MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_014804	TCCAAT	2	12	1529044	1529055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231501
28002	NC_014804	ATGC	2	8	1529074	1529081	25 %	25 %	25 %	25 %	315231501
28003	NC_014804	TTC	2	6	1529177	1529182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231501
28004	NC_014804	TTG	2	6	1529219	1529224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231501
28005	NC_014804	TCA	2	6	1529385	1529390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231501
28006	NC_014804	CTG	2	6	1529489	1529494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231501
28007	NC_014804	CAA	2	6	1529559	1529564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231501
28008	NC_014804	GCAAC	2	10	1529622	1529631	40 %	0 %	20 %	40 %	315231501
28009	NC_014804	ATT	2	6	1529642	1529647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231501
28010	NC_014804	TCC	2	6	1529667	1529672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231501
28011	NC_014804	ACCAGT	2	12	1529673	1529684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315231501
28012	NC_014804	GGA	2	6	1529774	1529779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231501
28013	NC_014804	TGC	2	6	1529780	1529785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231501
28014	NC_014804	CAG	2	6	1529844	1529849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231501
28015	NC_014804	AG	3	6	1529851	1529856	50 %	0 %	50 %	0 %	315231501
28016	NC_014804	TCC	2	6	1529871	1529876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231501
28017	NC_014804	ATC	3	9	1529941	1529949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231501
28018	NC_014804	TCC	2	6	1529975	1529980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231501
28019	NC_014804	CTC	2	6	1530007	1530012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231501
28020	NC_014804	TTG	2	6	1532133	1532138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231502
28021	NC_014804	TCT	2	6	1532303	1532308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231503
28022	NC_014804	GAA	2	6	1532347	1532352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231503
28023	NC_014804	CCCAAA	2	12	1532365	1532376	50 %	0 %	0 %	50 %	315231503
28024	NC_014804	AGT	2	6	1532634	1532639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231504
28025	NC_014804	GAAC	2	8	1532781	1532788	50 %	0 %	25 %	25 %	315231504
28026	NC_014804	CTT	2	6	1532797	1532802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231504
28027	NC_014804	ACC	2	6	1532860	1532865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231504
28028	NC_014804	ATT	2	6	1532876	1532881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231504
28029	NC_014804	CAA	2	6	1533079	1533084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231504
28030	NC_014804	CAA	2	6	1533120	1533125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231504
28031	NC_014804	CTT	2	6	1533133	1533138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231504
28032	NC_014804	TCA	2	6	1533158	1533163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231504
28033	NC_014804	TGG	2	6	1533172	1533177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231504
28034	NC_014804	CTT	2	6	1533193	1533198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231504
28035	NC_014804	GTT	2	6	1533343	1533348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231504
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28037	NC_014804	TCT	2	6	1533459	1533464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231504
28038	NC_014804	ACA	2	6	1533524	1533529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231504
28039	NC_014804	CTG	2	6	1533557	1533562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231504
28040	NC_014804	TA	3	6	1533737	1533742	50 %	50 %	0 %	0 %	315231505
28041	NC_014804	GAG	2	6	1533745	1533750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231505
28042	NC_014804	CTG	2	6	1533767	1533772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231505
28043	NC_014804	TTG	2	6	1533776	1533781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231505
28044	NC_014804	TGAA	2	8	1533837	1533844	50 %	25 %	25 %	0 %	315231505
28045	NC_014804	AG	3	6	1533974	1533979	50 %	0 %	50 %	0 %	315231505
28046	NC_014804	GAAGT	2	10	1533993	1534002	40 %	20 %	40 %	0 %	315231505
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28048	NC_014804	TC	3	6	1534136	1534141	0 %	50 %	0 %	50 %	315231505
28049	NC_014804	CCTC	2	8	1534160	1534167	0 %	25 %	0 %	75 %	315231505
28050	NC_014804	ATA	2	6	1534201	1534206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231505
28051	NC_014804	TC	3	6	1534265	1534270	0 %	50 %	0 %	50 %	315231505
28052	NC_014804	AG	3	6	1534310	1534315	50 %	0 %	50 %	0 %	315231505
28053	NC_014804	TCA	2	6	1534331	1534336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231505
28054	NC_014804	GCT	2	6	1534442	1534447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231505
28055	NC_014804	CAA	2	6	1534554	1534559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231505
28056	NC_014804	TCG	2	6	1534562	1534567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231505
28057	NC_014804	CAG	2	6	1534579	1534584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231505
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28059	NC_014804	TTTCC	2	10	1534794	1534803	0 %	60 %	0 %	40 %	315231506
28060	NC_014804	CTTT	2	8	1534804	1534811	0 %	75 %	0 %	25 %	315231506
28061	NC_014804	TTG	2	6	1534848	1534853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231506
28062	NC_014804	TA	3	6	1534881	1534886	50 %	50 %	0 %	0 %	315231506
28063	NC_014804	GAG	2	6	1534983	1534988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231506
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28067	NC_014804	T	6	6	1535120	1535125	0 %	100 %	0 %	0 %	315231506
28068	NC_014804	CTC	2	6	1535128	1535133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231506
28069	NC_014804	T	8	8	1535134	1535141	0 %	100 %	0 %	0 %	315231506
28070	NC_014804	CT	3	6	1535149	1535154	0 %	50 %	0 %	50 %	315231506
28071	NC_014804	TTC	2	6	1535155	1535160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231506
28072	NC_014804	TC	3	6	1535159	1535164	0 %	50 %	0 %	50 %	315231506
