MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014804	TTGT	2	8	568550	568557	0 %	75 %	25 %	0 %	315230429
10502	NC_014804	AGAT	2	8	568574	568581	50 %	25 %	25 %	0 %	315230429
10503	NC_014804	ACA	2	6	568667	568672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230429
10504	NC_014804	GAT	2	6	568809	568814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230429
10505	NC_014804	TCC	2	6	569077	569082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230429
10506	NC_014804	AAG	2	6	569131	569136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230429
10507	NC_014804	ACT	2	6	569189	569194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10508	NC_014804	GCT	2	6	569232	569237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230429
10509	NC_014804	AGT	2	6	569442	569447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230429
10510	NC_014804	CAT	2	6	569487	569492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10511	NC_014804	ATCCCT	2	12	569518	569529	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	315230429
10512	NC_014804	CAG	2	6	569544	569549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230429
10513	NC_014804	CCA	2	6	569599	569604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230429
10514	NC_014804	TTC	2	6	569656	569661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230429
10515	NC_014804	TTG	2	6	569718	569723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230429
10516	NC_014804	ACT	2	6	569729	569734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10517	NC_014804	ATT	2	6	569753	569758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230429
10518	NC_014804	CAA	2	6	569808	569813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230429
10519	NC_014804	GCT	2	6	569937	569942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230429
10520	NC_014804	AG	3	6	570011	570016	50 %	0 %	50 %	0 %	315230429
10521	NC_014804	CAT	2	6	570066	570071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10522	NC_014804	TAT	2	6	570196	570201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230429
10523	NC_014804	TC	3	6	570250	570255	0 %	50 %	0 %	50 %	315230429
10524	NC_014804	TAT	2	6	570334	570339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230429
10525	NC_014804	TGA	2	6	570402	570407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230429
10526	NC_014804	AAG	2	6	570472	570477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230429
10527	NC_014804	CA	3	6	570506	570511	50 %	0 %	0 %	50 %	315230429
10528	NC_014804	AG	3	6	570515	570520	50 %	0 %	50 %	0 %	315230429
10529	NC_014804	C	6	6	570546	570551	0 %	0 %	0 %	100 %	315230429
10530	NC_014804	AAC	2	6	570614	570619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230429
10531	NC_014804	TGT	2	6	570642	570647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230429
10532	NC_014804	CAT	2	6	570685	570690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10533	NC_014804	AGCCC	2	10	570707	570716	20 %	0 %	20 %	60 %	315230429
10534	NC_014804	CTT	2	6	570730	570735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230429
10535	NC_014804	AAGT	2	8	570739	570746	50 %	25 %	25 %	0 %	315230429
10536	NC_014804	AAT	2	6	570754	570759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230429
10537	NC_014804	GAA	2	6	570763	570768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230429
10538	NC_014804	CAT	2	6	570904	570909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230429
10539	NC_014804	GTA	2	6	570910	570915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230429
10540	NC_014804	CAA	2	6	571032	571037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230429
10541	NC_014804	T	6	6	571104	571109	0 %	100 %	0 %	0 %	315230429
10542	NC_014804	TA	3	6	571253	571258	50 %	50 %	0 %	0 %	315230430
10543	NC_014804	TCA	2	6	571278	571283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230430
10544	NC_014804	TTC	2	6	571325	571330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230430
10545	NC_014804	TTA	2	6	571345	571350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230430
10546	NC_014804	CTC	2	6	571357	571362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230430
10547	NC_014804	CTT	2	6	571372	571377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230430
10548	NC_014804	ATC	2	6	571389	571394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230430
10549	NC_014804	ACT	2	6	571428	571433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230430
10550	NC_014804	TA	3	6	571502	571507	50 %	50 %	0 %	0 %	315230430
10551	NC_014804	AGA	2	6	571573	571578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230430
10552	NC_014804	CATAT	2	10	571658	571667	40 %	40 %	0 %	20 %	315230430
10553	NC_014804	TCT	2	6	571681	571686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230430
10554	NC_014804	CT	3	6	571694	571699	0 %	50 %	0 %	50 %	315230430
10555	NC_014804	CAG	2	6	571702	571707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230430
10556	NC_014804	TAA	2	6	571744	571749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230430
10557	NC_014804	CAA	2	6	571849	571854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230430
10558	NC_014804	CTT	2	6	571883	571888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230430
10559	NC_014804	TG	3	6	571935	571940	0 %	50 %	50 %	0 %	315230430
10560	NC_014804	TTC	2	6	572022	572027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230430
10561	NC_014804	GCA	2	6	572061	572066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230430
10562	NC_014804	CGA	2	6	572086	572091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230430
10563	NC_014804	ATC	2	6	572136	572141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230430
10564	NC_014804	AT	3	6	572153	572158	50 %	50 %	0 %	0 %	315230430
10565	NC_014804	CTTT	2	8	572260	572267	0 %	75 %	0 %	25 %	315230430
10566	NC_014804	TTGAC	2	10	572271	572280	20 %	40 %	20 %	20 %	315230430
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10571	NC_014804	CT	3	6	572459	572464	0 %	50 %	0 %	50 %	315230430
10572	NC_014804	TA	3	6	572473	572478	50 %	50 %	0 %	0 %	315230430
10573	NC_014804	CAG	2	6	572510	572515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230430
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10582	NC_014804	CA	3	6	572959	572964	50 %	0 %	0 %	50 %	315230430
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10588	NC_014804	GA	3	6	573582	573587	50 %	0 %	50 %	0 %	315230432
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10600	NC_014804	ATGAC	2	10	574184	574193	40 %	20 %	20 %	20 %	315230432
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10602	NC_014804	AG	3	6	574271	574276	50 %	0 %	50 %	0 %	315230432
10603	NC_014804	CTTTAT	2	12	574311	574322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315230433
10604	NC_014804	AT	3	6	574331	574336	50 %	50 %	0 %	0 %	315230433
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10608	NC_014804	TCA	3	9	574526	574534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230433
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10610	NC_014804	TG	3	6	574591	574596	0 %	50 %	50 %	0 %	315230433
10611	NC_014804	TTA	2	6	574608	574613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230433
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10616	NC_014804	CCT	2	6	575004	575009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230433
10617	NC_014804	ATGA	2	8	575026	575033	50 %	25 %	25 %	0 %	315230433
10618	NC_014804	TCT	2	6	575040	575045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230433
10619	NC_014804	TCA	2	6	575096	575101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230433
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10850	NC_014804	AT	4	8	588343	588350	50 %	50 %	0 %	0 %	315230446
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10858	NC_014804	TTTTA	2	10	588739	588748	20 %	80 %	0 %	0 %	315230446
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10861	NC_014804	TATT	2	8	589041	589048	25 %	75 %	0 %	0 %	315230446
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10984	NC_014804	TGA	2	6	596433	596438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230455
10985	NC_014804	AGA	2	6	596484	596489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230455
10986	NC_014804	GAA	2	6	596595	596600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230455
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10988	NC_014804	GA	3	6	596655	596660	50 %	0 %	50 %	0 %	315230456
10989	NC_014804	AGC	2	6	596689	596694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230456
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10991	NC_014804	AGA	2	6	596787	596792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230456
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