MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014804	ATA	2	6	543280	543285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230395
10003	NC_014804	CTG	2	6	543361	543366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230395
10004	NC_014804	GAG	2	6	543375	543380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230395
10005	NC_014804	GCC	2	6	543467	543472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230396
10006	NC_014804	GAG	2	6	543497	543502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230396
10007	NC_014804	TTC	2	6	543531	543536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230396
10008	NC_014804	TCG	2	6	543537	543542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230396
10009	NC_014804	AAG	2	6	543566	543571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230396
10010	NC_014804	TCT	2	6	543684	543689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230396
10011	NC_014804	T	6	6	543796	543801	0 %	100 %	0 %	0 %	315230396
10012	NC_014804	TTA	2	6	543892	543897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230396
10013	NC_014804	T	6	6	543898	543903	0 %	100 %	0 %	0 %	315230396
10014	NC_014804	TGC	2	6	543941	543946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230396
10015	NC_014804	ATT	2	6	543951	543956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230396
10016	NC_014804	TA	5	10	544184	544193	50 %	50 %	0 %	0 %	315230397
10017	NC_014804	TTCTC	2	10	544244	544253	0 %	60 %	0 %	40 %	315230397
10018	NC_014804	AGC	2	6	544279	544284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230397
10019	NC_014804	TA	3	6	544375	544380	50 %	50 %	0 %	0 %	315230397
10020	NC_014804	TCT	2	6	544381	544386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230397
10021	NC_014804	TCT	2	6	544394	544399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230397
10022	NC_014804	C	6	6	544401	544406	0 %	0 %	0 %	100 %	315230397
10023	NC_014804	GAAA	2	8	544470	544477	75 %	0 %	25 %	0 %	315230398
10024	NC_014804	CTT	2	6	544521	544526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230398
10025	NC_014804	CT	3	6	544532	544537	0 %	50 %	0 %	50 %	315230398
10026	NC_014804	CAAC	2	8	544541	544548	50 %	0 %	0 %	50 %	315230398
10027	NC_014804	TC	4	8	544624	544631	0 %	50 %	0 %	50 %	315230398
10028	NC_014804	TTC	2	6	544639	544644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230398
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10030	NC_014804	CT	3	6	544672	544677	0 %	50 %	0 %	50 %	315230398
10031	NC_014804	AGCA	2	8	544689	544696	50 %	0 %	25 %	25 %	315230398
10032	NC_014804	T	6	6	544710	544715	0 %	100 %	0 %	0 %	315230398
10033	NC_014804	CCA	2	6	544719	544724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230398
10034	NC_014804	GTT	2	6	544821	544826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230398
10035	NC_014804	TCA	2	6	544835	544840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230398
10036	NC_014804	GTA	2	6	544935	544940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230398
10037	NC_014804	CT	3	6	545036	545041	0 %	50 %	0 %	50 %	315230398
10038	NC_014804	AGT	2	6	545111	545116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230398
10039	NC_014804	CTC	2	6	545124	545129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10040	NC_014804	TCC	2	6	545134	545139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10041	NC_014804	CAG	2	6	545193	545198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230398
10042	NC_014804	TTC	2	6	545202	545207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230398
10043	NC_014804	AAG	2	6	545232	545237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230398
10044	NC_014804	TCC	2	6	545250	545255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10045	NC_014804	CTC	2	6	545280	545285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10046	NC_014804	A	6	6	545320	545325	100 %	0 %	0 %	0 %	315230398
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10051	NC_014804	TGA	2	6	545557	545562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230398
10052	NC_014804	A	6	6	545571	545576	100 %	0 %	0 %	0 %	315230398
10053	NC_014804	GAG	2	6	545685	545690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230398
10054	NC_014804	TCC	2	6	545744	545749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10055	NC_014804	TTC	2	6	545750	545755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230398
10056	NC_014804	CTC	2	6	545796	545801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230398
10057	NC_014804	ACTC	2	8	546006	546013	25 %	25 %	0 %	50 %	315230399
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10060	NC_014804	TG	3	6	546052	546057	0 %	50 %	50 %	0 %	315230399
10061	NC_014804	CTC	2	6	546134	546139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230399
