MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014974	CCA	2	6	200833	200838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449333
4502	NC_014974	GGC	2	6	200896	200901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4503	NC_014974	GTT	2	6	200927	200932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449333
4504	NC_014974	CGG	2	6	200965	200970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4505	NC_014974	TGG	2	6	201004	201009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449333
4506	NC_014974	GCC	2	6	201069	201074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449333
4507	NC_014974	CGG	3	9	201076	201084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4508	NC_014974	G	6	6	201083	201088	0 %	0 %	100 %	0 %	320449333
4509	NC_014974	AGT	2	6	201121	201126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449333
4510	NC_014974	TTG	2	6	201168	201173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449333
4511	NC_014974	GGC	2	6	201216	201221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4512	NC_014974	CAGGGC	2	12	201227	201238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449333
4513	NC_014974	GTA	2	6	201254	201259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449333
4514	NC_014974	CCT	2	6	201281	201286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449333
4515	NC_014974	GGC	2	6	201311	201316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4516	NC_014974	CGG	3	9	201325	201333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4517	NC_014974	GCC	2	6	201396	201401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449333
4518	NC_014974	GGC	2	6	201418	201423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449333
4519	NC_014974	GGTG	2	8	201520	201527	0 %	25 %	75 %	0 %	320449333
4520	NC_014974	GTG	2	6	201683	201688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449334
4521	NC_014974	CCT	2	6	201799	201804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449334
4522	NC_014974	GGT	2	6	201829	201834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449334
4523	NC_014974	CAC	2	6	201859	201864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449334
4524	NC_014974	TGG	2	6	201918	201923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449334
4525	NC_014974	G	6	6	201922	201927	0 %	0 %	100 %	0 %	320449334
4526	NC_014974	CCT	3	9	201967	201975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449334
4527	NC_014974	C	6	6	201984	201989	0 %	0 %	0 %	100 %	320449334
4528	NC_014974	GCA	2	6	201997	202002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449334
4529	NC_014974	AGC	2	6	202029	202034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449334
4530	NC_014974	C	7	7	202511	202517	0 %	0 %	0 %	100 %	320449335
4531	NC_014974	CAG	2	6	202560	202565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449335
4532	NC_014974	ACC	2	6	202572	202577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449335
4533	NC_014974	CGC	2	6	202579	202584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449335
4534	NC_014974	CCA	2	6	202603	202608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449335
4535	NC_014974	AGG	2	6	202680	202685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449335
4536	NC_014974	CCT	3	9	202693	202701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449335
4537	NC_014974	G	6	6	202930	202935	0 %	0 %	100 %	0 %	320449336
4538	NC_014974	GGA	2	6	202996	203001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4539	NC_014974	CCA	2	6	203020	203025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449336
4540	NC_014974	AGG	2	6	203068	203073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4541	NC_014974	GAG	2	6	203090	203095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4542	NC_014974	GAG	2	6	203120	203125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4543	NC_014974	GGA	3	9	203137	203145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4544	NC_014974	CCG	2	6	203162	203167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449336
4545	NC_014974	G	6	6	203173	203178	0 %	0 %	100 %	0 %	320449336
4546	NC_014974	GGC	3	9	203192	203200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449336
4547	NC_014974	AGG	2	6	203238	203243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4548	NC_014974	CCT	2	6	203254	203259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449336
4549	NC_014974	AGG	2	6	203316	203321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4550	NC_014974	C	7	7	203339	203345	0 %	0 %	0 %	100 %	320449336
4551	NC_014974	CCGC	2	8	203353	203360	0 %	0 %	25 %	75 %	320449336
4552	NC_014974	AAG	2	6	203378	203383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449336
4553	NC_014974	AGG	2	6	203388	203393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4554	NC_014974	GGA	2	6	203399	203404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4555	NC_014974	GGA	3	9	203422	203430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4556	NC_014974	GGC	2	6	203455	203460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449336
4557	NC_014974	CTCC	2	8	203521	203528	0 %	25 %	0 %	75 %	320449336
4558	NC_014974	TCCT	2	8	203534	203541	0 %	50 %	0 %	50 %	320449336
4559	NC_014974	GCCG	2	8	203599	203606	0 %	0 %	50 %	50 %	320449336
