MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_014974	GGCG	2	8	1968305	1968312	0 %	0 %	75 %	25 %	320451132
42502	NC_014974	TCT	2	6	1968314	1968319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451132
42503	NC_014974	TCC	2	6	1968385	1968390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451132
42504	NC_014974	CCA	2	6	1968425	1968430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451132
42505	NC_014974	TCC	2	6	1968442	1968447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451132
42506	NC_014974	GCC	2	6	1968502	1968507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451132
42507	NC_014974	GA	3	6	1968511	1968516	50 %	0 %	50 %	0 %	320451132
42508	NC_014974	TCCC	2	8	1968597	1968604	0 %	25 %	0 %	75 %	320451132
42509	NC_014974	C	7	7	1968697	1968703	0 %	0 %	0 %	100 %	320451132
42510	NC_014974	AGA	2	6	1968763	1968768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451132
42511	NC_014974	C	6	6	1968775	1968780	0 %	0 %	0 %	100 %	320451132
42512	NC_014974	AGG	2	6	1968790	1968795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451132
42513	NC_014974	GGT	2	6	1968798	1968803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451132
42514	NC_014974	C	6	6	1968807	1968812	0 %	0 %	0 %	100 %	320451132
42515	NC_014974	GCC	3	9	1968817	1968825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451132
42516	NC_014974	GTA	2	6	1968897	1968902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451132
42517	NC_014974	AGA	2	6	1968914	1968919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451132
42518	NC_014974	GGGGT	2	10	1968921	1968930	0 %	20 %	80 %	0 %	320451132
42519	NC_014974	CCT	2	6	1968941	1968946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451132
42520	NC_014974	GTA	2	6	1968951	1968956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451132
42521	NC_014974	CAC	2	6	1968970	1968975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451132
42522	NC_014974	CTC	2	6	1969098	1969103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451132
42523	NC_014974	C	6	6	1969231	1969236	0 %	0 %	0 %	100 %	320451133
42524	NC_014974	AAG	2	6	1969260	1969265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451133
42525	NC_014974	ACCTC	2	10	1969319	1969328	20 %	20 %	0 %	60 %	320451133
42526	NC_014974	TGG	2	6	1969356	1969361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451134
42527	NC_014974	GAG	3	9	1969427	1969435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451134
42528	NC_014974	CCA	2	6	1969453	1969458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451134
42529	NC_014974	GCC	2	6	1969478	1969483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451134
42530	NC_014974	CGC	2	6	1969489	1969494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451134
42531	NC_014974	GGAA	2	8	1969536	1969543	50 %	0 %	50 %	0 %	320451134
42532	NC_014974	TGGG	2	8	1969547	1969554	0 %	25 %	75 %	0 %	320451134
42533	NC_014974	GGAGG	2	10	1969558	1969567	20 %	0 %	80 %	0 %	320451134
42534	NC_014974	GGT	2	6	1969669	1969674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451134
42535	NC_014974	CATAGG	2	12	1969712	1969723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320451135
42536	NC_014974	TCCC	2	8	1969724	1969731	0 %	25 %	0 %	75 %	320451135
42537	NC_014974	AGGACC	2	12	1969768	1969779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451135
42538	NC_014974	CAC	2	6	1969818	1969823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451135
42539	NC_014974	AGA	2	6	1969834	1969839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451135
42540	NC_014974	CCA	2	6	1969979	1969984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451135
42541	NC_014974	ACC	2	6	1969999	1970004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451135
42542	NC_014974	GCC	2	6	1970005	1970010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451135
42543	NC_014974	GGTCC	2	10	1970013	1970022	0 %	20 %	40 %	40 %	320451135
42544	NC_014974	GTT	2	6	1970042	1970047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451135
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42546	NC_014974	CGGATG	2	12	1970120	1970131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451136
42547	NC_014974	CCT	2	6	1970241	1970246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451136
42548	NC_014974	GTA	2	6	1970302	1970307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451136
42549	NC_014974	TCTCCT	2	12	1970370	1970381	0 %	50 %	0 %	50 %	320451136
42550	NC_014974	CCA	2	6	1970406	1970411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451136
42551	NC_014974	GTT	2	6	1970413	1970418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451136
42552	NC_014974	CGG	2	6	1970420	1970425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451136
