MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014804	GAT	2	6	216792	216797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230023
4002	NC_014804	TGA	2	6	216822	216827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230023
4003	NC_014804	TGT	2	6	216828	216833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230023
4004	NC_014804	ACT	2	6	216920	216925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230023
4005	NC_014804	GAA	2	6	217005	217010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230023
4006	NC_014804	AAG	2	6	217032	217037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230023
4007	NC_014804	GAT	2	6	217047	217052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230023
4008	NC_014804	ATG	2	6	217083	217088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230023
4009	NC_014804	GAA	2	6	217125	217130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230024
4010	NC_014804	ACA	2	6	217138	217143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230024
4011	NC_014804	ATG	2	6	217249	217254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230024
4012	NC_014804	AGA	2	6	217263	217268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230024
4013	NC_014804	AGG	2	6	217321	217326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230024
4014	NC_014804	GTG	2	6	217331	217336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230025
4015	NC_014804	CTT	2	6	217392	217397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230025
4016	NC_014804	TTAAAT	2	12	217398	217409	50 %	50 %	0 %	0 %	315230025
4017	NC_014804	GAG	2	6	217481	217486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230025
4018	NC_014804	TTG	2	6	217509	217514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230025
4019	NC_014804	A	6	6	217521	217526	100 %	0 %	0 %	0 %	315230025
4020	NC_014804	TTC	2	6	217596	217601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230025
4021	NC_014804	CTTG	2	8	217640	217647	0 %	50 %	25 %	25 %	315230025
4022	NC_014804	TA	3	6	217697	217702	50 %	50 %	0 %	0 %	315230025
4023	NC_014804	AGG	2	6	217704	217709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230025
4024	NC_014804	TTG	2	6	217788	217793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230025
4025	NC_014804	TAA	2	6	217960	217965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230026
4026	NC_014804	AGA	3	9	218126	218134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230026
4027	NC_014804	AGA	2	6	218142	218147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230026
4028	NC_014804	TGA	2	6	218156	218161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230026
4029	NC_014804	GAA	2	6	218223	218228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230026
4030	NC_014804	ATGTTG	2	12	218323	218334	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315230026
4031	NC_014804	AGA	3	9	218344	218352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230026
4032	NC_014804	AAG	2	6	218353	218358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230026
4033	NC_014804	TGA	2	6	218471	218476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230026
4034	NC_014804	CTG	2	6	218508	218513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230026
4035	NC_014804	TAA	2	6	218560	218565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230026
4036	NC_014804	G	6	6	218674	218679	0 %	0 %	100 %	0 %	315230027
4037	NC_014804	AGA	2	6	218686	218691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230027
4038	NC_014804	TGA	2	6	218719	218724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230027
4039	NC_014804	T	6	6	218754	218759	0 %	100 %	0 %	0 %	315230027
4040	NC_014804	TAG	2	6	218790	218795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230027
4041	NC_014804	ATT	2	6	218850	218855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230027
4042	NC_014804	CGT	2	6	218856	218861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230027
4043	NC_014804	AAC	2	6	218968	218973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230027
4044	NC_014804	TAA	2	6	218994	218999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230027
4045	NC_014804	TGA	2	6	219025	219030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230027
4046	NC_014804	CAAG	2	8	219057	219064	50 %	0 %	25 %	25 %	315230027
4047	NC_014804	GAA	2	6	219065	219070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230027
4048	NC_014804	TTC	2	6	219071	219076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230027
4049	NC_014804	CAT	2	6	219132	219137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230027
4050	NC_014804	GAA	2	6	219143	219148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230027
4051	NC_014804	ACT	2	6	219162	219167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230027
4052	NC_014804	TGT	2	6	219366	219371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230027
4053	NC_014804	AGG	2	6	219456	219461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230027
4054	NC_014804	AT	3	6	219515	219520	50 %	50 %	0 %	0 %	315230027
4055	NC_014804	TGA	2	6	219565	219570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230027
4056	NC_014804	GGA	2	6	219587	219592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230027
4057	NC_014804	TTC	2	6	219603	219608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230027
4058	NC_014804	A	6	6	219640	219645	100 %	0 %	0 %	0 %	315230027
4059	NC_014804	GAA	2	6	219719	219724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230027
4060	NC_014804	TAA	2	6	219795	219800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230027
4061	NC_014804	AAAGA	2	10	219801	219810	80 %	0 %	20 %	0 %	315230027
4062	NC_014804	G	7	7	219841	219847	0 %	0 %	100 %	0 %	315230028
4063	NC_014804	AGG	2	6	219927	219932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230028
4064	NC_014804	TGA	2	6	219982	219987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230028
