MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 47806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014964	AAG	2	6	158008	158013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115004
3003	NC_014964	CGA	2	6	158075	158080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115004
3004	NC_014964	TAT	2	6	158133	158138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115004
3005	NC_014964	AAAT	2	8	158140	158147	75 %	25 %	0 %	0 %	320115004
3006	NC_014964	AT	3	6	158175	158180	50 %	50 %	0 %	0 %	320115004
3007	NC_014964	CT	3	6	158218	158223	0 %	50 %	0 %	50 %	320115004
3008	NC_014964	AGG	2	6	158257	158262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115004
3009	NC_014964	GAA	2	6	158331	158336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115004
3010	NC_014964	ACA	2	6	158391	158396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115004
3011	NC_014964	GAA	2	6	158421	158426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115004
3012	NC_014964	ATG	2	6	158590	158595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115004
3013	NC_014964	TGA	2	6	158636	158641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115004
3014	NC_014964	TAAA	2	8	158656	158663	75 %	25 %	0 %	0 %	320115004
3015	NC_014964	ATA	2	6	158673	158678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115004
3016	NC_014964	ATA	2	6	158787	158792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115005
3017	NC_014964	CATAAG	2	12	158819	158830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	320115005
3018	NC_014964	TAC	2	6	158880	158885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115005
3019	NC_014964	TATAT	2	10	158892	158901	40 %	60 %	0 %	0 %	320115005
3020	NC_014964	ATT	2	6	158917	158922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115005
3021	NC_014964	T	6	6	159113	159118	0 %	100 %	0 %	0 %	320115005
3022	NC_014964	TCA	2	6	159148	159153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115005
3023	NC_014964	TTC	2	6	159183	159188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115005
3024	NC_014964	TTTCTT	2	12	159269	159280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	320115005
3025	NC_014964	AGT	2	6	159290	159295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115005
3026	NC_014964	TTGCTT	2	12	159329	159340	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	320115005
3027	NC_014964	TAAT	2	8	159344	159351	50 %	50 %	0 %	0 %	320115005
3028	NC_014964	T	6	6	159385	159390	0 %	100 %	0 %	0 %	320115005
3029	NC_014964	CTT	2	6	159434	159439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115005
3030	NC_014964	CTT	2	6	159507	159512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115005
3031	NC_014964	AT	3	6	159937	159942	50 %	50 %	0 %	0 %	320115006
3032	NC_014964	AGG	2	6	159952	159957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115006
3033	NC_014964	CT	3	6	159967	159972	0 %	50 %	0 %	50 %	320115006
3034	NC_014964	CTG	2	6	159987	159992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115006
3035	NC_014964	CAT	2	6	159993	159998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115006
3036	NC_014964	TA	3	6	160055	160060	50 %	50 %	0 %	0 %	320115006
3037	NC_014964	AGA	2	6	160114	160119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115006
3038	NC_014964	TCA	2	6	160221	160226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115006
3039	NC_014964	AG	3	6	160231	160236	50 %	0 %	50 %	0 %	320115006
3040	NC_014964	AACG	2	8	160282	160289	50 %	0 %	25 %	25 %	320115006
3041	NC_014964	AAAG	2	8	160295	160302	75 %	0 %	25 %	0 %	320115006
3042	NC_014964	A	7	7	160323	160329	100 %	0 %	0 %	0 %	320115006
3043	NC_014964	GTA	2	6	160337	160342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3044	NC_014964	CCTT	2	8	160381	160388	0 %	50 %	0 %	50 %	320115006
3045	NC_014964	ATGTT	2	10	160434	160443	20 %	60 %	20 %	0 %	320115006
3046	NC_014964	AAAAC	2	10	160490	160499	80 %	0 %	0 %	20 %	320115006
3047	NC_014964	CAGAA	2	10	160561	160570	60 %	0 %	20 %	20 %	320115006
3048	NC_014964	A	6	6	160596	160601	100 %	0 %	0 %	0 %	320115006
3049	NC_014964	T	6	6	160608	160613	0 %	100 %	0 %	0 %	320115006
3050	NC_014964	ATGTAG	2	12	160617	160628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3051	NC_014964	AAG	2	6	160714	160719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115006
3052	NC_014964	GA	3	6	160759	160764	50 %	0 %	50 %	0 %	320115006
3053	NC_014964	A	7	7	160779	160785	100 %	0 %	0 %	0 %	320115006
3054	NC_014964	TAG	2	6	160812	160817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3055	NC_014964	ATG	2	6	160836	160841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3056	NC_014964	AT	3	6	160843	160848	50 %	50 %	0 %	0 %	320115006
3057	NC_014964	GCT	2	6	160892	160897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115006
3058	NC_014964	ATG	2	6	160932	160937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3059	NC_014964	GGA	2	6	160985	160990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115006
3060	NC_014964	TAA	2	6	161323	161328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115006
3061	NC_014964	TGA	2	6	161383	161388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115006
3062	NC_014964	TGG	2	6	161394	161399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115006
