MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 30860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014926	C	6	6	133	138	0 %	0 %	0 %	100 %	319788983
2	NC_014926	G	6	6	197	202	0 %	0 %	100 %	0 %	319788983
3	NC_014926	AGGC	2	8	236	243	25 %	0 %	50 %	25 %	319788983
4	NC_014926	GACC	2	8	317	324	25 %	0 %	25 %	50 %	319788983
5	NC_014926	GAGG	2	8	338	345	25 %	0 %	75 %	0 %	319788983
6	NC_014926	G	7	7	394	400	0 %	0 %	100 %	0 %	319788983
7	NC_014926	TTC	2	6	402	407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788983
8	NC_014926	ACG	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788983
9	NC_014926	TTC	2	6	435	440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788983
10	NC_014926	TCT	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788983
11	NC_014926	GAG	2	6	609	614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788983
12	NC_014926	AG	3	6	621	626	50 %	0 %	50 %	0 %	319788983
13	NC_014926	AGGG	2	8	642	649	25 %	0 %	75 %	0 %	319788983
14	NC_014926	CCT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788983
15	NC_014926	GGT	2	6	695	700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319788983
16	NC_014926	AG	4	8	734	741	50 %	0 %	50 %	0 %	319788983
17	NC_014926	AGG	2	6	991	996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788983
18	NC_014926	ACG	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788983
19	NC_014926	ACG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788983
20	NC_014926	GACC	2	8	1118	1125	25 %	0 %	25 %	50 %	319788983
21	NC_014926	GTG	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319788983
22	NC_014926	CGGC	2	8	1231	1238	0 %	0 %	50 %	50 %	319788983
23	NC_014926	ATA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788983
24	NC_014926	CGG	2	6	1375	1380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788983
25	NC_014926	GGA	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788983
26	NC_014926	CAAGGC	2	12	1469	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788983
27	NC_014926	AG	3	6	1505	1510	50 %	0 %	50 %	0 %	319788983
28	NC_014926	AG	3	6	1574	1579	50 %	0 %	50 %	0 %	319788984
29	NC_014926	CTT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788984
30	NC_014926	GGA	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788984
31	NC_014926	AAG	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788984
32	NC_014926	G	6	6	1790	1795	0 %	0 %	100 %	0 %	319788984
33	NC_014926	CTC	2	6	1884	1889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788984
34	NC_014926	ACCCG	2	10	1940	1949	20 %	0 %	20 %	60 %	319788984
35	NC_014926	CTG	2	6	1956	1961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788984
36	NC_014926	AGC	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
37	NC_014926	GAA	2	6	2051	2056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788984
38	NC_014926	AG	3	6	2079	2084	50 %	0 %	50 %	0 %	319788984
39	NC_014926	GGTA	2	8	2180	2187	25 %	25 %	50 %	0 %	319788984
40	NC_014926	AGC	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
41	NC_014926	AGG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788984
42	NC_014926	GAC	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
43	NC_014926	TGA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788984
44	NC_014926	GCC	2	6	2539	2544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788984
45	NC_014926	AGG	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788984
46	NC_014926	AAG	3	9	2745	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788984
47	NC_014926	AGG	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788984
48	NC_014926	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788984
49	NC_014926	AGC	2	6	2797	2802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
50	NC_014926	TTA	2	6	2836	2841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788984
51	NC_014926	AGG	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788984
52	NC_014926	CAG	3	9	2904	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
53	NC_014926	AAG	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788984
54	NC_014926	AG	3	6	2930	2935	50 %	0 %	50 %	0 %	319788984
55	NC_014926	CGA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788984
56	NC_014926	AG	3	6	3008	3013	50 %	0 %	50 %	0 %	319788984
57	NC_014926	CT	3	6	3080	3085	0 %	50 %	0 %	50 %	319788985
58	NC_014926	CTC	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788985
59	NC_014926	ACC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788985
60	NC_014926	ACC	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788985
61	NC_014926	CTG	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788985
62	NC_014926	AGA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788985
63	NC_014926	CAAGCT	2	12	3430	3441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319788985
64	NC_014926	GAA	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788985
65	NC_014926	GCTCCT	2	12	3544	3555	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319788985
66	NC_014926	GGA	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788985
67	NC_014926	CGC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788985
68	NC_014926	GAA	3	9	3710	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788985
69	NC_014926	CT	3	6	3858	3863	0 %	50 %	0 %	50 %	319788986
70	NC_014926	CTT	2	6	3948	3953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788986
71	NC_014926	CTTAAA	2	12	3996	4007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319788986
72	NC_014926	CG	3	6	4015	4020	0 %	0 %	50 %	50 %	319788986
73	NC_014926	GTC	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788986
74	NC_014926	CGG	2	6	4079	4084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788986
75	NC_014926	CTTC	2	8	4097	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	319788986
76	NC_014926	TTTACG	2	12	4105	4116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788986
77	NC_014926	TCG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788986
78	NC_014926	GAGCG	2	10	4347	4356	20 %	0 %	60 %	20 %	319788986
79	NC_014926	CTCCC	2	10	4374	4383	0 %	20 %	0 %	80 %	319788986
80	NC_014926	TTC	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788986
81	NC_014926	GGT	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319788986
82	NC_014926	CCGGCA	2	12	4465	4476	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319788986
83	NC_014926	AGT	2	6	4502	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788986
84	NC_014926	ACCG	2	8	4530	4537	25 %	0 %	25 %	50 %	319788986
85	NC_014926	CTC	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788986
86	NC_014926	CCT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788986
87	NC_014926	CCT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788986
88	NC_014926	CCT	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788986
89	NC_014926	CTG	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788986
90	NC_014926	TCG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788986
