MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X513 chromosome

Total Repeats: 50230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014538	ATC	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723219
2	NC_014538	CCA	2	6	163	168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307723219
3	NC_014538	ACA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307723219
4	NC_014538	ATT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723219
5	NC_014538	GAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723219
6	NC_014538	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	307723219
7	NC_014538	TAA	2	6	259	264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723219
8	NC_014538	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	307723219
9	NC_014538	ACG	2	6	289	294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723219
10	NC_014538	AAAT	2	8	311	318	75 %	25 %	0 %	0 %	307723219
11	NC_014538	AGA	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
12	NC_014538	GAA	3	9	348	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
13	NC_014538	ACT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723219
14	NC_014538	TTTA	2	8	527	534	25 %	75 %	0 %	0 %	307723219
15	NC_014538	GGA	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307723219
16	NC_014538	ATGC	2	8	570	577	25 %	25 %	25 %	25 %	307723219
17	NC_014538	TACGT	2	10	624	633	20 %	40 %	20 %	20 %	307723219
18	NC_014538	AGTT	2	8	652	659	25 %	50 %	25 %	0 %	307723219
19	NC_014538	GAC	2	6	672	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723219
20	NC_014538	GAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
21	NC_014538	TTC	2	6	718	723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307723219
22	NC_014538	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723219
23	NC_014538	A	6	6	750	755	100 %	0 %	0 %	0 %	307723219
24	NC_014538	GAAC	2	8	756	763	50 %	0 %	25 %	25 %	307723219
25	NC_014538	AAG	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
26	NC_014538	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307723219
27	NC_014538	ACC	2	6	836	841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307723219
28	NC_014538	AGA	2	6	860	865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
29	NC_014538	CCA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307723219
30	NC_014538	CGA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723219
31	NC_014538	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	307723219
32	NC_014538	TCAA	2	8	1013	1020	50 %	25 %	0 %	25 %	307723219
33	NC_014538	AG	3	6	1026	1031	50 %	0 %	50 %	0 %	307723219
34	NC_014538	TAA	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723219
35	NC_014538	TAA	2	6	1130	1135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723219
36	NC_014538	GA	3	6	1139	1144	50 %	0 %	50 %	0 %	307723219
37	NC_014538	GAA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
38	NC_014538	AGA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
39	NC_014538	A	6	6	1226	1231	100 %	0 %	0 %	0 %	307723219
40	NC_014538	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723219
41	NC_014538	TAC	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723219
42	NC_014538	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	307723219
43	NC_014538	TC	3	6	1382	1387	0 %	50 %	0 %	50 %	307723219
44	NC_014538	A	7	7	1660	1666	100 %	0 %	0 %	0 %	307723220
45	NC_014538	TG	4	8	1674	1681	0 %	50 %	50 %	0 %	307723220
46	NC_014538	ATT	2	6	1692	1697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723220
47	NC_014538	G	6	6	1721	1726	0 %	0 %	100 %	0 %	307723220
48	NC_014538	ACT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723220
49	NC_014538	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307723220
50	NC_014538	GTCAA	2	10	1784	1793	40 %	20 %	20 %	20 %	307723220
51	NC_014538	AGA	3	9	1848	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723220
52	NC_014538	TAG	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723220
53	NC_014538	TAA	2	6	2075	2080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723220
54	NC_014538	TA	3	6	2196	2201	50 %	50 %	0 %	0 %	307723220
55	NC_014538	AGA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723220
56	NC_014538	GAAG	2	8	2389	2396	50 %	0 %	50 %	0 %	307723220
57	NC_014538	AAT	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723220
58	NC_014538	TTA	2	6	2543	2548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723220
59	NC_014538	TCT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307723220
60	NC_014538	GAT	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723220
61	NC_014538	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	307723220
62	NC_014538	TTA	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723220
63	NC_014538	GAA	3	9	2671	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723220
64	NC_014538	TAA	3	9	2714	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723220
65	NC_014538	AT	3	6	2825	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	307723221
66	NC_014538	GGA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307723221
67	NC_014538	AAGCA	2	10	2881	2890	60 %	0 %	20 %	20 %	307723221
68	NC_014538	ATTT	2	8	2891	2898	25 %	75 %	0 %	0 %	307723221
69	NC_014538	A	6	6	2946	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	307723221
70	NC_014538	A	6	6	3065	3070	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
71	NC_014538	AATA	2	8	3087	3094	75 %	25 %	0 %	0 %	307723222
72	NC_014538	TTA	2	6	3130	3135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723222
73	NC_014538	TAA	2	6	3194	3199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723222
74	NC_014538	ATT	2	6	3212	3217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723222
75	NC_014538	A	7	7	3256	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
76	NC_014538	AATAA	2	10	3313	3322	80 %	20 %	0 %	0 %	307723222
