MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 47806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014964	TTAA	2	8	2156832	2156839	50 %	50 %	0 %	0 %	320116876
44002	NC_014964	TGACAT	2	12	2156848	2156859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	320116876
44003	NC_014964	TGA	2	6	2156897	2156902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116876
44004	NC_014964	CAA	2	6	2156903	2156908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116876
44005	NC_014964	CAC	2	6	2156944	2156949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116876
44006	NC_014964	T	6	6	2156980	2156985	0 %	100 %	0 %	0 %	320116876
44007	NC_014964	CAA	2	6	2156986	2156991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116876
44008	NC_014964	GTT	2	6	2157000	2157005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116876
44009	NC_014964	AT	3	6	2157052	2157057	50 %	50 %	0 %	0 %	320116877
44010	NC_014964	ATTT	2	8	2157101	2157108	25 %	75 %	0 %	0 %	320116877
44011	NC_014964	T	6	6	2157106	2157111	0 %	100 %	0 %	0 %	320116877
44012	NC_014964	AT	3	6	2157126	2157131	50 %	50 %	0 %	0 %	320116877
44013	NC_014964	TTA	2	6	2157163	2157168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116877
44014	NC_014964	TAC	2	6	2157232	2157237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116877
44015	NC_014964	T	7	7	2157240	2157246	0 %	100 %	0 %	0 %	320116877
44016	NC_014964	GTT	2	6	2157285	2157290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116877
44017	NC_014964	TAT	2	6	2157322	2157327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116877
44018	NC_014964	T	8	8	2157335	2157342	0 %	100 %	0 %	0 %	320116877
44019	NC_014964	T	6	6	2157514	2157519	0 %	100 %	0 %	0 %	320116877
44020	NC_014964	CTT	2	6	2157655	2157660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116877
44021	NC_014964	GAAA	2	8	2157687	2157694	75 %	0 %	25 %	0 %	320116877
44022	NC_014964	ATT	2	6	2157735	2157740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116877
44023	NC_014964	T	7	7	2157754	2157760	0 %	100 %	0 %	0 %	320116877
44024	NC_014964	GTA	2	6	2158136	2158141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116878
44025	NC_014964	TAAA	2	8	2158212	2158219	75 %	25 %	0 %	0 %	320116878
44026	NC_014964	GCA	2	6	2158238	2158243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116878
44027	NC_014964	GGC	2	6	2158274	2158279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320116878
44028	NC_014964	CAAA	2	8	2158385	2158392	75 %	0 %	0 %	25 %	320116878
44029	NC_014964	TAA	2	6	2158402	2158407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116878
44030	NC_014964	ATAAA	2	10	2158408	2158417	80 %	20 %	0 %	0 %	320116878
44031	NC_014964	CTC	2	6	2158520	2158525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116879
44032	NC_014964	AG	3	6	2158600	2158605	50 %	0 %	50 %	0 %	320116879
44033	NC_014964	GCT	2	6	2158635	2158640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116879
44034	NC_014964	CT	3	6	2158715	2158720	0 %	50 %	0 %	50 %	320116879
44035	NC_014964	AAC	2	6	2158723	2158728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116879
44036	NC_014964	TTC	2	6	2158733	2158738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116879
44037	NC_014964	AGG	2	6	2158757	2158762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320116879
44038	NC_014964	CCA	3	9	2158795	2158803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116879
44039	NC_014964	TCT	2	6	2158820	2158825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116879
44040	NC_014964	ACA	2	6	2158848	2158853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116879
44041	NC_014964	AGC	2	6	2159053	2159058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116880
44042	NC_014964	CTTT	2	8	2159093	2159100	0 %	75 %	0 %	25 %	320116880
44043	NC_014964	GCA	2	6	2159114	2159119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116880
44044	NC_014964	CCT	2	6	2159129	2159134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116880
44045	NC_014964	AGC	2	6	2159257	2159262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116880
44046	NC_014964	TCCA	2	8	2159281	2159288	25 %	25 %	0 %	50 %	320116880
44047	NC_014964	ATT	2	6	2159318	2159323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116880
44048	NC_014964	T	6	6	2159329	2159334	0 %	100 %	0 %	0 %	320116880
44049	NC_014964	TGCCAC	2	12	2159356	2159367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320116880
44050	NC_014964	TCT	2	6	2159438	2159443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116880
44051	NC_014964	CT	3	6	2159449	2159454	0 %	50 %	0 %	50 %	320116880
44052	NC_014964	T	6	6	2159544	2159549	0 %	100 %	0 %	0 %	320116880
44053	NC_014964	TGA	2	6	2159643	2159648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116881
44054	NC_014964	TCC	2	6	2159651	2159656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116881
44055	NC_014964	TTC	2	6	2159678	2159683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116881
44056	NC_014964	CAT	2	6	2159687	2159692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116881
44057	NC_014964	GTCCTG	2	12	2159701	2159712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116881
44058	NC_014964	TCC	2	6	2159720	2159725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116881
44059	NC_014964	TTG	2	6	2159745	2159750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116881
44060	NC_014964	A	6	6	2159773	2159778	100 %	0 %	0 %	0 %	320116881
44061	NC_014964	TCT	2	6	2159781	2159786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116881
44062	NC_014964	AGC	2	6	2159792	2159797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116881
44063	NC_014964	T	6	6	2159985	2159990	0 %	100 %	0 %	0 %	320116881
44064	NC_014964	CTT	2	6	2159995	2160000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116881
44065	NC_014964	CCA	2	6	2160012	2160017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116881