4065	NC_014804	ATT	2	6	220010	220015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230028
4066	NC_014804	AAG	2	6	220094	220099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230028
4067	NC_014804	AGC	2	6	220129	220134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230028
4068	NC_014804	TAA	2	6	220147	220152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230028
4069	NC_014804	CTAA	2	8	220157	220164	50 %	25 %	0 %	25 %	315230028
4070	NC_014804	T	6	6	220217	220222	0 %	100 %	0 %	0 %	315230029
4071	NC_014804	T	6	6	220245	220250	0 %	100 %	0 %	0 %	315230029
4072	NC_014804	TCC	2	6	220267	220272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230029
4073	NC_014804	CAT	2	6	220319	220324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230029
4074	NC_014804	AC	3	6	220327	220332	50 %	0 %	0 %	50 %	315230029
4075	NC_014804	AAT	2	6	220371	220376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230029
4076	NC_014804	TAT	2	6	220493	220498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230029
4077	NC_014804	GAA	2	6	221196	221201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230030
4078	NC_014804	TGA	2	6	221294	221299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230030
4079	NC_014804	CAA	2	6	221312	221317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230030
4080	NC_014804	ATA	2	6	221395	221400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230030
4081	NC_014804	ATG	2	6	221458	221463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230030
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4083	NC_014804	AT	3	6	221521	221526	50 %	50 %	0 %	0 %	315230030
4084	NC_014804	AAC	2	6	221578	221583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230030
4085	NC_014804	AAT	2	6	221603	221608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230030
4086	NC_014804	GGA	2	6	221683	221688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230030
4087	NC_014804	TCG	2	6	221779	221784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230030
4088	NC_014804	AGG	2	6	221827	221832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230030
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4091	NC_014804	AGT	2	6	221984	221989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230031
4092	NC_014804	CA	3	6	222045	222050	50 %	0 %	0 %	50 %	315230031
4093	NC_014804	AAT	2	6	222071	222076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230031
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4097	NC_014804	CT	3	6	222295	222300	0 %	50 %	0 %	50 %	315230031
4098	NC_014804	CAAG	2	8	222306	222313	50 %	0 %	25 %	25 %	315230031
4099	NC_014804	AG	3	6	222312	222317	50 %	0 %	50 %	0 %	315230031
4100	NC_014804	GAC	2	6	222322	222327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230031
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4102	NC_014804	TAATT	2	10	222383	222392	40 %	60 %	0 %	0 %	315230031
4103	NC_014804	CAG	2	6	222460	222465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230031
4104	NC_014804	TGC	2	6	222469	222474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230031
4105	NC_014804	AT	3	6	222655	222660	50 %	50 %	0 %	0 %	315230031
4106	NC_014804	CAG	2	6	222685	222690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230031
4107	NC_014804	TA	3	6	222694	222699	50 %	50 %	0 %	0 %	315230031
4108	NC_014804	CAA	2	6	222732	222737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230031
4109	NC_014804	GAG	2	6	222751	222756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230031
4110	NC_014804	ATA	2	6	222758	222763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230031
4111	NC_014804	ATGT	2	8	222850	222857	25 %	50 %	25 %	0 %	315230031
4112	NC_014804	AAATGA	2	12	222889	222900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315230032
4113	NC_014804	TCT	2	6	222921	222926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230032
4114	NC_014804	GAA	2	6	222953	222958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230032
4115	NC_014804	A	6	6	222979	222984	100 %	0 %	0 %	0 %	315230032
4116	NC_014804	GAT	2	6	223066	223071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230032
4117	NC_014804	TAAA	2	8	223208	223215	75 %	25 %	0 %	0 %	315230033
4118	NC_014804	CTC	3	9	223231	223239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230033
4119	NC_014804	GAA	2	6	223243	223248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230033
4120	NC_014804	TGC	2	6	223286	223291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230033
4121	NC_014804	TTA	2	6	223330	223335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230033
4122	NC_014804	CTG	2	6	223343	223348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230033
4123	NC_014804	TGA	2	6	223399	223404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230033
4124	NC_014804	CTT	2	6	223406	223411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230033
4125	NC_014804	TCC	2	6	223442	223447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230033
4126	NC_014804	CCA	2	6	223470	223475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230033
4127	NC_014804	GAAA	2	8	223672	223679	75 %	0 %	25 %	0 %	315230034
4128	NC_014804	AAG	2	6	223689	223694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230034
4129	NC_014804	TCT	2	6	223717	223722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230034
4130	NC_014804	AG	3	6	223726	223731	50 %	0 %	50 %	0 %	315230034
4131	NC_014804	CAGT	2	8	223794	223801	25 %	25 %	25 %	25 %	315230034
4132	NC_014804	TAT	2	6	223889	223894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230034
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4135	NC_014804	AT	3	6	224082	224087	50 %	50 %	0 %	0 %	315230035
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4139	NC_014804	GAT	2	6	224548	224553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230036
4140	NC_014804	GGT	2	6	224589	224594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230036
