MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermaerobacter marianensis DSM 12885 chromosome

Total Repeats: 71216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014831	GGCGC	2	10	533226	533235	0 %	0 %	60 %	40 %	317121297
13002	NC_014831	TCC	2	6	533293	533298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121297
13003	NC_014831	GCC	2	6	533332	533337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13004	NC_014831	ACC	2	6	533395	533400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121297
13005	NC_014831	GCC	2	6	533401	533406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13006	NC_014831	GAT	2	6	533418	533423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317121297
13007	NC_014831	GCCG	2	8	533438	533445	0 %	0 %	50 %	50 %	317121297
13008	NC_014831	CGC	2	6	533482	533487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13009	NC_014831	CGC	2	6	533557	533562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13010	NC_014831	CAG	2	6	533574	533579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121297
13011	NC_014831	CGC	2	6	533647	533652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13012	NC_014831	GCC	2	6	533686	533691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13013	NC_014831	GCC	2	6	533719	533724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13014	NC_014831	CGG	2	6	533827	533832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121297
13015	NC_014831	GGC	2	6	533838	533843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121297
13016	NC_014831	CGC	2	6	533854	533859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13017	NC_014831	AGG	2	6	533866	533871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121297
13018	NC_014831	AGC	2	6	533899	533904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121297
13019	NC_014831	CCA	2	6	533909	533914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121297
13020	NC_014831	GTG	2	6	533945	533950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121297
13021	NC_014831	ACC	2	6	533959	533964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121297
13022	NC_014831	CCG	2	6	534080	534085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121297
13023	NC_014831	TGCCCG	2	12	534089	534100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317121297
13024	NC_014831	GCCC	2	8	534101	534108	0 %	0 %	25 %	75 %	317121297
13025	NC_014831	CGG	2	6	534124	534129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121297
13026	NC_014831	CCGT	2	8	534207	534214	0 %	25 %	25 %	50 %	317121297
13027	NC_014831	CATGCC	2	12	534225	534236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317121297
13028	NC_014831	GAGC	2	8	534600	534607	25 %	0 %	50 %	25 %	317121298
13029	NC_014831	CTA	2	6	534618	534623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317121298
13030	NC_014831	GCCCG	2	10	534644	534653	0 %	0 %	40 %	60 %	317121298
13031	NC_014831	CGG	2	6	534656	534661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121298
13032	NC_014831	GCG	2	6	534669	534674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121298
13033	NC_014831	CTG	2	6	534700	534705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121298
13034	NC_014831	GTT	2	6	534717	534722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317121298
13035	NC_014831	GCA	2	6	534723	534728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121298
13036	NC_014831	GAC	2	6	534742	534747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121298
13037	NC_014831	CCG	3	9	534750	534758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121298
13038	NC_014831	CTG	2	6	534760	534765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121298
13039	NC_014831	GCC	3	9	534770	534778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121298
13040	NC_014831	GGC	2	6	534819	534824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121298
13041	NC_014831	CGC	2	6	534828	534833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121298
13042	NC_014831	G	6	6	534865	534870	0 %	0 %	100 %	0 %	317121298
13043	NC_014831	GC	3	6	534949	534954	0 %	0 %	50 %	50 %	317121298
13044	NC_014831	CGC	2	6	534997	535002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121298
13045	NC_014831	GGC	2	6	535022	535027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121298
13046	NC_014831	CGGCC	2	10	535045	535054	0 %	0 %	40 %	60 %	317121298
13047	NC_014831	AGG	2	6	535082	535087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121298
13048	NC_014831	CGG	2	6	535095	535100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121298
13049	NC_014831	CGGC	2	8	535128	535135	0 %	0 %	50 %	50 %	317121298
13050	NC_014831	GGGGC	2	10	535153	535162	0 %	0 %	80 %	20 %	317121298
13051	NC_014831	GCCG	2	8	535170	535177	0 %	0 %	50 %	50 %	317121298
13052	NC_014831	TCC	2	6	535192	535197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121299
13053	NC_014831	CCGGC	2	10	535205	535214	0 %	0 %	40 %	60 %	317121299
13054	NC_014831	GGC	2	6	535219	535224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121299
13055	NC_014831	GCC	2	6	535310	535315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121299
13056	NC_014831	G	6	6	535321	535326	0 %	0 %	100 %	0 %	317121299
13057	NC_014831	GAG	2	6	535370	535375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121299
13058	NC_014831	GCGG	3	12	535390	535401	0 %	0 %	75 %	25 %	317121299
13059	NC_014831	GGA	2	6	535402	535407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121299
13060	NC_014831	TGC	2	6	535416	535421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121299
13061	NC_014831	CGG	2	6	535449	535454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121299
13062	NC_014831	CGGC	2	8	535480	535487	0 %	0 %	50 %	50 %	317121299
13063	NC_014831	GCG	2	6	535528	535533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121299
13064	NC_014831	CTG	2	6	535586	535591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121299
13065	NC_014831	CGGC	2	8	535603	535610	0 %	0 %	50 %	50 %	317121299
13066	NC_014831	CCGGG	2	10	535630	535639	0 %	0 %	60 %	40 %	317121299
13067	NC_014831	GCCCTG	2	12	535691	535702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317121299