4560	NC_014974	GCCGG	2	10	203645	203654	0 %	0 %	60 %	40 %	320449336
4561	NC_014974	CCT	2	6	203713	203718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449336
4562	NC_014974	GGC	2	6	203731	203736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449336
4563	NC_014974	CGC	2	6	203764	203769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449336
4564	NC_014974	TGG	2	6	203772	203777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449336
4565	NC_014974	GAG	2	6	203786	203791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449336
4566	NC_014974	GA	3	6	203841	203846	50 %	0 %	50 %	0 %	320449337
4567	NC_014974	CCCCCA	2	12	203902	203913	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	320449337
4568	NC_014974	TCC	2	6	203943	203948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449337
4569	NC_014974	CAC	2	6	203993	203998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4570	NC_014974	AGG	2	6	204016	204021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449337
4571	NC_014974	CCA	2	6	204046	204051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4572	NC_014974	CTCC	2	8	204055	204062	0 %	25 %	0 %	75 %	320449337
4573	NC_014974	CCA	3	9	204115	204123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4574	NC_014974	CCCG	2	8	204124	204131	0 %	0 %	25 %	75 %	320449337
4575	NC_014974	CCA	2	6	204145	204150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4576	NC_014974	TTC	2	6	204176	204181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449337
4577	NC_014974	AGG	2	6	204204	204209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449337
4578	NC_014974	GGC	2	6	204217	204222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449337
4579	NC_014974	CCA	2	6	204233	204238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4580	NC_014974	CTCCAC	2	12	204242	204253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449337
4581	NC_014974	CAC	2	6	204257	204262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4582	NC_014974	C	6	6	204313	204318	0 %	0 %	0 %	100 %	320449337
4583	NC_014974	GGC	2	6	204399	204404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449337
4584	NC_014974	CTGG	2	8	204464	204471	0 %	25 %	50 %	25 %	320449337
4585	NC_014974	GCCACC	2	12	204606	204617	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449337
4586	NC_014974	CTC	2	6	204638	204643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449337
4587	NC_014974	ACC	3	9	204711	204719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449337
4588	NC_014974	AGG	2	6	204744	204749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449337
4589	NC_014974	GGA	2	6	204766	204771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449337
4590	NC_014974	AAG	2	6	204896	204901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449338
4591	NC_014974	C	6	6	204956	204961	0 %	0 %	0 %	100 %	320449338
4592	NC_014974	G	6	6	205012	205017	0 %	0 %	100 %	0 %	320449338
4593	NC_014974	AGG	2	6	205018	205023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4594	NC_014974	GGGT	2	8	205042	205049	0 %	25 %	75 %	0 %	320449338
4595	NC_014974	GGC	2	6	205142	205147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449338
4596	NC_014974	CGA	2	6	205205	205210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449338
4597	NC_014974	CCT	2	6	205247	205252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449338
4598	NC_014974	GGA	3	9	205340	205348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4599	NC_014974	TGG	2	6	205378	205383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449338
4600	NC_014974	GAG	2	6	205431	205436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4601	NC_014974	GGA	2	6	205439	205444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4602	NC_014974	GGT	2	6	205484	205489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449338
4603	NC_014974	GAG	2	6	205500	205505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4604	NC_014974	GGA	2	6	205535	205540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4605	NC_014974	GAG	2	6	205572	205577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449338
4606	NC_014974	CAT	2	6	205589	205594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449338
4607	NC_014974	CTGGGC	2	12	205604	205615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449338
4608	NC_014974	AAGG	2	8	205799	205806	50 %	0 %	50 %	0 %	320449339
4609	NC_014974	GGA	2	6	205831	205836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449339
4610	NC_014974	CAC	2	6	205882	205887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449339
4611	NC_014974	AGG	2	6	205905	205910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449339
4612	NC_014974	CGCC	2	8	205942	205949	0 %	0 %	25 %	75 %	320449339
4613	NC_014974	GGA	2	6	205951	205956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449339
4614	NC_014974	CCT	2	6	206023	206028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449339
4615	NC_014974	CCT	3	9	206041	206049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449339
4616	NC_014974	G	7	7	206059	206065	0 %	0 %	100 %	0 %	320449339
4617	NC_014974	CGGCTT	2	12	206066	206077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449339
4618	NC_014974	GCA	2	6	206086	206091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449339
