MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_014974	GCC	2	6	1989535	1989540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451159
43002	NC_014974	CAC	3	9	1989547	1989555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451159
43003	NC_014974	TGCGGG	2	12	1989564	1989575	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320451159
43004	NC_014974	GAA	2	6	1989576	1989581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451159
43005	NC_014974	GGC	2	6	1989591	1989596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451159
43006	NC_014974	GCC	2	6	1989650	1989655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451159
43007	NC_014974	CCCG	2	8	1989745	1989752	0 %	0 %	25 %	75 %	320451160
43008	NC_014974	CGG	2	6	1989779	1989784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451160
43009	NC_014974	CCT	2	6	1989786	1989791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451160
43010	NC_014974	CCG	2	6	1989804	1989809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451160
43011	NC_014974	ATG	2	6	1989830	1989835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451160
43012	NC_014974	CACC	2	8	1989858	1989865	25 %	0 %	0 %	75 %	320451160
43013	NC_014974	AAG	2	6	1989893	1989898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451160
43014	NC_014974	GCG	2	6	1989908	1989913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451160
43015	NC_014974	CCA	2	6	1990041	1990046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451160
43016	NC_014974	CAC	2	6	1990051	1990056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451160
43017	NC_014974	TCC	2	6	1990058	1990063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451160
43018	NC_014974	CAT	2	6	1990099	1990104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451160
43019	NC_014974	CAT	2	6	1990123	1990128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451160
43020	NC_014974	G	6	6	1990132	1990137	0 %	0 %	100 %	0 %	320451160
43021	NC_014974	GCC	2	6	1990169	1990174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451160
43022	NC_014974	AGG	2	6	1990232	1990237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451160
43023	NC_014974	TGA	2	6	1990281	1990286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451160
43024	NC_014974	GGC	2	6	1990309	1990314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451160
43025	NC_014974	CAC	2	6	1990363	1990368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451160
43026	NC_014974	CCA	3	9	1990509	1990517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451160
43027	NC_014974	AACCC	2	10	1990530	1990539	40 %	0 %	0 %	60 %	320451160
43028	NC_014974	CCA	2	6	1990548	1990553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451160
43029	NC_014974	CCT	2	6	1990579	1990584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451161
43030	NC_014974	CCAG	2	8	1990604	1990611	25 %	0 %	25 %	50 %	320451161
43031	NC_014974	CCA	2	6	1990673	1990678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451161
43032	NC_014974	CCG	2	6	1990679	1990684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451161
43033	NC_014974	CCT	2	6	1990721	1990726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451161
43034	NC_014974	TA	3	6	1990791	1990796	50 %	50 %	0 %	0 %	320451161
43035	NC_014974	CTT	2	6	1990800	1990805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451161
43036	NC_014974	CTC	3	9	1990809	1990817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451161
43037	NC_014974	AGG	3	9	1990849	1990857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451161
43038	NC_014974	G	6	6	1990893	1990898	0 %	0 %	100 %	0 %	320451161
43039	NC_014974	GAA	2	6	1991026	1991031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451162
43040	NC_014974	CTC	2	6	1991038	1991043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43041	NC_014974	TGG	2	6	1991061	1991066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451162
43042	NC_014974	TCC	2	6	1991162	1991167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43043	NC_014974	TCC	2	6	1991183	1991188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43044	NC_014974	CCG	2	6	1991358	1991363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451162
43045	NC_014974	CAC	2	6	1991374	1991379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451162
43046	NC_014974	GGA	2	6	1991395	1991400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451162
43047	NC_014974	GAAG	2	8	1991401	1991408	50 %	0 %	50 %	0 %	320451162
43048	NC_014974	GGT	2	6	1991416	1991421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451162
43049	NC_014974	CCG	2	6	1991451	1991456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451162
43050	NC_014974	TGCA	2	8	1991477	1991484	25 %	25 %	25 %	25 %	320451162
43051	NC_014974	TCC	2	6	1991507	1991512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43052	NC_014974	CTCC	2	8	1991556	1991563	0 %	25 %	0 %	75 %	320451162
43053	NC_014974	CTC	2	6	1991593	1991598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43054	NC_014974	GAA	2	6	1991626	1991631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451162
43055	NC_014974	CTC	2	6	1991644	1991649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43056	NC_014974	CCT	2	6	1991712	1991717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451162
43057	NC_014974	CTG	3	9	1991737	1991745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451162
43058	NC_014974	AGA	2	6	1991855	1991860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451163
43059	NC_014974	CCA	2	6	1991865	1991870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451163
43060	NC_014974	CGG	2	6	1991874	1991879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451163
43061	NC_014974	TCC	2	6	1991882	1991887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451163
43062	NC_014974	TCT	2	6	1991958	1991963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451163
43063	NC_014974	CAC	2	6	1991977	1991982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451163
43064	NC_014974	TGA	2	6	1992156	1992161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451163
43065	NC_014974	GCC	2	6	1992277	1992282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451163
43066	NC_014974	GCC	2	6	1992293	1992298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451163
