MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014974	TGCGCC	2	12	449085	449096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449584
10002	NC_014974	CGC	2	6	449110	449115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449584
10003	NC_014974	GAG	2	6	449177	449182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10004	NC_014974	CCT	2	6	449206	449211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10005	NC_014974	CTT	2	6	449248	449253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449584
10006	NC_014974	GTG	2	6	449258	449263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10007	NC_014974	TGGCGG	2	12	449280	449291	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449584
10008	NC_014974	CCT	2	6	449293	449298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10009	NC_014974	CGG	2	6	449305	449310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449584
10010	NC_014974	GGT	2	6	449317	449322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10011	NC_014974	G	6	6	449325	449330	0 %	0 %	100 %	0 %	320449584
10012	NC_014974	TGG	2	6	449349	449354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10013	NC_014974	GGA	3	9	449470	449478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10014	NC_014974	G	6	6	449520	449525	0 %	0 %	100 %	0 %	320449584
10015	NC_014974	CTGG	2	8	449545	449552	0 %	25 %	50 %	25 %	320449584
10016	NC_014974	TTCC	2	8	449608	449615	0 %	50 %	0 %	50 %	320449584
10017	NC_014974	GA	3	6	449628	449633	50 %	0 %	50 %	0 %	320449584
10018	NC_014974	TGG	2	6	449643	449648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10019	NC_014974	GGGC	2	8	449658	449665	0 %	0 %	75 %	25 %	320449584
10020	NC_014974	GTG	2	6	449675	449680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10021	NC_014974	GGA	2	6	449734	449739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10022	NC_014974	AGG	2	6	449757	449762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10023	NC_014974	GGC	2	6	449769	449774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449584
10024	NC_014974	GAG	2	6	449858	449863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10025	NC_014974	GGT	2	6	449866	449871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10026	NC_014974	G	6	6	449949	449954	0 %	0 %	100 %	0 %	320449584
10027	NC_014974	AGC	2	6	449976	449981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449584
10028	NC_014974	TCC	2	6	450021	450026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10029	NC_014974	CGGAAA	2	12	450060	450071	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	320449584
10030	NC_014974	AGG	2	6	450081	450086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10031	NC_014974	GGAGG	2	10	450103	450112	20 %	0 %	80 %	0 %	320449584
10032	NC_014974	ATC	2	6	450122	450127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449584
10033	NC_014974	CCA	2	6	450141	450146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449584
10034	NC_014974	CCG	2	6	450148	450153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449584
10035	NC_014974	A	6	6	450176	450181	100 %	0 %	0 %	0 %	320449584
10036	NC_014974	TGG	2	6	450189	450194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10037	NC_014974	AGG	2	6	450195	450200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10038	NC_014974	GAG	2	6	450209	450214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10039	NC_014974	CTC	2	6	450215	450220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10040	NC_014974	CTA	2	6	450232	450237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449584
10041	NC_014974	GCC	2	6	450318	450323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449585
10042	NC_014974	CCT	2	6	450355	450360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449585
10043	NC_014974	GGA	2	6	450379	450384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449585
10044	NC_014974	GTG	2	6	450431	450436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
10045	NC_014974	GGC	2	6	450448	450453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
10046	NC_014974	CGC	2	6	450460	450465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449585
10047	NC_014974	CACC	2	8	450526	450533	25 %	0 %	0 %	75 %	320449585
10048	NC_014974	GAG	3	9	450548	450556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449585
10049	NC_014974	GTG	2	6	450557	450562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
10050	NC_014974	GTG	2	6	450569	450574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
10051	NC_014974	G	6	6	450582	450587	0 %	0 %	100 %	0 %	320449585
10052	NC_014974	T	6	6	450611	450616	0 %	100 %	0 %	0 %	320449585
10053	NC_014974	GCG	2	6	450671	450676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
10054	NC_014974	GGGAG	2	10	450691	450700	20 %	0 %	80 %	0 %	320449585
10055	NC_014974	CCA	2	6	450708	450713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449585
10056	NC_014974	ACC	2	6	450762	450767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449585
10057	NC_014974	G	7	7	450778	450784	0 %	0 %	100 %	0 %	320449585
10058	NC_014974	GGT	2	6	450838	450843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
10059	NC_014974	GGT	2	6	450871	450876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
10060	NC_014974	CTGC	2	8	450944	450951	0 %	25 %	25 %	50 %	320449585
10061	NC_014974	AGG	2	6	450978	450983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449585
10062	NC_014974	GGC	2	6	450997	451002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
10063	NC_014974	CTC	2	6	451016	451021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449585
10064	NC_014974	GAG	2	6	451031	451036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449585
10065	NC_014974	AGGCA	2	10	451059	451068	40 %	0 %	40 %	20 %	320449585
10066	NC_014974	CGG	3	9	451137	451145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