91	NC_014926	TCG	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788986
92	NC_014926	ACTTC	2	10	5177	5186	20 %	40 %	0 %	40 %	319788986
93	NC_014926	ATC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788986
94	NC_014926	ATC	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788986
95	NC_014926	CCT	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788986
96	NC_014926	GGTA	2	8	5517	5524	25 %	25 %	50 %	0 %	319788986
97	NC_014926	AGC	3	9	5635	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788987
98	NC_014926	AGGC	2	8	5682	5689	25 %	0 %	50 %	25 %	319788987
99	NC_014926	TGCC	2	8	5693	5700	0 %	25 %	25 %	50 %	319788987
100	NC_014926	CCACGC	2	12	5822	5833	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319788987
101	NC_014926	GCC	2	6	5853	5858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788987
102	NC_014926	CT	3	6	5859	5864	0 %	50 %	0 %	50 %	319788987
103	NC_014926	AAG	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788987
104	NC_014926	AGG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788987
105	NC_014926	CCG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788987
106	NC_014926	AGC	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788987
107	NC_014926	GAAGGT	2	12	6026	6037	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319788987
108	NC_014926	CGG	2	6	6046	6051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788987
109	NC_014926	CCTC	2	8	6058	6065	0 %	25 %	0 %	75 %	319788987
110	NC_014926	AGG	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788987
111	NC_014926	CGG	2	6	6113	6118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788987
112	NC_014926	CA	3	6	6149	6154	50 %	0 %	0 %	50 %	319788987
113	NC_014926	GGC	2	6	6182	6187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788987
114	NC_014926	AGGG	2	8	6188	6195	25 %	0 %	75 %	0 %	319788987
115	NC_014926	AGAGG	2	10	6272	6281	40 %	0 %	60 %	0 %	319788987
116	NC_014926	TGC	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788987
117	NC_014926	CTC	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788987
118	NC_014926	AGG	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788987
119	NC_014926	TC	3	6	6675	6680	0 %	50 %	0 %	50 %	319788988
120	NC_014926	CCCT	2	8	6703	6710	0 %	25 %	0 %	75 %	319788988
121	NC_014926	GA	3	6	6757	6762	50 %	0 %	50 %	0 %	319788988
122	NC_014926	TCC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788988
123	NC_014926	AGG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788988
124	NC_014926	GAA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788988
125	NC_014926	GGT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319788988
126	NC_014926	AGC	2	6	6834	6839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788988
127	NC_014926	GCCACA	2	12	6900	6911	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319788988
128	NC_014926	AAG	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788988
129	NC_014926	AGA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788988
130	NC_014926	AGG	3	9	6950	6958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788988
131	NC_014926	CGG	2	6	7034	7039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788988
132	NC_014926	AAG	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788988
133	NC_014926	ACC	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788988
134	NC_014926	ACA	2	6	7229	7234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788988
135	NC_014926	TCG	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788988
136	NC_014926	GAC	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788988
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250	NC_014926	A	7	7	12919	12925	100 %	0 %	0 %	0 %	319788993
251	NC_014926	GA	3	6	12951	12956	50 %	0 %	50 %	0 %	319788993
252	NC_014926	G	6	6	12957	12962	0 %	0 %	100 %	0 %	319788993
253	NC_014926	CT	3	6	13024	13029	0 %	50 %	0 %	50 %	319788993
254	NC_014926	AGA	2	6	13134	13139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788993
255	NC_014926	GTCC	2	8	13302	13309	0 %	25 %	25 %	50 %	319788993
256	NC_014926	ATT	2	6	13324	13329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788993
257	NC_014926	GAA	2	6	13422	13427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788994
258	NC_014926	AGT	2	6	13428	13433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788994
259	NC_014926	GTT	2	6	13555	13560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788994
260	NC_014926	AGC	2	6	13600	13605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788994
261	NC_014926	AGG	3	9	13617	13625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788994
262	NC_014926	TCT	2	6	13630	13635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788994
263	NC_014926	CTA	2	6	13649	13654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788994
264	NC_014926	A	6	6	13661	13666	100 %	0 %	0 %	0 %	319788994
265	NC_014926	GTT	2	6	13738	13743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788994
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392	NC_014926	CTC	2	6	22097	22102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789002
393	NC_014926	CTG	2	6	22322	22327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789002
394	NC_014926	CT	3	6	22335	22340	0 %	50 %	0 %	50 %	319789002
395	NC_014926	AGC	2	6	22611	22616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789002
396	NC_014926	GAC	2	6	22646	22651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789002
397	NC_014926	TGT	2	6	22747	22752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789002
398	NC_014926	GAG	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789002
399	NC_014926	TTC	2	6	22868	22873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789002
400	NC_014926	GAT	2	6	22910	22915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319789002
401	NC_014926	GTC	2	6	22964	22969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789002
402	NC_014926	CCTG	2	8	22981	22988	0 %	25 %	25 %	50 %	319789002
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404	NC_014926	T	6	6	23081	23086	0 %	100 %	0 %	0 %	319789002
405	NC_014926	GCG	2	6	23117	23122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789002
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414	NC_014926	AGGG	2	8	23579	23586	25 %	0 %	75 %	0 %	319789003
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423	NC_014926	CTA	2	6	24223	24228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789005
424	NC_014926	CGGA	2	8	24263	24270	25 %	0 %	50 %	25 %	319789005
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495	NC_014926	TA	3	6	27241	27246	50 %	50 %	0 %	0 %	319789010
496	NC_014926	TCT	2	6	27481	27486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789011
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499	NC_014926	GTT	3	9	27648	27656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789011
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