3063	NC_014964	ATA	2	6	161402	161407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115006
3064	NC_014964	ATA	2	6	161799	161804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115007
3065	NC_014964	A	6	6	161815	161820	100 %	0 %	0 %	0 %	320115007
3066	NC_014964	GAG	2	6	161853	161858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115007
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3068	NC_014964	A	6	6	161906	161911	100 %	0 %	0 %	0 %	320115007
3069	NC_014964	ACT	2	6	161957	161962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115007
3070	NC_014964	TCT	2	6	161984	161989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115007
3071	NC_014964	A	7	7	162030	162036	100 %	0 %	0 %	0 %	320115007
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3074	NC_014964	AAAAT	2	10	162099	162108	80 %	20 %	0 %	0 %	320115007
3075	NC_014964	A	6	6	162152	162157	100 %	0 %	0 %	0 %	320115007
3076	NC_014964	AAT	2	6	162170	162175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115007
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3078	NC_014964	TA	3	6	162209	162214	50 %	50 %	0 %	0 %	320115007
3079	NC_014964	ATT	2	6	162223	162228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115007
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3082	NC_014964	AAG	2	6	162336	162341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115007
3083	NC_014964	ATA	2	6	162449	162454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115007
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3085	NC_014964	TAT	2	6	162620	162625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115007
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3090	NC_014964	GAG	2	6	165090	165095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115008
3091	NC_014964	TAAG	2	8	165121	165128	50 %	25 %	25 %	0 %	320115008
3092	NC_014964	CAA	2	6	165181	165186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115008
3093	NC_014964	AAG	2	6	165188	165193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
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3095	NC_014964	T	6	6	165282	165287	0 %	100 %	0 %	0 %	320115008
3096	NC_014964	AGA	2	6	165293	165298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
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3098	NC_014964	AGA	2	6	165350	165355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
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3102	NC_014964	GGA	2	6	165517	165522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115008
3103	NC_014964	TAA	2	6	165556	165561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
3104	NC_014964	A	6	6	165653	165658	100 %	0 %	0 %	0 %	320115008
3105	NC_014964	TG	3	6	165664	165669	0 %	50 %	50 %	0 %	320115008
3106	NC_014964	TA	3	6	165687	165692	50 %	50 %	0 %	0 %	320115008
3107	NC_014964	AAG	2	6	165717	165722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
3108	NC_014964	AAT	2	6	165761	165766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
3109	NC_014964	GAT	2	6	165771	165776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115008
3110	NC_014964	ATATAG	2	12	165817	165828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	320115008
3111	NC_014964	AAT	2	6	165849	165854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
3112	NC_014964	ACG	2	6	165859	165864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115008
3113	NC_014964	AAT	2	6	165894	165899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115009
3114	NC_014964	GAT	2	6	166003	166008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115009
3115	NC_014964	AT	3	6	166044	166049	50 %	50 %	0 %	0 %	320115009
3116	NC_014964	AGA	2	6	166062	166067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
3117	NC_014964	A	6	6	166098	166103	100 %	0 %	0 %	0 %	320115009
3118	NC_014964	TGAA	2	8	166160	166167	50 %	25 %	25 %	0 %	320115009
3119	NC_014964	GAA	3	9	166186	166194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
3120	NC_014964	A	7	7	166207	166213	100 %	0 %	0 %	0 %	320115009
3121	NC_014964	GTGCTT	2	12	166243	166254	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320115009
3122	NC_014964	AAT	2	6	166332	166337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115009
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3124	NC_014964	AGA	2	6	166374	166379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
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3241	NC_014964	TGG	2	6	171238	171243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115015
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3493	NC_014964	GGAA	2	8	184163	184170	50 %	0 %	50 %	0 %	320115027
3494	NC_014964	AAT	2	6	184196	184201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115027
3495	NC_014964	T	6	6	184207	184212	0 %	100 %	0 %	0 %	320115027
3496	NC_014964	GAA	2	6	184221	184226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115027
3497	NC_014964	ATAAA	2	10	184315	184324	80 %	20 %	0 %	0 %	320115027
3498	NC_014964	GCAGAG	2	12	184350	184361	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320115027
3499	NC_014964	A	7	7	184421	184427	100 %	0 %	0 %	0 %	320115027
3500	NC_014964	GAA	2	6	184467	184472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115027

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