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13069	NC_014831	CCA	2	6	535732	535737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121299
13070	NC_014831	GCC	2	6	535780	535785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121299
13071	NC_014831	GGC	2	6	535789	535794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121299
13072	NC_014831	TGG	2	6	535809	535814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121299
13073	NC_014831	GCGG	2	8	535819	535826	0 %	0 %	75 %	25 %	317121299
13074	NC_014831	CGGCA	2	10	535844	535853	20 %	0 %	40 %	40 %	317121299
13075	NC_014831	GTCC	2	8	535922	535929	0 %	25 %	25 %	50 %	317121299
13076	NC_014831	GCG	2	6	535940	535945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121299
13077	NC_014831	GCCG	2	8	535950	535957	0 %	0 %	50 %	50 %	317121299
13078	NC_014831	CTGG	2	8	535972	535979	0 %	25 %	50 %	25 %	317121299
13079	NC_014831	GCT	2	6	535984	535989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121299
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13082	NC_014831	TGG	2	6	536118	536123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121299
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13085	NC_014831	GCGG	2	8	536203	536210	0 %	0 %	75 %	25 %	317121299
13086	NC_014831	GCC	2	6	536239	536244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121299
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13088	NC_014831	GAC	2	6	536339	536344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121299
13089	NC_014831	GAAGC	2	10	536405	536414	40 %	0 %	40 %	20 %	317121299
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13093	NC_014831	TCGCCC	2	12	536667	536678	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	317121300
13094	NC_014831	ACC	2	6	536742	536747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121300
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13099	NC_014831	CGC	2	6	537035	537040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121301
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13101	NC_014831	CCA	2	6	537124	537129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121301
13102	NC_014831	CAC	2	6	537152	537157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121301
13103	NC_014831	GCCG	2	8	537234	537241	0 %	0 %	50 %	50 %	317121301
13104	NC_014831	CAG	2	6	537245	537250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121301
13105	NC_014831	CGGGCC	2	12	537255	537266	0 %	0 %	50 %	50 %	317121301
13106	NC_014831	GGC	2	6	537275	537280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121301
13107	NC_014831	TGA	2	6	537322	537327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317121301
13108	NC_014831	GGC	2	6	537348	537353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121301
13109	NC_014831	CCCGC	2	10	537388	537397	0 %	0 %	20 %	80 %	317121301
13110	NC_014831	CCG	2	6	537999	538004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121302
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13112	NC_014831	CGG	2	6	538125	538130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
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13115	NC_014831	CGG	2	6	538228	538233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
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13118	NC_014831	ACG	2	6	538371	538376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121302
13119	NC_014831	GCC	3	9	538415	538423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121302
13120	NC_014831	GGC	2	6	538426	538431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
13121	NC_014831	CGA	2	6	538456	538461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121302
13122	NC_014831	GCG	2	6	538465	538470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
13123	NC_014831	GCC	2	6	538521	538526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121302
13124	NC_014831	GTG	2	6	538538	538543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121302
13125	NC_014831	TGG	2	6	538563	538568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121302
13126	NC_014831	TCC	2	6	538578	538583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121302
13127	NC_014831	TGA	2	6	538587	538592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317121302
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13130	NC_014831	ATC	2	6	538619	538624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317121302
13131	NC_014831	CGA	2	6	538651	538656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121302
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13133	NC_014831	GC	3	6	538718	538723	0 %	0 %	50 %	50 %	317121302
13134	NC_014831	GCG	2	6	538740	538745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
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13141	NC_014831	AGTTCG	2	12	539025	539036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317121302
13142	NC_014831	GAC	2	6	539071	539076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121302
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13144	NC_014831	GGC	2	6	539098	539103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121302
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13149	NC_014831	GCT	2	6	539242	539247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121302
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13151	NC_014831	GCC	2	6	539684	539689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121303
13152	NC_014831	CTG	2	6	539699	539704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121303
13153	NC_014831	TGC	2	6	539742	539747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121303
13154	NC_014831	TCC	2	6	539784	539789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121303
13155	NC_014831	GCTG	2	8	539790	539797	0 %	25 %	50 %	25 %	317121303
13156	NC_014831	CCCGG	2	10	539812	539821	0 %	0 %	40 %	60 %	317121303
13157	NC_014831	CTC	2	6	539831	539836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121303
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13159	NC_014831	CGGG	2	8	539872	539879	0 %	0 %	75 %	25 %	317121303
13160	NC_014831	CCG	2	6	539880	539885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121303
