MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014974	TCC	2	6	136012	136017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449251
3002	NC_014974	CCA	2	6	136022	136027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449251
3003	NC_014974	CACC	2	8	136028	136035	25 %	0 %	0 %	75 %	320449251
3004	NC_014974	CAC	2	6	136044	136049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449251
3005	NC_014974	CGG	2	6	136085	136090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449251
3006	NC_014974	GAG	2	6	136146	136151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449251
3007	NC_014974	CCT	3	9	136163	136171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449251
3008	NC_014974	GGC	2	6	136175	136180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449251
3009	NC_014974	GCC	2	6	136183	136188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449251
3010	NC_014974	GAA	2	6	136200	136205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449251
3011	NC_014974	AGG	2	6	136228	136233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449251
3012	NC_014974	AGCCC	2	10	136262	136271	20 %	0 %	20 %	60 %	320449251
3013	NC_014974	GTG	2	6	136324	136329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449251
3014	NC_014974	CCA	2	6	136331	136336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449251
3015	NC_014974	C	6	6	136362	136367	0 %	0 %	0 %	100 %	320449251
3016	NC_014974	C	6	6	136380	136385	0 %	0 %	0 %	100 %	320449251
3017	NC_014974	GGC	2	6	136425	136430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449251
3018	NC_014974	CCT	2	6	136436	136441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449251
3019	NC_014974	GAG	2	6	136529	136534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449252
3020	NC_014974	TGGCC	2	10	136558	136567	0 %	20 %	40 %	40 %	320449252
3021	NC_014974	TCC	2	6	136573	136578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449252
3022	NC_014974	GCC	2	6	136638	136643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449252
3023	NC_014974	GGC	2	6	136652	136657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449252
3024	NC_014974	CAC	2	6	136670	136675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449252
3025	NC_014974	CCA	2	6	136699	136704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449252
3026	NC_014974	ACC	2	6	136776	136781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449252
3027	NC_014974	C	6	6	136795	136800	0 %	0 %	0 %	100 %	320449252
3028	NC_014974	CCA	2	6	136813	136818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449252
3029	NC_014974	GGCG	2	8	136819	136826	0 %	0 %	75 %	25 %	320449252
3030	NC_014974	G	6	6	136921	136926	0 %	0 %	100 %	0 %	320449252
3031	NC_014974	CCTT	2	8	137031	137038	0 %	50 %	0 %	50 %	320449252
3032	NC_014974	G	6	6	137103	137108	0 %	0 %	100 %	0 %	320449252
3033	NC_014974	CCT	4	12	137140	137151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449252
3034	NC_014974	CTC	2	6	137183	137188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449252
3035	NC_014974	TGG	2	6	137197	137202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449252
3036	NC_014974	C	6	6	137218	137223	0 %	0 %	0 %	100 %	320449252
3037	NC_014974	GGC	2	6	137242	137247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449252
3038	NC_014974	CG	3	6	137330	137335	0 %	0 %	50 %	50 %	320449252
3039	NC_014974	CCCG	2	8	137496	137503	0 %	0 %	25 %	75 %	320449252
3040	NC_014974	TCC	2	6	137526	137531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449252
3041	NC_014974	TCC	3	9	137553	137561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449252
3042	NC_014974	AGT	2	6	137674	137679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449252
3043	NC_014974	CAGGGC	2	12	137720	137731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449252
3044	NC_014974	CTT	2	6	137756	137761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449252
3045	NC_014974	GGGCG	2	10	137819	137828	0 %	0 %	80 %	20 %	320449252
3046	NC_014974	AAT	2	6	137833	137838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320449252
3047	NC_014974	GCC	2	6	137904	137909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449252
3048	NC_014974	CCT	2	6	137965	137970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449253
3049	NC_014974	CAGG	2	8	138062	138069	25 %	0 %	50 %	25 %	320449253
3050	NC_014974	ATC	2	6	138081	138086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449253
3051	NC_014974	TGG	2	6	138123	138128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449253
3052	NC_014974	GCT	2	6	138223	138228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449253
3053	NC_014974	CCA	2	6	138241	138246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449253
3054	NC_014974	GTT	2	6	138248	138253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449253
3055	NC_014974	CCTGCT	2	12	138271	138282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320449253
3056	NC_014974	GAT	2	6	138302	138307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449253
3057	NC_014974	CGG	2	6	138373	138378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449253
3058	NC_014974	GGC	3	9	138383	138391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449253
3059	NC_014974	CCA	2	6	138418	138423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449253
3060	NC_014974	CTT	2	6	138515	138520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449253
3061	NC_014974	CGTT	2	8	138576	138583	0 %	50 %	25 %	25 %	320449253
3062	NC_014974	GTG	2	6	138609	138614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449253
3063	NC_014974	GACCAG	2	12	138641	138652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449253
3064	NC_014974	CTC	2	6	138701	138706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449253
3065	NC_014974	TGG	2	6	138718	138723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449253
3066	NC_014974	CAC	2	6	138728	138733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449253
3067	NC_014974	TCC	2	6	138828	138833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449253
3068	NC_014974	GCT	3	9	138844	138852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449253
3069	NC_014974	CGG	2	6	138879	138884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449253
3070	NC_014974	G	6	6	138892	138897	0 %	0 %	100 %	0 %	320449253
3071	NC_014974	G	6	6	138947	138952	0 %	0 %	100 %	0 %	320449253
3072	NC_014974	C	6	6	138982	138987	0 %	0 %	0 %	100 %	320449253
