MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014804	CTT	2	6	737427	737432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230618
13502	NC_014804	CAT	2	6	737434	737439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230618
13503	NC_014804	T	6	6	737495	737500	0 %	100 %	0 %	0 %	315230618
13504	NC_014804	TTC	2	6	737524	737529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230618
13505	NC_014804	TCT	2	6	737639	737644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230618
13506	NC_014804	CTC	2	6	737647	737652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230618
13507	NC_014804	CT	4	8	737715	737722	0 %	50 %	0 %	50 %	315230618
13508	NC_014804	TGC	2	6	737726	737731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230618
13509	NC_014804	AGA	2	6	737785	737790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230618
13510	NC_014804	ACA	2	6	737820	737825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230618
13511	NC_014804	TCCCA	2	10	737856	737865	20 %	20 %	0 %	60 %	315230618
13512	NC_014804	AT	3	6	737888	737893	50 %	50 %	0 %	0 %	315230618
13513	NC_014804	AAC	2	6	738020	738025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230618
13514	NC_014804	CCAT	2	8	738033	738040	25 %	25 %	0 %	50 %	315230618
13515	NC_014804	GAA	2	6	738086	738091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230618
13516	NC_014804	TC	3	6	738138	738143	0 %	50 %	0 %	50 %	315230618
13517	NC_014804	CTT	2	6	738145	738150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230618
13518	NC_014804	TCA	2	6	738211	738216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230619
13519	NC_014804	CTT	2	6	738237	738242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230619
13520	NC_014804	GTC	2	6	738300	738305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230619
13521	NC_014804	TC	4	8	738370	738377	0 %	50 %	0 %	50 %	315230619
13522	NC_014804	TA	3	6	738496	738501	50 %	50 %	0 %	0 %	315230619
13523	NC_014804	TC	3	6	738509	738514	0 %	50 %	0 %	50 %	315230619
13524	NC_014804	CT	3	6	738565	738570	0 %	50 %	0 %	50 %	315230619
13525	NC_014804	A	6	6	738583	738588	100 %	0 %	0 %	0 %	315230619
13526	NC_014804	CTG	2	6	738602	738607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230619
13527	NC_014804	TCC	2	6	738623	738628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230619
13528	NC_014804	CT	3	6	738630	738635	0 %	50 %	0 %	50 %	315230619
13529	NC_014804	T	6	6	738663	738668	0 %	100 %	0 %	0 %	315230619
13530	NC_014804	ATC	2	6	738673	738678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230619
13531	NC_014804	CAA	2	6	738680	738685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230619
13532	NC_014804	TCC	2	6	738708	738713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230620
13533	NC_014804	CTC	2	6	738714	738719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230620
13534	NC_014804	GTA	2	6	738800	738805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230620
13535	NC_014804	ATC	2	6	738855	738860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230620
13536	NC_014804	CCAT	2	8	738879	738886	25 %	25 %	0 %	50 %	315230620
13537	NC_014804	ATT	3	9	739050	739058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230620
13538	NC_014804	TAA	2	6	739090	739095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230620
13539	NC_014804	CAT	2	6	739130	739135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230620
13540	NC_014804	GGC	2	6	739173	739178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230620
13541	NC_014804	AG	3	6	739246	739251	50 %	0 %	50 %	0 %	315230620
13542	NC_014804	GCT	2	6	739294	739299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230621
13543	NC_014804	TAT	2	6	739320	739325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230621
13544	NC_014804	ATC	2	6	739402	739407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230621
13545	NC_014804	AT	3	6	739502	739507	50 %	50 %	0 %	0 %	315230621
13546	NC_014804	GAA	2	6	739512	739517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230621
13547	NC_014804	GGA	2	6	739556	739561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230621
13548	NC_014804	ATG	2	6	739624	739629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230621
13549	NC_014804	GCC	2	6	739681	739686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230621
13550	NC_014804	CTG	2	6	739725	739730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230621
13551	NC_014804	CTA	2	6	739781	739786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230621
13552	NC_014804	CAG	2	6	739815	739820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230621
13553	NC_014804	GTAA	2	8	739822	739829	50 %	25 %	25 %	0 %	315230621
13554	NC_014804	CT	3	6	739832	739837	0 %	50 %	0 %	50 %	315230621
13555	NC_014804	AGCC	2	8	739847	739854	25 %	0 %	25 %	50 %	315230621
13556	NC_014804	GGC	2	6	739875	739880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230621
13557	NC_014804	AGG	2	6	739909	739914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230621
13558	NC_014804	TGA	2	6	739919	739924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230621
13559	NC_014804	ATGCTT	2	12	739951	739962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315230621
13560	NC_014804	TTG	2	6	739991	739996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230621
13561	NC_014804	GAT	2	6	740010	740015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230621
