MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014974	GCAA	2	8	1899687	1899694	50 %	0 %	25 %	25 %	320451064
41002	NC_014974	GCT	2	6	1899726	1899731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451064
41003	NC_014974	GCCCCC	2	12	1899789	1899800	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	320451064
41004	NC_014974	CAG	2	6	1899848	1899853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451064
41005	NC_014974	AAG	2	6	1899866	1899871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451064
41006	NC_014974	AGA	2	6	1899900	1899905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451064
41007	NC_014974	AGGG	2	8	1899947	1899954	25 %	0 %	75 %	0 %	320451064
41008	NC_014974	AGA	2	6	1899972	1899977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451064
41009	NC_014974	GGC	2	6	1900006	1900011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451064
41010	NC_014974	TA	3	6	1900118	1900123	50 %	50 %	0 %	0 %	320451064
41011	NC_014974	GTG	2	6	1900266	1900271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451065
41012	NC_014974	CTC	2	6	1900284	1900289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451065
41013	NC_014974	ACCC	2	8	1900443	1900450	25 %	0 %	0 %	75 %	320451065
41014	NC_014974	TCA	2	6	1900460	1900465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451065
41015	NC_014974	C	7	7	1900490	1900496	0 %	0 %	0 %	100 %	320451065
41016	NC_014974	CTC	2	6	1900500	1900505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451065
41017	NC_014974	GGGCCA	2	12	1900517	1900528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451065
41018	NC_014974	CCT	2	6	1900583	1900588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451065
41019	NC_014974	CCA	2	6	1900694	1900699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451065
41020	NC_014974	CGC	2	6	1900749	1900754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451065
41021	NC_014974	TCT	2	6	1900790	1900795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451065
41022	NC_014974	CCTT	2	8	1900804	1900811	0 %	50 %	0 %	50 %	320451065
41023	NC_014974	GGAA	2	8	1900907	1900914	50 %	0 %	50 %	0 %	320451066
41024	NC_014974	ATC	2	6	1900964	1900969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451066
41025	NC_014974	CTG	2	6	1901000	1901005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451066
41026	NC_014974	GGA	2	6	1901029	1901034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451066
41027	NC_014974	GGA	2	6	1901065	1901070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451066
41028	NC_014974	CTC	2	6	1901150	1901155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451066
41029	NC_014974	C	6	6	1901214	1901219	0 %	0 %	0 %	100 %	320451067
41030	NC_014974	AGG	2	6	1901236	1901241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451067
41031	NC_014974	CCT	2	6	1901264	1901269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451067
41032	NC_014974	GGTG	2	8	1901273	1901280	0 %	25 %	75 %	0 %	320451067
41033	NC_014974	CCA	3	9	1901282	1901290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41034	NC_014974	TCG	2	6	1901374	1901379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451067
41035	NC_014974	AGG	3	9	1901383	1901391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451067
41036	NC_014974	AGG	3	9	1901407	1901415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451067
41037	NC_014974	GCC	2	6	1901515	1901520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451067
41038	NC_014974	AGG	3	9	1901656	1901664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451067
41039	NC_014974	AGG	2	6	1901668	1901673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451067
41040	NC_014974	CCGCT	2	10	1901684	1901693	0 %	20 %	20 %	60 %	320451067
41041	NC_014974	CCA	2	6	1901708	1901713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41042	NC_014974	GGC	2	6	1901787	1901792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451067
41043	NC_014974	CCA	2	6	1901861	1901866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41044	NC_014974	CTTC	2	8	1901948	1901955	0 %	50 %	0 %	50 %	320451067
41045	NC_014974	CCT	2	6	1901981	1901986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451067
41046	NC_014974	A	6	6	1902057	1902062	100 %	0 %	0 %	0 %	320451067
41047	NC_014974	GGT	2	6	1902065	1902070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451067
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41049	NC_014974	CAC	3	9	1902204	1902212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41050	NC_014974	GGC	2	6	1902228	1902233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451067
41051	NC_014974	G	7	7	1902369	1902375	0 %	0 %	100 %	0 %	320451067
41052	NC_014974	CCA	2	6	1902422	1902427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41053	NC_014974	C	7	7	1902488	1902494	0 %	0 %	0 %	100 %	320451067
41054	NC_014974	CCA	2	6	1902560	1902565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451067
41055	NC_014974	CCT	2	6	1902566	1902571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451067
41056	NC_014974	GCGGTA	2	12	1902651	1902662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451067
41057	NC_014974	TAA	2	6	1902921	1902926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320451068
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41060	NC_014974	CTT	2	6	1902988	1902993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451068
41061	NC_014974	GCAC	2	8	1903012	1903019	25 %	0 %	25 %	50 %	320451068
41062	NC_014974	GTG	2	6	1903023	1903028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451068
41063	NC_014974	GGT	2	6	1903031	1903036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451068
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41067	NC_014974	CTC	2	6	1903118	1903123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451068
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41069	NC_014974	C	7	7	1903250	1903256	0 %	0 %	0 %	100 %	320451068
41070	NC_014974	GGC	2	6	1903258	1903263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451068
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41072	NC_014974	GTC	2	6	1903376	1903381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451068
41073	NC_014974	GCT	2	6	1903414	1903419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451068
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41077	NC_014974	GTC	2	6	1903526	1903531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451068
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41087	NC_014974	CAC	2	6	1904072	1904077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451068
41088	NC_014974	TGG	2	6	1904163	1904168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451068
41089	NC_014974	CAC	2	6	1904237	1904242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451068
41090	NC_014974	TGCGTA	2	12	1904418	1904429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320451069
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41093	NC_014974	TGG	2	6	1904547	1904552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451069
41094	NC_014974	CCCTC	2	10	1904568	1904577	0 %	20 %	0 %	80 %	320451069
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41099	NC_014974	AGG	2	6	1904760	1904765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451069
41100	NC_014974	GC	3	6	1904775	1904780	0 %	0 %	50 %	50 %	320451069
41101	NC_014974	CGG	2	6	1904822	1904827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451069
41102	NC_014974	ACC	2	6	1904916	1904921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451069
41103	NC_014974	CCA	2	6	1904955	1904960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451069
41104	NC_014974	ACT	2	6	1904961	1904966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451069
41105	NC_014974	CAA	2	6	1904986	1904991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320451069
41106	NC_014974	GATT	2	8	1905022	1905029	25 %	50 %	25 %	0 %	320451069
41107	NC_014974	TGA	2	6	1905031	1905036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451069
41108	NC_014974	CAA	2	6	1905052	1905057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320451069
41109	NC_014974	CCCCTG	2	12	1905066	1905077	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320451069
41110	NC_014974	GCC	3	9	1905122	1905130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451069
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41112	NC_014974	CGC	2	6	1905175	1905180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451069
41113	NC_014974	CGA	2	6	1905217	1905222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451069
41114	NC_014974	ACG	3	9	1905228	1905236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451069
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41116	NC_014974	CGC	2	6	1905277	1905282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451069
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41231	NC_014974	CCA	2	6	1910240	1910245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451075
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