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4143	NC_014804	GGC	2	6	224684	224689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230037
4144	NC_014804	CTC	2	6	224903	224908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230037
4145	NC_014804	GGC	2	6	224968	224973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230037
4146	NC_014804	T	6	6	225318	225323	0 %	100 %	0 %	0 %	315230037
4147	NC_014804	TCT	2	6	225330	225335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230037
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4151	NC_014804	TTC	3	9	225557	225565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230037
4152	NC_014804	CTA	2	6	225576	225581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230037
4153	NC_014804	CT	3	6	225611	225616	0 %	50 %	0 %	50 %	315230037
4154	NC_014804	TAG	2	6	225620	225625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230037
4155	NC_014804	TGG	2	6	225673	225678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230037
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4161	NC_014804	CTT	2	6	226130	226135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4162	NC_014804	GCA	2	6	226233	226238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230038
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4179	NC_014804	TTC	2	6	227149	227154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
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4182	NC_014804	TGT	2	6	227359	227364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230038
4183	NC_014804	CT	3	6	227374	227379	0 %	50 %	0 %	50 %	315230038
4184	NC_014804	GATGCT	2	12	227453	227464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315230038
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4186	NC_014804	CT	4	8	227546	227553	0 %	50 %	0 %	50 %	315230038
4187	NC_014804	T	6	6	227603	227608	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4188	NC_014804	ATT	2	6	227610	227615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230038
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4196	NC_014804	GAA	3	9	228216	228224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230039
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4200	NC_014804	TGA	2	6	228477	228482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230039
4201	NC_014804	GTT	2	6	228490	228495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230039
4202	NC_014804	GTA	2	6	228504	228509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230039
4203	NC_014804	TTC	2	6	228517	228522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4204	NC_014804	AGG	2	6	228553	228558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230039
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4213	NC_014804	ATAAC	2	10	228937	228946	60 %	20 %	0 %	20 %	315230039
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4224	NC_014804	CTG	2	6	229531	229536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230039
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4230	NC_014804	T	6	6	229945	229950	0 %	100 %	0 %	0 %	315230039
4231	NC_014804	TC	4	8	230053	230060	0 %	50 %	0 %	50 %	315230039
4232	NC_014804	GAA	2	6	230106	230111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230039
4233	NC_014804	TTG	2	6	230204	230209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230039
4234	NC_014804	TC	3	6	230222	230227	0 %	50 %	0 %	50 %	315230039
4235	NC_014804	CTGCTT	2	12	230276	230287	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315230039
4236	NC_014804	CTC	2	6	230331	230336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230040
4237	NC_014804	TGG	2	6	230557	230562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230040
4238	NC_014804	TAACAT	2	12	230575	230586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315230040
4239	NC_014804	T	6	6	230605	230610	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
4240	NC_014804	T	6	6	230658	230663	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
4241	NC_014804	T	6	6	230806	230811	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
4242	NC_014804	TCT	3	9	230817	230825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230040
4243	NC_014804	TA	3	6	230845	230850	50 %	50 %	0 %	0 %	315230040
4244	NC_014804	TAAT	2	8	230907	230914	50 %	50 %	0 %	0 %	315230040
4245	NC_014804	A	7	7	230915	230921	100 %	0 %	0 %	0 %	315230040
4246	NC_014804	T	6	6	230960	230965	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
4247	NC_014804	CTT	2	6	230971	230976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230040
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4364	NC_014804	AT	3	6	236767	236772	50 %	50 %	0 %	0 %	315230046
4365	NC_014804	ATG	2	6	236820	236825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230046
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4368	NC_014804	T	6	6	236954	236959	0 %	100 %	0 %	0 %	315230046
4369	NC_014804	TGA	2	6	236974	236979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230046
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4479	NC_014804	CTTT	2	8	242721	242728	0 %	75 %	0 %	25 %	315230052
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4481	NC_014804	AT	3	6	242783	242788	50 %	50 %	0 %	0 %	315230052
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4487	NC_014804	ACG	2	6	243213	243218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230052
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4490	NC_014804	TCT	2	6	243294	243299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230052
4491	NC_014804	GCA	2	6	243315	243320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230052
4492	NC_014804	TTG	2	6	243412	243417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230052
4493	NC_014804	CAAT	2	8	243418	243425	50 %	25 %	0 %	25 %	315230052
4494	NC_014804	TGT	2	6	243446	243451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230052
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