4619	NC_014974	CTC	2	6	206144	206149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449339
4620	NC_014974	CCT	2	6	206177	206182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449340
4621	NC_014974	GAGGCG	2	12	206244	206255	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320449340
4622	NC_014974	CCA	2	6	206318	206323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449340
4623	NC_014974	AGG	2	6	206341	206346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449341
4624	NC_014974	GGA	2	6	206440	206445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449341
4625	NC_014974	GCG	2	6	206447	206452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449341
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4746	NC_014974	TCC	2	6	210617	210622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449342
4747	NC_014974	TGG	2	6	210742	210747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449343
4748	NC_014974	GCG	3	9	210792	210800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449343
4749	NC_014974	TGG	2	6	210937	210942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449343
4750	NC_014974	TCC	2	6	210988	210993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449343
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4783	NC_014974	AGGG	2	8	212195	212202	25 %	0 %	75 %	0 %	320449344
4784	NC_014974	GCCAGG	2	12	212235	212246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449344
4785	NC_014974	GAAG	2	8	212310	212317	50 %	0 %	50 %	0 %	320449344
4786	NC_014974	CAGGG	2	10	212321	212330	20 %	0 %	60 %	20 %	320449344
4787	NC_014974	GAC	2	6	212363	212368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449344
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4795	NC_014974	G	6	6	212979	212984	0 %	0 %	100 %	0 %	320449345
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4812	NC_014974	GCCTT	2	10	214069	214078	0 %	40 %	20 %	40 %	320449347
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4822	NC_014974	TGG	2	6	214401	214406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449348
4823	NC_014974	TCC	2	6	214469	214474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449348
4824	NC_014974	CGG	2	6	214502	214507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449348
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4826	NC_014974	GCC	2	6	214568	214573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449348
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4848	NC_014974	TCC	2	6	215514	215519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449349
4849	NC_014974	CCGGG	2	10	215525	215534	0 %	0 %	60 %	40 %	320449349
4850	NC_014974	TCT	2	6	215535	215540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449349
4851	NC_014974	GGA	2	6	215545	215550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449349
4852	NC_014974	G	6	6	215657	215662	0 %	0 %	100 %	0 %	320449349
4853	NC_014974	CTC	2	6	215730	215735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449350
4854	NC_014974	CCT	2	6	215771	215776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449350
4855	NC_014974	CTCC	2	8	215795	215802	0 %	25 %	0 %	75 %	320449350
4856	NC_014974	TCT	2	6	215803	215808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449350
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4858	NC_014974	CCA	2	6	215885	215890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449350
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4860	NC_014974	GCG	2	6	216012	216017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449350
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4862	NC_014974	C	6	6	216118	216123	0 %	0 %	0 %	100 %	320449350
4863	NC_014974	CGG	2	6	216147	216152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449350
4864	NC_014974	GGAGGG	2	12	216192	216203	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	320449350
4865	NC_014974	CGC	2	6	216290	216295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449350
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4868	NC_014974	GAG	2	6	216369	216374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449350
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4988	NC_014974	GGCATC	2	12	222115	222126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449355
4989	NC_014974	CAT	2	6	222132	222137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449355
4990	NC_014974	G	6	6	222249	222254	0 %	0 %	100 %	0 %	320449355
4991	NC_014974	CCT	2	6	222279	222284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449355
4992	NC_014974	GGCCA	2	10	222301	222310	20 %	0 %	40 %	40 %	320449355
4993	NC_014974	GGCG	2	8	222404	222411	0 %	0 %	75 %	25 %	320449355
4994	NC_014974	AGG	2	6	222449	222454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449355
4995	NC_014974	GGA	2	6	222456	222461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449356
4996	NC_014974	GAA	2	6	222466	222471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449356
4997	NC_014974	CGG	2	6	222477	222482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449356
4998	NC_014974	CTTGG	2	10	222503	222512	0 %	40 %	40 %	20 %	320449356
4999	NC_014974	CCT	3	9	222610	222618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449356
5000	NC_014974	GATG	2	8	222622	222629	25 %	25 %	50 %	0 %	320449356

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