MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 47806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014964	CTG	2	6	23472	23477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114876
502	NC_014964	GAAT	2	8	23544	23551	50 %	25 %	25 %	0 %	320114876
503	NC_014964	GCT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114876
504	NC_014964	TAC	2	6	23601	23606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114876
505	NC_014964	CA	3	6	23672	23677	50 %	0 %	0 %	50 %	320114876
506	NC_014964	ACA	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114876
507	NC_014964	AGA	2	6	23752	23757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114876
508	NC_014964	A	6	6	23774	23779	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
509	NC_014964	A	6	6	23790	23795	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
510	NC_014964	TAT	2	6	23815	23820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114876
511	NC_014964	GAA	2	6	24086	24091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114877
512	NC_014964	ATA	2	6	24185	24190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
513	NC_014964	A	6	6	24244	24249	100 %	0 %	0 %	0 %	320114877
514	NC_014964	CTA	2	6	24273	24278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114877
515	NC_014964	CCT	2	6	24320	24325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114877
516	NC_014964	GAA	2	6	24332	24337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114877
517	NC_014964	AG	3	6	24357	24362	50 %	0 %	50 %	0 %	320114877
518	NC_014964	TA	3	6	24365	24370	50 %	50 %	0 %	0 %	320114877
519	NC_014964	A	6	6	24461	24466	100 %	0 %	0 %	0 %	320114877
520	NC_014964	AT	3	6	24496	24501	50 %	50 %	0 %	0 %	320114877
521	NC_014964	ACA	2	6	24689	24694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114877
522	NC_014964	ATT	2	6	24725	24730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114877
523	NC_014964	TAG	2	6	24736	24741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114877
524	NC_014964	TAA	2	6	24768	24773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
525	NC_014964	ACA	2	6	24803	24808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114877
526	NC_014964	AGAA	2	8	24830	24837	75 %	0 %	25 %	0 %	320114877
527	NC_014964	TTA	2	6	24861	24866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114877
528	NC_014964	GA	3	6	24921	24926	50 %	0 %	50 %	0 %	320114877
529	NC_014964	ATTG	2	8	24943	24950	25 %	50 %	25 %	0 %	320114877
530	NC_014964	TTG	2	6	24993	24998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114877
531	NC_014964	T	6	6	25010	25015	0 %	100 %	0 %	0 %	320114877
532	NC_014964	AAT	2	6	25027	25032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
533	NC_014964	AGG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114877
534	NC_014964	A	6	6	25039	25044	100 %	0 %	0 %	0 %	320114877
535	NC_014964	ATAGA	2	10	25119	25128	60 %	20 %	20 %	0 %	320114877
536	NC_014964	TGA	2	6	25129	25134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114877
537	NC_014964	TAA	2	6	25140	25145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
538	NC_014964	AGA	2	6	25193	25198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114878
539	NC_014964	GTA	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114878
540	NC_014964	AGCA	2	8	25376	25383	50 %	0 %	25 %	25 %	320114878
541	NC_014964	TGGG	2	8	25450	25457	0 %	25 %	75 %	0 %	320114878
542	NC_014964	A	7	7	25513	25519	100 %	0 %	0 %	0 %	320114878
543	NC_014964	GTT	2	6	25611	25616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114878
544	NC_014964	GGAT	2	8	25619	25626	25 %	25 %	50 %	0 %	320114878
545	NC_014964	ATT	2	6	25630	25635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114878
546	NC_014964	TTA	2	6	25773	25778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114878
547	NC_014964	TA	3	6	25793	25798	50 %	50 %	0 %	0 %	320114878
548	NC_014964	GATAG	2	10	25843	25852	40 %	20 %	40 %	0 %	320114879
549	NC_014964	AGA	2	6	25863	25868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
550	NC_014964	ATT	2	6	25888	25893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114879
551	NC_014964	GAT	2	6	25900	25905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114879
552	NC_014964	GCA	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114879
553	NC_014964	GAA	2	6	26154	26159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
554	NC_014964	TAG	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114879
555	NC_014964	AGA	2	6	26184	26189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
556	NC_014964	TGG	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114879
557	NC_014964	A	7	7	26376	26382	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
558	NC_014964	TTG	2	6	26498	26503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114879
559	NC_014964	GAA	2	6	26509	26514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
560	NC_014964	ATAA	2	8	26557	26564	75 %	25 %	0 %	0 %	320114879
561	NC_014964	AGGA	2	8	26675	26682	50 %	0 %	50 %	0 %	320114879
562	NC_014964	AGGA	2	8	26705	26712	50 %	0 %	50 %	0 %	320114879
