MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014974	AGGA	2	8	66407	66414	50 %	0 %	50 %	0 %	320449186
1502	NC_014974	CGC	2	6	66522	66527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449187
1503	NC_014974	CTT	2	6	66550	66555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1504	NC_014974	CCA	2	6	66570	66575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449187
1505	NC_014974	GGT	2	6	66583	66588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449187
1506	NC_014974	GGC	2	6	66610	66615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1507	NC_014974	TGCC	2	8	66657	66664	0 %	25 %	25 %	50 %	320449187
1508	NC_014974	CCA	2	6	66666	66671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449187
1509	NC_014974	GGC	2	6	66691	66696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1510	NC_014974	ACC	2	6	66743	66748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449187
1511	NC_014974	CTC	2	6	66793	66798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1512	NC_014974	CTT	2	6	66847	66852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1513	NC_014974	GAG	2	6	66883	66888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449187
1514	NC_014974	CGCCA	2	10	66889	66898	20 %	0 %	20 %	60 %	320449187
1515	NC_014974	CTT	2	6	66964	66969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1516	NC_014974	GGC	2	6	66991	66996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1517	NC_014974	C	6	6	67019	67024	0 %	0 %	0 %	100 %	320449187
1518	NC_014974	CTT	2	6	67090	67095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1519	NC_014974	TCC	2	6	67121	67126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1520	NC_014974	CTTGCC	2	12	67129	67140	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320449187
1521	NC_014974	TGG	2	6	67149	67154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449187
1522	NC_014974	CGGCC	2	10	67182	67191	0 %	0 %	40 %	60 %	320449187
1523	NC_014974	CTC	2	6	67231	67236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1524	NC_014974	ACC	2	6	67249	67254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449187
1525	NC_014974	CGG	2	6	67260	67265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1526	NC_014974	GCG	2	6	67288	67293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1527	NC_014974	TTG	2	6	67346	67351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449187
1528	NC_014974	ACC	2	6	67352	67357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449187
1529	NC_014974	AGG	3	9	67397	67405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449187
1530	NC_014974	GAG	2	6	67441	67446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449187
1531	NC_014974	CTT	2	6	67465	67470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1532	NC_014974	TGA	2	6	67527	67532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449187
1533	NC_014974	CTC	2	6	67606	67611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1534	NC_014974	TGA	2	6	67617	67622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449187
1535	NC_014974	CCT	2	6	67626	67631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1536	NC_014974	TGG	2	6	67692	67697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449187
1537	NC_014974	CCT	2	6	67701	67706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1538	NC_014974	TCC	2	6	67721	67726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1539	NC_014974	TCT	2	6	67749	67754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1540	NC_014974	CCG	2	6	67758	67763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449187
1541	NC_014974	CGG	2	6	67812	67817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1542	NC_014974	TTC	2	6	67823	67828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1543	NC_014974	CGGTGG	2	12	67860	67871	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449187
1544	NC_014974	CGT	2	6	67890	67895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449187
1545	NC_014974	CCT	2	6	67911	67916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449187
1546	NC_014974	GAG	2	6	67918	67923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449187
1547	NC_014974	GGT	2	6	67944	67949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449187
1548	NC_014974	TGG	2	6	67995	68000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449187
1549	NC_014974	CTT	2	6	68011	68016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449187
1550	NC_014974	CGC	2	6	68082	68087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449187
1551	NC_014974	CGG	2	6	68099	68104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449187
1552	NC_014974	CTC	2	6	68194	68199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449188
1553	NC_014974	TCGATC	2	12	68204	68215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320449188
1554	NC_014974	GCC	2	6	68221	68226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449188
1555	NC_014974	CCT	2	6	68253	68258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449188
1556	NC_014974	GCC	2	6	68365	68370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449188
1557	NC_014974	CTC	3	9	68383	68391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449188
1558	NC_014974	CAC	2	6	68401	68406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449188
1559	NC_014974	TGG	2	6	68568	68573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449189
1560	NC_014974	CAC	2	6	68579	68584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449189