10067	NC_014974	ACC	2	6	451173	451178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449585
10068	NC_014974	AGGA	2	8	451199	451206	50 %	0 %	50 %	0 %	320449585
10069	NC_014974	CCT	2	6	451228	451233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449585
10070	NC_014974	CGGG	2	8	451262	451269	0 %	0 %	75 %	25 %	320449585
10071	NC_014974	T	6	6	451304	451309	0 %	100 %	0 %	0 %	320449585
10072	NC_014974	GGC	2	6	451345	451350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
10073	NC_014974	TGG	2	6	451395	451400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449585
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10078	NC_014974	CCA	3	9	451705	451713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449586
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10080	NC_014974	GGC	2	6	451781	451786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449586
10081	NC_014974	CAC	2	6	451832	451837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449586
10082	NC_014974	ACC	3	9	451941	451949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449586
10083	NC_014974	C	7	7	451956	451962	0 %	0 %	0 %	100 %	320449586
10084	NC_014974	GGA	3	9	451981	451989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449586
10085	NC_014974	GGGC	2	8	452038	452045	0 %	0 %	75 %	25 %	320449586
10086	NC_014974	CGT	2	6	452107	452112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449586
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10088	NC_014974	GAG	2	6	452153	452158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449586
10089	NC_014974	C	6	6	452232	452237	0 %	0 %	0 %	100 %	320449586
10090	NC_014974	GGA	2	6	452293	452298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449586
10091	NC_014974	GAG	2	6	452426	452431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449586
10092	NC_014974	AGG	2	6	452568	452573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449587
10093	NC_014974	ATG	2	6	452595	452600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449587
10094	NC_014974	GGC	3	9	452723	452731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449587
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10096	NC_014974	G	6	6	452776	452781	0 %	0 %	100 %	0 %	320449587
10097	NC_014974	GGA	2	6	452794	452799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449587
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10100	NC_014974	AGCC	2	8	453021	453028	25 %	0 %	25 %	50 %	320449587
10101	NC_014974	AGG	2	6	453066	453071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449587
10102	NC_014974	AGG	2	6	453075	453080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449587
10103	NC_014974	GGAG	2	8	453124	453131	25 %	0 %	75 %	0 %	320449587
10104	NC_014974	GGA	2	6	453145	453150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449587
10105	NC_014974	GGT	2	6	453175	453180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449587
10106	NC_014974	G	6	6	453206	453211	0 %	0 %	100 %	0 %	320449587
10107	NC_014974	GTG	2	6	453240	453245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449587
10108	NC_014974	CCA	2	6	453422	453427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449588
10109	NC_014974	CCA	3	9	453455	453463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449588
10110	NC_014974	CGA	2	6	453593	453598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449588
10111	NC_014974	AGG	2	6	453613	453618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449588
10112	NC_014974	GGA	2	6	453773	453778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449588
10113	NC_014974	CATC	2	8	453794	453801	25 %	25 %	0 %	50 %	320449588
10114	NC_014974	CCAGGA	2	12	453833	453844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449588
10115	NC_014974	C	6	6	453892	453897	0 %	0 %	0 %	100 %	320449588
10116	NC_014974	AGG	3	9	453937	453945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449588
10117	NC_014974	AGA	2	6	453953	453958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449588
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10119	NC_014974	CCG	2	6	454025	454030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449588
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10121	NC_014974	GGC	2	6	454074	454079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449588
10122	NC_014974	CTC	2	6	454119	454124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449588
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10124	NC_014974	TTG	2	6	454213	454218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449588
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10229	NC_014974	TGG	2	6	459196	459201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449593
10230	NC_014974	C	6	6	459234	459239	0 %	0 %	0 %	100 %	320449593
10231	NC_014974	GAT	2	6	459269	459274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449593
10232	NC_014974	AGGT	2	8	459363	459370	25 %	25 %	50 %	0 %	320449593
10233	NC_014974	CCA	2	6	459376	459381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449593
10234	NC_014974	GGAT	2	8	459388	459395	25 %	25 %	50 %	0 %	320449593
10235	NC_014974	TCC	2	6	459468	459473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449593
10236	NC_014974	TGCGCA	2	12	459478	459489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449593
10237	NC_014974	GAA	2	6	459491	459496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449593
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10239	NC_014974	TGA	2	6	459565	459570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449593
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10483	NC_014974	TCG	2	6	471200	471205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449601
10484	NC_014974	AGA	2	6	471209	471214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449601
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