	6	2098554	2098559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451284
45489	NC_014974	GCG	2	6	2098644	2098649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451284
45490	NC_014974	CTT	2	6	2098685	2098690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451285
45491	NC_014974	GTA	2	6	2098733	2098738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451285
45492	NC_014974	CTT	2	6	2098766	2098771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451285
45493	NC_014974	GC	3	6	2098776	2098781	0 %	0 %	50 %	50 %	320451285
45494	NC_014974	GGC	2	6	2098787	2098792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451285
45495	NC_014974	TGG	2	6	2098837	2098842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451285
45496	NC_014974	CCA	3	9	2098879	2098887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451285
45497	NC_014974	TGA	2	6	2098957	2098962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451285
45498	NC_014974	CAC	2	6	2099075	2099080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451285
45499	NC_014974	CCA	3	9	2099089	2099097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451285
45500	NC_014974	CAC	2	6	2099225	2099230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451286

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