1561	NC_014974	AGG	3	9	68607	68615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1562	NC_014974	GCTC	2	8	68631	68638	0 %	25 %	25 %	50 %	320449189
1563	NC_014974	GAG	4	12	68705	68716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1564	NC_014974	GCC	2	6	68751	68756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449189
1565	NC_014974	CCG	2	6	68773	68778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449189
1566	NC_014974	TGA	2	6	68785	68790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449189
1567	NC_014974	GAA	2	6	68792	68797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449189
1568	NC_014974	AGG	2	6	68807	68812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1569	NC_014974	TGGG	2	8	68838	68845	0 %	25 %	75 %	0 %	320449189
1570	NC_014974	GGC	2	6	68969	68974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449189
1571	NC_014974	GAAG	2	8	69028	69035	50 %	0 %	50 %	0 %	320449189
1572	NC_014974	T	6	6	69052	69057	0 %	100 %	0 %	0 %	320449189
1573	NC_014974	GGC	2	6	69076	69081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449189
1574	NC_014974	GAA	2	6	69200	69205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449189
1575	NC_014974	GGGC	2	8	69211	69218	0 %	0 %	75 %	25 %	320449189
1576	NC_014974	CCCAGG	2	12	69291	69302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449189
1577	NC_014974	CGG	2	6	69348	69353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449189
1578	NC_014974	GAA	2	6	69458	69463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449189
1579	NC_014974	AAGGGG	2	12	69464	69475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1580	NC_014974	GAG	3	9	69587	69595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1581	NC_014974	AGG	2	6	69597	69602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449189
1582	NC_014974	CGGGG	2	10	69655	69664	0 %	0 %	80 %	20 %	320449190
1583	NC_014974	CCA	2	6	69684	69689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449190
1584	NC_014974	GGCT	2	8	69699	69706	0 %	25 %	50 %	25 %	320449190
1585	NC_014974	GGC	2	6	69751	69756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449190
1586	NC_014974	CCT	2	6	69765	69770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1587	NC_014974	GTCC	2	8	69794	69801	0 %	25 %	25 %	50 %	320449190
1588	NC_014974	AGGGCC	2	12	69809	69820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449190
1589	NC_014974	CCT	2	6	69873	69878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1590	NC_014974	AGCC	2	8	69890	69897	25 %	0 %	25 %	50 %	320449190
1591	NC_014974	AGG	2	6	69908	69913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1592	NC_014974	CCT	2	6	69924	69929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1593	NC_014974	CACCCG	2	12	69934	69945	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449190
1594	NC_014974	CCT	2	6	69951	69956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1595	NC_014974	TCC	2	6	69974	69979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1596	NC_014974	GGA	2	6	70032	70037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1597	NC_014974	TCG	2	6	70046	70051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449190
1598	NC_014974	CTC	3	9	70117	70125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1599	NC_014974	GAG	2	6	70216	70221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1600	NC_014974	CCA	2	6	70260	70265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449190
1601	NC_014974	AGG	2	6	70301	70306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1602	NC_014974	CTTC	2	8	70307	70314	0 %	50 %	0 %	50 %	320449190
1603	NC_014974	GGTAGA	2	12	70317	70328	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320449190
1604	NC_014974	AGG	2	6	70349	70354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1605	NC_014974	AAAGG	2	10	70378	70387	60 %	0 %	40 %	0 %	320449190
1606	NC_014974	GGT	2	6	70417	70422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449190
1607	NC_014974	TCC	2	6	70442	70447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1608	NC_014974	AGA	2	6	70448	70453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449190
1609	NC_014974	C	6	6	70459	70464	0 %	0 %	0 %	100 %	320449190
1610	NC_014974	AGG	2	6	70469	70474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1611	NC_014974	TCC	2	6	70499	70504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449190
1612	NC_014974	AGG	2	6	70508	70513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449190
1613	NC_014974	TCC	3	9	70597	70605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449191
1614	NC_014974	CCG	2	6	70615	70620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449191
1615	NC_014974	GC	3	6	70623	70628	0 %	0 %	50 %	50 %	320449191
1616	NC_014974	TC	3	6	70663	70668	0 %	50 %	0 %	50 %	320449191
1617	NC_014974	GGGA	2	8	70681	70688	25 %	0 %	75 %	0 %	320449191
1618	NC_014974	CGC	2	6	70777	70782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449191
1619	NC_014974	CCT	2	6	70847	70852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449192
1620	NC_014974	TCCCGG	2	12	70858	70869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449192
1621	NC_014974	AGG	2	6	70891	70896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449192
1622	NC_014974	GA	3	6	70897	70902	50 %	0 %	50 %	0 %	320449192
1623	NC_014974	C	6	6	71053	71058	0 %	0 %	0 %	100 %	320449192
1624	NC_014974	AGG	2	6	71074	71079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449192
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1626	NC_014974	C	6	6	71148	71153	0 %	0 %	0 %	100 %	320449192
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