MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

< Previous12...3233343536373839404142...102103Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014974	GGC	2	6	820687	820692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449951
18003	NC_014974	ACCCTC	2	12	820706	820717	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449951
18004	NC_014974	GGC	2	6	820765	820770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449951
18005	NC_014974	GGA	3	9	820834	820842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18006	NC_014974	GTG	2	6	820928	820933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18007	NC_014974	TGG	2	6	820965	820970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18008	NC_014974	AGG	2	6	820971	820976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18009	NC_014974	GGA	2	6	820993	820998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18010	NC_014974	CTT	2	6	821045	821050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18011	NC_014974	GTG	2	6	821051	821056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18012	NC_014974	GGC	2	6	821074	821079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449951
18013	NC_014974	CCGGG	2	10	821095	821104	0 %	0 %	60 %	40 %	320449951
18014	NC_014974	CCG	2	6	821161	821166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449951
18015	NC_014974	GCT	2	6	821186	821191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449951
18016	NC_014974	AGG	2	6	821238	821243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18017	NC_014974	GGC	2	6	821287	821292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449951
18018	NC_014974	GGA	2	6	821308	821313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18019	NC_014974	GGA	2	6	821380	821385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449951
18020	NC_014974	CAC	2	6	821441	821446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449951
18021	NC_014974	CCT	2	6	821480	821485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449951
18022	NC_014974	ACCCC	2	10	821547	821556	20 %	0 %	0 %	80 %	320449951
18023	NC_014974	GGT	2	6	821557	821562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18024	NC_014974	TCT	2	6	821568	821573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18025	NC_014974	CTT	2	6	821618	821623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18026	NC_014974	TCC	3	9	821625	821633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449951
18027	NC_014974	CTCAAG	2	12	821696	821707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320449951
18028	NC_014974	TCT	2	6	821751	821756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18029	NC_014974	GGT	2	6	821761	821766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18030	NC_014974	TTC	2	6	821789	821794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18031	NC_014974	TCC	2	6	821901	821906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449951
18032	NC_014974	GGT	2	6	821923	821928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18033	NC_014974	TCT	2	6	821934	821939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
18034	NC_014974	GGCCT	2	10	821942	821951	0 %	20 %	40 %	40 %	320449951
18035	NC_014974	CAC	3	9	821975	821983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449951
18036	NC_014974	TGG	2	6	822024	822029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18037	NC_014974	CCTGGC	2	12	822034	822045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449951
18038	NC_014974	CAT	2	6	822088	822093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449951
18039	NC_014974	CTTG	2	8	822115	822122	0 %	50 %	25 %	25 %	320449951
18040	NC_014974	GTT	2	6	822290	822295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449951
18041	NC_014974	TGG	2	6	822306	822311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449951
18042	NC_014974	CTC	3	9	822335	822343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449951
18043	NC_014974	ACC	2	6	822344	822349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449951
18044	NC_014974	TTC	2	6	822392	822397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449951
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18047	NC_014974	GAA	2	6	822484	822489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449952
18048	NC_014974	TGG	2	6	822507	822512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449952
18049	NC_014974	GCG	2	6	822536	822541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449952
18050	NC_014974	GAG	2	6	822542	822547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449952
18051	NC_014974	GCG	2	6	822548	822553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449952
18052	NC_014974	TCC	2	6	822554	822559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449952
18053	NC_014974	TCC	2	6	822711	822716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449952
18054	NC_014974	TGGGG	2	10	822807	822816	0 %	20 %	80 %	0 %	320449953
18055	NC_014974	AGG	2	6	822827	822832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449953
18056	NC_014974	AGG	2	6	822865	822870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449953
18057	NC_014974	AGGCCA	2	12	822901	822912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449953
18058	NC_014974	AGGCCA	2	12	822934	822945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449953
18059	NC_014974	GCTT	2	8	822955	822962	0 %	50 %	25 %	25 %	320449953
18060	NC_014974	GGCC	2	8	822986	822993	0 %	0 %	50 %	50 %	320449953
18061	NC_014974	GCC	2	6	822999	823004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449953
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18072	NC_014974	TGG	2	6	823609	823614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449954
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18099	NC_014974	ATC	2	6	824822	824827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449956
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18101	NC_014974	ACG	2	6	824958	824963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449956
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18103	NC_014974	TGG	2	6	825024	825029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449956
18104	NC_014974	GA	3	6	825045	825050	50 %	0 %	50 %	0 %	320449956
18105	NC_014974	G	6	6	825097	825102	0 %	0 %	100 %	0 %	320449956
18106	NC_014974	AGG	2	6	825180	825185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449956
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18109	NC_014974	GGT	3	9	825220	825228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449956
18110	NC_014974	GGA	2	6	825232	825237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449956
18111	NC_014974	G	6	6	825367	825372	0 %	0 %	100 %	0 %	320449956
18112	NC_014974	CAG	2	6	825419	825424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449956
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18114	NC_014974	TGG	2	6	825504	825509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449956
18115	NC_014974	GCC	2	6	825596	825601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449956
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18118	NC_014974	GAG	2	6	825731	825736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449956
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18240	NC_014974	TGG	2	6	830443	830448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449959
18241	NC_014974	CAC	2	6	830507	830512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449959
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18244	NC_014974	GTA	2	6	830621	830626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449959
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18355	NC_014974	TCC	2	6	835107	835112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449961
18356	NC_014974	CAC	2	6	835169	835174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449961
18357	NC_014974	G	6	6	835175	835180	0 %	0 %	100 %	0 %	320449961
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18480	NC_014974	CTGGAG	2	12	840141	840152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449966
18481	NC_014974	C	6	6	840178	840183	0 %	0 %	0 %	100 %	320449966
18482	NC_014974	TGG	2	6	840193	840198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449966
18483	NC_014974	CGAGGC	2	12	840203	840214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449966
18484	NC_014974	GGA	2	6	840221	840226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449966
18485	NC_014974	TCC	2	6	840229	840234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449966
18486	NC_014974	CTG	2	6	840321	840326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449966
18487	NC_014974	ACT	3	9	840328	840336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449966
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18490	NC_014974	CGG	2	6	840438	840443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449966
18491	NC_014974	GTG	2	6	840462	840467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449966
18492	NC_014974	CGG	2	6	840484	840489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449966
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18494	NC_014974	GGA	2	6	840515	840520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449966
18495	NC_014974	ACG	2	6	840538	840543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449966
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18498	NC_014974	TCCA	2	8	840597	840604	25 %	25 %	0 %	50 %	320449966
18499	NC_014974	GTG	2	6	840753	840758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449966
18500	NC_014974	TGG	2	6	840805	840810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449966

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