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13168	NC_014831	GCCC	2	8	540136	540143	0 %	0 %	25 %	75 %	317121303
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13181	NC_014831	GGC	2	6	540496	540501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121303
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13185	NC_014831	CGG	2	6	540651	540656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121303
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13198	NC_014831	CATCGC	2	12	541273	541284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317121303
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13200	NC_014831	GCT	3	9	541309	541317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121303
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13211	NC_014831	GGC	2	6	541567	541572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121303
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13217	NC_014831	CGG	2	6	541818	541823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121304
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13219	NC_014831	CTG	2	6	542315	542320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121305
13220	NC_014831	TAT	2	6	542373	542378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317121305
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13222	NC_014831	GGA	2	6	542453	542458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121305
13223	NC_014831	TCC	2	6	542470	542475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121305
13224	NC_014831	GAC	3	9	542520	542528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121305
13225	NC_014831	CGGC	2	8	542596	542603	0 %	0 %	50 %	50 %	317121305
13226	NC_014831	CGGG	2	8	542651	542658	0 %	0 %	75 %	25 %	317121305
13227	NC_014831	GGC	2	6	542698	542703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121305
13228	NC_014831	GGCGG	2	10	542738	542747	0 %	0 %	80 %	20 %	317121305
13229	NC_014831	AGG	2	6	542764	542769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121305
13230	NC_014831	ACC	2	6	542783	542788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317121305
13231	NC_014831	TGG	2	6	542799	542804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121306
13232	NC_014831	CGG	2	6	542855	542860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121306
13233	NC_014831	GCT	2	6	542878	542883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121306
13234	NC_014831	G	6	6	542933	542938	0 %	0 %	100 %	0 %	317121306
13235	NC_014831	GGT	2	6	542944	542949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121306
13236	NC_014831	CCT	2	6	542961	542966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317121306
13237	NC_014831	TCA	2	6	543046	543051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317121306
13238	NC_014831	CAG	2	6	543056	543061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121306
13239	NC_014831	GCG	2	6	543064	543069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121306
13240	NC_014831	CGG	2	6	543082	543087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121306
13241	NC_014831	CGGC	2	8	543161	543168	0 %	0 %	50 %	50 %	317121306
13242	NC_014831	GCC	2	6	543171	543176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121306
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13273	NC_014831	CGG	2	6	544516	544521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121307
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13276	NC_014831	TCG	2	6	544629	544634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121307
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13345	NC_014831	G	6	6	547385	547390	0 %	0 %	100 %	0 %	317121309
13346	NC_014831	CGGC	2	8	547405	547412	0 %	0 %	50 %	50 %	317121309
13347	NC_014831	GCC	2	6	547554	547559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121310
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13349	NC_014831	GAC	2	6	547575	547580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317121310
13350	NC_014831	GAG	2	6	547611	547616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317121310
13351	NC_014831	CGGGGG	2	12	547623	547634	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	317121310
13352	NC_014831	CG	3	6	547674	547679	0 %	0 %	50 %	50 %	317121310
13353	NC_014831	CCCA	2	8	547758	547765	25 %	0 %	0 %	75 %	317121310
13354	NC_014831	GGC	2	6	547805	547810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121310
13355	NC_014831	GTG	2	6	547896	547901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317121310
13356	NC_014831	GGC	2	6	547914	547919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121310
13357	NC_014831	ATCGAC	2	12	547935	547946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	317121310
13358	NC_014831	GGC	2	6	547958	547963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121310
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13476	NC_014831	GCCG	2	8	552277	552284	0 %	0 %	50 %	50 %	317121314
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13479	NC_014831	CGG	2	6	552357	552362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121314
13480	NC_014831	CCGC	2	8	552378	552385	0 %	0 %	25 %	75 %	317121314
13481	NC_014831	CCG	2	6	552452	552457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317121315
13482	NC_014831	CCCGG	2	10	552465	552474	0 %	0 %	40 %	60 %	317121315
13483	NC_014831	GGCC	2	8	552486	552493	0 %	0 %	50 %	50 %	317121315
13484	NC_014831	CG	3	6	552520	552525	0 %	0 %	50 %	50 %	317121315
13485	NC_014831	CGGC	2	8	552534	552541	0 %	0 %	50 %	50 %	317121315
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13487	NC_014831	G	6	6	552563	552568	0 %	0 %	100 %	0 %	317121315
13488	NC_014831	GGC	2	6	552608	552613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317121315
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13491	NC_014831	CG	3	6	552661	552666	0 %	0 %	50 %	50 %	317121315
13492	NC_014831	CGCC	2	8	552674	552681	0 %	0 %	25 %	75 %	317121315
13493	NC_014831	GCT	2	6	552684	552689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317121315
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13495	NC_014831	CG	3	6	552720	552725	0 %	0 %	50 %	50 %	317121315
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