MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014804	TTC	3	9	268757	268765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230083
5002	NC_014804	TGG	2	6	268937	268942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230084
5003	NC_014804	ATG	2	6	269009	269014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230084
5004	NC_014804	TTA	2	6	269015	269020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230084
5005	NC_014804	AG	3	6	269238	269243	50 %	0 %	50 %	0 %	315230084
5006	NC_014804	A	6	6	269368	269373	100 %	0 %	0 %	0 %	315230084
5007	NC_014804	GAT	2	6	269475	269480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230085
5008	NC_014804	AAG	2	6	269586	269591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230085
5009	NC_014804	ATA	2	6	269607	269612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230085
5010	NC_014804	GAA	2	6	269778	269783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230085
5011	NC_014804	AAT	2	6	269789	269794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230085
5012	NC_014804	TTGG	2	8	269799	269806	0 %	50 %	50 %	0 %	315230085
5013	NC_014804	AGA	2	6	269840	269845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230085
5014	NC_014804	AGG	2	6	269872	269877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230085
5015	NC_014804	ATT	2	6	269919	269924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230085
5016	NC_014804	AGA	2	6	269988	269993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230086
5017	NC_014804	GAA	2	6	270147	270152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230086
5018	NC_014804	AGA	2	6	270224	270229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230086
5019	NC_014804	TAA	2	6	270287	270292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230086
5020	NC_014804	CA	3	6	270376	270381	50 %	0 %	0 %	50 %	315230086
5021	NC_014804	GA	3	6	270392	270397	50 %	0 %	50 %	0 %	315230086
5022	NC_014804	AGA	3	9	270395	270403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230086
5023	NC_014804	AAG	2	6	270518	270523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230087
5024	NC_014804	TTG	2	6	270552	270557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230087
5025	NC_014804	ATC	2	6	270566	270571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230087
5026	NC_014804	TTG	2	6	270573	270578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230087
5027	NC_014804	TTA	2	6	270622	270627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230087
5028	NC_014804	AAC	2	6	270659	270664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230087
5029	NC_014804	TAA	2	6	270705	270710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230087
5030	NC_014804	TAA	2	6	270831	270836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230087
5031	NC_014804	ATT	2	6	270864	270869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230087
5032	NC_014804	ATT	2	6	270876	270881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230087
5033	NC_014804	GGA	2	6	270895	270900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230087
5034	NC_014804	TAT	2	6	271030	271035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230088
5035	NC_014804	CCA	2	6	271049	271054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230088
5036	NC_014804	CTT	2	6	271081	271086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230088
5037	NC_014804	TTCT	2	8	271088	271095	0 %	75 %	0 %	25 %	315230088
5038	NC_014804	TGG	2	6	271100	271105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230088
5039	NC_014804	GGC	2	6	271177	271182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230088
5040	NC_014804	ATA	2	6	271219	271224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230088
5041	NC_014804	GA	4	8	271246	271253	50 %	0 %	50 %	0 %	315230088
5042	NC_014804	TCT	2	6	271264	271269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230088
5043	NC_014804	AG	3	6	271379	271384	50 %	0 %	50 %	0 %	315230088
5044	NC_014804	GAA	2	6	271468	271473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230088
5045	NC_014804	AATA	2	8	271537	271544	75 %	25 %	0 %	0 %	315230088
5046	NC_014804	GAA	2	6	271599	271604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230088
5047	NC_014804	GAA	2	6	271810	271815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230088
5048	NC_014804	TTCC	2	8	271858	271865	0 %	50 %	0 %	50 %	315230088
5049	NC_014804	TTGAA	2	10	271917	271926	40 %	40 %	20 %	0 %	315230089
5050	NC_014804	TC	3	6	272019	272024	0 %	50 %	0 %	50 %	315230089
5051	NC_014804	T	6	6	272036	272041	0 %	100 %	0 %	0 %	315230089
5052	NC_014804	TGA	2	6	272149	272154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230089
5053	NC_014804	CCT	2	6	272155	272160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230089
5054	NC_014804	TGA	2	6	272200	272205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230089