3073	NC_014974	CCG	2	6	138991	138996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449253
3074	NC_014974	AGA	2	6	139005	139010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449253
3075	NC_014974	CCT	2	6	139071	139076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3076	NC_014974	GTG	2	6	139082	139087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449254
3077	NC_014974	TCC	2	6	139115	139120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3078	NC_014974	TGGCG	2	10	139188	139197	0 %	20 %	60 %	20 %	320449254
3079	NC_014974	TCG	2	6	139202	139207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449254
3080	NC_014974	CCA	3	9	139209	139217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449254
3081	NC_014974	TCC	2	6	139307	139312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3082	NC_014974	TCC	2	6	139380	139385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3083	NC_014974	GA	3	6	139400	139405	50 %	0 %	50 %	0 %	320449254
3084	NC_014974	GCG	2	6	139418	139423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3085	NC_014974	GCG	2	6	139475	139480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3086	NC_014974	GGC	2	6	139522	139527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3087	NC_014974	TC	3	6	139563	139568	0 %	50 %	0 %	50 %	320449254
3088	NC_014974	CCA	2	6	139569	139574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449254
3089	NC_014974	TGA	2	6	139575	139580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449254
3090	NC_014974	CCTG	2	8	139590	139597	0 %	25 %	25 %	50 %	320449254
3091	NC_014974	GGT	2	6	139744	139749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449254
3092	NC_014974	TGA	2	6	139779	139784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449254
3093	NC_014974	CCT	2	6	139812	139817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3094	NC_014974	CGG	2	6	139872	139877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3095	NC_014974	CTT	2	6	139879	139884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449254
3096	NC_014974	CCCG	2	8	139974	139981	0 %	0 %	25 %	75 %	320449254
3097	NC_014974	GCC	2	6	140014	140019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449254
3098	NC_014974	TGA	2	6	140037	140042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449254
3099	NC_014974	GTG	2	6	140069	140074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449254
3100	NC_014974	GCG	2	6	140198	140203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3101	NC_014974	CCT	4	12	140229	140240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3102	NC_014974	TCC	2	6	140279	140284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3103	NC_014974	GGC	2	6	140317	140322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3104	NC_014974	CGG	2	6	140334	140339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3105	NC_014974	AGGCC	2	10	140352	140361	20 %	0 %	40 %	40 %	320449254
3106	NC_014974	CGT	2	6	140385	140390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449254
3107	NC_014974	GAG	2	6	140422	140427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449254
3108	NC_014974	GGT	2	6	140448	140453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449254
3109	NC_014974	CCG	2	6	140470	140475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449254
3110	NC_014974	GAG	3	9	140491	140499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449254
3111	NC_014974	GGC	2	6	140500	140505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3112	NC_014974	G	6	6	140516	140521	0 %	0 %	100 %	0 %	320449254
3113	NC_014974	CCA	2	6	140604	140609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449254
3114	NC_014974	GGC	2	6	140622	140627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3115	NC_014974	CTT	2	6	140644	140649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449254
3116	NC_014974	TCC	2	6	140657	140662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3117	NC_014974	CGGGC	2	10	140670	140679	0 %	0 %	60 %	40 %	320449254
3118	NC_014974	CCA	2	6	140691	140696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449254
3119	NC_014974	CTC	2	6	140758	140763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3120	NC_014974	CCT	2	6	140778	140783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449254
3121	NC_014974	GGC	2	6	140802	140807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449254
3122	NC_014974	T	6	6	140808	140813	0 %	100 %	0 %	0 %	320449254
3123	NC_014974	TGG	2	6	140825	140830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449254
3124	NC_014974	GAG	2	6	140860	140865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449254
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3153	NC_014974	G	6	6	141795	141800	0 %	0 %	100 %	0 %	320449255
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3232	NC_014974	TCC	2	6	145026	145031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449261
3233	NC_014974	TGG	2	6	145089	145094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449261
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3237	NC_014974	AGG	2	6	145273	145278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449261
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3239	NC_014974	GGA	4	12	145359	145370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449262
3240	NC_014974	TGG	2	6	145454	145459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449262
3241	NC_014974	CGG	2	6	145460	145465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449262
3242	NC_014974	GCG	2	6	145491	145496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449262
3243	NC_014974	GACCTG	2	12	145501	145512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449262
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3245	NC_014974	CCT	2	6	145625	145630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449263
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3489	NC_014974	C	6	6	156573	156578	0 %	0 %	0 %	100 %	320449278
3490	NC_014974	CGC	2	6	156600	156605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449278
3491	NC_014974	CCG	2	6	156611	156616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449278
3492	NC_014974	GAG	2	6	156664	156669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449278
3493	NC_014974	GGC	2	6	156723	156728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449278
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