MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014974	AGG	2	6	110697	110702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449230
2502	NC_014974	GCG	2	6	110717	110722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449230
2503	NC_014974	GGT	2	6	110734	110739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449230
2504	NC_014974	GAG	2	6	110813	110818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449230
2505	NC_014974	GAAG	2	8	110842	110849	50 %	0 %	50 %	0 %	320449230
2506	NC_014974	CAAGG	2	10	110927	110936	40 %	0 %	40 %	20 %	320449230
2507	NC_014974	AGG	3	9	110934	110942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449230
2508	NC_014974	C	6	6	110977	110982	0 %	0 %	0 %	100 %	320449230
2509	NC_014974	AAGG	2	8	110986	110993	50 %	0 %	50 %	0 %	320449230
2510	NC_014974	GCG	2	6	111035	111040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449230
2511	NC_014974	G	6	6	111058	111063	0 %	0 %	100 %	0 %	320449230
2512	NC_014974	GGA	2	6	111088	111093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449230
2513	NC_014974	AAG	2	6	111098	111103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449230
2514	NC_014974	GGA	2	6	111277	111282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449231
2515	NC_014974	CTT	2	6	111305	111310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449231
2516	NC_014974	GGGAG	2	10	111346	111355	20 %	0 %	80 %	0 %	320449231
2517	NC_014974	CTGG	2	8	111356	111363	0 %	25 %	50 %	25 %	320449231
2518	NC_014974	CAA	2	6	111451	111456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449231
2519	NC_014974	CCT	3	9	111469	111477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449231
2520	NC_014974	CTC	2	6	111497	111502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449231
2521	NC_014974	GCG	2	6	111592	111597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449231
2522	NC_014974	TC	3	6	111607	111612	0 %	50 %	0 %	50 %	320449231
2523	NC_014974	CGA	2	6	111628	111633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449231
2524	NC_014974	GAG	2	6	111656	111661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449231
2525	NC_014974	GGA	2	6	111685	111690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449231
2526	NC_014974	CCT	2	6	111734	111739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2527	NC_014974	CTC	3	9	111744	111752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2528	NC_014974	ACCT	2	8	111753	111760	25 %	25 %	0 %	50 %	320449232
2529	NC_014974	CGGG	2	8	111801	111808	0 %	0 %	75 %	25 %	320449232
2530	NC_014974	TGG	2	6	111817	111822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2531	NC_014974	CTC	2	6	111840	111845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2532	NC_014974	CAT	2	6	111911	111916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449232
2533	NC_014974	CTT	2	6	111947	111952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449232
2534	NC_014974	GCG	2	6	111960	111965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449232
2535	NC_014974	TCC	2	6	112006	112011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2536	NC_014974	CCT	2	6	112130	112135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2537	NC_014974	GGC	2	6	112145	112150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449232
2538	NC_014974	GTG	2	6	112200	112205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2539	NC_014974	GTTT	2	8	112235	112242	0 %	75 %	25 %	0 %	320449232
2540	NC_014974	CTG	2	6	112263	112268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449232
2541	NC_014974	GGT	2	6	112283	112288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2542	NC_014974	CTC	2	6	112299	112304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2543	NC_014974	C	6	6	112335	112340	0 %	0 %	0 %	100 %	320449232
2544	NC_014974	C	7	7	112343	112349	0 %	0 %	0 %	100 %	320449232
2545	NC_014974	TCC	2	6	112420	112425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2546	NC_014974	TGG	2	6	112453	112458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2547	NC_014974	TCC	2	6	112468	112473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
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2549	NC_014974	CTT	2	6	112505	112510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449232
2550	NC_014974	CGC	2	6	112541	112546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449232
2551	NC_014974	CCA	2	6	112609	112614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449232
2552	NC_014974	CTT	2	6	112626	112631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449232
2553	NC_014974	GCC	2	6	112635	112640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449232
2554	NC_014974	CCT	2	6	112643	112648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2555	NC_014974	CTT	2	6	112719	112724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449232
2556	NC_014974	CTGG	2	8	112725	112732	0 %	25 %	50 %	25 %	320449232
2557	NC_014974	GGGAA	2	10	112802	112811	40 %	0 %	60 %	0 %	320449232
2558	NC_014974	AGCC	2	8	112909	112916	25 %	0 %	25 %	50 %	320449233
2559	NC_014974	TCC	2	6	112939	112944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2560	NC_014974	CAC	2	6	112956	112961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449233
2561	NC_014974	TCC	2	6	112981	112986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2562	NC_014974	GAG	2	6	113022	113027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449233
2563	NC_014974	AGGGTG	2	12	113038	113049	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449233
2564	NC_014974	CTC	2	6	113068	113073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2565	NC_014974	CCT	2	6	113093	113098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2566	NC_014974	G	7	7	113110	113116	0 %	0 %	100 %	0 %	320449233
2567	NC_014974	GAG	3	9	113136	113144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449233