77	NC_014538	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	307723222
78	NC_014538	ATA	2	6	3385	3390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723222
79	NC_014538	AAG	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723222
80	NC_014538	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307723222
81	NC_014538	AAAAGT	2	12	3529	3540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307723222
82	NC_014538	TGA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723222
83	NC_014538	TAG	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723222
84	NC_014538	TGA	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723222
85	NC_014538	ATT	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723222
86	NC_014538	A	6	6	3612	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
87	NC_014538	A	7	7	3633	3639	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
88	NC_014538	CAG	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723222
89	NC_014538	GAA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723222
90	NC_014538	A	7	7	3727	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
91	NC_014538	ACA	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307723222
92	NC_014538	ATT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723222
93	NC_014538	TTC	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307723222
94	NC_014538	A	6	6	3915	3920	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
95	NC_014538	A	7	7	3984	3990	100 %	0 %	0 %	0 %	307723222
96	NC_014538	TAC	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723222
97	NC_014538	GTT	2	6	4087	4092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307723222
98	NC_014538	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	307723223
99	NC_014538	GGC	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307723223
100	NC_014538	ACT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723223
101	NC_014538	GAA	3	9	4230	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723223
102	NC_014538	TAT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723223
103	NC_014538	TTAT	3	12	4309	4320	25 %	75 %	0 %	0 %	307723223
104	NC_014538	AAG	2	6	4346	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723223
105	NC_014538	A	6	6	4357	4362	100 %	0 %	0 %	0 %	307723223
106	NC_014538	A	6	6	4393	4398	100 %	0 %	0 %	0 %	307723224
107	NC_014538	TTG	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307723224
108	NC_014538	AAG	2	6	4431	4436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
109	NC_014538	ATT	2	6	4464	4469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723224
110	NC_014538	A	6	6	4495	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	307723224
111	NC_014538	GAAAG	2	10	4521	4530	60 %	0 %	40 %	0 %	307723224
112	NC_014538	AAGAA	2	10	4556	4565	80 %	0 %	20 %	0 %	307723224
113	NC_014538	ATAA	2	8	4608	4615	75 %	25 %	0 %	0 %	307723224
114	NC_014538	TAAT	2	8	4657	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	307723224
115	NC_014538	GGA	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307723224
116	NC_014538	AGA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
117	NC_014538	A	6	6	4773	4778	100 %	0 %	0 %	0 %	307723224
118	NC_014538	T	6	6	4859	4864	0 %	100 %	0 %	0 %	307723224
119	NC_014538	T	7	7	4922	4928	0 %	100 %	0 %	0 %	307723224
120	NC_014538	TAT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723224
121	NC_014538	ATT	2	6	4987	4992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723224
122	NC_014538	TTTA	2	8	4995	5002	25 %	75 %	0 %	0 %	307723224
123	NC_014538	CAG	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723224
124	NC_014538	AG	4	8	5117	5124	50 %	0 %	50 %	0 %	307723224
125	NC_014538	AT	3	6	5175	5180	50 %	50 %	0 %	0 %	307723224
126	NC_014538	AGC	2	6	5260	5265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307723224
127	NC_014538	AGT	2	6	5285	5290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723224
128	NC_014538	GAG	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307723224
129	NC_014538	ATT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307723224
130	NC_014538	AAG	3	9	5440	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
131	NC_014538	TGG	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307723224
132	NC_014538	G	6	6	5461	5466	0 %	0 %	100 %	0 %	307723224
133	NC_014538	ATGA	2	8	5517	5524	50 %	25 %	25 %	0 %	307723224
134	NC_014538	CTA	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307723224
135	NC_014538	ATA	2	6	5566	5571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307723224
136	NC_014538	AAG	2	6	5605	5610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
137	NC_014538	TATGGC	2	12	5633	5644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307723224
138	NC_014538	GCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307723224
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140	NC_014538	CTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307723224
141	NC_014538	ATG	3	9	5778	5786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723224
142	NC_014538	GAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
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144	NC_014538	CTTA	2	8	6022	6029	25 %	50 %	0 %	25 %	307723224
145	NC_014538	AAG	2	6	6097	6102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307723224
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263	NC_014538	A	7	7	11204	11210	100 %	0 %	0 %	0 %	307723228
264	NC_014538	GTT	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307723228
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267	NC_014538	C	6	6	11359	11364	0 %	0 %	0 %	100 %	307723228
268	NC_014538	ATAA	2	8	11426	11433	75 %	25 %	0 %	0 %	307723228
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400	NC_014538	GTAGAT	2	12	17810	17821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307723233
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