MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014410	AATGAA	2	12	215994	216005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304315733
4002	NC_014410	GATG	2	8	216008	216015	25 %	25 %	50 %	0 %	304315733
4003	NC_014410	ATT	2	6	216048	216053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315733
4004	NC_014410	AGA	2	6	216056	216061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315733
4005	NC_014410	TACGAT	2	12	216156	216167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304315733
4006	NC_014410	AG	3	6	216240	216245	50 %	0 %	50 %	0 %	304315733
4007	NC_014410	AT	3	6	216260	216265	50 %	50 %	0 %	0 %	304315733
4008	NC_014410	TGAAT	2	10	216338	216347	40 %	40 %	20 %	0 %	304315733
4009	NC_014410	GAA	2	6	216499	216504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315734
4010	NC_014410	A	6	6	216590	216595	100 %	0 %	0 %	0 %	304315734
4011	NC_014410	TAC	2	6	216602	216607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315734
4012	NC_014410	TA	3	6	216608	216613	50 %	50 %	0 %	0 %	304315734
4013	NC_014410	GAG	2	6	216620	216625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315734
4014	NC_014410	TGA	2	6	216690	216695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315734
4015	NC_014410	GAT	2	6	216718	216723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315734
4016	NC_014410	AAAT	2	8	216801	216808	75 %	25 %	0 %	0 %	304315734
4017	NC_014410	TGG	2	6	216826	216831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315734
4018	NC_014410	GTA	2	6	216872	216877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315734
4019	NC_014410	TTAA	2	8	216912	216919	50 %	50 %	0 %	0 %	304315734
4020	NC_014410	ATA	2	6	216925	216930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315735
4021	NC_014410	AGA	2	6	217013	217018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315735
4022	NC_014410	AGA	2	6	217037	217042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315735
4023	NC_014410	ATA	2	6	217134	217139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315735
4024	NC_014410	GCTTAA	2	12	217148	217159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304315735
4025	NC_014410	ATC	2	6	217388	217393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315735
4026	NC_014410	AG	3	6	217425	217430	50 %	0 %	50 %	0 %	304315735
4027	NC_014410	TA	3	6	217434	217439	50 %	50 %	0 %	0 %	304315735
4028	NC_014410	ATG	2	6	217441	217446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315735
4029	NC_014410	TGC	2	6	217604	217609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315735
4030	NC_014410	AGA	2	6	217613	217618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315735
4031	NC_014410	AGG	2	6	217672	217677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315735
4032	NC_014410	GCG	2	6	217738	217743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315735
4033	NC_014410	AAAT	2	8	217907	217914	75 %	25 %	0 %	0 %	304315735
4034	NC_014410	AT	3	6	217945	217950	50 %	50 %	0 %	0 %	304315735
4035	NC_014410	AAG	2	6	218068	218073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315735
4036	NC_014410	GA	3	6	218114	218119	50 %	0 %	50 %	0 %	304315735
4037	NC_014410	GCC	2	6	218145	218150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304315735
4038	NC_014410	TTC	2	6	218154	218159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315735
4039	NC_014410	ATA	2	6	218274	218279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315735
4040	NC_014410	GAT	2	6	218310	218315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315735
4041	NC_014410	GAA	2	6	218346	218351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315735
4042	NC_014410	TTAA	2	8	218364	218371	50 %	50 %	0 %	0 %	304315735
4043	NC_014410	AGC	2	6	218405	218410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315735
4044	NC_014410	CA	3	6	218425	218430	50 %	0 %	0 %	50 %	304315735
4045	NC_014410	TA	3	6	218442	218447	50 %	50 %	0 %	0 %	304315735
4046	NC_014410	CA	3	6	218469	218474	50 %	0 %	0 %	50 %	304315735
4047	NC_014410	TGA	2	6	218504	218509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315735
4048	NC_014410	TGA	2	6	218515	218520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315735
4049	NC_014410	CAA	2	6	218545	218550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315735
4050	NC_014410	TAA	2	6	218557	218562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315735
4051	NC_014410	CAT	2	6	218872	218877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315736
4052	NC_014410	ATT	2	6	218899	218904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315736
4053	NC_014410	ACA	2	6	218948	218953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315736
4054	NC_014410	ATG	3	9	218995	219003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315736
4055	NC_014410	TGA	2	6	219136	219141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315736
4056	NC_014410	TAC	2	6	219156	219161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315736
4057	NC_014410	TGA	2	6	219167	219172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315736
4058	NC_014410	TGG	2	6	219290	219295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315736
4059	NC_014410	A	6	6	219327	219332	100 %	0 %	0 %	0 %	304315736
4060	NC_014410	TAAA	2	8	219374	219381	75 %	25 %	0 %	0 %	304315736
4061	NC_014410	ACA	2	6	220075	220080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315737
4062	NC_014410	GAA	2	6	220095	220100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315737
4063	NC_014410	GA	3	6	220102	220107	50 %	0 %	50 %	0 %	304315737
4064	NC_014410	A	6	6	220191	220196	100 %	0 %	0 %	0 %	304315737
4065	NC_014410	TA	3	6	220198	220203	50 %	50 %	0 %	0 %	304315737
4066	NC_014410	AT	3	6	220363	220368	50 %	50 %	0 %	0 %	304315738
4067	NC_014410	TAA	2	6	220510	220515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315738
4068	NC_014410	TAA	2	6	220585	220590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315738
4069	NC_014410	GTG	2	6	220615	220620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315738
