MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014974	CTC	2	6	222680	222685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449356
5002	NC_014974	AGG	2	6	222720	222725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449356
5003	NC_014974	A	6	6	222729	222734	100 %	0 %	0 %	0 %	320449356
5004	NC_014974	TGG	2	6	222738	222743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449356
5005	NC_014974	CCAGG	2	10	222842	222851	20 %	0 %	40 %	40 %	320449356
5006	NC_014974	CAGGG	2	10	222932	222941	20 %	0 %	60 %	20 %	320449356
5007	NC_014974	G	6	6	222939	222944	0 %	0 %	100 %	0 %	320449356
5008	NC_014974	GGA	2	6	222946	222951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449356
5009	NC_014974	CCT	2	6	223005	223010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5010	NC_014974	TGA	2	6	223011	223016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449357
5011	NC_014974	AGG	2	6	223049	223054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449357
5012	NC_014974	ACC	2	6	223061	223066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449357
5013	NC_014974	C	6	6	223065	223070	0 %	0 %	0 %	100 %	320449357
5014	NC_014974	CCT	2	6	223080	223085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5015	NC_014974	CCT	2	6	223116	223121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5016	NC_014974	CCG	2	6	223122	223127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449357
5017	NC_014974	GAG	2	6	223153	223158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449357
5018	NC_014974	CTT	2	6	223208	223213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449357
5019	NC_014974	GAG	2	6	223234	223239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449357
5020	NC_014974	GGAGA	2	10	223291	223300	40 %	0 %	60 %	0 %	320449357
5021	NC_014974	GA	4	8	223297	223304	50 %	0 %	50 %	0 %	320449357
5022	NC_014974	AGG	2	6	223337	223342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449357
5023	NC_014974	AGG	3	9	223352	223360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449357
5024	NC_014974	TCG	2	6	223367	223372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449357
5025	NC_014974	CTC	2	6	223396	223401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5026	NC_014974	GGTG	2	8	223413	223420	0 %	25 %	75 %	0 %	320449357
5027	NC_014974	CCT	2	6	223431	223436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5028	NC_014974	G	6	6	223467	223472	0 %	0 %	100 %	0 %	320449357
5029	NC_014974	C	6	6	223513	223518	0 %	0 %	0 %	100 %	320449357
5030	NC_014974	TCC	2	6	223520	223525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449357
5031	NC_014974	ATC	2	6	223556	223561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449357
5032	NC_014974	GGGC	2	8	223575	223582	0 %	0 %	75 %	25 %	320449358
5033	NC_014974	CTC	2	6	223608	223613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449358
5034	NC_014974	GGA	2	6	223643	223648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449358
5035	NC_014974	CTT	2	6	223704	223709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449358
5036	NC_014974	GGGCCA	2	12	223751	223762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449358
5037	NC_014974	TCC	2	6	223768	223773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449358
5038	NC_014974	CAC	2	6	223791	223796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449358
5039	NC_014974	GGGCCT	2	12	223814	223825	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449358
5040	NC_014974	CGG	2	6	223829	223834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449358
5041	NC_014974	GAG	4	12	223848	223859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449358
5042	NC_014974	CCA	2	6	223880	223885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449358
5043	NC_014974	GCC	2	6	223966	223971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449358
5044	NC_014974	CGC	2	6	224013	224018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449358
5045	NC_014974	CCA	3	9	224033	224041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449358
5046	NC_014974	CCA	2	6	224069	224074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449358
5047	NC_014974	GCG	2	6	224085	224090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449358
5048	NC_014974	GCCC	2	8	224155	224162	0 %	0 %	25 %	75 %	320449358
5049	NC_014974	GAG	3	9	224172	224180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449358
5050	NC_014974	CAG	2	6	224235	224240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449358
5051	NC_014974	CCGG	2	8	224267	224274	0 %	0 %	50 %	50 %	320449358
5052	NC_014974	TC	3	6	224304	224309	0 %	50 %	0 %	50 %	320449358
5053	NC_014974	ACCGC	2	10	224459	224468	20 %	0 %	20 %	60 %	320449359
5054	NC_014974	CAAG	2	8	224481	224488	50 %	0 %	25 %	25 %	320449359
5055	NC_014974	CTGC	2	8	224494	224501	0 %	25 %	25 %	50 %	320449359
5056	NC_014974	GAGGAA	2	12	224542	224553	50 %	0 %	50 %	0 %	320449359
5057	NC_014974	TGC	2	6	224574	224579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449359
5058	NC_014974	GAC	2	6	224617	224622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449359
5059	NC_014974	GTG	2	6	224677	224682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449359
5060	NC_014974	GTG	2	6	224686	224691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449359
5061	NC_014974	GGT	2	6	224853	224858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449359
5062	NC_014974	TGG	2	6	224981	224986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449359
5063	NC_014974	CCT	2	6	225028	225033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449360
5064	NC_014974	AGG	2	6	225057	225062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449360
5065	NC_014974	TTC	2	6	225069	225074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449360
5066	NC_014974	GCG	2	6	225098	225103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449360
5067	NC_014974	CAG	2	6	225245	225250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449360
5068	NC_014974	GTG	2	6	225251	225256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449360
5069	NC_014974	GAA	2	6	225286	225291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449360
5070	NC_014974	TTC	2	6	225306	225311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449360
5071	NC_014974	CTTCC	2	10	225318	225327	0 %	40 %	0 %	60 %	320449360
5072	NC_014974	CTT	2	6	225350	225355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449360
