MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermaerobacter marianensis DSM 12885 chromosome

Total Repeats: 71216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014831	CCGTG	2	10	506	515	0 %	20 %	40 %	40 %	317120850
2	NC_014831	GGT	2	6	722	727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120850
3	NC_014831	GGT	3	9	749	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120850
4	NC_014831	GCCGGC	2	12	767	778	0 %	0 %	50 %	50 %	317120850
5	NC_014831	CCA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317120850
6	NC_014831	GCCG	2	8	824	831	0 %	0 %	50 %	50 %	317120850
7	NC_014831	TCC	2	6	852	857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120850
8	NC_014831	GC	3	6	969	974	0 %	0 %	50 %	50 %	317120850
9	NC_014831	CGG	2	6	998	1003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120850
10	NC_014831	TGC	2	6	1051	1056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120850
11	NC_014831	GAT	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317120850
12	NC_014831	CGA	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120850
13	NC_014831	AGG	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120850
14	NC_014831	TTC	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317120850
15	NC_014831	GCC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120850
16	NC_014831	GGA	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120850
17	NC_014831	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120850
18	NC_014831	AAG	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317120850
19	NC_014831	CGA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120850
20	NC_014831	TGG	2	6	1510	1515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120850
21	NC_014831	ACCA	2	8	1530	1537	50 %	0 %	0 %	50 %	317120850
22	NC_014831	GACCTG	2	12	1545	1556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317120850
23	NC_014831	AGG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120850
24	NC_014831	GCC	3	9	1583	1591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120850
25	NC_014831	CAA	2	6	1598	1603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317120850
26	NC_014831	AGG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120850
27	NC_014831	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120850
28	NC_014831	GAG	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120850
29	NC_014831	CGG	2	6	1772	1777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120850
30	NC_014831	ACG	2	6	1788	1793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120850
31	NC_014831	GACG	2	8	1891	1898	25 %	0 %	50 %	25 %	317120850
32	NC_014831	CTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120851
33	NC_014831	AGC	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120851
34	NC_014831	TGG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120851
35	NC_014831	CCCGG	2	10	2387	2396	0 %	0 %	40 %	60 %	317120851
36	NC_014831	GAA	2	6	2403	2408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317120851
37	NC_014831	TCC	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120851
38	NC_014831	GGC	2	6	2428	2433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120851
39	NC_014831	TGG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120851
40	NC_014831	GCC	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120851
41	NC_014831	GCC	2	6	2459	2464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120851
42	NC_014831	TGGAGG	2	12	2479	2490	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	317120851
43	NC_014831	GCA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120851
44	NC_014831	CTG	2	6	2610	2615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120851
45	NC_014831	TGC	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120851
46	NC_014831	GAC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120851
47	NC_014831	CGA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120851
48	NC_014831	CGAC	2	8	2722	2729	25 %	0 %	25 %	50 %	317120851
49	NC_014831	GCT	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120851
50	NC_014831	GGC	2	6	2789	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120851
51	NC_014831	GC	3	6	2826	2831	0 %	0 %	50 %	50 %	317120851
52	NC_014831	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317120851
53	NC_014831	TGG	2	6	2920	2925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120851
54	NC_014831	GCC	2	6	3021	3026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120851
55	NC_014831	CGGC	2	8	3083	3090	0 %	0 %	50 %	50 %	317120851
56	NC_014831	GAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120851
57	NC_014831	TGG	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120851
58	NC_014831	GAG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120851
59	NC_014831	CGA	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120851
60	NC_014831	TGC	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120851
61	NC_014831	GTG	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120852
62	NC_014831	CTG	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
63	NC_014831	CCT	2	6	3510	3515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120852
64	NC_014831	CGC	2	6	3531	3536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120852
65	NC_014831	GAC	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120852
66	NC_014831	GGCC	2	8	3630	3637	0 %	0 %	50 %	50 %	317120852
67	NC_014831	GGT	2	6	3738	3743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120852
68	NC_014831	CGC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120852
69	NC_014831	CTG	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
70	NC_014831	GGT	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120852
71	NC_014831	GCT	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
72	NC_014831	CGGG	2	8	3904	3911	0 %	0 %	75 %	25 %	317120852
73	NC_014831	CGC	2	6	3915	3920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120852
74	NC_014831	GCT	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
75	NC_014831	CTC	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120852
76	NC_014831	GCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120852
77	NC_014831	CTG	2	6	3994	3999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
78	NC_014831	TGG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120852
