MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 47806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014964	AG	3	6	258918	258923	50 %	0 %	50 %	0 %	320115085
5002	NC_014964	ATA	2	6	258942	258947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115085
5003	NC_014964	AAC	2	6	258948	258953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115085
5004	NC_014964	GGA	2	6	259019	259024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115085
5005	NC_014964	AT	3	6	259035	259040	50 %	50 %	0 %	0 %	320115085
5006	NC_014964	GAAAAA	2	12	259041	259052	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	320115085
5007	NC_014964	GTAATG	2	12	259062	259073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115085
5008	NC_014964	GGC	2	6	259077	259082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320115085
5009	NC_014964	AG	3	6	259197	259202	50 %	0 %	50 %	0 %	320115085
5010	NC_014964	ATCA	2	8	259209	259216	50 %	25 %	0 %	25 %	320115085
5011	NC_014964	AGA	2	6	259244	259249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115085
5012	NC_014964	CTT	2	6	259284	259289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115085
5013	NC_014964	CCT	2	6	259297	259302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320115085
5014	NC_014964	AC	3	6	259336	259341	50 %	0 %	0 %	50 %	320115085
5015	NC_014964	ATT	2	6	259350	259355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115085
5016	NC_014964	AT	3	6	259412	259417	50 %	50 %	0 %	0 %	320115085
5017	NC_014964	GT	3	6	259460	259465	0 %	50 %	50 %	0 %	320115085
5018	NC_014964	AAT	2	6	259478	259483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115085
5019	NC_014964	AT	3	6	259530	259535	50 %	50 %	0 %	0 %	320115085
5020	NC_014964	TAT	2	6	259571	259576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115085
5021	NC_014964	AG	3	6	259586	259591	50 %	0 %	50 %	0 %	320115085
5022	NC_014964	AAG	2	6	259645	259650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115085
5023	NC_014964	TAT	2	6	259700	259705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115085
5024	NC_014964	AGCAA	2	10	259707	259716	60 %	0 %	20 %	20 %	320115085
5025	NC_014964	TGAAA	2	10	259880	259889	60 %	20 %	20 %	0 %	320115085
5026	NC_014964	AAT	2	6	259901	259906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115085
5027	NC_014964	A	6	6	259974	259979	100 %	0 %	0 %	0 %	320115085
5028	NC_014964	CTT	2	6	259989	259994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115085
5029	NC_014964	AAG	2	6	260017	260022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115085
5030	NC_014964	AT	3	6	260064	260069	50 %	50 %	0 %	0 %	320115085
5031	NC_014964	GGAT	2	8	260156	260163	25 %	25 %	50 %	0 %	320115085
5032	NC_014964	TAA	2	6	260176	260181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115085
5033	NC_014964	A	6	6	260199	260204	100 %	0 %	0 %	0 %	320115085
5034	NC_014964	ATA	2	6	260209	260214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115085
5035	NC_014964	GGC	2	6	260285	260290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320115085
5036	NC_014964	GAA	2	6	260352	260357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115085
5037	NC_014964	AGT	2	6	260424	260429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115086
5038	NC_014964	AGG	2	6	260442	260447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115086
5039	NC_014964	ATA	2	6	260500	260505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115086
5040	NC_014964	AT	3	6	260544	260549	50 %	50 %	0 %	0 %	320115086
5041	NC_014964	GTG	2	6	260570	260575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115086
5042	NC_014964	AGA	2	6	260604	260609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115086
5043	NC_014964	TA	3	6	260623	260628	50 %	50 %	0 %	0 %	320115086
5044	NC_014964	A	6	6	260707	260712	100 %	0 %	0 %	0 %	320115086
5045	NC_014964	GGA	2	6	260843	260848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115086
5046	NC_014964	GATTCC	2	12	260901	260912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320115086
5047	NC_014964	A	6	6	260924	260929	100 %	0 %	0 %	0 %	320115086
5048	NC_014964	ATA	2	6	260942	260947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115086
5049	NC_014964	AGA	2	6	261135	261140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115086
5050	NC_014964	GAA	2	6	261158	261163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115086
5051	NC_014964	GCT	2	6	261256	261261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115086
5052	NC_014964	CAC	2	6	261365	261370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320115086
5053	NC_014964	GGA	2	6	261396	261401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115086
5054	NC_014964	A	7	7	261407	261413	100 %	0 %	0 %	0 %	320115086
5055	NC_014964	TC	3	6	261484	261489	0 %	50 %	0 %	50 %	320115086
5056	NC_014964	CTTT	2	8	261571	261578	0 %	75 %	0 %	25 %	320115086
5057	NC_014964	AGGA	2	8	261607	261614	50 %	0 %	50 %	0 %	320115086
5058	NC_014964	AGGT	2	8	261634	261641	25 %	25 %	50 %	0 %	320115086
5059	NC_014964	GGA	2	6	261667	261672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115087
5060	NC_014964	TCC	2	6	261680	261685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320115087
5061	NC_014964	AGA	2	6	261772	261777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115087
5062	NC_014964	TGA	2	6	261817	261822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5063	NC_014964	GA	3	6	261834	261839	50 %	0 %	50 %	0 %	320115087
