MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	TCCG	2	8	347	354	0 %	25 %	25 %	50 %	319774849
2	NC_014917	CGA	2	6	369	374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774849
3	NC_014917	CTG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774849
4	NC_014917	GAAGG	2	10	504	513	40 %	0 %	60 %	0 %	319774849
5	NC_014917	GA	4	8	616	623	50 %	0 %	50 %	0 %	319774849
6	NC_014917	CT	3	6	676	681	0 %	50 %	0 %	50 %	319774850
7	NC_014917	GGCGG	2	10	733	742	0 %	0 %	80 %	20 %	319774850
8	NC_014917	AGT	3	9	802	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774850
9	NC_014917	CTA	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774850
10	NC_014917	CTC	2	6	840	845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774850
11	NC_014917	CTT	2	6	869	874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774850
12	NC_014917	GTTGAC	2	12	1039	1050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319774851
13	NC_014917	GA	3	6	1082	1087	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
14	NC_014917	TTGT	2	8	1246	1253	0 %	75 %	25 %	0 %	319774851
15	NC_014917	CGC	2	6	1291	1296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774851
16	NC_014917	TTTG	2	8	1299	1306	0 %	75 %	25 %	0 %	319774851
17	NC_014917	CTTC	2	8	1388	1395	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
18	NC_014917	CT	4	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
19	NC_014917	TC	3	6	1443	1448	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
20	NC_014917	CAC	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774851
21	NC_014917	AT	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
22	NC_014917	TGG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774851
23	NC_014917	AT	3	6	1480	1485	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
24	NC_014917	GTA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774851
25	NC_014917	TTCTT	2	10	1497	1506	0 %	80 %	0 %	20 %	319774851
26	NC_014917	GTA	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774851
27	NC_014917	TCC	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
28	NC_014917	AG	3	6	1834	1839	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
29	NC_014917	CTC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
30	NC_014917	CTC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
31	NC_014917	CTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
32	NC_014917	AGGTAG	2	12	1964	1975	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319774851
33	NC_014917	AG	3	6	1974	1979	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
34	NC_014917	GAA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774851
35	NC_014917	TGT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774851
36	NC_014917	TTC	2	6	2091	2096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774851
37	NC_014917	GCCCCT	2	12	2098	2109	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319774851
38	NC_014917	CTC	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
39	NC_014917	TTG	2	6	2226	2231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774851
40	NC_014917	GGT	3	9	2254	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774851
41	NC_014917	AG	3	6	2355	2360	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
42	NC_014917	GGC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774851
43	NC_014917	GACG	2	8	2400	2407	25 %	0 %	50 %	25 %	319774851
44	NC_014917	CTT	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774851
45	NC_014917	T	7	7	2594	2600	0 %	100 %	0 %	0 %	319774852
46	NC_014917	TAT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774852
47	NC_014917	GTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774852
48	NC_014917	CT	3	6	2832	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
49	NC_014917	TC	3	6	2895	2900	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
50	NC_014917	CCTGC	2	10	2966	2975	0 %	20 %	20 %	60 %	319774852
51	NC_014917	CTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774852
52	NC_014917	CAG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774852
53	NC_014917	CCT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
54	NC_014917	TCC	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
55	NC_014917	AGG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
56	NC_014917	TCA	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774853
57	NC_014917	TCT	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
58	NC_014917	TC	4	8	3370	3377	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
59	NC_014917	GGTT	2	8	3399	3406	0 %	50 %	50 %	0 %	319774853
60	NC_014917	GAA	2	6	3545	3550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
61	NC_014917	AG	3	6	3569	3574	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
62	NC_014917	TCCT	2	8	3612	3619	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
63	NC_014917	AGT	3	9	3631	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
64	NC_014917	GAA	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
65	NC_014917	GTG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774853
66	NC_014917	CCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
67	NC_014917	CAG	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774853
68	NC_014917	GAA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
69	NC_014917	CTC	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
70	NC_014917	CTCC	2	8	3937	3944	0 %	25 %	0 %	75 %	319774853
71	NC_014917	CGA	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774853
72	NC_014917	GTCCC	2	10	3965	3974	0 %	20 %	20 %	60 %	319774853
73	NC_014917	TCG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
74	NC_014917	GTC	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
75	NC_014917	GTA	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
76	NC_014917	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
77	NC_014917	TGA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
78	NC_014917	CT	3	6	4307	4312	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
79	NC_014917	GAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
80	NC_014917	AGT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
81	NC_014917	AG	3	6	4394	4399	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
82	NC_014917	CCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
83	NC_014917	C	6	6	4528	4533	0 %	0 %	0 %	100 %	319774853
84	NC_014917	CT	3	6	4543	4548	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
85	NC_014917	AGA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
86	NC_014917	TCG	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
87	NC_014917	AGT	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
88	NC_014917	AGG	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
89	NC_014917	T	6	6	4859	4864	0 %	100 %	0 %	0 %	319774853
90	NC_014917	ACC	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774853
91	NC_014917	CGG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774853
92	NC_014917	CTT	3	9	5041	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
93	NC_014917	CTG	2	6	5104	5109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
94	NC_014917	CCT	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
95	NC_014917	GAA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
96	NC_014917	CCG	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774853
97	NC_014917	GAGG	2	8	5195	5202	25 %	0 %	75 %	0 %	319774853
98	NC_014917	TTC	2	6	5242	5247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
99	NC_014917	CT	4	8	5263	5270	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
100	NC_014917	TG	3	6	5460	5465	0 %	50 %	50 %	0 %	319774853
101	NC_014917	CCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774853
102	NC_014917	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
103	NC_014917	GTC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
104	NC_014917	GTTCC	2	10	5535	5544	0 %	40 %	20 %	40 %	319774853
105	NC_014917	GCG	2	6	5575	5580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774853
106	NC_014917	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
107	NC_014917	CTC	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774854
108	NC_014917	TC	3	6	5841	5846	0 %	50 %	0 %	50 %	319774854
109	NC_014917	CGA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
110	NC_014917	AG	3	6	5929	5934	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
111	NC_014917	AGA	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
112	NC_014917	ACT	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
113	NC_014917	CCA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774854
114	NC_014917	GACCTT	2	12	6100	6111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319774854
115	NC_014917	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774854
116	NC_014917	GAG	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774854
117	NC_014917	CGA	2	6	6255	6260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
118	NC_014917	GCC	2	6	6274	6279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774854
119	NC_014917	CCT	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774854
120	NC_014917	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774854
121	NC_014917	GAG	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774854
122	NC_014917	CGA	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
123	NC_014917	AG	3	6	6484	6489	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
124	NC_014917	CTT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774854
125	NC_014917	ACT	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
126	NC_014917	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
127	NC_014917	CCCAG	2	10	6710	6719	20 %	0 %	20 %	60 %	319774854
128	NC_014917	CTA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
129	NC_014917	TATGCC	2	12	6835	6846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319774855
130	NC_014917	AGA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774855
131	NC_014917	GTT	2	6	6883	6888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774855
132	NC_014917	TCCC	2	8	6914	6921	0 %	25 %	0 %	75 %	319774855
133	NC_014917	AGG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
134	NC_014917	GAG	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
135	NC_014917	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774855
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395	NC_014917	CTG	2	6	20229	20234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774873
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399	NC_014917	TGT	2	6	20440	20445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774874
400	NC_014917	CTC	2	6	20451	20456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774874
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