79	NC_014831	CGG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120852
80	NC_014831	GGCG	2	8	4044	4051	0 %	0 %	75 %	25 %	317120852
81	NC_014831	GAG	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120852
82	NC_014831	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120852
83	NC_014831	GAG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120852
84	NC_014831	GAC	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120852
85	NC_014831	CTG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
86	NC_014831	CAG	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120852
87	NC_014831	GCCCTG	2	12	4327	4338	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317120852
88	NC_014831	CGG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120852
89	NC_014831	TGC	3	9	4394	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
90	NC_014831	GAC	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120852
91	NC_014831	CGG	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120852
92	NC_014831	CGAC	2	8	4490	4497	25 %	0 %	25 %	50 %	317120852
93	NC_014831	GTC	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
94	NC_014831	GCT	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120852
95	NC_014831	G	6	6	4583	4588	0 %	0 %	100 %	0 %	317120852
96	NC_014831	AGGCC	2	10	4721	4730	20 %	0 %	40 %	40 %	317120853
97	NC_014831	CGG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
98	NC_014831	CGGC	2	8	4804	4811	0 %	0 %	50 %	50 %	317120853
99	NC_014831	GCT	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120853
100	NC_014831	TCC	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120853
101	NC_014831	GTG	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120853
102	NC_014831	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
103	NC_014831	CTGG	2	8	4999	5006	0 %	25 %	50 %	25 %	317120853
104	NC_014831	ATC	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317120853
105	NC_014831	CGC	2	6	5054	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
106	NC_014831	GCC	2	6	5132	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
107	NC_014831	GGC	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
108	NC_014831	CCG	2	6	5170	5175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
109	NC_014831	CGGG	2	8	5197	5204	0 %	0 %	75 %	25 %	317120853
110	NC_014831	CGG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
111	NC_014831	CGG	2	6	5213	5218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
112	NC_014831	GCC	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
113	NC_014831	CCCGG	2	10	5231	5240	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
114	NC_014831	CGG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
115	NC_014831	CGC	3	9	5291	5299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
116	NC_014831	CCGACC	2	12	5344	5355	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	317120853
117	NC_014831	CGC	2	6	5363	5368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
118	NC_014831	TGGC	2	8	5376	5383	0 %	25 %	50 %	25 %	317120853
119	NC_014831	CGC	2	6	5384	5389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
120	NC_014831	CGG	4	12	5391	5402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
121	NC_014831	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
122	NC_014831	CGGC	2	8	5476	5483	0 %	0 %	50 %	50 %	317120853
123	NC_014831	GCGCC	2	10	5512	5521	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
124	NC_014831	CCG	2	6	5535	5540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
125	NC_014831	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	317120853
126	NC_014831	CGC	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
127	NC_014831	GCC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
128	NC_014831	GCCGC	2	10	5638	5647	0 %	0 %	40 %	60 %	317120853
129	NC_014831	GAG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120853
130	NC_014831	CGG	2	6	5658	5663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
131	NC_014831	GGT	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120853
132	NC_014831	CCG	2	6	5743	5748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
133	NC_014831	GGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120853
134	NC_014831	GGC	2	6	5777	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
135	NC_014831	CGG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120853
136	NC_014831	GCC	4	12	5843	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120853
137	NC_014831	CGCT	2	8	5862	5869	0 %	25 %	25 %	50 %	317120853
138	NC_014831	GCT	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120853
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142	NC_014831	GCT	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120854
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148	NC_014831	CGG	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120854
149	NC_014831	GCGG	2	8	6392	6399	0 %	0 %	75 %	25 %	317120854
150	NC_014831	ACG	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120854
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155	NC_014831	GC	3	6	6841	6846	0 %	0 %	50 %	50 %	317120855
156	NC_014831	ACG	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120855
157	NC_014831	CGG	2	6	6898	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120855
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163	NC_014831	G	6	6	7137	7142	0 %	0 %	100 %	0 %	317120855
164	NC_014831	CGG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120855
165	NC_014831	GGCGTG	2	12	7186	7197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	317120855
166	NC_014831	GGT	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120855
167	NC_014831	TGGAGG	2	12	7226	7237	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	317120855
168	NC_014831	GCG	2	6	7239	7244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120855
169	NC_014831	CCG	2	6	7272	7277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120855
170	NC_014831	ACC	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317120855
171	NC_014831	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120855
172	NC_014831	GAG	2	6	7372	7377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120855
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174	NC_014831	TGG	3	9	7397	7405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120855