5073	NC_014974	CCT	2	6	225499	225504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449360
5074	NC_014974	CCG	2	6	225517	225522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449360
5075	NC_014974	AGGA	2	8	225527	225534	50 %	0 %	50 %	0 %	320449360
5076	NC_014974	GGT	2	6	225583	225588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449360
5077	NC_014974	AGGGGA	2	12	225602	225613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449360
5078	NC_014974	CCAC	2	8	225627	225634	25 %	0 %	0 %	75 %	320449360
5079	NC_014974	TTTC	2	8	225739	225746	0 %	75 %	0 %	25 %	320449360
5080	NC_014974	GGAGA	2	10	225752	225761	40 %	0 %	60 %	0 %	320449360
5081	NC_014974	C	6	6	225852	225857	0 %	0 %	0 %	100 %	320449360
5082	NC_014974	CCT	2	6	225880	225885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449360
5083	NC_014974	CTT	2	6	225905	225910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449360
5084	NC_014974	GCC	2	6	225911	225916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449360
5085	NC_014974	TGG	2	6	226056	226061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449360
5086	NC_014974	GCAC	2	8	226066	226073	25 %	0 %	25 %	50 %	320449360
5087	NC_014974	TGG	3	9	226083	226091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449360
5088	NC_014974	CCG	2	6	226123	226128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449360
5089	NC_014974	TCT	2	6	226138	226143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449360
5090	NC_014974	GGT	2	6	226210	226215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449360
5091	NC_014974	CTC	2	6	226234	226239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449360
5092	NC_014974	GGA	2	6	226375	226380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449360
5093	NC_014974	TCA	2	6	226386	226391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449360
5094	NC_014974	GCC	2	6	226496	226501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449360
5095	NC_014974	GAA	2	6	226519	226524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449360
5096	NC_014974	G	6	6	226564	226569	0 %	0 %	100 %	0 %	320449360
5097	NC_014974	CTT	2	6	226651	226656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449361
5098	NC_014974	GGA	2	6	226723	226728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5099	NC_014974	GGA	2	6	226744	226749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5100	NC_014974	CGCCCT	2	12	226768	226779	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449361
5101	NC_014974	CGA	2	6	226814	226819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449361
5102	NC_014974	CCCCT	2	10	226824	226833	0 %	20 %	0 %	80 %	320449361
5103	NC_014974	TCC	2	6	226857	226862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449361
5104	NC_014974	GGC	2	6	226909	226914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449361
5105	NC_014974	GGA	2	6	226987	226992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5106	NC_014974	C	6	6	227009	227014	0 %	0 %	0 %	100 %	320449361
5107	NC_014974	TTC	2	6	227015	227020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449361
5108	NC_014974	GCC	2	6	227049	227054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449361
5109	NC_014974	GGA	2	6	227056	227061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5110	NC_014974	GGT	2	6	227089	227094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449361
5111	NC_014974	GAG	2	6	227108	227113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5112	NC_014974	CTT	2	6	227123	227128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449361
5113	NC_014974	GGA	2	6	227302	227307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5114	NC_014974	GCC	2	6	227309	227314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449361
5115	NC_014974	GGT	2	6	227332	227337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449361
5116	NC_014974	GGC	2	6	227358	227363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449361
5117	NC_014974	GTG	2	6	227381	227386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449361
5118	NC_014974	GAG	2	6	227420	227425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449361
5119	NC_014974	ACC	2	6	227460	227465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449361
5120	NC_014974	CAC	2	6	227485	227490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449361
5121	NC_014974	G	7	7	227710	227716	0 %	0 %	100 %	0 %	320449361
5122	NC_014974	TGG	2	6	227727	227732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449361
5123	NC_014974	CAA	2	6	227734	227739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449361
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5234	NC_014974	GGT	2	6	231139	231144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449363
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5240	NC_014974	CCG	2	6	231345	231350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449363
5241	NC_014974	CCTGGA	2	12	231394	231405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449363
5242	NC_014974	CGA	2	6	231424	231429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449363
5243	NC_014974	TCC	2	6	231471	231476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449363
5244	NC_014974	GAG	2	6	231533	231538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449363
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5246	NC_014974	GGA	3	9	231646	231654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449363
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5492	NC_014974	GGT	2	6	243081	243086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449374
5493	NC_014974	CAC	3	9	243114	243122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449374
5494	NC_014974	CTC	2	6	243141	243146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449374
5495	NC_014974	GGC	2	6	243161	243166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449374
5496	NC_014974	C	6	6	243255	243260	0 %	0 %	0 %	100 %	320449375
5497	NC_014974	AGG	3	9	243264	243272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449375
5498	NC_014974	CCG	2	6	243310	243315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449375
5499	NC_014974	CCA	2	6	243340	243345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449375
5500	NC_014974	AGG	2	6	243366	243371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449375

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