MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 47806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014964	TCC	2	6	47756	47761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114910
1002	NC_014964	CAAG	2	8	47775	47782	50 %	0 %	25 %	25 %	320114910
1003	NC_014964	CAA	2	6	47809	47814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114910
1004	NC_014964	AGA	2	6	47846	47851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1005	NC_014964	CA	3	6	47880	47885	50 %	0 %	0 %	50 %	320114910
1006	NC_014964	CTG	2	6	47926	47931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1007	NC_014964	AGG	2	6	47932	47937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114910
1008	NC_014964	AGA	2	6	48017	48022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1009	NC_014964	ACA	2	6	48045	48050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114910
1010	NC_014964	AG	3	6	48051	48056	50 %	0 %	50 %	0 %	320114910
1011	NC_014964	GCA	2	6	48096	48101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1012	NC_014964	GCT	2	6	48138	48143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1013	NC_014964	TCA	2	6	48146	48151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114910
1014	NC_014964	GAAA	2	8	48231	48238	75 %	0 %	25 %	0 %	320114910
1015	NC_014964	AAAG	2	8	48276	48283	75 %	0 %	25 %	0 %	320114910
1016	NC_014964	CAG	2	6	48295	48300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1017	NC_014964	CAG	2	6	48307	48312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1018	NC_014964	TAA	2	6	48322	48327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114910
1019	NC_014964	AAG	2	6	48338	48343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1020	NC_014964	GGA	2	6	48405	48410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114910
1021	NC_014964	C	6	6	48422	48427	0 %	0 %	0 %	100 %	320114910
1022	NC_014964	AT	3	6	48518	48523	50 %	50 %	0 %	0 %	320114910
1023	NC_014964	AGC	2	6	48574	48579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1024	NC_014964	GCCA	2	8	48630	48637	25 %	0 %	25 %	50 %	320114910
1025	NC_014964	ACC	2	6	48642	48647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114910
1026	NC_014964	GCA	2	6	48729	48734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114910
1027	NC_014964	AGAAAG	2	12	48797	48808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1028	NC_014964	AGCAGA	2	12	48815	48826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	320114910
1029	NC_014964	GAA	2	6	48857	48862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1030	NC_014964	AAG	2	6	48863	48868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114910
1031	NC_014964	TAG	2	6	48908	48913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114911
1032	NC_014964	T	6	6	48936	48941	0 %	100 %	0 %	0 %	320114911
1033	NC_014964	T	6	6	48951	48956	0 %	100 %	0 %	0 %	320114911
1034	NC_014964	AAG	2	6	48995	49000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1035	NC_014964	AT	3	6	49020	49025	50 %	50 %	0 %	0 %	320114911
1036	NC_014964	AG	3	6	49029	49034	50 %	0 %	50 %	0 %	320114911
1037	NC_014964	A	7	7	49062	49068	100 %	0 %	0 %	0 %	320114911
1038	NC_014964	CTG	2	6	49103	49108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1039	NC_014964	CTAT	2	8	49139	49146	25 %	50 %	0 %	25 %	320114911
1040	NC_014964	GAAAAA	2	12	49154	49165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	320114911
1041	NC_014964	TGA	2	6	49167	49172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114911
1042	NC_014964	AGGACA	2	12	49194	49205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	320114911
1043	NC_014964	ACAA	2	8	49267	49274	75 %	0 %	0 %	25 %	320114911
1044	NC_014964	C	6	6	49278	49283	0 %	0 %	0 %	100 %	320114911
1045	NC_014964	TGT	2	6	49296	49301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114911
1046	NC_014964	TTC	2	6	49311	49316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114911
1047	NC_014964	CAA	2	6	49370	49375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114911
1048	NC_014964	AAG	2	6	49389	49394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1049	NC_014964	AAT	2	6	49395	49400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114911
1050	NC_014964	CTA	2	6	49577	49582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114911
1051	NC_014964	ATT	2	6	49598	49603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114911
1052	NC_014964	ATA	2	6	49639	49644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114911
1053	NC_014964	CTG	2	6	49706	49711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1054	NC_014964	CTT	2	6	49730	49735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114911
1055	NC_014964	CAC	2	6	49739	49744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114911
1056	NC_014964	GGA	2	6	49801	49806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114911
1057	NC_014964	CTG	2	6	49810	49815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1058	NC_014964	GA	3	6	49839	49844	50 %	0 %	50 %	0 %	320114911
1059	NC_014964	CAGCCT	2	12	49853	49864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320114911
1060	NC_014964	AGA	2	6	49884	49889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1061	NC_014964	AAG	2	6	49896	49901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1062	NC_014964	CAG	2	6	49919	49924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1063	NC_014964	GAAA	2	8	50001	50008	75 %	0 %	25 %	0 %	320114911
