MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_014804	TAC	2	6	1227897	1227902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231178
22502	NC_014804	TCA	2	6	1227935	1227940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231178
22503	NC_014804	CTT	2	6	1228049	1228054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231179
22504	NC_014804	TCG	2	6	1228127	1228132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231179
22505	NC_014804	AGA	2	6	1228158	1228163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231179
22506	NC_014804	TCG	2	6	1228172	1228177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231179
22507	NC_014804	GAG	2	6	1228193	1228198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231179
22508	NC_014804	C	6	6	1228335	1228340	0 %	0 %	0 %	100 %	315231179
22509	NC_014804	GGA	2	6	1228413	1228418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231179
22510	NC_014804	AGT	2	6	1228500	1228505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231179
22511	NC_014804	GGT	2	6	1228512	1228517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231179
22512	NC_014804	TCC	2	6	1228564	1228569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231179
22513	NC_014804	GAG	2	6	1228585	1228590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231179
22514	NC_014804	CTT	2	6	1228680	1228685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231179
22515	NC_014804	ATT	2	6	1228700	1228705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231179
22516	NC_014804	TGG	2	6	1228742	1228747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231179
22517	NC_014804	TGA	2	6	1228749	1228754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231179
22518	NC_014804	GA	3	6	1228766	1228771	50 %	0 %	50 %	0 %	315231179
22519	NC_014804	CCA	2	6	1228794	1228799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231179
22520	NC_014804	GCTCA	2	10	1228900	1228909	20 %	20 %	20 %	40 %	315231179
22521	NC_014804	CTC	2	6	1228911	1228916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231179
22522	NC_014804	GCG	2	6	1229007	1229012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231179
22523	NC_014804	CTT	2	6	1229157	1229162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231180
22524	NC_014804	TGA	2	6	1229207	1229212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231180
22525	NC_014804	AGA	2	6	1229270	1229275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231180
22526	NC_014804	TCG	2	6	1229332	1229337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22527	NC_014804	CTC	2	6	1229370	1229375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231180
22528	NC_014804	TTC	2	6	1229416	1229421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231180
22529	NC_014804	CCG	2	6	1229464	1229469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231180
22530	NC_014804	GA	3	6	1229565	1229570	50 %	0 %	50 %	0 %	315231180
22531	NC_014804	AAC	2	6	1229571	1229576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231180
22532	NC_014804	TGC	2	6	1229648	1229653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22533	NC_014804	TAT	2	6	1229685	1229690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231180
22534	NC_014804	TTG	3	9	1229698	1229706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231180
22535	NC_014804	TGA	2	6	1229711	1229716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231180
22536	NC_014804	GTG	2	6	1229740	1229745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231180
22537	NC_014804	CGT	2	6	1229789	1229794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22538	NC_014804	GAA	2	6	1229913	1229918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231180
22539	NC_014804	GTG	2	6	1229988	1229993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231180
22540	NC_014804	CTG	2	6	1230017	1230022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22541	NC_014804	CTT	2	6	1230042	1230047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231180
22542	NC_014804	CCT	2	6	1230074	1230079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231180
22543	NC_014804	ATT	2	6	1230091	1230096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231180
22544	NC_014804	CTT	2	6	1230102	1230107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231180
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22546	NC_014804	CTG	2	6	1230155	1230160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22547	NC_014804	AG	3	6	1230168	1230173	50 %	0 %	50 %	0 %	315231180
22548	NC_014804	CTT	2	6	1230177	1230182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231180
22549	NC_014804	CTC	2	6	1230306	1230311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231180
22550	NC_014804	CAA	2	6	1230317	1230322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231180
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22552	NC_014804	CTG	2	6	1230531	1230536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231180
22553	NC_014804	TCC	2	6	1230545	1230550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231181
22554	NC_014804	CCG	2	6	1230552	1230557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231181
22555	NC_014804	CCTT	2	8	1230617	1230624	0 %	50 %	0 %	50 %	315231181
22556	NC_014804	CTT	2	6	1230823	1230828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231181
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22558	NC_014804	ATT	2	6	1230911	1230916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231181
22559	NC_014804	GGA	2	6	1230966	1230971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231181
22560	NC_014804	CT	3	6	1231038	1231043	0 %	50 %	0 %	50 %	315231181
22561	NC_014804	ATT	2	6	1231082	1231087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231181
22562	NC_014804	AAC	2	6	1231168	1231173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231181
22563	NC_014804	CTCGCC	2	12	1231180	1231191	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	315231181
22564	NC_014804	CTC	2	6	1231424	1231429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231182
