MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014974	AAG	2	6	680402	680407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449820
15002	NC_014974	G	6	6	680426	680431	0 %	0 %	100 %	0 %	320449820
15003	NC_014974	C	6	6	680438	680443	0 %	0 %	0 %	100 %	320449820
15004	NC_014974	CCA	2	6	680502	680507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15005	NC_014974	CCA	2	6	680559	680564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15006	NC_014974	ATC	2	6	680576	680581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449821
15007	NC_014974	CCGGGG	2	12	680631	680642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15008	NC_014974	CAT	2	6	680665	680670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449821
15009	NC_014974	CCA	2	6	680700	680705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15010	NC_014974	CAG	2	6	680755	680760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449821
15011	NC_014974	CGC	3	9	680779	680787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449821
15012	NC_014974	CGAAGG	2	12	680793	680804	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320449821
15013	NC_014974	CCA	2	6	680805	680810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15014	NC_014974	CGG	2	6	680827	680832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15015	NC_014974	AGG	2	6	680867	680872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449821
15016	NC_014974	GTA	2	6	680932	680937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15017	NC_014974	GGC	2	6	680995	681000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15018	NC_014974	CCGC	2	8	681008	681015	0 %	0 %	25 %	75 %	320449821
15019	NC_014974	CCA	2	6	681018	681023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15020	NC_014974	GAT	2	6	681073	681078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15021	NC_014974	TCG	2	6	681113	681118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449821
15022	NC_014974	GGCCC	2	10	681157	681166	0 %	0 %	40 %	60 %	320449821
15023	NC_014974	CAG	2	6	681211	681216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449821
15024	NC_014974	TCT	2	6	681222	681227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449821
15025	NC_014974	TCC	2	6	681260	681265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449821
15026	NC_014974	TGA	2	6	681288	681293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15027	NC_014974	GGC	2	6	681310	681315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15028	NC_014974	GTG	2	6	681329	681334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449821
15029	NC_014974	AGG	2	6	681338	681343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449821
15030	NC_014974	GCGG	2	8	681376	681383	0 %	0 %	75 %	25 %	320449821
15031	NC_014974	GAT	2	6	681412	681417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15032	NC_014974	CCA	2	6	681441	681446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15033	NC_014974	GGC	2	6	681543	681548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15034	NC_014974	TGAAGG	2	12	681561	681572	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320449821
15035	NC_014974	TGGCGA	2	12	681606	681617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449821
15036	NC_014974	GAT	2	6	681637	681642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15037	NC_014974	GCC	2	6	681688	681693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449821
15038	NC_014974	CCA	2	6	681711	681716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449821
15039	NC_014974	GAT	2	6	681727	681732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15040	NC_014974	TGG	2	6	681825	681830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449821
15041	NC_014974	GGC	2	6	681835	681840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15042	NC_014974	GCGG	2	8	681847	681854	0 %	0 %	75 %	25 %	320449821
15043	NC_014974	AGT	2	6	681861	681866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15044	NC_014974	C	6	6	681950	681955	0 %	0 %	0 %	100 %	320449821
15045	NC_014974	GGC	2	6	682027	682032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15046	NC_014974	CGG	3	9	682044	682052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15047	NC_014974	GGC	2	6	682054	682059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15048	NC_014974	CGC	2	6	682080	682085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449821
15049	NC_014974	GGCC	2	8	682086	682093	0 %	0 %	50 %	50 %	320449821
15050	NC_014974	GATGTA	2	12	682135	682146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15051	NC_014974	TCC	2	6	682203	682208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449822
15052	NC_014974	CGT	2	6	682219	682224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449822
15053	NC_014974	GTA	2	6	682256	682261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449822
15054	NC_014974	CTG	2	6	682295	682300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449822
15055	NC_014974	CCA	2	6	682354	682359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449822
15056	NC_014974	GGA	2	6	682360	682365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449822
15057	NC_014974	CTC	2	6	682648	682653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15058	NC_014974	GA	3	6	682661	682666	50 %	0 %	50 %	0 %	320449823
15059	NC_014974	GAG	2	6	682699	682704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
15060	NC_014974	GCG	2	6	682705	682710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
15061	NC_014974	CTC	2	6	682822	682827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15062	NC_014974	CAC	2	6	682852	682857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
15063	NC_014974	CCG	2	6	682905	682910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449823
15064	NC_014974	CGG	2	6	682953	682958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
15065	NC_014974	CGT	2	6	682989	682994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449823
15066	NC_014974	CTC	2	6	683023	683028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15067	NC_014974	CAT	2	6	683122	683127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449823
15068	NC_014974	CCT	2	6	683159	683164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15069	NC_014974	G	6	6	683171	683176	0 %	0 %	100 %	0 %	320449823
15070	NC_014974	CTC	2	6	683188	683193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15071	NC_014974	CCA	2	6	683196	683201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
15072	NC_014974	GGA	2	6	683253	683258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
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15074	NC_014974	GCCC	2	8	683280	683287	0 %	0 %	25 %	75 %	320449823
15075	NC_014974	CCA	2	6	683299	683304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
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15079	NC_014974	CCA	2	6	683508	683513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
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15082	NC_014974	CTCC	2	8	683574	683581	0 %	25 %	0 %	75 %	320449823
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15085	NC_014974	TGG	2	6	683634	683639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
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15090	NC_014974	GGT	2	6	683689	683694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
15091	NC_014974	CAC	2	6	683698	683703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
15092	NC_014974	C	6	6	683707	683712	0 %	0 %	0 %	100 %	320449823
15093	NC_014974	GTGGAC	2	12	683713	683724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449823
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15098	NC_014974	GGC	2	6	684171	684176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
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15101	NC_014974	TGG	2	6	684303	684308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
15102	NC_014974	CCT	2	6	684474	684479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
15103	NC_014974	AAG	2	6	684508	684513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449823
15104	NC_014974	CTC	3	9	684530	684538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
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15106	NC_014974	CGGGG	2	10	684645	684654	0 %	0 %	80 %	20 %	320449824
15107	NC_014974	AGG	2	6	684675	684680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
15108	NC_014974	TCT	2	6	684691	684696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449824
15109	NC_014974	AGG	2	6	684702	684707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
15110	NC_014974	CTC	2	6	684716	684721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
15111	NC_014974	CCT	2	6	684727	684732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
15112	NC_014974	TCC	2	6	684768	684773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
15113	NC_014974	GGC	2	6	684788	684793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
15114	NC_014974	GGGT	2	8	684810	684817	0 %	25 %	75 %	0 %	320449824
15115	NC_014974	GCC	2	6	684825	684830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449824
15116	NC_014974	CGG	2	6	684838	684843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
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15119	NC_014974	C	7	7	684967	684973	0 %	0 %	0 %	100 %	320449824
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15222	NC_014974	GAAG	2	8	688869	688876	50 %	0 %	50 %	0 %	320449825
15223	NC_014974	GCCC	2	8	688945	688952	0 %	0 %	25 %	75 %	320449825
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15237	NC_014974	CTC	2	6	689610	689615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449827
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15480	NC_014974	AGG	2	6	699768	699773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449839
15481	NC_014974	TCC	2	6	699780	699785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449839
15482	NC_014974	GCG	2	6	699819	699824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449839
15483	NC_014974	CCA	2	6	699865	699870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449839
15484	NC_014974	GCC	2	6	699990	699995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449839
15485	NC_014974	ACC	3	9	700011	700019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449839
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15491	NC_014974	CCT	2	6	700276	700281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449839
15492	NC_014974	CCT	2	6	700288	700293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449839
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