44066	NC_014964	CTTC	2	8	2160050	2160057	0 %	50 %	0 %	50 %	320116882
44067	NC_014964	TAT	2	6	2160318	2160323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116882
44068	NC_014964	CTT	2	6	2160348	2160353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116882
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44070	NC_014964	CA	3	6	2160479	2160484	50 %	0 %	0 %	50 %	320116882
44071	NC_014964	AAT	2	6	2160485	2160490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116882
44072	NC_014964	ATA	2	6	2160556	2160561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116883
44073	NC_014964	AAT	2	6	2160690	2160695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116883
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44077	NC_014964	TA	3	6	2160822	2160827	50 %	50 %	0 %	0 %	320116883
44078	NC_014964	AAT	2	6	2160845	2160850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116883
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44085	NC_014964	TTC	2	6	2161285	2161290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116883
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44087	NC_014964	T	6	6	2161405	2161410	0 %	100 %	0 %	0 %	320116883
44088	NC_014964	CTT	2	6	2161415	2161420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116883
44089	NC_014964	TCC	2	6	2161476	2161481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116883
44090	NC_014964	TGC	2	6	2161497	2161502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116883
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44092	NC_014964	TTA	2	6	2161534	2161539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116883
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44099	NC_014964	ACC	2	6	2161758	2161763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116884
44100	NC_014964	AGG	2	6	2161836	2161841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320116884
44101	NC_014964	GCAATT	2	12	2161987	2161998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	320116884
44102	NC_014964	CTT	2	6	2162012	2162017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116884
44103	NC_014964	TAT	2	6	2162049	2162054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116884
44104	NC_014964	A	7	7	2162061	2162067	100 %	0 %	0 %	0 %	320116884
44105	NC_014964	CAA	2	6	2162153	2162158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116884
44106	NC_014964	GCA	2	6	2162176	2162181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116884
44107	NC_014964	A	6	6	2162199	2162204	100 %	0 %	0 %	0 %	320116884
44108	NC_014964	T	6	6	2162218	2162223	0 %	100 %	0 %	0 %	320116884
44109	NC_014964	A	6	6	2162224	2162229	100 %	0 %	0 %	0 %	320116884
44110	NC_014964	C	6	6	2162242	2162247	0 %	0 %	0 %	100 %	320116884
44111	NC_014964	ATT	2	6	2162260	2162265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116884
44112	NC_014964	TAT	2	6	2162280	2162285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116884
44113	NC_014964	ATGG	2	8	2162737	2162744	25 %	25 %	50 %	0 %	320116885
44114	NC_014964	CGA	2	6	2162843	2162848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116885
44115	NC_014964	T	6	6	2162871	2162876	0 %	100 %	0 %	0 %	320116885
44116	NC_014964	TA	3	6	2163013	2163018	50 %	50 %	0 %	0 %	320116886
44117	NC_014964	TGT	2	6	2163135	2163140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116886
44118	NC_014964	TAC	2	6	2163230	2163235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116886
44119	NC_014964	ATCT	2	8	2163320	2163327	25 %	50 %	0 %	25 %	320116886
44120	NC_014964	GT	3	6	2163399	2163404	0 %	50 %	50 %	0 %	320116886
44121	NC_014964	TTC	2	6	2163406	2163411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116886
44122	NC_014964	CTG	2	6	2163471	2163476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116886
44123	NC_014964	CTT	2	6	2163508	2163513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116886
44124	NC_014964	TCC	2	6	2163518	2163523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116886
44125	NC_014964	ATT	2	6	2163546	2163551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116886
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44127	NC_014964	TCC	2	6	2163629	2163634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116886
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44138	NC_014964	ATCA	2	8	2163977	2163984	50 %	25 %	0 %	25 %	320116886
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44223	NC_014964	TCA	2	6	2167364	2167369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116891
44224	NC_014964	CAA	2	6	2167464	2167469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116891
44225	NC_014964	TCA	2	6	2167583	2167588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116891
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44227	NC_014964	AT	5	10	2167745	2167754	50 %	50 %	0 %	0 %	320116891
44228	NC_014964	TTGA	2	8	2167914	2167921	25 %	50 %	25 %	0 %	320116891
44229	NC_014964	CCCTA	2	10	2168020	2168029	20 %	20 %	0 %	60 %	320116891
44230	NC_014964	T	6	6	2168133	2168138	0 %	100 %	0 %	0 %	320116891
44231	NC_014964	TC	3	6	2168198	2168203	0 %	50 %	0 %	50 %	320116891
44232	NC_014964	CTG	2	6	2168568	2168573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116892
44233	NC_014964	T	6	6	2168589	2168594	0 %	100 %	0 %	0 %	320116892
44234	NC_014964	CTT	2	6	2168604	2168609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116892
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44474	NC_014964	A	6	6	2180180	2180185	100 %	0 %	0 %	0 %	320116906
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44477	NC_014964	ATA	2	6	2180265	2180270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116906
44478	NC_014964	TAA	2	6	2180278	2180283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116906
44479	NC_014964	TGT	2	6	2180356	2180361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116907
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