MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_014804	TGCAT	2	10	1282497	1282506	20 %	40 %	20 %	20 %	315231237
23502	NC_014804	AG	3	6	1282534	1282539	50 %	0 %	50 %	0 %	315231237
23503	NC_014804	GAAG	2	8	1282585	1282592	50 %	0 %	50 %	0 %	315231238
23504	NC_014804	GAA	2	6	1282660	1282665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231238
23505	NC_014804	TCT	2	6	1282729	1282734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231238
23506	NC_014804	CTTT	2	8	1282782	1282789	0 %	75 %	0 %	25 %	315231238
23507	NC_014804	CAA	2	6	1282862	1282867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231238
23508	NC_014804	ACC	2	6	1282915	1282920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231239
23509	NC_014804	TGA	2	6	1282944	1282949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231239
23510	NC_014804	ATC	2	6	1283045	1283050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231239
23511	NC_014804	TGG	2	6	1283089	1283094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231239
23512	NC_014804	TTGC	2	8	1283213	1283220	0 %	50 %	25 %	25 %	315231239
23513	NC_014804	GGC	2	6	1283234	1283239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231239
23514	NC_014804	GCA	2	6	1283255	1283260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231239
23515	NC_014804	CAA	2	6	1283262	1283267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231239
23516	NC_014804	TCC	2	6	1283305	1283310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231239
23517	NC_014804	CAG	2	6	1283355	1283360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231239
23518	NC_014804	TAT	2	6	1283395	1283400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231239
23519	NC_014804	TCC	2	6	1283410	1283415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231239
23520	NC_014804	GAA	2	6	1283460	1283465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231239
23521	NC_014804	ACACCA	2	12	1283477	1283488	50 %	0 %	0 %	50 %	315231239
23522	NC_014804	ATCC	2	8	1283606	1283613	25 %	25 %	0 %	50 %	315231239
23523	NC_014804	CT	4	8	1283616	1283623	0 %	50 %	0 %	50 %	315231239
23524	NC_014804	TGAT	2	8	1283628	1283635	25 %	50 %	25 %	0 %	315231239
23525	NC_014804	AG	3	6	1283667	1283672	50 %	0 %	50 %	0 %	315231239
23526	NC_014804	CAG	2	6	1283698	1283703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231239
23527	NC_014804	TA	3	6	1283848	1283853	50 %	50 %	0 %	0 %	315231239
23528	NC_014804	TAAGTT	2	12	1283857	1283868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	315231239
23529	NC_014804	CCAA	2	8	1283984	1283991	50 %	0 %	0 %	50 %	315231239
23530	NC_014804	AGC	2	6	1284086	1284091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231239
23531	NC_014804	AG	3	6	1284144	1284149	50 %	0 %	50 %	0 %	315231239
23532	NC_014804	TCA	2	6	1284162	1284167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231239
23533	NC_014804	T	6	6	1284382	1284387	0 %	100 %	0 %	0 %	315231239
23534	NC_014804	AG	3	6	1284417	1284422	50 %	0 %	50 %	0 %	315231239
23535	NC_014804	ATC	2	6	1284431	1284436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231239
23536	NC_014804	ATC	2	6	1284455	1284460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231239
23537	NC_014804	CCT	2	6	1284468	1284473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231240
23538	NC_014804	TGC	2	6	1284615	1284620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231240
23539	NC_014804	TGG	2	6	1284624	1284629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231240
23540	NC_014804	TCCCTC	2	12	1284827	1284838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231240
23541	NC_014804	GAA	2	6	1284850	1284855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231241
23542	NC_014804	TCC	2	6	1284970	1284975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231241
23543	NC_014804	AAT	2	6	1284977	1284982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231241
23544	NC_014804	GAA	2	6	1285012	1285017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231241
23545	NC_014804	C	6	6	1285172	1285177	0 %	0 %	0 %	100 %	315231241
23546	NC_014804	CCT	2	6	1285184	1285189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231241
23547	NC_014804	ATG	2	6	1285271	1285276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231241
23548	NC_014804	GTC	2	6	1285280	1285285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231241
23549	NC_014804	T	6	6	1285287	1285292	0 %	100 %	0 %	0 %	315231241
23550	NC_014804	TCCT	2	8	1285300	1285307	0 %	50 %	0 %	50 %	315231242
23551	NC_014804	GTT	2	6	1285407	1285412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231242
23552	NC_014804	ATC	2	6	1285495	1285500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231242
23553	NC_014804	GCA	2	6	1285501	1285506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231242
23554	NC_014804	AGG	2	6	1285507	1285512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231242
23555	NC_014804	AGCA	2	8	1285533	1285540	50 %	0 %	25 %	25 %	315231242
23556	NC_014804	CCT	2	6	1285567	1285572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231243
23557	NC_014804	AAG	2	6	1285595	1285600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231243
