MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014974	CCT	2	6	243391	243396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449375
5502	NC_014974	G	6	6	243490	243495	0 %	0 %	100 %	0 %	320449375
5503	NC_014974	CGT	2	6	243541	243546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449375
5504	NC_014974	CCG	2	6	243601	243606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449375
5505	NC_014974	C	6	6	243626	243631	0 %	0 %	0 %	100 %	320449375
5506	NC_014974	C	6	6	243633	243638	0 %	0 %	0 %	100 %	320449375
5507	NC_014974	CGG	2	6	243703	243708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449375
5508	NC_014974	GGCC	2	8	243715	243722	0 %	0 %	50 %	50 %	320449375
5509	NC_014974	TCC	2	6	243768	243773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449375
5510	NC_014974	AGG	2	6	243774	243779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449375
5511	NC_014974	CCT	2	6	243790	243795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449375
5512	NC_014974	CCA	2	6	243823	243828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449375
5513	NC_014974	GCC	2	6	243849	243854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449375
5514	NC_014974	CTT	2	6	243857	243862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449375
5515	NC_014974	GCTT	2	8	243869	243876	0 %	50 %	25 %	25 %	320449375
5516	NC_014974	GCG	2	6	243918	243923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449375
5517	NC_014974	AAG	2	6	243962	243967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449375
5518	NC_014974	GAG	3	9	244052	244060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449375
5519	NC_014974	GAG	2	6	244097	244102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449375
5520	NC_014974	GGC	2	6	244139	244144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449375
5521	NC_014974	TCC	2	6	244251	244256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449376
5522	NC_014974	CCTGGT	2	12	244288	244299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449376
5523	NC_014974	CCGC	2	8	244356	244363	0 %	0 %	25 %	75 %	320449376
5524	NC_014974	GGC	2	6	244373	244378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449376
5525	NC_014974	TCC	2	6	244395	244400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449376
5526	NC_014974	TGGCCC	2	12	244416	244427	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449376
5527	NC_014974	AACGC	2	10	244602	244611	40 %	0 %	20 %	40 %	320449377
5528	NC_014974	AGG	2	6	244625	244630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5529	NC_014974	C	6	6	244644	244649	0 %	0 %	0 %	100 %	320449377
5530	NC_014974	GAA	2	6	244702	244707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449377
5531	NC_014974	GTA	2	6	244714	244719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449377
5532	NC_014974	ACCAGG	2	12	244802	244813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449377
5533	NC_014974	AGCCT	2	10	244850	244859	20 %	20 %	20 %	40 %	320449377
5534	NC_014974	G	6	6	244872	244877	0 %	0 %	100 %	0 %	320449377
5535	NC_014974	GGCCCG	2	12	244960	244971	0 %	0 %	50 %	50 %	320449377
5536	NC_014974	CAC	2	6	245011	245016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449377
5537	NC_014974	AGG	2	6	245042	245047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5538	NC_014974	AAG	2	6	245093	245098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449377
5539	NC_014974	TCC	2	6	245126	245131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449377
5540	NC_014974	AGG	2	6	245178	245183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5541	NC_014974	CCA	2	6	245196	245201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449377
5542	NC_014974	CTT	2	6	245206	245211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449377
5543	NC_014974	AGCCC	2	10	245285	245294	20 %	0 %	20 %	60 %	320449377
5544	NC_014974	CCA	2	6	245314	245319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449377
5545	NC_014974	GCC	2	6	245417	245422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449377
5546	NC_014974	C	7	7	245436	245442	0 %	0 %	0 %	100 %	320449377
5547	NC_014974	GAG	2	6	245446	245451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5548	NC_014974	GTG	3	9	245498	245506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449377
5549	NC_014974	CCAG	2	8	245592	245599	25 %	0 %	25 %	50 %	320449377
5550	NC_014974	AGA	2	6	245613	245618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449377
5551	NC_014974	AGG	2	6	245648	245653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5552	NC_014974	AGG	2	6	245660	245665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5553	NC_014974	GAG	2	6	245683	245688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449377
5554	NC_014974	AGG	2	6	245731	245736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449378
5555	NC_014974	TGG	3	9	245756	245764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449378
5556	NC_014974	CCT	2	6	245837	245842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449378
5557	NC_014974	CAC	2	6	245889	245894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449378
5558	NC_014974	AGGGCC	2	12	245968	245979	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449378