4070	NC_014410	GGA	2	6	220626	220631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315738
4071	NC_014410	ATA	2	6	220725	220730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315738
4072	NC_014410	A	6	6	220730	220735	100 %	0 %	0 %	0 %	304315738
4073	NC_014410	ATC	2	6	220761	220766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315738
4074	NC_014410	A	6	6	220865	220870	100 %	0 %	0 %	0 %	304315738
4075	NC_014410	AAT	2	6	220898	220903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315738
4076	NC_014410	GAT	2	6	220923	220928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315738
4077	NC_014410	TAT	2	6	220931	220936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315738
4078	NC_014410	AC	3	6	220972	220977	50 %	0 %	0 %	50 %	304315738
4079	NC_014410	AGA	2	6	221024	221029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315738
4080	NC_014410	AG	3	6	221145	221150	50 %	0 %	50 %	0 %	304315739
4081	NC_014410	ACAA	2	8	221171	221178	75 %	0 %	0 %	25 %	304315739
4082	NC_014410	GCGAT	2	10	221232	221241	20 %	20 %	40 %	20 %	304315739
4083	NC_014410	TTC	2	6	221242	221247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315739
4084	NC_014410	GAG	2	6	221264	221269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315739
4085	NC_014410	TTA	2	6	221273	221278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315739
4086	NC_014410	CAG	2	6	221331	221336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315739
4087	NC_014410	TATTGA	2	12	221352	221363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304315739
4088	NC_014410	CATA	2	8	221370	221377	50 %	25 %	0 %	25 %	304315739
4089	NC_014410	TGT	2	6	221416	221421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315739
4090	NC_014410	GTG	2	6	221453	221458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315739
4091	NC_014410	TGC	2	6	221464	221469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315739
4092	NC_014410	ATC	2	6	221509	221514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315739
4093	NC_014410	ATTTTT	2	12	221539	221550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304315739
4094	NC_014410	ATC	2	6	221626	221631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315739
4095	NC_014410	AAT	2	6	221671	221676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315739
4096	NC_014410	AGG	2	6	221710	221715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315739
4097	NC_014410	CTA	2	6	221727	221732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315739
4098	NC_014410	TTTC	2	8	221907	221914	0 %	75 %	0 %	25 %	304315739
4099	NC_014410	TA	3	6	221990	221995	50 %	50 %	0 %	0 %	304315739
4100	NC_014410	TAT	2	6	222017	222022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315739
4101	NC_014410	TAT	2	6	222040	222045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315739
4102	NC_014410	CAT	2	6	222097	222102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315739
4103	NC_014410	AAG	2	6	222108	222113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315739
4104	NC_014410	TAA	2	6	222133	222138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315739
4105	NC_014410	GAG	2	6	222141	222146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315739
4106	NC_014410	CAA	2	6	222192	222197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315739
4107	NC_014410	TAG	2	6	222204	222209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315739
4108	NC_014410	AAC	2	6	222307	222312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315739
4109	NC_014410	TAT	2	6	222340	222345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315739
4110	NC_014410	TAA	2	6	222381	222386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315739
4111	NC_014410	TAG	2	6	222387	222392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315739
4112	NC_014410	ATG	2	6	222455	222460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315739
4113	NC_014410	AAAC	2	8	222469	222476	75 %	0 %	0 %	25 %	304315739
4114	NC_014410	AGA	2	6	222514	222519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315739
4115	NC_014410	TAAA	2	8	222585	222592	75 %	25 %	0 %	0 %	304315739
4116	NC_014410	TGA	2	6	222661	222666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315739
4117	NC_014410	GCG	2	6	222672	222677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315739
4118	NC_014410	AGG	2	6	222689	222694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315739
4119	NC_014410	ATT	2	6	222700	222705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315739
4120	NC_014410	AGG	2	6	222746	222751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315739
4121	NC_014410	GAA	2	6	222785	222790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315739
4122	NC_014410	ATA	2	6	222870	222875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315739
4123	NC_014410	TA	4	8	222885	222892	50 %	50 %	0 %	0 %	304315739
4124	NC_014410	CTA	2	6	222930	222935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315739
4125	NC_014410	GAT	4	12	222953	222964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315739
4126	NC_014410	AGTA	2	8	222978	222985	50 %	25 %	25 %	0 %	304315739
4127	NC_014410	GAA	2	6	223033	223038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315740
4128	NC_014410	TTTA	2	8	223040	223047	25 %	75 %	0 %	0 %	304315740
4129	NC_014410	T	6	6	223055	223060	0 %	100 %	0 %	0 %	304315740
4130	NC_014410	TAA	2	6	223065	223070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315740
4131	NC_014410	TG	3	6	223071	223076	0 %	50 %	50 %	0 %	304315740
4132	NC_014410	TGA	2	6	223136	223141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315740
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4134	NC_014410	TTTG	2	8	223191	223198	0 %	75 %	25 %	0 %	304315740
4135	NC_014410	T	6	6	223294	223299	0 %	100 %	0 %	0 %	304315740
4136	NC_014410	GCA	2	6	223317	223322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315740
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4139	NC_014410	TGC	2	6	223396	223401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315740