5055	NC_014804	CT	3	6	272215	272220	0 %	50 %	0 %	50 %	315230089
5056	NC_014804	GCT	2	6	272221	272226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230089
5057	NC_014804	TA	3	6	272279	272284	50 %	50 %	0 %	0 %	315230089
5058	NC_014804	GCC	2	6	272295	272300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230089
5059	NC_014804	GCA	2	6	272319	272324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230089
5060	NC_014804	TTTCT	2	10	272349	272358	0 %	80 %	0 %	20 %	315230089
5061	NC_014804	TTTG	2	8	272408	272415	0 %	75 %	25 %	0 %	315230089
5062	NC_014804	TAT	3	9	272420	272428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230089
5063	NC_014804	TTAT	2	8	272433	272440	25 %	75 %	0 %	0 %	315230089
5064	NC_014804	GTTT	2	8	272507	272514	0 %	75 %	25 %	0 %	315230089
5065	NC_014804	TCC	2	6	272535	272540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230089
5066	NC_014804	TTC	2	6	272631	272636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230089
5067	NC_014804	AT	3	6	272648	272653	50 %	50 %	0 %	0 %	315230089
5068	NC_014804	AGT	2	6	272656	272661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230089
5069	NC_014804	GTC	2	6	272783	272788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230089
5070	NC_014804	ATCA	2	8	272846	272853	50 %	25 %	0 %	25 %	315230089
5071	NC_014804	ACA	2	6	273060	273065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230089
5072	NC_014804	AGG	2	6	273133	273138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230090
5073	NC_014804	CT	3	6	273160	273165	0 %	50 %	0 %	50 %	315230090
5074	NC_014804	CAT	2	6	273224	273229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230090
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5077	NC_014804	CT	3	6	273386	273391	0 %	50 %	0 %	50 %	315230090
5078	NC_014804	CTT	2	6	273461	273466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230090
5079	NC_014804	GCC	2	6	273597	273602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230090
5080	NC_014804	TTC	2	6	273644	273649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230090
5081	NC_014804	CTT	2	6	273698	273703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230090
5082	NC_014804	TTC	2	6	273821	273826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230090
5083	NC_014804	CTT	2	6	273979	273984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230090
5084	NC_014804	ATG	2	6	274021	274026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230090
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5086	NC_014804	GTTA	2	8	274095	274102	25 %	50 %	25 %	0 %	315230090
5087	NC_014804	CATG	2	8	274142	274149	25 %	25 %	25 %	25 %	315230090
5088	NC_014804	GAA	2	6	274368	274373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230091
5089	NC_014804	TGTGG	2	10	274397	274406	0 %	40 %	60 %	0 %	315230091
5090	NC_014804	G	6	6	274566	274571	0 %	0 %	100 %	0 %	315230091
5091	NC_014804	AG	3	6	274578	274583	50 %	0 %	50 %	0 %	315230091
5092	NC_014804	A	6	6	274698	274703	100 %	0 %	0 %	0 %	315230091
5093	NC_014804	ATT	2	6	274708	274713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230091
5094	NC_014804	TCC	3	9	274720	274728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230091
5095	NC_014804	AAC	2	6	274743	274748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230091
5096	NC_014804	GATAA	2	10	274764	274773	60 %	20 %	20 %	0 %	315230091
5097	NC_014804	AGA	2	6	274793	274798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230091
5098	NC_014804	CA	3	6	274842	274847	50 %	0 %	0 %	50 %	315230091
5099	NC_014804	AGA	2	6	274854	274859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230091
5100	NC_014804	GAA	2	6	274938	274943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230091
5101	NC_014804	AG	3	6	274962	274967	50 %	0 %	50 %	0 %	315230091
5102	NC_014804	CTG	2	6	275199	275204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230091
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5104	NC_014804	TAT	2	6	275235	275240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230091
5105	NC_014804	AAAAG	2	10	275244	275253	80 %	0 %	20 %	0 %	315230091
5106	NC_014804	CATC	2	8	275302	275309	25 %	25 %	0 %	50 %	315230092
5107	NC_014804	CAGC	2	8	275367	275374	25 %	0 %	25 %	50 %	315230092
5108	NC_014804	ATG	2	6	275376	275381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230092
5109	NC_014804	CAG	2	6	275417	275422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230092
5110	NC_014804	TAT	2	6	275507	275512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230092
5111	NC_014804	CTT	2	6	275525	275530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230092
5112	NC_014804	CT	3	6	275539	275544	0 %	50 %	0 %	50 %	315230092
5113	NC_014804	CAG	2	6	275579	275584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230092