563	NC_014964	ATC	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114879
564	NC_014964	AAT	2	6	26881	26886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114879
565	NC_014964	A	6	6	26891	26896	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
566	NC_014964	TGT	2	6	26925	26930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114879
567	NC_014964	CAAAA	2	10	26982	26991	80 %	0 %	0 %	20 %	320114879
568	NC_014964	A	6	6	26988	26993	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
569	NC_014964	AT	3	6	27111	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	320114880
570	NC_014964	GAAA	2	8	27139	27146	75 %	0 %	25 %	0 %	320114880
571	NC_014964	ATG	2	6	27319	27324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114880
572	NC_014964	GA	3	6	27355	27360	50 %	0 %	50 %	0 %	320114880
573	NC_014964	GGA	2	6	27554	27559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114880
574	NC_014964	AATAA	2	10	27560	27569	80 %	20 %	0 %	0 %	320114880
575	NC_014964	TTATT	2	10	27582	27591	20 %	80 %	0 %	0 %	320114881
576	NC_014964	AGG	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114881
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578	NC_014964	TAT	2	6	27653	27658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114881
579	NC_014964	ACC	2	6	27774	27779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114881
580	NC_014964	AT	3	6	27800	27805	50 %	50 %	0 %	0 %	320114881
581	NC_014964	ATG	2	6	27828	27833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114881
582	NC_014964	AAG	2	6	27902	27907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114881
583	NC_014964	ATT	2	6	27978	27983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114881
584	NC_014964	A	7	7	28115	28121	100 %	0 %	0 %	0 %	320114881
585	NC_014964	CAA	2	6	28126	28131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114881
586	NC_014964	TTG	2	6	28168	28173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114881
587	NC_014964	T	6	6	28200	28205	0 %	100 %	0 %	0 %	320114881
588	NC_014964	AAT	2	6	28209	28214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114881
589	NC_014964	CAA	2	6	28303	28308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114881
590	NC_014964	AT	3	6	28376	28381	50 %	50 %	0 %	0 %	320114881
591	NC_014964	T	6	6	28475	28480	0 %	100 %	0 %	0 %	320114881
592	NC_014964	AAT	2	6	28553	28558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114881
593	NC_014964	ATA	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114881
594	NC_014964	CAA	2	6	28594	28599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114881
595	NC_014964	T	8	8	28609	28616	0 %	100 %	0 %	0 %	320114881
596	NC_014964	ATT	2	6	28643	28648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114881
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598	NC_014964	GTG	2	6	28876	28881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114882
599	NC_014964	CAC	2	6	28883	28888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114882
600	NC_014964	ACTC	2	8	28963	28970	25 %	25 %	0 %	50 %	320114882
601	NC_014964	TCT	2	6	29130	29135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
602	NC_014964	CTT	2	6	29148	29153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
603	NC_014964	GCT	3	9	29166	29174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114882
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609	NC_014964	TTC	2	6	29384	29389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
610	NC_014964	TTA	2	6	29515	29520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114882
611	NC_014964	TGT	2	6	29554	29559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114882
612	NC_014964	TTC	3	9	29624	29632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
613	NC_014964	TGC	2	6	29653	29658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114882
614	NC_014964	TTC	2	6	29720	29725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
615	NC_014964	AT	3	6	29765	29770	50 %	50 %	0 %	0 %	320114882
616	NC_014964	A	7	7	29799	29805	100 %	0 %	0 %	0 %	320114882
617	NC_014964	CTTTT	2	10	29881	29890	0 %	80 %	0 %	20 %	320114882
618	NC_014964	T	6	6	29951	29956	0 %	100 %	0 %	0 %	320114882
619	NC_014964	AAAT	2	8	29957	29964	75 %	25 %	0 %	0 %	320114882
620	NC_014964	TC	3	6	29968	29973	0 %	50 %	0 %	50 %	320114882
621	NC_014964	CTTT	2	8	29983	29990	0 %	75 %	0 %	25 %	320114882
622	NC_014964	ATT	2	6	29993	29998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114882
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624	NC_014964	CTT	2	6	30027	30032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
625	NC_014964	ATT	2	6	30039	30044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114882
626	NC_014964	ATG	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114882
627	NC_014964	TCT	2	6	30161	30166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114882
628	NC_014964	CTA	2	6	30566	30571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114883
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