4140	NC_014410	GACA	2	8	223440	223447	50 %	0 %	25 %	25 %	304315740
4141	NC_014410	AGC	2	6	223505	223510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315740
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4143	NC_014410	TGT	2	6	223615	223620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315740
4144	NC_014410	ATA	2	6	223779	223784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315740
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4146	NC_014410	TAT	2	6	223802	223807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315740
4147	NC_014410	ATG	2	6	223817	223822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315740
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4149	NC_014410	TCT	2	6	223881	223886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315740
4150	NC_014410	TCT	2	6	223911	223916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315740
4151	NC_014410	CAT	2	6	223948	223953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315740
4152	NC_014410	TC	3	6	223980	223985	0 %	50 %	0 %	50 %	304315740
4153	NC_014410	CTT	2	6	224016	224021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315740
4154	NC_014410	TAT	2	6	224269	224274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315741
4155	NC_014410	GTG	2	6	224277	224282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315741
4156	NC_014410	TGAAGC	2	12	224299	224310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304315741
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4161	NC_014410	AG	3	6	224566	224571	50 %	0 %	50 %	0 %	304315741
4162	NC_014410	TGGA	2	8	224606	224613	25 %	25 %	50 %	0 %	304315741
4163	NC_014410	AAGA	2	8	224621	224628	75 %	0 %	25 %	0 %	304315741
4164	NC_014410	ATG	2	6	224661	224666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315741
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4167	NC_014410	TGC	2	6	224779	224784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315741
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4183	NC_014410	TA	3	6	225551	225556	50 %	50 %	0 %	0 %	304315742
4184	NC_014410	A	7	7	225569	225575	100 %	0 %	0 %	0 %	304315742
4185	NC_014410	AG	3	6	225595	225600	50 %	0 %	50 %	0 %	304315742
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4187	NC_014410	TGA	3	9	225658	225666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315742
4188	NC_014410	TGA	2	6	225673	225678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315742
4189	NC_014410	GAC	2	6	225689	225694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315742
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4191	NC_014410	GACG	2	8	225915	225922	25 %	0 %	50 %	25 %	304315743
4192	NC_014410	TGG	2	6	226157	226162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315743
4193	NC_014410	ATC	2	6	226426	226431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315744
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4195	NC_014410	TGC	2	6	226497	226502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315744
4196	NC_014410	TAGCAA	2	12	226568	226579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304315744
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4198	NC_014410	TA	3	6	226597	226602	50 %	50 %	0 %	0 %	304315744
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4200	NC_014410	TAG	2	6	226700	226705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315744
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4226	NC_014410	TGA	2	6	227761	227766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315745
4227	NC_014410	AT	3	6	227771	227776	50 %	50 %	0 %	0 %	304315745
4228	NC_014410	TGA	2	6	227794	227799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315745
4229	NC_014410	AAGA	2	8	227813	227820	75 %	0 %	25 %	0 %	304315745
4230	NC_014410	TGAGG	2	10	227827	227836	20 %	20 %	60 %	0 %	304315745
4231	NC_014410	TGT	2	6	227851	227856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315745
4232	NC_014410	GTG	2	6	227883	227888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315745
4233	NC_014410	CTTGGA	2	12	227891	227902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304315745
4234	NC_014410	TGA	2	6	228007	228012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315745
4235	NC_014410	GTG	2	6	228087	228092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315745
4236	NC_014410	ATT	2	6	228134	228139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315745
4237	NC_014410	AAG	2	6	228159	228164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315745
4238	NC_014410	GAA	2	6	228262	228267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315745
4239	NC_014410	AGATG	2	10	228271	228280	40 %	20 %	40 %	0 %	304315745
4240	NC_014410	GAA	2	6	228293	228298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315745
4241	NC_014410	CAG	2	6	228315	228320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315745
4242	NC_014410	ATA	2	6	228345	228350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315745
4243	NC_014410	ATG	2	6	228357	228362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315745
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4492	NC_014410	GAC	2	6	240158	240163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315756
4493	NC_014410	TGT	2	6	240201	240206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315756
4494	NC_014410	AG	3	6	240232	240237	50 %	0 %	50 %	0 %	304315756
4495	NC_014410	ATT	2	6	240243	240248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315756
4496	NC_014410	TGA	2	6	240290	240295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315756
4497	NC_014410	TGA	3	9	240329	240337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315756
4498	NC_014410	TGA	2	6	240345	240350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315756
4499	NC_014410	AT	3	6	240357	240362	50 %	50 %	0 %	0 %	304315757
4500	NC_014410	CCA	2	6	240493	240498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315757

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