5064	NC_014964	ATG	2	6	261846	261851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5065	NC_014964	CA	3	6	261917	261922	50 %	0 %	0 %	50 %	320115087
5066	NC_014964	GAA	2	6	261924	261929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115087
5067	NC_014964	TTTA	2	8	261963	261970	25 %	75 %	0 %	0 %	320115087
5068	NC_014964	TAA	2	6	262002	262007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115087
5069	NC_014964	CAT	2	6	262106	262111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115087
5070	NC_014964	CTT	2	6	262112	262117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115087
5071	NC_014964	TAC	2	6	262213	262218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115087
5072	NC_014964	TTGATA	2	12	262221	262232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	320115087
5073	NC_014964	GAT	2	6	262262	262267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5074	NC_014964	GAT	2	6	262342	262347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5075	NC_014964	GAA	2	6	262367	262372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115087
5076	NC_014964	AGC	2	6	262436	262441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115087
5077	NC_014964	ATG	2	6	262442	262447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5078	NC_014964	GCA	2	6	262469	262474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115087
5079	NC_014964	TAA	2	6	262479	262484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115087
5080	NC_014964	TACT	2	8	262524	262531	25 %	50 %	0 %	25 %	320115087
5081	NC_014964	TGA	2	6	262533	262538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5082	NC_014964	CT	4	8	262544	262551	0 %	50 %	0 %	50 %	320115087
5083	NC_014964	AGG	2	6	262572	262577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115087
5084	NC_014964	TTTG	2	8	262588	262595	0 %	75 %	25 %	0 %	320115087
5085	NC_014964	GAT	2	6	262639	262644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115087
5086	NC_014964	TAAAG	2	10	262654	262663	60 %	20 %	20 %	0 %	320115087
5087	NC_014964	ACA	2	6	262668	262673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115087
5088	NC_014964	AG	3	6	262795	262800	50 %	0 %	50 %	0 %	320115087
5089	NC_014964	A	6	6	262838	262843	100 %	0 %	0 %	0 %	320115087
5090	NC_014964	A	6	6	262900	262905	100 %	0 %	0 %	0 %	320115087
5091	NC_014964	CAATC	2	10	262932	262941	40 %	20 %	0 %	40 %	320115087
5092	NC_014964	AAAT	2	8	263252	263259	75 %	25 %	0 %	0 %	320115088
5093	NC_014964	AGGG	2	8	263272	263279	25 %	0 %	75 %	0 %	320115088
5094	NC_014964	T	7	7	263435	263441	0 %	100 %	0 %	0 %	320115088
5095	NC_014964	TGG	2	6	263512	263517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115088
5096	NC_014964	AGA	2	6	263620	263625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115088
5097	NC_014964	CAG	2	6	263734	263739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5098	NC_014964	TGG	2	6	263749	263754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115088
5099	NC_014964	CGA	2	6	263774	263779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5100	NC_014964	A	7	7	263812	263818	100 %	0 %	0 %	0 %	320115088
5101	NC_014964	TTAC	2	8	263890	263897	25 %	50 %	0 %	25 %	320115088
5102	NC_014964	A	6	6	264000	264005	100 %	0 %	0 %	0 %	320115088
5103	NC_014964	CTG	2	6	264112	264117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5104	NC_014964	A	7	7	264218	264224	100 %	0 %	0 %	0 %	320115088
5105	NC_014964	TAC	2	6	264251	264256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115088
5106	NC_014964	CAA	2	6	264307	264312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115088
5107	NC_014964	T	7	7	264333	264339	0 %	100 %	0 %	0 %	320115088
5108	NC_014964	TGC	3	9	264545	264553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5109	NC_014964	GAC	2	6	264638	264643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5110	NC_014964	AT	3	6	264665	264670	50 %	50 %	0 %	0 %	320115088
5111	NC_014964	AGG	2	6	264736	264741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115088
5112	NC_014964	AGG	2	6	264754	264759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115088
5113	NC_014964	TGCT	2	8	264814	264821	0 %	50 %	25 %	25 %	320115088
5114	NC_014964	TCG	2	6	264892	264897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5115	NC_014964	TGAT	2	8	264910	264917	25 %	50 %	25 %	0 %	320115088
5116	NC_014964	GCAG	2	8	264959	264966	25 %	0 %	50 %	25 %	320115088
5117	NC_014964	CGA	3	9	265088	265096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5118	NC_014964	TAG	2	6	265162	265167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115088
5119	NC_014964	A	6	6	265175	265180	100 %	0 %	0 %	0 %	320115088
5120	NC_014964	ACG	2	6	265219	265224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5121	NC_014964	AAAG	2	8	265235	265242	75 %	0 %	25 %	0 %	320115088
5122	NC_014964	CGA	2	6	265313	265318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115088
5123	NC_014964	GGA	2	6	265346	265351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115088
5124	NC_014964	GGCTCT	2	12	265514	265525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115088
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5497	NC_014964	GTCTTT	2	12	286242	286253	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	320115109
5498	NC_014964	T	6	6	286251	286256	0 %	100 %	0 %	0 %	320115109
5499	NC_014964	TGT	2	6	286282	286287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320115109
5500	NC_014964	ATT	2	6	286341	286346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115109

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