MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014974	CAT	2	6	157098	157103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449278
3502	NC_014974	CCG	2	6	157182	157187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449279
3503	NC_014974	CCT	2	6	157188	157193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449279
3504	NC_014974	CCT	2	6	157233	157238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449279
3505	NC_014974	AGG	2	6	157241	157246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3506	NC_014974	AGG	2	6	157251	157256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3507	NC_014974	CCG	2	6	157296	157301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449279
3508	NC_014974	TCT	2	6	157418	157423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449279
3509	NC_014974	C	7	7	157443	157449	0 %	0 %	0 %	100 %	320449279
3510	NC_014974	GAG	2	6	157450	157455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3511	NC_014974	GGA	2	6	157458	157463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3512	NC_014974	GGA	2	6	157503	157508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3513	NC_014974	GCG	2	6	157551	157556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449279
3514	NC_014974	GAG	2	6	157570	157575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3515	NC_014974	CAC	2	6	157615	157620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449279
3516	NC_014974	G	6	6	157654	157659	0 %	0 %	100 %	0 %	320449279
3517	NC_014974	GAG	2	6	157663	157668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3518	NC_014974	CTT	2	6	157690	157695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449279
3519	NC_014974	AGG	2	6	157727	157732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3520	NC_014974	CGCC	2	8	157761	157768	0 %	0 %	25 %	75 %	320449279
3521	NC_014974	CCCGAC	2	12	157789	157800	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449279
3522	NC_014974	TCA	2	6	157802	157807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449279
3523	NC_014974	TCC	2	6	157841	157846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449279
3524	NC_014974	CTT	2	6	157914	157919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449279
3525	NC_014974	GAG	2	6	157929	157934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449279
3526	NC_014974	AAGGG	2	10	158144	158153	40 %	0 %	60 %	0 %	320449280
3527	NC_014974	AGATCG	2	12	158191	158202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320449280
3528	NC_014974	C	6	6	158260	158265	0 %	0 %	0 %	100 %	320449280
3529	NC_014974	GGT	2	6	158315	158320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449280
3530	NC_014974	CCT	2	6	158387	158392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449280
3531	NC_014974	GCC	2	6	158418	158423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449280
3532	NC_014974	CGGG	2	8	158426	158433	0 %	0 %	75 %	25 %	320449280
3533	NC_014974	ATC	2	6	158445	158450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449280
3534	NC_014974	GAG	2	6	158451	158456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449280
3535	NC_014974	AGG	2	6	158461	158466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449280
3536	NC_014974	C	6	6	158491	158496	0 %	0 %	0 %	100 %	320449280
3537	NC_014974	CCG	2	6	158515	158520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449280
3538	NC_014974	GGGT	2	8	158590	158597	0 %	25 %	75 %	0 %	320449280
3539	NC_014974	CAGG	2	8	158627	158634	25 %	0 %	50 %	25 %	320449280
3540	NC_014974	GTG	2	6	158664	158669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449280
3541	NC_014974	ACC	2	6	158769	158774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449280
3542	NC_014974	TGG	2	6	158902	158907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449280
3543	NC_014974	TGG	2	6	158914	158919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449280
3544	NC_014974	CAA	2	6	158936	158941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449280
3545	NC_014974	CCG	2	6	159030	159035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449280
3546	NC_014974	TCA	2	6	159061	159066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449280
3547	NC_014974	GCGG	2	8	159104	159111	0 %	0 %	75 %	25 %	320449280
3548	NC_014974	GAG	3	9	159135	159143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449280
3549	NC_014974	GAG	2	6	159201	159206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449280
3550	NC_014974	CTC	3	9	159260	159268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449281
3551	NC_014974	GCTT	2	8	159279	159286	0 %	50 %	25 %	25 %	320449281
3552	NC_014974	CCT	2	6	159378	159383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449281
3553	NC_014974	GGC	2	6	159444	159449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449281
3554	NC_014974	GGC	2	6	159491	159496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449282
3555	NC_014974	CTT	2	6	159533	159538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449282
3556	NC_014974	GGGCAT	2	12	159681	159692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449283
3557	NC_014974	AG	3	6	159730	159735	50 %	0 %	50 %	0 %	320449283
3558	NC_014974	TGG	4	12	159752	159763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449283
3559	NC_014974	TGG	3	9	159779	159787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449283
3560	NC_014974	CTT	2	6	159804	159809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449283
3561	NC_014974	C	6	6	159836	159841	0 %	0 %	0 %	100 %	320449283
3562	NC_014974	GAAG	2	8	159935	159942	50 %	0 %	50 %	0 %	320449283
3563	NC_014974	CCA	2	6	159981	159986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449283
3564	NC_014974	GAG	2	6	159997	160002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449283
3565	NC_014974	GTG	2	6	160027	160032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449283
3566	NC_014974	CCA	2	6	160049	160054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449283
3567	NC_014974	GCC	3	9	160111	160119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449283