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22566	NC_014804	TCC	2	6	1231536	1231541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231182
22567	NC_014804	CAG	2	6	1231684	1231689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231182
22568	NC_014804	CTC	2	6	1231692	1231697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231182
22569	NC_014804	CA	3	6	1231713	1231718	50 %	0 %	0 %	50 %	315231182
22570	NC_014804	TC	3	6	1231731	1231736	0 %	50 %	0 %	50 %	315231182
22571	NC_014804	ATG	2	6	1231794	1231799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231182
22572	NC_014804	C	6	6	1231903	1231908	0 %	0 %	0 %	100 %	315231182
22573	NC_014804	TCA	2	6	1231912	1231917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231182
22574	NC_014804	TGC	2	6	1231925	1231930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231182
22575	NC_014804	GCC	2	6	1231946	1231951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231182
22576	NC_014804	T	6	6	1232011	1232016	0 %	100 %	0 %	0 %	315231182
22577	NC_014804	AATG	2	8	1232108	1232115	50 %	25 %	25 %	0 %	315231182
22578	NC_014804	TC	4	8	1232251	1232258	0 %	50 %	0 %	50 %	315231182
22579	NC_014804	GAAACA	2	12	1232265	1232276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315231182
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22582	NC_014804	TC	3	6	1232418	1232423	0 %	50 %	0 %	50 %	315231182
22583	NC_014804	ACC	2	6	1232476	1232481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231183
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22585	NC_014804	TCT	2	6	1232519	1232524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231183
22586	NC_014804	GTC	2	6	1232575	1232580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231183
22587	NC_014804	TCA	2	6	1232648	1232653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231183
22588	NC_014804	TCT	2	6	1232773	1232778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231183
22589	NC_014804	TCT	2	6	1232790	1232795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231183
22590	NC_014804	AGG	2	6	1232896	1232901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231183
22591	NC_014804	ATT	2	6	1232912	1232917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231183
22592	NC_014804	ATT	2	6	1232996	1233001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231183
22593	NC_014804	TGT	2	6	1233096	1233101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231183
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22595	NC_014804	ATAG	2	8	1233235	1233242	50 %	25 %	25 %	0 %	315231183
22596	NC_014804	CAA	2	6	1233279	1233284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231183
22597	NC_014804	T	7	7	1233307	1233313	0 %	100 %	0 %	0 %	315231183
22598	NC_014804	ACT	2	6	1233353	1233358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231183
22599	NC_014804	GAT	2	6	1233400	1233405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231183
22600	NC_014804	GAA	2	6	1233539	1233544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231184
22601	NC_014804	TCT	2	6	1233638	1233643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231184
22602	NC_014804	CCT	3	9	1233653	1233661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231184
22603	NC_014804	TGA	2	6	1233674	1233679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231184
22604	NC_014804	TCG	2	6	1233698	1233703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
22605	NC_014804	AGT	2	6	1233704	1233709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231184
22606	NC_014804	TCC	2	6	1233715	1233720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231184
22607	NC_014804	TGCTCG	2	12	1233763	1233774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
22608	NC_014804	GGC	2	6	1233777	1233782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231184
22609	NC_014804	GCT	2	6	1233821	1233826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
22610	NC_014804	TTC	3	9	1233897	1233905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231184
22611	NC_014804	CT	3	6	1233996	1234001	0 %	50 %	0 %	50 %	315231184
22612	NC_014804	GTT	2	6	1234007	1234012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231184
22613	NC_014804	TCC	2	6	1234320	1234325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231185
22614	NC_014804	AAG	2	6	1234328	1234333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231185
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22616	NC_014804	TTAT	2	8	1234476	1234483	25 %	75 %	0 %	0 %	315231185
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22852	NC_014804	TA	3	6	1246605	1246610	50 %	50 %	0 %	0 %	315231199
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22953	NC_014804	GAAT	2	8	1252277	1252284	50 %	25 %	25 %	0 %	315231205
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22962	NC_014804	GTAG	2	8	1253023	1253030	25 %	25 %	50 %	0 %	315231206
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22966	NC_014804	CTC	2	6	1253087	1253092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231207
22967	NC_014804	CCA	2	6	1253165	1253170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231207
22968	NC_014804	T	6	6	1253261	1253266	0 %	100 %	0 %	0 %	315231207
22969	NC_014804	CTT	2	6	1253267	1253272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231207
22970	NC_014804	ATC	2	6	1253358	1253363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231207
22971	NC_014804	TAT	2	6	1253417	1253422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231207
22972	NC_014804	AAC	2	6	1253507	1253512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231207
22973	NC_014804	TCC	2	6	1253516	1253521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231207
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22989	NC_014804	GAT	2	6	1254769	1254774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231208
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22996	NC_014804	CTG	2	6	1255053	1255058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231210
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23000	NC_014804	CGG	2	6	1255685	1255690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231210

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