MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014974	GCG	2	6	178970	178975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449306
4002	NC_014974	GAGGC	2	10	179019	179028	20 %	0 %	60 %	20 %	320449306
4003	NC_014974	TCC	2	6	179095	179100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449306
4004	NC_014974	TGCC	2	8	179108	179115	0 %	25 %	25 %	50 %	320449306
4005	NC_014974	G	6	6	179122	179127	0 %	0 %	100 %	0 %	320449306
4006	NC_014974	GGC	2	6	179144	179149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449306
4007	NC_014974	GAA	2	6	179198	179203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449306
4008	NC_014974	GGC	2	6	179204	179209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449306
4009	NC_014974	AAG	2	6	179370	179375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449307
4010	NC_014974	TGG	2	6	179383	179388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449307
4011	NC_014974	CTT	2	6	179412	179417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449307
4012	NC_014974	CCT	2	6	179429	179434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449307
4013	NC_014974	CAC	2	6	179444	179449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449307
4014	NC_014974	AGG	2	6	179464	179469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449307
4015	NC_014974	CTT	2	6	179567	179572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449307
4016	NC_014974	CCA	2	6	179656	179661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449307
4017	NC_014974	CGG	3	9	179668	179676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449307
4018	NC_014974	TCC	2	6	179754	179759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449308
4019	NC_014974	GGA	2	6	179803	179808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4020	NC_014974	GGA	2	6	179857	179862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4021	NC_014974	CCTGC	2	10	179930	179939	0 %	20 %	20 %	60 %	320449308
4022	NC_014974	CCA	3	9	180046	180054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4023	NC_014974	GGC	2	6	180103	180108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4024	NC_014974	GTGCAG	2	12	180117	180128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449308
4025	NC_014974	GCAGGG	2	12	180155	180166	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320449308
4026	NC_014974	GCC	2	6	180174	180179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449308
4027	NC_014974	AGG	2	6	180183	180188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4028	NC_014974	GCGG	2	8	180191	180198	0 %	0 %	75 %	25 %	320449308
4029	NC_014974	CTGGCC	2	12	180210	180221	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449308
4030	NC_014974	CAC	2	6	180233	180238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4031	NC_014974	C	6	6	180313	180318	0 %	0 %	0 %	100 %	320449308
4032	NC_014974	GCCCC	2	10	180354	180363	0 %	0 %	20 %	80 %	320449308
4033	NC_014974	GTG	2	6	180389	180394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449308
4034	NC_014974	G	6	6	180394	180399	0 %	0 %	100 %	0 %	320449308
4035	NC_014974	CGG	3	9	180442	180450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4036	NC_014974	CCT	2	6	180478	180483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449308
4037	NC_014974	GAG	2	6	180557	180562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4038	NC_014974	GTG	2	6	180563	180568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449308
4039	NC_014974	CGG	3	9	180574	180582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4040	NC_014974	CTTGGC	2	12	180599	180610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449308
4041	NC_014974	GGC	2	6	180647	180652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4042	NC_014974	TCG	2	6	180660	180665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449308
4043	NC_014974	CCT	2	6	180674	180679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449308
4044	NC_014974	CTC	2	6	180683	180688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449308
4045	NC_014974	AGG	2	6	180717	180722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4046	NC_014974	CCA	2	6	180751	180756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4047	NC_014974	GGC	2	6	180758	180763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4048	NC_014974	AGG	2	6	180786	180791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449308
4049	NC_014974	TCCA	2	8	180857	180864	25 %	25 %	0 %	50 %	320449308
4050	NC_014974	CAC	2	6	180911	180916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4051	NC_014974	GGC	2	6	180923	180928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4052	NC_014974	CTTC	2	8	180963	180970	0 %	50 %	0 %	50 %	320449308
4053	NC_014974	CCG	2	6	180982	180987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449308
4054	NC_014974	CAC	3	9	180998	181006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4055	NC_014974	TTC	2	6	181035	181040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449308
4056	NC_014974	GGC	2	6	181043	181048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449308
4057	NC_014974	TCC	2	6	181068	181073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449308
4058	NC_014974	CCA	2	6	181093	181098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449308
4059	NC_014974	AGA	3	9	181468	181476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449309
4060	NC_014974	AGG	2	6	181483	181488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4061	NC_014974	CGAAGG	2	12	181493	181504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320449309
4062	NC_014974	CCACCC	2	12	181526	181537	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	320449309
4063	NC_014974	C	6	6	181535	181540	0 %	0 %	0 %	100 %	320449309
4064	NC_014974	GGT	2	6	181584	181589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449309
4065	NC_014974	CCA	2	6	181598	181603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449309
4066	NC_014974	GAA	2	6	181659	181664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449309
4067	NC_014974	AAG	2	6	181689	181694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449309
4068	NC_014974	GAG	3	9	181707	181715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4069	NC_014974	CCA	2	6	181742	181747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449309
4070	NC_014974	C	6	6	181810	181815	0 %	0 %	0 %	100 %	320449309
4071	NC_014974	AGG	4	12	181822	181833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4072	NC_014974	AGGCGT	2	12	181862	181873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449309
4073	NC_014974	CCCAG	2	10	181878	181887	20 %	0 %	20 %	60 %	320449309
4074	NC_014974	AGGCCA	2	12	181919	181930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449309
4075	NC_014974	G	7	7	182014	182020	0 %	0 %	100 %	0 %	320449309
4076	NC_014974	CCA	2	6	182051	182056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449309
4077	NC_014974	ACC	3	9	182059	182067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449309
4078	NC_014974	AGG	2	6	182077	182082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4079	NC_014974	C	6	6	182087	182092	0 %	0 %	0 %	100 %	320449309
