MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014974	AGG	2	6	520376	520381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11502	NC_014974	GAG	2	6	520417	520422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11503	NC_014974	GGA	2	6	520434	520439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11504	NC_014974	CCT	2	6	520452	520457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449651
11505	NC_014974	TGC	2	6	520472	520477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449651
11506	NC_014974	GGA	2	6	520557	520562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11507	NC_014974	GAGG	2	8	520566	520573	25 %	0 %	75 %	0 %	320449651
11508	NC_014974	G	6	6	520619	520624	0 %	0 %	100 %	0 %	320449651
11509	NC_014974	GGGAG	2	10	520685	520694	20 %	0 %	80 %	0 %	320449651
11510	NC_014974	CGC	2	6	520737	520742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449651
11511	NC_014974	GCC	2	6	520756	520761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449651
11512	NC_014974	AGG	2	6	520796	520801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11513	NC_014974	GCAG	2	8	520842	520849	25 %	0 %	50 %	25 %	320449651
11514	NC_014974	TCCC	2	8	520875	520882	0 %	25 %	0 %	75 %	320449651
11515	NC_014974	GAG	2	6	520885	520890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449651
11516	NC_014974	CCT	2	6	520908	520913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449651
11517	NC_014974	G	7	7	520924	520930	0 %	0 %	100 %	0 %	320449651
11518	NC_014974	GGGTGG	2	12	520937	520948	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320449651
11519	NC_014974	TC	3	6	520986	520991	0 %	50 %	0 %	50 %	320449651
11520	NC_014974	CCT	2	6	521788	521793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449652
11521	NC_014974	ACC	2	6	521829	521834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449652
11522	NC_014974	CTC	2	6	521843	521848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449652
11523	NC_014974	T	6	6	521886	521891	0 %	100 %	0 %	0 %	320449652
11524	NC_014974	G	6	6	521930	521935	0 %	0 %	100 %	0 %	320449652
11525	NC_014974	GGC	2	6	521972	521977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449652
11526	NC_014974	TCC	2	6	522003	522008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449652
11527	NC_014974	CGG	2	6	522025	522030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449652
11528	NC_014974	CAC	2	6	522074	522079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449652
11529	NC_014974	CCT	2	6	522115	522120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449652
11530	NC_014974	GAG	2	6	522164	522169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449652
11531	NC_014974	CCT	2	6	522175	522180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449652
11532	NC_014974	GCA	2	6	522214	522219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449652
11533	NC_014974	CCA	2	6	522226	522231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449652
11534	NC_014974	GGCT	2	8	522271	522278	0 %	25 %	50 %	25 %	320449652
11535	NC_014974	GAG	2	6	522338	522343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449652
11536	NC_014974	GTC	2	6	522344	522349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449652
11537	NC_014974	TCT	2	6	522361	522366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449652
11538	NC_014974	CGC	2	6	522386	522391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449653
11539	NC_014974	TTG	2	6	522408	522413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449653
11540	NC_014974	CTG	2	6	522422	522427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449653
11541	NC_014974	GAAGAT	2	12	522494	522505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	320449653
11542	NC_014974	GGA	2	6	522598	522603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449653
11543	NC_014974	AGG	2	6	522642	522647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449653
11544	NC_014974	CGG	3	9	522727	522735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449653
11545	NC_014974	TGG	2	6	522766	522771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449653
11546	NC_014974	CCGC	2	8	522775	522782	0 %	0 %	25 %	75 %	320449653
11547	NC_014974	TTG	2	6	522783	522788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449653
11548	NC_014974	GTC	2	6	522791	522796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449653
11549	NC_014974	TCT	2	6	522814	522819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449653
11550	NC_014974	CTG	2	6	522863	522868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449653
11551	NC_014974	AGG	3	9	522885	522893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449653
11552	NC_014974	ACC	2	6	522897	522902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449653
11553	NC_014974	GA	3	6	523023	523028	50 %	0 %	50 %	0 %	320449653
11554	NC_014974	CCT	2	6	523111	523116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449653
11555	NC_014974	CCA	2	6	523120	523125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449653
11556	NC_014974	CCA	2	6	523156	523161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449653
11557	NC_014974	GCCAG	2	10	523189	523198	20 %	0 %	40 %	40 %	320449653
11558	NC_014974	GGGT	2	8	523225	523232	0 %	25 %	75 %	0 %	320449653
11559	NC_014974	GGC	2	6	523381	523386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449653
11560	NC_014974	TCC	2	6	523389	523394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449653
11561	NC_014974	CCA	2	6	523435	523440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449653
11562	NC_014974	CAC	2	6	523520	523525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449653
11563	NC_014974	TCT	2	6	523573	523578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449653
11564	NC_014974	CCCCGT	2	12	523585	523596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449653
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11567	NC_014974	C	6	6	523741	523746	0 %	0 %	0 %	100 %	320449654
11568	NC_014974	GA	3	6	523881	523886	50 %	0 %	50 %	0 %	320449654
11569	NC_014974	CACG	2	8	523926	523933	25 %	0 %	25 %	50 %	320449654
11570	NC_014974	CTT	2	6	523956	523961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449655
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11573	NC_014974	GGA	2	6	524063	524068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449655
11574	NC_014974	GGC	2	6	524078	524083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449655
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11580	NC_014974	TGG	2	6	524599	524604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449657
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11585	NC_014974	CGGGG	2	10	524699	524708	0 %	0 %	80 %	20 %	320449657
11586	NC_014974	CACC	2	8	524897	524904	25 %	0 %	0 %	75 %	320449657
11587	NC_014974	AGG	2	6	524956	524961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449657
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11589	NC_014974	GGT	2	6	524975	524980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449657
11590	NC_014974	GGA	2	6	524981	524986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449657
11591	NC_014974	TGG	2	6	525028	525033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449657
11592	NC_014974	CTTTCC	2	12	525081	525092	0 %	50 %	0 %	50 %	320449657
11593	NC_014974	CTT	2	6	525102	525107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449657
11594	NC_014974	GAG	2	6	525138	525143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449657
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11601	NC_014974	AGG	2	6	525417	525422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449658
11602	NC_014974	TCC	2	6	525498	525503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449658
11603	NC_014974	CCT	2	6	525517	525522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449658
11604	NC_014974	GA	3	6	525545	525550	50 %	0 %	50 %	0 %	320449658
11605	NC_014974	CAT	2	6	525556	525561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449658
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11607	NC_014974	TCCTT	2	10	525816	525825	0 %	60 %	0 %	40 %	320449658
11608	NC_014974	GAG	2	6	525827	525832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449658
11609	NC_014974	GGA	2	6	525858	525863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449658
11610	NC_014974	CTC	3	9	525887	525895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449658
11611	NC_014974	GAG	2	6	525908	525913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449658
11612	NC_014974	CTC	2	6	525925	525930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449658
11613	NC_014974	CAC	2	6	525940	525945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449658
11614	NC_014974	GGC	2	6	525958	525963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449658
11615	NC_014974	AGG	2	6	526008	526013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449658
11616	NC_014974	CGA	2	6	526033	526038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449658
11617	NC_014974	CCTTT	2	10	526042	526051	0 %	60 %	0 %	40 %	320449658
11618	NC_014974	GAT	2	6	526078	526083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449658
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