3568	NC_014974	CCT	2	6	160224	160229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449283
3569	NC_014974	CCG	2	6	160232	160237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449283
3570	NC_014974	CCT	2	6	160269	160274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449283
3571	NC_014974	TGG	2	6	160355	160360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449283
3572	NC_014974	ACCCCG	2	12	160409	160420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449283
3573	NC_014974	AGG	2	6	160505	160510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449283
3574	NC_014974	GCC	2	6	160513	160518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449283
3575	NC_014974	GCC	2	6	160591	160596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449283
3576	NC_014974	GAA	2	6	160611	160616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449283
3577	NC_014974	GGA	2	6	160668	160673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449283
3578	NC_014974	CTG	2	6	160702	160707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449283
3579	NC_014974	CCA	2	6	160718	160723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449283
3580	NC_014974	GGC	2	6	160754	160759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449283
3581	NC_014974	CCA	2	6	160796	160801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449283
3582	NC_014974	GGC	3	9	160869	160877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449283
3583	NC_014974	AGG	2	6	160931	160936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449283
3584	NC_014974	GAC	2	6	160982	160987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449284
3585	NC_014974	TGG	2	6	161016	161021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449284
3586	NC_014974	GGA	2	6	161023	161028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449284
3587	NC_014974	CCTTCG	2	12	161040	161051	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320449284
3588	NC_014974	AGG	2	6	161076	161081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449284
3589	NC_014974	GGAA	2	8	161108	161115	50 %	0 %	50 %	0 %	320449284
3590	NC_014974	GGT	2	6	161176	161181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449284
3591	NC_014974	TCT	2	6	161205	161210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449284
3592	NC_014974	GGA	2	6	161251	161256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449284
3593	NC_014974	GGT	2	6	161257	161262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449284
3594	NC_014974	GAG	2	6	161325	161330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449284
3595	NC_014974	CGC	2	6	161352	161357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449284
3596	NC_014974	GAGG	2	8	161377	161384	25 %	0 %	75 %	0 %	320449284
3597	NC_014974	CTG	2	6	161390	161395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449284
3598	NC_014974	ACT	2	6	161397	161402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449284
3599	NC_014974	AAG	2	6	161405	161410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449284
3600	NC_014974	GGA	2	6	161446	161451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449285
3601	NC_014974	GCG	2	6	161475	161480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449285
3602	NC_014974	GTG	2	6	161489	161494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449285
3603	NC_014974	GAGGTG	2	12	161588	161599	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449285
3604	NC_014974	GGA	2	6	161602	161607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449285
3605	NC_014974	CTT	2	6	161620	161625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449285
3606	NC_014974	GAG	2	6	161666	161671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449285
3607	NC_014974	GAG	2	6	161741	161746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449285
3608	NC_014974	TGCGG	2	10	161776	161785	0 %	20 %	60 %	20 %	320449286
3609	NC_014974	GCG	2	6	161837	161842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449286
3610	NC_014974	GGT	2	6	161853	161858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449286
3611	NC_014974	GCCC	2	8	161883	161890	0 %	0 %	25 %	75 %	320449286
3612	NC_014974	GGA	2	6	161892	161897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449286
3613	NC_014974	GGA	2	6	161901	161906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449286
3614	NC_014974	CGA	2	6	162041	162046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449287
3615	NC_014974	AAG	2	6	162090	162095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449287
3616	NC_014974	GGA	2	6	162146	162151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449287
3617	NC_014974	GTG	2	6	162234	162239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449287
3618	NC_014974	CCA	2	6	162280	162285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449287
3619	NC_014974	CCCAG	2	10	162313	162322	20 %	0 %	20 %	60 %	320449287
3620	NC_014974	CTC	2	6	162330	162335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449287
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3622	NC_014974	GGA	2	6	162365	162370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449287
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3991	NC_014974	TGG	2	6	178472	178477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449305
3992	NC_014974	TGG	2	6	178532	178537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449305
3993	NC_014974	ACC	2	6	178561	178566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449305
3994	NC_014974	GGAGG	2	10	178584	178593	20 %	0 %	80 %	0 %	320449305
3995	NC_014974	GGT	3	9	178653	178661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449305
3996	NC_014974	GGT	2	6	178701	178706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449305
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3998	NC_014974	GGA	2	6	178790	178795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449306
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4000	NC_014974	CAGG	2	8	178916	178923	25 %	0 %	50 %	25 %	320449306

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