4080	NC_014974	CCT	2	6	182105	182110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449309
4081	NC_014974	AGG	2	6	182113	182118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4082	NC_014974	G	6	6	182123	182128	0 %	0 %	100 %	0 %	320449309
4083	NC_014974	GCC	2	6	182131	182136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449309
4084	NC_014974	C	6	6	182142	182147	0 %	0 %	0 %	100 %	320449309
4085	NC_014974	AGG	2	6	182167	182172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4086	NC_014974	GCG	2	6	182236	182241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449309
4087	NC_014974	GGCCC	2	10	182262	182271	0 %	0 %	40 %	60 %	320449309
4088	NC_014974	CCA	2	6	182327	182332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449309
4089	NC_014974	GGA	2	6	182333	182338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4090	NC_014974	TGA	2	6	182348	182353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449309
4091	NC_014974	AGG	2	6	182374	182379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449309
4092	NC_014974	AGA	2	6	182417	182422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449309
4093	NC_014974	CCG	2	6	182444	182449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449309
4094	NC_014974	GGCCCA	2	12	182450	182461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449309
4095	NC_014974	AGG	2	6	182588	182593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4096	NC_014974	CGGG	2	8	182702	182709	0 %	0 %	75 %	25 %	320449310
4097	NC_014974	AAGAGG	2	12	182726	182737	50 %	0 %	50 %	0 %	320449310
4098	NC_014974	CAC	2	6	182746	182751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449310
4099	NC_014974	C	6	6	182781	182786	0 %	0 %	0 %	100 %	320449310
4100	NC_014974	GAG	2	6	182845	182850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4101	NC_014974	GAG	2	6	182944	182949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4102	NC_014974	CAC	2	6	182995	183000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449310
4103	NC_014974	GGCCAC	2	12	183022	183033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449310
4104	NC_014974	C	6	6	183063	183068	0 %	0 %	0 %	100 %	320449310
4105	NC_014974	AGG	2	6	183071	183076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4106	NC_014974	GAG	2	6	183088	183093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4107	NC_014974	GGA	2	6	183111	183116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4108	NC_014974	GGT	2	6	183133	183138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449310
4109	NC_014974	GTA	2	6	183154	183159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449310
4110	NC_014974	GGA	2	6	183195	183200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449310
4111	NC_014974	GGC	2	6	183217	183222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449310
4112	NC_014974	GAA	2	6	183256	183261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449310
4113	NC_014974	G	6	6	183295	183300	0 %	0 %	100 %	0 %	320449310
4114	NC_014974	ATC	2	6	183371	183376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449310
4115	NC_014974	CAC	2	6	183387	183392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449311
4116	NC_014974	GAG	3	9	183408	183416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449311
4117	NC_014974	AGG	2	6	183463	183468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449311
4118	NC_014974	AGG	2	6	183475	183480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449311
4119	NC_014974	G	6	6	183526	183531	0 %	0 %	100 %	0 %	320449311
4120	NC_014974	GAG	2	6	183591	183596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449311
4121	NC_014974	AGGA	2	8	183657	183664	50 %	0 %	50 %	0 %	320449311
4122	NC_014974	GGA	3	9	183662	183670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449311
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4224	NC_014974	GGGGC	2	10	188050	188059	0 %	0 %	80 %	20 %	320449316
4225	NC_014974	C	6	6	188163	188168	0 %	0 %	0 %	100 %	320449316
4226	NC_014974	CGG	2	6	188175	188180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449316
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4228	NC_014974	ACCC	2	8	188410	188417	25 %	0 %	0 %	75 %	320449316
4229	NC_014974	CGG	2	6	188434	188439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449316
4230	NC_014974	GGGTG	2	10	188476	188485	0 %	20 %	80 %	0 %	320449316
4231	NC_014974	CGA	2	6	188491	188496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449316
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4234	NC_014974	AAG	2	6	188560	188565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449317
4235	NC_014974	CGC	3	9	188692	188700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449317
4236	NC_014974	AGC	2	6	188720	188725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449317
4237	NC_014974	CTT	2	6	188767	188772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449317
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4239	NC_014974	CCT	2	6	188898	188903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449318
4240	NC_014974	AGGCGG	2	12	188996	189007	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320449318
4241	NC_014974	CCTCAC	2	12	189033	189044	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449318
4242	NC_014974	GCGG	2	8	189054	189061	0 %	0 %	75 %	25 %	320449318
4243	NC_014974	GTG	2	6	189241	189246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449318
4244	NC_014974	TCA	2	6	189334	189339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449319
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4357	NC_014974	TGG	2	6	195381	195386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449326
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4360	NC_014974	CGGCC	2	10	195463	195472	0 %	0 %	40 %	60 %	320449326
4361	NC_014974	AGG	2	6	195490	195495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449326
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4398	NC_014974	CTT	2	6	196929	196934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449328
4399	NC_014974	AGG	2	6	196952	196957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
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4485	NC_014974	G	6	6	200253	200258	0 %	0 %	100 %	0 %	320449332
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4488	NC_014974	CCT	2	6	200458	200463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449333
4489	NC_014974	CGT	2	6	200497	200502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449333
4490	NC_014974	G	6	6	200516	200521	0 %	0 %	100 %	0 %	320449333
4491	NC_014974	CCT	2	6	200533	200538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449333
4492	NC_014974	CTTC	2	8	200542	200549	0 %	50 %	0 %	50 %	320449333
4493	NC_014974	TCC	3	9	200589	200597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449333
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4496	NC_014974	GTC	3	9	200702	200710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449333
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