5114	NC_014804	TTC	2	6	275627	275632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230092
5115	NC_014804	CT	3	6	275662	275667	0 %	50 %	0 %	50 %	315230092
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5119	NC_014804	TTG	2	6	275820	275825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230092
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5121	NC_014804	TAT	2	6	275933	275938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230092
5122	NC_014804	T	6	6	275938	275943	0 %	100 %	0 %	0 %	315230092
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5124	NC_014804	ATA	2	6	276014	276019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230093
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5246	NC_014804	ACA	2	6	281174	281179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230096
5247	NC_014804	ACT	2	6	281235	281240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230096
5248	NC_014804	AGA	2	6	281245	281250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230096
5249	NC_014804	AGG	2	6	281267	281272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230096
5250	NC_014804	CGA	2	6	281334	281339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230096
5251	NC_014804	TGG	2	6	281474	281479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230096
5252	NC_014804	TCCT	2	8	281660	281667	0 %	50 %	0 %	50 %	315230097
5253	NC_014804	T	6	6	281675	281680	0 %	100 %	0 %	0 %	315230097
5254	NC_014804	AATCA	2	10	281684	281693	60 %	20 %	0 %	20 %	315230097
5255	NC_014804	GTT	2	6	281714	281719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230097
5256	NC_014804	GAT	2	6	281822	281827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230097
5257	NC_014804	TCA	2	6	281835	281840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230097
5258	NC_014804	CT	3	6	281885	281890	0 %	50 %	0 %	50 %	315230097
5259	NC_014804	CTT	2	6	281942	281947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230097
5260	NC_014804	T	6	6	281946	281951	0 %	100 %	0 %	0 %	315230097
5261	NC_014804	TTAGCT	2	12	281967	281978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315230097
5262	NC_014804	TTC	2	6	282063	282068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230097
5263	NC_014804	TATC	2	8	282097	282104	25 %	50 %	0 %	25 %	315230097
5264	NC_014804	TAT	2	6	282153	282158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230098
5265	NC_014804	ATGC	2	8	282255	282262	25 %	25 %	25 %	25 %	315230098
5266	NC_014804	CTT	2	6	282317	282322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230098
5267	NC_014804	CTT	2	6	282375	282380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230098
5268	NC_014804	AAC	2	6	282402	282407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230098
5269	NC_014804	T	6	6	282443	282448	0 %	100 %	0 %	0 %	315230098
5270	NC_014804	TTA	2	6	282476	282481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230098
5271	NC_014804	CT	3	6	282540	282545	0 %	50 %	0 %	50 %	315230098
5272	NC_014804	TGT	2	6	282563	282568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230098
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5275	NC_014804	ATC	2	6	282792	282797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230098
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5277	NC_014804	CGT	2	6	282988	282993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230099
5278	NC_014804	ATC	2	6	283250	283255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230099
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5280	NC_014804	T	6	6	283272	283277	0 %	100 %	0 %	0 %	315230100
5281	NC_014804	ATTT	2	8	283356	283363	25 %	75 %	0 %	0 %	315230100
5282	NC_014804	TA	3	6	283392	283397	50 %	50 %	0 %	0 %	315230100
5283	NC_014804	GTAT	2	8	283400	283407	25 %	50 %	25 %	0 %	315230100
5284	NC_014804	AC	3	6	283446	283451	50 %	0 %	0 %	50 %	315230100
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5287	NC_014804	ATCTTC	2	12	283566	283577	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	315230100
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5293	NC_014804	TTTG	2	8	283773	283780	0 %	75 %	25 %	0 %	315230100
5294	NC_014804	TCC	2	6	283805	283810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230100
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5304	NC_014804	TGA	2	6	284340	284345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230101
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5309	NC_014804	CGG	2	6	284646	284651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230101
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5312	NC_014804	TTATG	2	10	284715	284724	20 %	60 %	20 %	0 %	315230101
5313	NC_014804	TGC	2	6	284730	284735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230101
5314	NC_014804	GATT	2	8	284747	284754	25 %	50 %	25 %	0 %	315230101