43067	NC_014974	ACC	2	6	1992350	1992355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451163
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43069	NC_014974	CTC	2	6	1992477	1992482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451164
43070	NC_014974	AGG	2	6	1992554	1992559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451164
43071	NC_014974	GCC	2	6	1992594	1992599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451164
43072	NC_014974	CACCTC	2	12	1992600	1992611	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320451164
43073	NC_014974	CTG	2	6	1992687	1992692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451164
43074	NC_014974	TCC	2	6	1992730	1992735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451164
43075	NC_014974	C	6	6	1992755	1992760	0 %	0 %	0 %	100 %	320451164
43076	NC_014974	AGA	2	6	1992767	1992772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451164
43077	NC_014974	GGTA	2	8	1992785	1992792	25 %	25 %	50 %	0 %	320451164
43078	NC_014974	GGT	2	6	1992812	1992817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451164
43079	NC_014974	TGGCC	2	10	1992827	1992836	0 %	20 %	40 %	40 %	320451164
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43083	NC_014974	TGC	2	6	1992997	1993002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451164
43084	NC_014974	C	6	6	1993105	1993110	0 %	0 %	0 %	100 %	320451164
43085	NC_014974	GA	3	6	1993288	1993293	50 %	0 %	50 %	0 %	320451164
43086	NC_014974	CAC	2	6	1993296	1993301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451164
43087	NC_014974	CCT	2	6	1993337	1993342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451164
43088	NC_014974	GCG	2	6	1993347	1993352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451164
43089	NC_014974	AAAGG	2	10	1993365	1993374	60 %	0 %	40 %	0 %	320451164
43090	NC_014974	CTC	2	6	1993386	1993391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451164
43091	NC_014974	CAC	2	6	1993428	1993433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451164
43092	NC_014974	TGG	2	6	1993456	1993461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451164
43093	NC_014974	CTT	2	6	1993536	1993541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451164
43094	NC_014974	GAG	2	6	1993647	1993652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451164
43095	NC_014974	C	7	7	1993679	1993685	0 %	0 %	0 %	100 %	320451164
43096	NC_014974	C	6	6	1993705	1993710	0 %	0 %	0 %	100 %	320451164
43097	NC_014974	GTA	2	6	1993851	1993856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451164
43098	NC_014974	AGT	2	6	1993937	1993942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451164
43099	NC_014974	AGG	2	6	1993978	1993983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451164
43100	NC_014974	CCG	2	6	1994117	1994122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451165
43101	NC_014974	CCA	2	6	1994162	1994167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451165
43102	NC_014974	TGA	2	6	1994453	1994458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451165
43103	NC_014974	GCT	2	6	1994465	1994470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451165
43104	NC_014974	TGGA	2	8	1994515	1994522	25 %	25 %	50 %	0 %	320451165
43105	NC_014974	GGGCCA	2	12	1994621	1994632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451165
43106	NC_014974	CCA	3	9	1994630	1994638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451165
43107	NC_014974	CTT	2	6	1994667	1994672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451165
43108	NC_014974	CTC	2	6	1994688	1994693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451166
43109	NC_014974	CTC	2	6	1994713	1994718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451166
43110	NC_014974	CAC	2	6	1994719	1994724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451166
43111	NC_014974	CGCC	2	8	1994929	1994936	0 %	0 %	25 %	75 %	320451166
43112	NC_014974	AGG	2	6	1995044	1995049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451166
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43114	NC_014974	CCT	2	6	1995108	1995113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451166
43115	NC_014974	TCC	2	6	1995182	1995187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451166
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43117	NC_014974	GCC	2	6	1995224	1995229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451166
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43224	NC_014974	AGGG	2	8	2000294	2000301	25 %	0 %	75 %	0 %	320451174
43225	NC_014974	GAA	2	6	2000352	2000357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451174
43226	NC_014974	GGT	2	6	2000360	2000365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451174
43227	NC_014974	CCA	2	6	2000384	2000389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451174
43228	NC_014974	GCCCC	2	10	2000390	2000399	0 %	0 %	20 %	80 %	320451174
43229	NC_014974	C	6	6	2000396	2000401	0 %	0 %	0 %	100 %	320451174
43230	NC_014974	GTG	2	6	2000419	2000424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451174
43231	NC_014974	AGCCC	2	10	2000437	2000446	20 %	0 %	20 %	60 %	320451174
43232	NC_014974	CGGTGG	2	12	2000485	2000496	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320451174
43233	NC_014974	CCT	3	9	2000507	2000515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451174
43234	NC_014974	GGA	2	6	2000531	2000536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451174
43235	NC_014974	C	6	6	2000584	2000589	0 %	0 %	0 %	100 %	320451174
43236	NC_014974	CCTCCA	2	12	2000594	2000605	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320451174
43237	NC_014974	G	6	6	2000636	2000641	0 %	0 %	100 %	0 %	320451174
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43240	NC_014974	CCAC	2	8	2000882	2000889	25 %	0 %	0 %	75 %	320451174
43241	NC_014974	GA	3	6	2000947	2000952	50 %	0 %	50 %	0 %	320451174
43242	NC_014974	GGCGAT	2	12	2000982	2000993	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451174
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43468	NC_014974	GCC	2	6	2010035	2010040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451181
43469	NC_014974	AAG	3	9	2010071	2010079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451181
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