13562	NC_014804	GT	3	6	740037	740042	0 %	50 %	50 %	0 %	315230621
13563	NC_014804	CTT	2	6	740052	740057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230621
13564	NC_014804	GGC	2	6	740098	740103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230621
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13566	NC_014804	CATGAA	2	12	740148	740159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315230621
13567	NC_014804	C	6	6	740225	740230	0 %	0 %	0 %	100 %	315230622
13568	NC_014804	GGAA	2	8	740401	740408	50 %	0 %	50 %	0 %	315230622
13569	NC_014804	TCT	2	6	740415	740420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230622
13570	NC_014804	ATT	2	6	740512	740517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230622
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13572	NC_014804	TA	3	6	740596	740601	50 %	50 %	0 %	0 %	315230622
13573	NC_014804	CCT	2	6	740615	740620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230622
13574	NC_014804	TTG	2	6	740632	740637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230622
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13579	NC_014804	CTTG	2	8	740880	740887	0 %	50 %	25 %	25 %	315230622
13580	NC_014804	AGCTA	2	10	740913	740922	40 %	20 %	20 %	20 %	315230622
13581	NC_014804	GAA	2	6	741033	741038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230622
13582	NC_014804	AT	3	6	741124	741129	50 %	50 %	0 %	0 %	315230622
13583	NC_014804	AGC	2	6	741183	741188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230622
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13586	NC_014804	AAG	2	6	741222	741227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230622
13587	NC_014804	TAT	2	6	741231	741236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230622
13588	NC_014804	TTC	2	6	741263	741268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230622
13589	NC_014804	TGGT	2	8	741370	741377	0 %	50 %	50 %	0 %	315230622
13590	NC_014804	CAG	2	6	741462	741467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230622
13591	NC_014804	CTG	2	6	741478	741483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230622
13592	NC_014804	ATA	2	6	741577	741582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230622
13593	NC_014804	AG	3	6	741637	741642	50 %	0 %	50 %	0 %	315230622
13594	NC_014804	TGT	2	6	741650	741655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230622
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13598	NC_014804	ATC	2	6	741720	741725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230622
13599	NC_014804	TCA	2	6	741758	741763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230622
13600	NC_014804	TTGAT	2	10	741859	741868	20 %	60 %	20 %	0 %	315230622
13601	NC_014804	AGG	2	6	741871	741876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230622
13602	NC_014804	GAG	2	6	741897	741902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230622
13603	NC_014804	GCA	2	6	741973	741978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230622
13604	NC_014804	CAA	2	6	742041	742046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230622
13605	NC_014804	ATT	2	6	742057	742062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230622
13606	NC_014804	CAT	2	6	742129	742134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230623
13607	NC_014804	TCC	2	6	742242	742247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230623
13608	NC_014804	TCCCT	2	10	742259	742268	0 %	40 %	0 %	60 %	315230623
13609	NC_014804	TAA	2	6	742302	742307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230623
13610	NC_014804	TGC	2	6	742370	742375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230623
13611	NC_014804	GCA	2	6	742590	742595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230623
13612	NC_014804	GTTT	2	8	742682	742689	0 %	75 %	25 %	0 %	315230623
13613	NC_014804	AT	3	6	742808	742813	50 %	50 %	0 %	0 %	315230623
13614	NC_014804	TTACTG	2	12	742843	742854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315230623
13615	NC_014804	CAATGC	2	12	742937	742948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315230623
13616	NC_014804	AAGC	2	8	742978	742985	50 %	0 %	25 %	25 %	315230623
13617	NC_014804	ACCA	2	8	743039	743046	50 %	0 %	0 %	50 %	315230623
13618	NC_014804	AGA	2	6	743047	743052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230623
13619	NC_014804	ACC	2	6	743066	743071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230623
13620	NC_014804	TA	3	6	743078	743083	50 %	50 %	0 %	0 %	315230623
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13982	NC_014804	AT	3	6	762725	762730	50 %	50 %	0 %	0 %	315230647
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13985	NC_014804	AT	3	6	762778	762783	50 %	50 %	0 %	0 %	315230647
13986	NC_014804	AAC	2	6	762872	762877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230647
13987	NC_014804	CT	3	6	762888	762893	0 %	50 %	0 %	50 %	315230647
13988	NC_014804	TAAAAT	2	12	762988	762999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230647
13989	NC_014804	TCC	2	6	763001	763006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230647
13990	NC_014804	AT	3	6	763019	763024	50 %	50 %	0 %	0 %	315230647
13991	NC_014804	CTAT	2	8	763067	763074	25 %	50 %	0 %	25 %	315230647
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13994	NC_014804	CTA	2	6	763231	763236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230647
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