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10063	NC_014804	TCA	2	6	546209	546214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230399
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10070	NC_014804	TCC	2	6	546646	546651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230399
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10072	NC_014804	CCT	2	6	546743	546748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230399
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10080	NC_014804	GAAGGG	2	12	546962	546973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230399
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10083	NC_014804	TTCA	2	8	547016	547023	25 %	50 %	0 %	25 %	315230399
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10091	NC_014804	GAA	2	6	547537	547542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230400
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10101	NC_014804	GGA	2	6	548103	548108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230401
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10103	NC_014804	GTT	2	6	548297	548302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230402
10104	NC_014804	ATC	2	6	548394	548399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230402
10105	NC_014804	GAG	2	6	548444	548449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230402
10106	NC_014804	TGAAAA	2	12	548515	548526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315230402
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10108	NC_014804	TCAT	2	8	548598	548605	25 %	50 %	0 %	25 %	315230402
10109	NC_014804	AG	3	6	548609	548614	50 %	0 %	50 %	0 %	315230402
10110	NC_014804	GTA	2	6	548870	548875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230402
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10112	NC_014804	AG	3	6	548920	548925	50 %	0 %	50 %	0 %	315230402
10113	NC_014804	CAT	2	6	548984	548989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230403
10114	NC_014804	AG	3	6	549012	549017	50 %	0 %	50 %	0 %	315230403
10115	NC_014804	TCAT	2	8	549051	549058	25 %	50 %	0 %	25 %	315230403
10116	NC_014804	TTG	2	6	549100	549105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230403
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10119	NC_014804	GCTT	2	8	549184	549191	0 %	50 %	25 %	25 %	315230403
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10241	NC_014804	T	6	6	555335	555340	0 %	100 %	0 %	0 %	315230410
10242	NC_014804	AAAG	2	8	555384	555391	75 %	0 %	25 %	0 %	315230410
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10366	NC_014804	TCA	3	9	562016	562024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230418
10367	NC_014804	TTC	2	6	562093	562098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230418
10368	NC_014804	TTG	2	6	562164	562169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230418
10369	NC_014804	TCC	3	9	562192	562200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230418
10370	NC_014804	GCC	2	6	562273	562278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230418
10371	NC_014804	TGT	2	6	562326	562331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230418
10372	NC_014804	GTA	2	6	562354	562359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230418
10373	NC_014804	ATTCCA	2	12	562388	562399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230418
10374	NC_014804	AATC	2	8	562533	562540	50 %	25 %	0 %	25 %	315230418
10375	NC_014804	GGT	2	6	562547	562552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230418
10376	NC_014804	CTT	2	6	562677	562682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230418
10377	NC_014804	TTA	2	6	562686	562691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230418
10378	NC_014804	ATA	2	6	562741	562746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230418
10379	NC_014804	TTTCC	2	10	562768	562777	0 %	60 %	0 %	40 %	315230418
10380	NC_014804	AT	3	6	562834	562839	50 %	50 %	0 %	0 %	315230418
10381	NC_014804	GCA	2	6	562841	562846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230418
10382	NC_014804	T	6	6	562954	562959	0 %	100 %	0 %	0 %	315230418
10383	NC_014804	GA	3	6	563003	563008	50 %	0 %	50 %	0 %	315230418
10384	NC_014804	ACA	2	6	563039	563044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230418
10385	NC_014804	TCAC	2	8	563063	563070	25 %	25 %	0 %	50 %	315230419
10386	NC_014804	CCT	2	6	563071	563076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230419
10387	NC_014804	TCG	2	6	563154	563159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230419
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10389	NC_014804	CTT	2	6	563176	563181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230419
10390	NC_014804	CTT	2	6	563366	563371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230420
10391	NC_014804	CCTC	2	8	563377	563384	0 %	25 %	0 %	75 %	315230420
10392	NC_014804	CAG	2	6	563552	563557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230420