1064	NC_014964	AGC	2	6	50010	50015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1065	NC_014964	TGA	2	6	50034	50039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114911
1066	NC_014964	GGA	2	6	50119	50124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114911
1067	NC_014964	TCC	2	6	50172	50177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114911
1068	NC_014964	AGC	2	6	50208	50213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114911
1069	NC_014964	GCTG	2	8	50235	50242	0 %	25 %	50 %	25 %	320114911
1070	NC_014964	AT	3	6	50249	50254	50 %	50 %	0 %	0 %	320114911
1071	NC_014964	TA	3	6	50320	50325	50 %	50 %	0 %	0 %	320114911
1072	NC_014964	ATA	2	6	50353	50358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114911
1073	NC_014964	TTC	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114911
1074	NC_014964	AC	3	6	50415	50420	50 %	0 %	0 %	50 %	320114911
1075	NC_014964	TGA	2	6	50475	50480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114911
1076	NC_014964	AGGCA	2	10	50519	50528	40 %	0 %	40 %	20 %	320114911
1077	NC_014964	AGA	2	6	50601	50606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1078	NC_014964	AGG	2	6	50615	50620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114911
1079	NC_014964	AGA	2	6	50661	50666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114911
1080	NC_014964	TAA	2	6	50694	50699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114911
1081	NC_014964	TAT	2	6	50705	50710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114911
1082	NC_014964	AGG	2	6	50724	50729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114911
1083	NC_014964	CTG	2	6	50807	50812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114912
1084	NC_014964	TGA	2	6	50843	50848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114912
1085	NC_014964	GCA	2	6	50938	50943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114912
1086	NC_014964	GTT	2	6	50956	50961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114912
1087	NC_014964	T	8	8	51015	51022	0 %	100 %	0 %	0 %	320114913
1088	NC_014964	T	6	6	51066	51071	0 %	100 %	0 %	0 %	320114913
1089	NC_014964	AGTA	2	8	51092	51099	50 %	25 %	25 %	0 %	320114913
1090	NC_014964	T	6	6	51111	51116	0 %	100 %	0 %	0 %	320114913
1091	NC_014964	AT	3	6	51158	51163	50 %	50 %	0 %	0 %	320114913
1092	NC_014964	ATA	2	6	51189	51194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114913
1093	NC_014964	AT	3	6	51242	51247	50 %	50 %	0 %	0 %	320114913
1094	NC_014964	TTC	2	6	51266	51271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114913
1095	NC_014964	TGC	3	9	51308	51316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114913
1096	NC_014964	TGGT	2	8	51336	51343	0 %	50 %	50 %	0 %	320114913
1097	NC_014964	TA	3	6	51352	51357	50 %	50 %	0 %	0 %	320114913
1098	NC_014964	AGC	2	6	51386	51391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114913
1099	NC_014964	CTG	2	6	51397	51402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114913
1100	NC_014964	ATTTTA	2	12	51498	51509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114913
1101	NC_014964	GT	3	6	51598	51603	0 %	50 %	50 %	0 %	320114913
1102	NC_014964	TGG	2	6	51612	51617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114913
1103	NC_014964	AG	3	6	51618	51623	50 %	0 %	50 %	0 %	320114913
1104	NC_014964	TTG	2	6	51625	51630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114913
1105	NC_014964	GGCT	2	8	51738	51745	0 %	25 %	50 %	25 %	320114913
1106	NC_014964	GTAT	2	8	51841	51848	25 %	50 %	25 %	0 %	320114913
1107	NC_014964	GAT	2	6	51860	51865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114913
1108	NC_014964	T	6	6	51923	51928	0 %	100 %	0 %	0 %	320114914
1109	NC_014964	TGGA	2	8	51937	51944	25 %	25 %	50 %	0 %	320114914
1110	NC_014964	T	6	6	51953	51958	0 %	100 %	0 %	0 %	320114914
1111	NC_014964	TTTA	2	8	51990	51997	25 %	75 %	0 %	0 %	320114914
1112	NC_014964	GTT	2	6	52073	52078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114914
1113	NC_014964	AATT	2	8	52138	52145	50 %	50 %	0 %	0 %	320114914
1114	NC_014964	AAT	2	6	52271	52276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114915
1115	NC_014964	GAA	2	6	52296	52301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114915
1116	NC_014964	AGAT	2	8	52343	52350	50 %	25 %	25 %	0 %	320114915
1117	NC_014964	A	6	6	52385	52390	100 %	0 %	0 %	0 %	320114915
1118	NC_014964	TTA	2	6	52400	52405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114915
1119	NC_014964	AAG	2	6	52448	52453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114915
1120	NC_014964	AT	4	8	52454	52461	50 %	50 %	0 %	0 %	320114915
1121	NC_014964	TG	3	6	52466	52471	0 %	50 %	50 %	0 %	320114915
1122	NC_014964	A	6	6	52570	52575	100 %	0 %	0 %	0 %	320114915
1123	NC_014964	CCA	2	6	52615	52620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114915
1124	NC_014964	AT	4	8	52639	52646	50 %	50 %	0 %	0 %	320114915
1125	NC_014964	AAT	2	6	52668	52673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114915
1126	NC_014964	GACT	2	8	52730	52737	25 %	25 %	25 %	25 %	320114915
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1128	NC_014964	AG	3	6	52755	52760	50 %	0 %	50 %	0 %	320114915
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1257	NC_014964	GCA	2	6	58487	58492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114920
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