42553	NC_014974	AAG	2	6	1970449	1970454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451136
42554	NC_014974	AGCC	2	8	1970462	1970469	25 %	0 %	25 %	50 %	320451136
42555	NC_014974	G	6	6	1970473	1970478	0 %	0 %	100 %	0 %	320451136
42556	NC_014974	CTT	2	6	1970491	1970496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451136
42557	NC_014974	ACC	2	6	1970502	1970507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451136
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42559	NC_014974	GAG	2	6	1970604	1970609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451136
42560	NC_014974	CCCCA	2	10	1970722	1970731	20 %	0 %	0 %	80 %	320451136
42561	NC_014974	CCT	2	6	1970807	1970812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451137
42562	NC_014974	GGT	2	6	1970828	1970833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
42563	NC_014974	AGG	2	6	1970866	1970871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451137
42564	NC_014974	GTG	2	6	1970874	1970879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
42565	NC_014974	TCC	2	6	1970899	1970904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451137
42566	NC_014974	TGG	2	6	1970905	1970910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
42567	NC_014974	G	6	6	1970916	1970921	0 %	0 %	100 %	0 %	320451137
42568	NC_014974	AGA	2	6	1970947	1970952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451137
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42570	NC_014974	GAA	2	6	1971062	1971067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451137
42571	NC_014974	TGG	2	6	1971085	1971090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
42572	NC_014974	CCA	2	6	1971091	1971096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451137
42573	NC_014974	GAC	2	6	1971102	1971107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451137
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42577	NC_014974	GGA	2	6	1971353	1971358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451137
42578	NC_014974	CAC	2	6	1971365	1971370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451137
42579	NC_014974	TGG	2	6	1971421	1971426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
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42582	NC_014974	TTC	2	6	1971517	1971522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451137
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42586	NC_014974	CCG	2	6	1971793	1971798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451137
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42588	NC_014974	CACC	2	8	1971901	1971908	25 %	0 %	0 %	75 %	320451137
42589	NC_014974	TCT	2	6	1971913	1971918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451137
42590	NC_014974	ACC	2	6	1971925	1971930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451137
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42598	NC_014974	GTA	2	6	1972196	1972201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451138
42599	NC_014974	GCCCC	2	10	1972318	1972327	0 %	0 %	20 %	80 %	320451138
42600	NC_014974	GGC	2	6	1972382	1972387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451139
42601	NC_014974	GCC	2	6	1972399	1972404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451139
42602	NC_014974	GCCA	2	8	1972416	1972423	25 %	0 %	25 %	50 %	320451139
42603	NC_014974	CAC	2	6	1972466	1972471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451139
42604	NC_014974	TCCC	2	8	1972490	1972497	0 %	25 %	0 %	75 %	320451139
42605	NC_014974	GGA	2	6	1972504	1972509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451139
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42607	NC_014974	G	6	6	1972652	1972657	0 %	0 %	100 %	0 %	320451140
42608	NC_014974	CAC	2	6	1972749	1972754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451140
42609	NC_014974	CGGGC	2	10	1972838	1972847	0 %	0 %	60 %	40 %	320451140
42610	NC_014974	CA	3	6	1972856	1972861	50 %	0 %	0 %	50 %	320451140
42611	NC_014974	GGA	2	6	1972934	1972939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451140
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42614	NC_014974	C	7	7	1973021	1973027	0 %	0 %	0 %	100 %	320451140
42615	NC_014974	CCT	2	6	1973039	1973044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451140
42616	NC_014974	GGCTT	2	10	1973080	1973089	0 %	40 %	40 %	20 %	320451140
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42854	NC_014974	AGG	2	6	1983806	1983811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451153
42855	NC_014974	GTG	2	6	1983848	1983853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451153
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