2568	NC_014974	C	6	6	113153	113158	0 %	0 %	0 %	100 %	320449233
2569	NC_014974	GA	3	6	113267	113272	50 %	0 %	50 %	0 %	320449233
2570	NC_014974	AGG	2	6	113396	113401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449233
2571	NC_014974	AGG	2	6	113633	113638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449233
2572	NC_014974	CAC	2	6	113649	113654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449233
2573	NC_014974	GGC	2	6	113664	113669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449233
2574	NC_014974	GAGGC	2	10	113707	113716	20 %	0 %	60 %	20 %	320449233
2575	NC_014974	GCCACG	2	12	113728	113739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449233
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2579	NC_014974	GAGG	2	8	113918	113925	25 %	0 %	75 %	0 %	320449233
2580	NC_014974	G	6	6	113924	113929	0 %	0 %	100 %	0 %	320449233
2581	NC_014974	CTC	2	6	114030	114035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2582	NC_014974	TCC	2	6	114052	114057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
2583	NC_014974	TCC	2	6	114127	114132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449233
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2587	NC_014974	CTC	2	6	114385	114390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449234
2588	NC_014974	GGA	2	6	114396	114401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449234
2589	NC_014974	CTCCGC	2	12	114427	114438	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449234
2590	NC_014974	GCC	2	6	114491	114496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449234
2591	NC_014974	CTC	2	6	114577	114582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449234
2592	NC_014974	GCG	2	6	114616	114621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449234
2593	NC_014974	ACC	2	6	114629	114634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449234
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2595	NC_014974	TGGCCT	2	12	114738	114749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449234
2596	NC_014974	GA	3	6	114767	114772	50 %	0 %	50 %	0 %	320449234
2597	NC_014974	ACC	2	6	114800	114805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449234
2598	NC_014974	GGC	2	6	114832	114837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449234
2599	NC_014974	C	6	6	114853	114858	0 %	0 %	0 %	100 %	320449234
2600	NC_014974	AGG	2	6	114863	114868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449234
2601	NC_014974	CCA	2	6	114870	114875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449234
2602	NC_014974	G	6	6	114892	114897	0 %	0 %	100 %	0 %	320449234
2603	NC_014974	TCCCGG	2	12	114904	114915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449234
2604	NC_014974	GCG	2	6	114938	114943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449234
2605	NC_014974	CAC	2	6	114958	114963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449234
2606	NC_014974	TCT	2	6	115005	115010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449234
2607	NC_014974	AAG	2	6	115027	115032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449234
2608	NC_014974	TCC	2	6	115124	115129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449234
2609	NC_014974	AGG	2	6	115253	115258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449234
2610	NC_014974	GCC	2	6	115286	115291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449234
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2612	NC_014974	GGCCTT	2	12	115318	115329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449234
2613	NC_014974	GGC	2	6	115439	115444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449235
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2615	NC_014974	CTC	2	6	115479	115484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449235
2616	NC_014974	GGCC	2	8	115486	115493	0 %	0 %	50 %	50 %	320449235
2617	NC_014974	GTA	2	6	115509	115514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449235
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2620	NC_014974	GGA	2	6	115628	115633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449235
2621	NC_014974	TCC	2	6	115681	115686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449235
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2623	NC_014974	CCG	2	6	115732	115737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449235
2624	NC_014974	TCC	2	6	115747	115752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449235
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2645	NC_014974	CCT	2	6	116463	116468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449236
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2751	NC_014974	GCG	2	6	120862	120867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449240
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2863	NC_014974	GCTC	2	8	125950	125957	0 %	25 %	25 %	50 %	320449244
2864	NC_014974	C	6	6	125957	125962	0 %	0 %	0 %	100 %	320449244
2865	NC_014974	CCT	2	6	126018	126023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449244
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2990	NC_014974	CTT	2	6	135451	135456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449250
2991	NC_014974	CCA	2	6	135554	135559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449251
2992	NC_014974	CCT	2	6	135578	135583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449251
2993	NC_014974	TCC	3	9	135637	135645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449251
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2995	NC_014974	GCC	2	6	135759	135764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449251
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2998	NC_014974	CCA	2	6	135911	135916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449251
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