175	NC_014831	GGC	2	6	7498	7503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120855
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210	NC_014831	TCT	2	6	8651	8656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317120855
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230	NC_014831	GCGACC	2	12	9578	9589	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317120856
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232	NC_014831	CAT	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317120856
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240	NC_014831	CAT	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317120856
241	NC_014831	CTG	2	6	9964	9969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120856
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243	NC_014831	AGC	2	6	10007	10012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120856
244	NC_014831	TCC	2	6	10049	10054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317120856
245	NC_014831	CAGGCC	2	12	10222	10233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317120856
246	NC_014831	GAG	3	9	10285	10293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120856
247	NC_014831	GCT	2	6	10302	10307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120856
248	NC_014831	GCGG	2	8	10326	10333	0 %	0 %	75 %	25 %	317120856
249	NC_014831	CAT	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317120856
250	NC_014831	CGA	2	6	10404	10409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120856
251	NC_014831	TCGAGG	2	12	10445	10456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317120856
252	NC_014831	GAG	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120856
253	NC_014831	GTG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120856
254	NC_014831	TCACCC	2	12	10484	10495	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	317120856
255	NC_014831	CAGC	2	8	10536	10543	25 %	0 %	25 %	50 %	317120856
256	NC_014831	CGG	2	6	10548	10553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120856
257	NC_014831	GAG	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120856
258	NC_014831	TCG	2	6	10592	10597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120856
259	NC_014831	CTG	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120856
260	NC_014831	ACC	2	6	10661	10666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317120856
261	NC_014831	GCCG	2	8	10690	10697	0 %	0 %	50 %	50 %	317120856
262	NC_014831	CGG	2	6	10712	10717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120856
263	NC_014831	GATCGA	2	12	10728	10739	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317120856
264	NC_014831	CCG	2	6	10757	10762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120856
265	NC_014831	GGT	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120856
266	NC_014831	CCG	2	6	10860	10865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120856
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270	NC_014831	TGG	2	6	10946	10951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120856
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280	NC_014831	CCGG	2	8	11229	11236	0 %	0 %	50 %	50 %	317120856
281	NC_014831	GAG	2	6	11239	11244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120856
282	NC_014831	GGC	2	6	11263	11268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120856
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284	NC_014831	GCCGC	2	10	11309	11318	0 %	0 %	40 %	60 %	317120856
285	NC_014831	CCG	2	6	11363	11368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120856
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289	NC_014831	GCCG	2	8	11604	11611	0 %	0 %	50 %	50 %	317120857
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292	NC_014831	GCC	3	9	11671	11679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120857
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295	NC_014831	GCC	2	6	11728	11733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120857
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369	NC_014831	GC	3	6	14961	14966	0 %	0 %	50 %	50 %	317120860
370	NC_014831	AGT	2	6	15009	15014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317120860
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372	NC_014831	GCT	3	9	15237	15245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120860
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376	NC_014831	GGCC	2	8	15379	15386	0 %	0 %	50 %	50 %	317120860
377	NC_014831	CAC	2	6	15407	15412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317120860
378	NC_014831	GCG	2	6	15449	15454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120860
379	NC_014831	GCC	2	6	15488	15493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120860
380	NC_014831	CAG	2	6	15496	15501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317120860
381	NC_014831	GCT	2	6	15510	15515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120860
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384	NC_014831	CCG	2	6	15570	15575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317120860
385	NC_014831	GGC	2	6	15616	15621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120860
386	NC_014831	GGT	2	6	15633	15638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120860
387	NC_014831	GTC	2	6	15650	15655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120860
388	NC_014831	GCCGG	2	10	15667	15676	0 %	0 %	60 %	40 %	317120860
389	NC_014831	CAT	2	6	15678	15683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317120860
390	NC_014831	CTG	2	6	15694	15699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120860
391	NC_014831	GGC	2	6	15763	15768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317120860
392	NC_014831	GTC	2	6	15796	15801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120860
393	NC_014831	GCCA	2	8	15836	15843	25 %	0 %	25 %	50 %	317120860
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412	NC_014831	TGG	2	6	17615	17620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317120862
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499	NC_014831	GAG	2	6	21085	21090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317120870
500	NC_014831	TCG	2	6	21134	21139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317120870

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