MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

< Previous12...6263646566676869707172...102103Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_014974	AGG	2	6	1540230	1540235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450669
33004	NC_014974	G	6	6	1540258	1540263	0 %	0 %	100 %	0 %	320450669
33005	NC_014974	GAG	2	6	1540269	1540274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450669
33006	NC_014974	GAG	3	9	1540307	1540315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450669
33007	NC_014974	CTT	2	6	1540394	1540399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450669
33008	NC_014974	CTC	2	6	1540400	1540405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450669
33009	NC_014974	CCA	2	6	1540406	1540411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450669
33010	NC_014974	CGGGG	2	10	1540442	1540451	0 %	0 %	80 %	20 %	320450669
33011	NC_014974	G	7	7	1540470	1540476	0 %	0 %	100 %	0 %	320450669
33012	NC_014974	AGG	2	6	1540514	1540519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450669
33013	NC_014974	GAG	2	6	1540529	1540534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450669
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33015	NC_014974	AGT	2	6	1540606	1540611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450669
33016	NC_014974	CCG	2	6	1540661	1540666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450670
33017	NC_014974	CCT	2	6	1540745	1540750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450670
33018	NC_014974	CCT	2	6	1540754	1540759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450670
33019	NC_014974	GCC	2	6	1540837	1540842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450670
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33022	NC_014974	CCCGG	2	10	1540960	1540969	0 %	0 %	40 %	60 %	320450671
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33028	NC_014974	CCGT	2	8	1541150	1541157	0 %	25 %	25 %	50 %	320450671
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33033	NC_014974	GGGGCC	2	12	1541341	1541352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450672
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33038	NC_014974	AGGCC	2	10	1541595	1541604	20 %	0 %	40 %	40 %	320450673
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33046	NC_014974	GAG	2	6	1542203	1542208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450674
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33052	NC_014974	CCA	2	6	1542289	1542294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450674
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33054	NC_014974	TCA	2	6	1542397	1542402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450674
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33090	NC_014974	AGGT	2	8	1543763	1543770	25 %	25 %	50 %	0 %	320450679
33091	NC_014974	GGTT	2	8	1543776	1543783	0 %	50 %	50 %	0 %	320450679
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33118	NC_014974	GCG	2	6	1545270	1545275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450683
33119	NC_014974	GAG	2	6	1545293	1545298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450683
33120	NC_014974	TTC	2	6	1545326	1545331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450683
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33125	NC_014974	GCCT	2	8	1545549	1545556	0 %	25 %	25 %	50 %	320450684
33126	NC_014974	GGT	2	6	1545570	1545575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450684
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33231	NC_014974	GTC	2	6	1549296	1549301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450688
33232	NC_014974	TGA	2	6	1549328	1549333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450688
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33234	NC_014974	GGA	2	6	1549364	1549369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450688
33235	NC_014974	GCGG	2	8	1549449	1549456	0 %	0 %	75 %	25 %	320450688
33236	NC_014974	GCGG	2	8	1549467	1549474	0 %	0 %	75 %	25 %	320450688
33237	NC_014974	AGG	2	6	1549493	1549498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450688
33238	NC_014974	CCT	2	6	1549586	1549591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450688
33239	NC_014974	AGGG	2	8	1549629	1549636	25 %	0 %	75 %	0 %	320450688
33240	NC_014974	TTC	2	6	1549680	1549685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450688
33241	NC_014974	C	6	6	1549747	1549752	0 %	0 %	0 %	100 %	320450688
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33243	NC_014974	CGGG	2	8	1549789	1549796	0 %	0 %	75 %	25 %	320450688
33244	NC_014974	CGTT	2	8	1549819	1549826	0 %	50 %	25 %	25 %	320450688
33245	NC_014974	GAG	2	6	1549836	1549841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450688
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33248	NC_014974	AGG	2	6	1550098	1550103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450688
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33250	NC_014974	G	6	6	1550206	1550211	0 %	0 %	100 %	0 %	320450689
33251	NC_014974	GTC	2	6	1550218	1550223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450689
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33253	NC_014974	AG	3	6	1550228	1550233	50 %	0 %	50 %	0 %	320450689
33254	NC_014974	GAG	2	6	1550353	1550358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450689
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33256	NC_014974	ATC	2	6	1550381	1550386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450689
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33265	NC_014974	CGGT	2	8	1550817	1550824	0 %	25 %	50 %	25 %	320450691
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33270	NC_014974	GGA	2	6	1551597	1551602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450692
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33272	NC_014974	TGG	2	6	1551687	1551692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450692
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33338	NC_014974	CCG	2	6	1555142	1555147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450698
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33340	NC_014974	GATGGC	2	12	1555173	1555184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320450698
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33342	NC_014974	TCC	3	9	1555217	1555225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450698
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33345	NC_014974	CTC	2	6	1555407	1555412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450698
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33347	NC_014974	TCC	2	6	1555512	1555517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450698
33348	NC_014974	TGG	2	6	1555520	1555525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450698
33349	NC_014974	TCCC	2	8	1555590	1555597	0 %	25 %	0 %	75 %	320450698
33350	NC_014974	CCT	2	6	1555640	1555645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450698
33351	NC_014974	ACC	2	6	1555681	1555686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450698
33352	NC_014974	TCT	2	6	1555709	1555714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450698
33353	NC_014974	AT	3	6	1555747	1555752	50 %	50 %	0 %	0 %	320450698
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33460	NC_014974	GAAA	2	8	1560840	1560847	75 %	0 %	25 %	0 %	320450701
33461	NC_014974	CCTCC	2	10	1560878	1560887	0 %	20 %	0 %	80 %	320450701
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33466	NC_014974	GAGTA	2	10	1561159	1561168	40 %	20 %	40 %	0 %	320450701
33467	NC_014974	G	6	6	1561232	1561237	0 %	0 %	100 %	0 %	320450701
33468	NC_014974	GGA	2	6	1561248	1561253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450701
33469	NC_014974	GTC	2	6	1561316	1561321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450701
33470	NC_014974	CTC	2	6	1561347	1561352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
33471	NC_014974	CTC	2	6	1561367	1561372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
33472	NC_014974	CCT	2	6	1561399	1561404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
33473	NC_014974	GAG	2	6	1561447	1561452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450701
33474	NC_014974	GTA	2	6	1561469	1561474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450701
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33479	NC_014974	CT	3	6	1561638	1561643	0 %	50 %	0 %	50 %	320450701
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33496	NC_014974	ATG	2	6	1562772	1562777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450704
33497	NC_014974	GAT	2	6	1562828	1562833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450704
33498	NC_014974	GCC	2	6	1562907	1562912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450704
33499	NC_014974	ACC	2	6	1562922	1562927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450704
33500	NC_014974	GCC	2	6	1562928	1562933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450704

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