10393	NC_014804	AAAT	2	8	563696	563703	75 %	25 %	0 %	0 %	315230420
10394	NC_014804	ACA	2	6	563718	563723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230420
10395	NC_014804	CCTT	2	8	563778	563785	0 %	50 %	0 %	50 %	315230420
10396	NC_014804	GAG	2	6	563798	563803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230420
10397	NC_014804	TCCC	2	8	563804	563811	0 %	25 %	0 %	75 %	315230420
10398	NC_014804	TAA	2	6	563870	563875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230420
10399	NC_014804	TC	3	6	563916	563921	0 %	50 %	0 %	50 %	315230420
10400	NC_014804	AT	3	6	563947	563952	50 %	50 %	0 %	0 %	315230420
10401	NC_014804	AAG	2	6	564136	564141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230421
10402	NC_014804	AG	3	6	564148	564153	50 %	0 %	50 %	0 %	315230421
10403	NC_014804	CTAA	2	8	564169	564176	50 %	25 %	0 %	25 %	315230421
10404	NC_014804	AGC	2	6	564236	564241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230421
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10412	NC_014804	CTAAAT	2	12	564984	564995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315230422
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10423	NC_014804	TCA	2	6	565503	565508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230423
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10426	NC_014804	TCT	2	6	565611	565616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230423
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10435	NC_014804	AAT	2	6	565999	566004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230424
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10437	NC_014804	TCC	2	6	566030	566035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230424
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10444	NC_014804	ACC	2	6	566362	566367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230424
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10457	NC_014804	A	6	6	566787	566792	100 %	0 %	0 %	0 %	315230425
10458	NC_014804	TGA	2	6	566801	566806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230425
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10469	NC_014804	AAGC	2	8	567193	567200	50 %	0 %	25 %	25 %	315230426
10470	NC_014804	ATG	2	6	567247	567252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230427
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10472	NC_014804	A	6	6	567295	567300	100 %	0 %	0 %	0 %	315230427
10473	NC_014804	T	6	6	567307	567312	0 %	100 %	0 %	0 %	315230427
10474	NC_014804	ACTTG	2	10	567341	567350	20 %	40 %	20 %	20 %	315230427
10475	NC_014804	A	6	6	567501	567506	100 %	0 %	0 %	0 %	315230427
10476	NC_014804	TGAA	2	8	567571	567578	50 %	25 %	25 %	0 %	315230427
10477	NC_014804	AGG	2	6	567599	567604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230427
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10479	NC_014804	CAT	2	6	567784	567789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230427
10480	NC_014804	TTG	2	6	567799	567804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230427
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10482	NC_014804	AAG	2	6	567882	567887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230427
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10484	NC_014804	TCA	2	6	567987	567992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230428
10485	NC_014804	AG	3	6	568037	568042	50 %	0 %	50 %	0 %	315230428
10486	NC_014804	GCT	2	6	568057	568062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230428
10487	NC_014804	ACG	2	6	568092	568097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230428
10488	NC_014804	TAT	2	6	568102	568107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230428
10489	NC_014804	AGA	2	6	568122	568127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230428
10490	NC_014804	CAC	2	6	568148	568153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230428
10491	NC_014804	A	7	7	568213	568219	100 %	0 %	0 %	0 %	315230428
10492	NC_014804	GAA	2	6	568238	568243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230428
10493	NC_014804	GAC	2	6	568274	568279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230428
10494	NC_014804	AAAC	2	8	568294	568301	75 %	0 %	0 %	25 %	315230428
10495	NC_014804	TAA	2	6	568371	568376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230429
10496	NC_014804	TA	3	6	568411	568416	50 %	50 %	0 %	0 %	315230429
10497	NC_014804	CTT	2	6	568485	568490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230429
10498	NC_014804	ATG	2	6	568508	568513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230429
10499	NC_014804	AT	3	6	568517	568522	50 %	50 %	0 %	0 %	315230429
10500	NC_014804	TGC	2	6	568531	568536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230429

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