28073	NC_014804	TCTTT	2	10	1535181	1535190	0 %	80 %	0 %	20 %	315231506
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28077	NC_014804	TTGG	2	8	1535447	1535454	0 %	50 %	50 %	0 %	315231507
28078	NC_014804	GAG	2	6	1535476	1535481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231507
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28081	NC_014804	ATCA	2	8	1535591	1535598	50 %	25 %	0 %	25 %	315231507
28082	NC_014804	TCT	2	6	1535608	1535613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231507
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28085	NC_014804	TAG	2	6	1535806	1535811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231508
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28087	NC_014804	AG	3	6	1535855	1535860	50 %	0 %	50 %	0 %	315231508
28088	NC_014804	TTC	2	6	1535886	1535891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231508
28089	NC_014804	GT	3	6	1535896	1535901	0 %	50 %	50 %	0 %	315231508
28090	NC_014804	GAA	2	6	1535906	1535911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231508
28091	NC_014804	AACA	2	8	1536036	1536043	75 %	0 %	0 %	25 %	315231508
28092	NC_014804	TGCT	2	8	1536198	1536205	0 %	50 %	25 %	25 %	315231508
28093	NC_014804	AAC	2	6	1536294	1536299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231508
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28097	NC_014804	CA	3	6	1536611	1536616	50 %	0 %	0 %	50 %	315231508
28098	NC_014804	CGA	2	6	1536725	1536730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231508
28099	NC_014804	CT	3	6	1536744	1536749	0 %	50 %	0 %	50 %	315231508
28100	NC_014804	ATC	2	6	1536808	1536813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231508
28101	NC_014804	CTTT	2	8	1536953	1536960	0 %	75 %	0 %	25 %	315231508
28102	NC_014804	GAG	2	6	1537012	1537017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231508
28103	NC_014804	GGA	2	6	1537049	1537054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231508
28104	NC_014804	CGG	2	6	1537122	1537127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231508
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28107	NC_014804	CTT	2	6	1537221	1537226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231508
28108	NC_014804	TTA	2	6	1537271	1537276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231508
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28111	NC_014804	TCCTCT	2	12	1537347	1537358	0 %	50 %	0 %	50 %	315231508
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28113	NC_014804	TCT	2	6	1537474	1537479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231508
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28115	NC_014804	CT	3	6	1537498	1537503	0 %	50 %	0 %	50 %	315231508
28116	NC_014804	CTT	2	6	1537536	1537541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231508
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28118	NC_014804	AATC	2	8	1537602	1537609	50 %	25 %	0 %	25 %	315231508
28119	NC_014804	CAT	2	6	1537631	1537636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231508
28120	NC_014804	TCC	2	6	1537814	1537819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231508
28121	NC_014804	TC	3	6	1537984	1537989	0 %	50 %	0 %	50 %	315231508
28122	NC_014804	TCA	2	6	1538008	1538013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231508
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28129	NC_014804	CT	3	6	1538190	1538195	0 %	50 %	0 %	50 %	315231508
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28134	NC_014804	TTTA	2	8	1538631	1538638	25 %	75 %	0 %	0 %	315231509
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28151	NC_014804	CATG	2	8	1539649	1539656	25 %	25 %	25 %	25 %	315231509
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28200	NC_014804	TCT	2	6	1542416	1542421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231512
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28219	NC_014804	TC	3	6	1543315	1543320	0 %	50 %	0 %	50 %	315231513
28220	NC_014804	TCT	2	6	1543326	1543331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231513
28221	NC_014804	ATC	2	6	1543352	1543357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231513
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28223	NC_014804	CAA	2	6	1543455	1543460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231514
28224	NC_014804	CGC	2	6	1543461	1543466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231514
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28226	NC_014804	CT	3	6	1543532	1543537	0 %	50 %	0 %	50 %	315231514
28227	NC_014804	AACC	2	8	1543582	1543589	50 %	0 %	0 %	50 %	315231514
28228	NC_014804	A	6	6	1543701	1543706	100 %	0 %	0 %	0 %	315231514
28229	NC_014804	GCCC	2	8	1543707	1543714	0 %	0 %	25 %	75 %	315231514
28230	NC_014804	CGC	2	6	1543828	1543833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231515
28231	NC_014804	ATT	2	6	1543838	1543843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231515
28232	NC_014804	CTC	2	6	1543846	1543851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231515
28233	NC_014804	TATTT	2	10	1543870	1543879	20 %	80 %	0 %	0 %	315231515
28234	NC_014804	CTC	2	6	1543894	1543899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231515
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28236	NC_014804	CTTTCT	2	12	1544182	1544193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231515
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28460	NC_014804	GA	3	6	1556052	1556057	50 %	0 %	50 %	0 %	315231528
28461	NC_014804	TGA	2	6	1556198	1556203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231528
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28473	NC_014804	ACA	2	6	1556811	1556816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231528
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28475	NC_014804	CT	3	6	1556881	1556886	0 %	50 %	0 %	50 %	315231528
28476	NC_014804	CTA	2	6	1556917	1556922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231528
28477	NC_014804	AAT	2	6	1556933	1556938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231528
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28486	NC_014804	A	6	6	1557321	1557326	100 %	0 %	0 %	0 %	315231528
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