5315	NC_014804	GGA	2	6	284758	284763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230101
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5320	NC_014804	CCA	2	6	284928	284933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230101
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5322	NC_014804	GCG	2	6	284956	284961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230101
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5324	NC_014804	CCA	2	6	285084	285089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230101
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5327	NC_014804	ATG	2	6	285262	285267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230101
5328	NC_014804	GAC	2	6	285271	285276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230101
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5330	NC_014804	GAAG	2	8	285342	285349	50 %	0 %	50 %	0 %	315230101
5331	NC_014804	CTA	2	6	285381	285386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230101
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5335	NC_014804	TGT	2	6	285668	285673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230102
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5338	NC_014804	TTGA	2	8	285917	285924	25 %	50 %	25 %	0 %	315230102
5339	NC_014804	AGG	2	6	285987	285992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230102
5340	NC_014804	TTC	2	6	286120	286125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230103
5341	NC_014804	TGA	2	6	286191	286196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230103
5342	NC_014804	CCT	2	6	286222	286227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230103
5343	NC_014804	ATA	2	6	286240	286245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230103
5344	NC_014804	AG	3	6	286501	286506	50 %	0 %	50 %	0 %	315230104
5345	NC_014804	TTTG	2	8	286512	286519	0 %	75 %	25 %	0 %	315230104
5346	NC_014804	GCT	2	6	286557	286562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230104
5347	NC_014804	ATT	2	6	286614	286619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230104
5348	NC_014804	TGG	2	6	286689	286694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230104
5349	NC_014804	GGA	2	6	286765	286770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230104
5350	NC_014804	TGA	2	6	286779	286784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230104
5351	NC_014804	AAG	2	6	286810	286815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230105
5352	NC_014804	AAAG	2	8	286904	286911	75 %	0 %	25 %	0 %	315230105
5353	NC_014804	AGCA	2	8	287013	287020	50 %	0 %	25 %	25 %	315230106
5354	NC_014804	TGAT	2	8	287024	287031	25 %	50 %	25 %	0 %	315230106
5355	NC_014804	AGC	2	6	287034	287039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230106
5356	NC_014804	GAA	2	6	287152	287157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230106
5357	NC_014804	A	6	6	287230	287235	100 %	0 %	0 %	0 %	315230106
5358	NC_014804	GAG	2	6	287239	287244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230106
5359	NC_014804	CAA	2	6	287276	287281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230106
5360	NC_014804	AGCTTG	2	12	287315	287326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315230106
5361	NC_014804	GTT	2	6	287359	287364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230106
5362	NC_014804	AG	3	6	287434	287439	50 %	0 %	50 %	0 %	315230106
5363	NC_014804	GA	3	6	287465	287470	50 %	0 %	50 %	0 %	315230106
5364	NC_014804	GCTT	2	8	287510	287517	0 %	50 %	25 %	25 %	315230106
5365	NC_014804	AGG	2	6	287531	287536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230106
5366	NC_014804	TCA	2	6	287606	287611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230106
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5368	NC_014804	AG	3	6	287774	287779	50 %	0 %	50 %	0 %	315230107
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5491	NC_014804	GAA	2	6	293582	293587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230111
5492	NC_014804	GTG	2	6	293673	293678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230112
5493	NC_014804	AG	3	6	293717	293722	50 %	0 %	50 %	0 %	315230112
5494	NC_014804	TTG	2	6	293726	293731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230112
5495	NC_014804	GTT	2	6	293755	293760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230112
5496	NC_014804	ATC	2	6	293761	293766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230112
5497	NC_014804	GCAG	2	8	293778	293785	25 %	0 %	50 %	25 %	315230112
5498	NC_014804	GGAGAT	2	12	293902	293913	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	315230112
5499	NC_014804	AAG	2	6	293952	293957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230112
5500	NC_014804	GGCA	2	8	294014	294021	25 %	0 %	50 %	25 %	315230112

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