5559	NC_014974	CCT	2	6	246038	246043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449378
5560	NC_014974	C	6	6	246107	246112	0 %	0 %	0 %	100 %	320449378
5561	NC_014974	CCT	2	6	246131	246136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449378
5562	NC_014974	C	8	8	246191	246198	0 %	0 %	0 %	100 %	320449378
5563	NC_014974	GTG	2	6	246208	246213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449378
5564	NC_014974	AGG	2	6	246295	246300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449378
5565	NC_014974	C	6	6	246465	246470	0 %	0 %	0 %	100 %	320449379
5566	NC_014974	GCG	2	6	246487	246492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449379
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5569	NC_014974	TGG	2	6	246618	246623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449379
5570	NC_014974	GGGTGG	2	12	246624	246635	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320449379
5571	NC_014974	ACC	2	6	246642	246647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449379
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5573	NC_014974	GGT	2	6	246748	246753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449379
5574	NC_014974	CTC	2	6	246821	246826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
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5578	NC_014974	CTC	3	9	246926	246934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
5579	NC_014974	G	7	7	246935	246941	0 %	0 %	100 %	0 %	320449379
5580	NC_014974	G	6	6	246944	246949	0 %	0 %	100 %	0 %	320449379
5581	NC_014974	CTT	2	6	246950	246955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449379
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5583	NC_014974	G	6	6	246966	246971	0 %	0 %	100 %	0 %	320449379
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5588	NC_014974	ACC	2	6	247263	247268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449379
5589	NC_014974	TCC	2	6	247317	247322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
5590	NC_014974	G	6	6	247328	247333	0 %	0 %	100 %	0 %	320449379
5591	NC_014974	CTT	2	6	247361	247366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449379
5592	NC_014974	CTC	3	9	247373	247381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
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5594	NC_014974	TCT	2	6	247446	247451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449379
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5596	NC_014974	TGGCCC	2	12	247467	247478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449379
5597	NC_014974	TCC	2	6	247564	247569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
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5601	NC_014974	TTCCCC	2	12	247728	247739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
5602	NC_014974	CTC	3	9	247775	247783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449379
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5605	NC_014974	GGGC	2	8	247988	247995	0 %	0 %	75 %	25 %	320449380
5606	NC_014974	GTG	2	6	247999	248004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449380
5607	NC_014974	TGG	3	9	248084	248092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449380
5608	NC_014974	G	6	6	248126	248131	0 %	0 %	100 %	0 %	320449380
5609	NC_014974	GAGG	2	8	248133	248140	25 %	0 %	75 %	0 %	320449380
5610	NC_014974	GAC	2	6	248148	248153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449380
5611	NC_014974	TGGCCT	2	12	248171	248182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449380
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5613	NC_014974	GAA	2	6	248255	248260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449381
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5618	NC_014974	TTG	2	6	248409	248414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449381
5619	NC_014974	CTG	2	6	248442	248447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
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5621	NC_014974	CTG	2	6	248508	248513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
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5623	NC_014974	CTG	2	6	248640	248645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
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5990	NC_014974	TCGG	2	8	266861	266868	0 %	25 %	50 %	25 %	320449397
5991	NC_014974	GGC	2	6	266898	266903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449397
5992	NC_014974	TCT	2	6	266956	266961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449397
5993	NC_014974	GCAA	2	8	267069	267076	50 %	0 %	25 %	25 %	320449398
5994	NC_014974	TCC	3	9	267153	267161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449398
5995	NC_014974	G	6	6	267163	267168	0 %	0 %	100 %	0 %	320449398
5996	NC_014974	GGT	2	6	267178	267183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449398
5997	NC_014974	GGT	2	6	267211	267216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449398
5998	NC_014974	GCTC	2	8	267226	267233	0 %	25 %	25 %	50 %	320449398
5999	NC_014974	GGCAAG	2	12	267236	267247	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320449398
6000	NC_014974	GGA	2	6	267288	267293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449398

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