MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_014974	GCCG	2	8	564300	564307	0 %	0 %	50 %	50 %	320449698
12503	NC_014974	GGGA	2	8	564319	564326	25 %	0 %	75 %	0 %	320449698
12504	NC_014974	GAG	2	6	564445	564450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449698
12505	NC_014974	GGA	2	6	564462	564467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449698
12506	NC_014974	CCA	2	6	564471	564476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449698
12507	NC_014974	CTT	2	6	564583	564588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449699
12508	NC_014974	GAT	2	6	564640	564645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449699
12509	NC_014974	G	7	7	564649	564655	0 %	0 %	100 %	0 %	320449699
12510	NC_014974	TGGG	2	8	564658	564665	0 %	25 %	75 %	0 %	320449699
12511	NC_014974	CCT	2	6	564717	564722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449699
12512	NC_014974	G	6	6	564752	564757	0 %	0 %	100 %	0 %	320449699
12513	NC_014974	GGC	2	6	564759	564764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449699
12514	NC_014974	CTT	2	6	564778	564783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449699
12515	NC_014974	GGA	3	9	564840	564848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449699
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12517	NC_014974	GGC	2	6	564882	564887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449699
12518	NC_014974	GGC	2	6	564890	564895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449699
12519	NC_014974	G	7	7	564913	564919	0 %	0 %	100 %	0 %	320449699
12520	NC_014974	GAG	2	6	564934	564939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449699
12521	NC_014974	CCT	2	6	565008	565013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449699
12522	NC_014974	GGC	2	6	565047	565052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449699
12523	NC_014974	CCT	2	6	565155	565160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449699
12524	NC_014974	CTC	2	6	565176	565181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449699
12525	NC_014974	GAG	2	6	565321	565326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449699
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12529	NC_014974	GGGTGC	2	12	566586	566597	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449700
12530	NC_014974	TGGA	2	8	566607	566614	25 %	25 %	50 %	0 %	320449700
12531	NC_014974	CTTCC	2	10	566642	566651	0 %	40 %	0 %	60 %	320449700
12532	NC_014974	CTC	2	6	566663	566668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449700
12533	NC_014974	TGGAGG	2	12	566697	566708	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449700
12534	NC_014974	G	6	6	566712	566717	0 %	0 %	100 %	0 %	320449700
12535	NC_014974	CAC	2	6	566735	566740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449700
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12537	NC_014974	GGGA	2	8	566793	566800	25 %	0 %	75 %	0 %	320449700
12538	NC_014974	GGA	2	6	566902	566907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449700
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12540	NC_014974	GGGTG	2	10	566929	566938	0 %	20 %	80 %	0 %	320449700
12541	NC_014974	ACC	2	6	566946	566951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449700
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12545	NC_014974	GAG	2	6	567098	567103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449700
12546	NC_014974	TGC	2	6	567178	567183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449701
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12548	NC_014974	CCTTC	2	10	567352	567361	0 %	40 %	0 %	60 %	320449701
12549	NC_014974	TGG	2	6	567435	567440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449701
12550	NC_014974	GTG	2	6	567446	567451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449701
12551	NC_014974	CTA	2	6	567556	567561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449701
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12553	NC_014974	C	6	6	567649	567654	0 %	0 %	0 %	100 %	320449701
12554	NC_014974	GGCCT	2	10	567684	567693	0 %	20 %	40 %	40 %	320449701
12555	NC_014974	GCCT	2	8	567740	567747	0 %	25 %	25 %	50 %	320449702
12556	NC_014974	TGGCGG	2	12	567758	567769	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449702
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12558	NC_014974	CTC	2	6	567912	567917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449702
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12565	NC_014974	C	7	7	568316	568322	0 %	0 %	0 %	100 %	320449702
12566	NC_014974	TGG	2	6	568349	568354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449702
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12571	NC_014974	TCA	2	6	568520	568525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449702
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12588	NC_014974	TGG	2	6	569661	569666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449703
12589	NC_014974	C	6	6	569675	569680	0 %	0 %	0 %	100 %	320449703
12590	NC_014974	CCA	2	6	569704	569709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449703
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12592	NC_014974	TAGG	2	8	569873	569880	25 %	25 %	50 %	0 %	320449703
12593	NC_014974	GTG	2	6	569898	569903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449703
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12596	NC_014974	CG	3	6	569990	569995	0 %	0 %	50 %	50 %	320449703
12597	NC_014974	CAC	2	6	569996	570001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449703
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12602	NC_014974	GGT	2	6	570321	570326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449704
12603	NC_014974	CTGG	2	8	570334	570341	0 %	25 %	50 %	25 %	320449704
12604	NC_014974	G	6	6	570384	570389	0 %	0 %	100 %	0 %	320449704
12605	NC_014974	ACG	2	6	570440	570445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449704
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12607	NC_014974	G	7	7	570508	570514	0 %	0 %	100 %	0 %	320449704
12608	NC_014974	CGGGGC	2	12	570520	570531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449704
12609	NC_014974	GGA	2	6	570543	570548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449704
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12611	NC_014974	CCA	2	6	570570	570575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449704
12612	NC_014974	TCCCCC	2	12	570664	570675	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320449704
12613	NC_014974	CCT	2	6	570699	570704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449704
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12618	NC_014974	TGGG	2	8	570903	570910	0 %	25 %	75 %	0 %	320449704
12619	NC_014974	CAC	2	6	571036	571041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449704
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12983	NC_014974	CACCTC	2	12	588056	588067	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449726
12984	NC_014974	GTG	2	6	588285	588290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449726
12985	NC_014974	CCA	2	6	588328	588333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449726
12986	NC_014974	GGA	2	6	588415	588420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449726
12987	NC_014974	G	6	6	588467	588472	0 %	0 %	100 %	0 %	320449726
12988	NC_014974	ACC	2	6	588584	588589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449727
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12991	NC_014974	TGA	2	6	588657	588662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449727
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