23558	NC_014804	GTT	2	6	1285611	1285616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231243
23559	NC_014804	CAG	2	6	1285763	1285768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231243
23560	NC_014804	CAC	2	6	1285930	1285935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231244
23561	NC_014804	ACC	2	6	1286006	1286011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231244
23562	NC_014804	TGT	2	6	1286041	1286046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231244
23563	NC_014804	TGC	2	6	1286056	1286061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231244
23564	NC_014804	CTT	3	9	1286178	1286186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231245
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23566	NC_014804	CTG	2	6	1286300	1286305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231245
23567	NC_014804	TTG	3	9	1286306	1286314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231245
23568	NC_014804	TAG	2	6	1286394	1286399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231245
23569	NC_014804	CCA	2	6	1286411	1286416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231245
23570	NC_014804	CATT	2	8	1286432	1286439	25 %	50 %	0 %	25 %	315231245
23571	NC_014804	TCC	2	6	1286446	1286451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231246
23572	NC_014804	TTTTC	2	10	1286496	1286505	0 %	80 %	0 %	20 %	315231246
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23578	NC_014804	AGTA	2	8	1286892	1286899	50 %	25 %	25 %	0 %	315231246
23579	NC_014804	TTC	2	6	1287277	1287282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231247
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23586	NC_014804	CA	3	6	1287586	1287591	50 %	0 %	0 %	50 %	315231247
23587	NC_014804	AC	3	6	1287603	1287608	50 %	0 %	0 %	50 %	315231247
23588	NC_014804	T	6	6	1287631	1287636	0 %	100 %	0 %	0 %	315231247
23589	NC_014804	CAT	2	6	1287711	1287716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231247
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23591	NC_014804	CTT	2	6	1287787	1287792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231247
23592	NC_014804	AG	3	6	1287814	1287819	50 %	0 %	50 %	0 %	315231247
23593	NC_014804	CAG	2	6	1287849	1287854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231248
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23596	NC_014804	TG	3	6	1287999	1288004	0 %	50 %	50 %	0 %	315231248
23597	NC_014804	CAA	2	6	1288016	1288021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231248
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23599	NC_014804	AAT	2	6	1288132	1288137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231248
23600	NC_014804	GCCA	2	8	1288231	1288238	25 %	0 %	25 %	50 %	315231248
23601	NC_014804	AAG	2	6	1288254	1288259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231248
23602	NC_014804	TGT	2	6	1288352	1288357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231248
23603	NC_014804	CAT	2	6	1288389	1288394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231248
23604	NC_014804	CT	3	6	1288401	1288406	0 %	50 %	0 %	50 %	315231248
23605	NC_014804	ATC	2	6	1288420	1288425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231248
23606	NC_014804	CAG	2	6	1288503	1288508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231248
23607	NC_014804	AG	3	6	1288544	1288549	50 %	0 %	50 %	0 %	315231248
23608	NC_014804	CAA	2	6	1288575	1288580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231248
23609	NC_014804	TAT	2	6	1288644	1288649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231248
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23612	NC_014804	TTCC	2	8	1289170	1289177	0 %	50 %	0 %	50 %	315231249
23613	NC_014804	CT	3	6	1289260	1289265	0 %	50 %	0 %	50 %	315231249
23614	NC_014804	AAC	2	6	1289303	1289308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231249
23615	NC_014804	TCCT	2	8	1289415	1289422	0 %	50 %	0 %	50 %	315231249
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23845	NC_014804	CA	3	6	1302571	1302576	50 %	0 %	0 %	50 %	315231272
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23852	NC_014804	CTC	2	6	1302906	1302911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
23853	NC_014804	CCT	2	6	1302967	1302972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
23854	NC_014804	GA	3	6	1302999	1303004	50 %	0 %	50 %	0 %	315231273
23855	NC_014804	AAT	2	6	1303029	1303034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231273
23856	NC_014804	TCAC	2	8	1303084	1303091	25 %	25 %	0 %	50 %	315231273
23857	NC_014804	TCC	2	6	1303159	1303164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
23858	NC_014804	TTCC	2	8	1303230	1303237	0 %	50 %	0 %	50 %	315231273
23859	NC_014804	GGATTT	2	12	1303297	1303308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315231273
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23862	NC_014804	TCT	2	6	1303514	1303519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
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23871	NC_014804	TTCT	2	8	1303904	1303911	0 %	75 %	0 %	25 %	315231273
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