MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014410	TGA	2	6	52730	52735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315580
1002	NC_014410	CTT	2	6	52746	52751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315580
1003	NC_014410	CAG	2	6	52792	52797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315580
1004	NC_014410	GCA	2	6	53091	53096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315580
1005	NC_014410	AGA	2	6	53225	53230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315580
1006	NC_014410	ATA	2	6	53301	53306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315580
1007	NC_014410	ACG	2	6	53335	53340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315580
1008	NC_014410	TGA	3	9	53363	53371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315580
1009	NC_014410	ATTG	2	8	53381	53388	25 %	50 %	25 %	0 %	304315580
1010	NC_014410	TG	3	6	53398	53403	0 %	50 %	50 %	0 %	304315580
1011	NC_014410	ATT	2	6	53480	53485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315580
1012	NC_014410	GGT	2	6	53516	53521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315580
1013	NC_014410	TA	3	6	53537	53542	50 %	50 %	0 %	0 %	304315580
1014	NC_014410	GA	3	6	53546	53551	50 %	0 %	50 %	0 %	304315580
1015	NC_014410	A	6	6	53555	53560	100 %	0 %	0 %	0 %	304315580
1016	NC_014410	GA	3	6	53565	53570	50 %	0 %	50 %	0 %	304315580
1017	NC_014410	CTAA	2	8	53593	53600	50 %	25 %	0 %	25 %	304315580
1018	NC_014410	A	6	6	53739	53744	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1019	NC_014410	GAA	2	6	53759	53764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315581
1020	NC_014410	T	6	6	53780	53785	0 %	100 %	0 %	0 %	304315581
1021	NC_014410	ACA	2	6	53903	53908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315581
1022	NC_014410	ATA	2	6	53923	53928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315581
1023	NC_014410	GCA	2	6	53938	53943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315581
1024	NC_014410	TGA	2	6	53958	53963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1025	NC_014410	AATAT	2	10	53983	53992	60 %	40 %	0 %	0 %	304315581
1026	NC_014410	TAT	2	6	54024	54029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315581
1027	NC_014410	GGA	2	6	54084	54089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315581
1028	NC_014410	GCC	2	6	54090	54095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304315581
1029	NC_014410	TATATT	2	12	54105	54116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315581
1030	NC_014410	CTA	2	6	54146	54151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315581
1031	NC_014410	GATTT	2	10	54170	54179	20 %	60 %	20 %	0 %	304315581
1032	NC_014410	GAT	2	6	54267	54272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1033	NC_014410	GA	3	6	54297	54302	50 %	0 %	50 %	0 %	304315581
1034	NC_014410	GT	4	8	54324	54331	0 %	50 %	50 %	0 %	304315581
1035	NC_014410	ATG	2	6	54338	54343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1036	NC_014410	ATG	3	9	54353	54361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1037	NC_014410	ATG	2	6	54386	54391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1038	NC_014410	TA	3	6	54398	54403	50 %	50 %	0 %	0 %	304315581
1039	NC_014410	AGAT	2	8	54452	54459	50 %	25 %	25 %	0 %	304315581
1040	NC_014410	TGT	2	6	54506	54511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315581
1041	NC_014410	GAA	2	6	54559	54564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315581
1042	NC_014410	ATT	2	6	54693	54698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315581
1043	NC_014410	ATG	2	6	54821	54826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1044	NC_014410	TAT	2	6	54831	54836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315581
1045	NC_014410	A	6	6	54841	54846	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1046	NC_014410	TGC	2	6	54888	54893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315581
1047	NC_014410	A	7	7	54903	54909	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1048	NC_014410	TAA	2	6	54972	54977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315581
1049	NC_014410	ATA	2	6	54988	54993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315581
1050	NC_014410	A	7	7	54993	54999	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1051	NC_014410	GAT	2	6	55008	55013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315581
1052	NC_014410	T	6	6	55013	55018	0 %	100 %	0 %	0 %	304315581
1053	NC_014410	T	6	6	55020	55025	0 %	100 %	0 %	0 %	304315581
1054	NC_014410	TTA	2	6	55142	55147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315581
1055	NC_014410	TA	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	304315581
1056	NC_014410	A	8	8	55189	55196	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1057	NC_014410	TTGA	2	8	55210	55217	25 %	50 %	25 %	0 %	304315581
1058	NC_014410	A	7	7	55224	55230	100 %	0 %	0 %	0 %	304315581
1059	NC_014410	AGG	2	6	55342	55347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315582
1060	NC_014410	CAG	2	6	55391	55396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315582
1061	NC_014410	GAA	2	6	55411	55416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315582
1062	NC_014410	GAA	2	6	55491	55496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315582
1063	NC_014410	GTT	2	6	55529	55534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315582
1064	NC_014410	AGC	2	6	55573	55578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315582
1065	NC_014410	AAG	2	6	55594	55599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315582
1066	NC_014410	AGG	2	6	55639	55644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315582
1067	NC_014410	TTA	2	6	55804	55809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315583
1068	NC_014410	A	6	6	55835	55840	100 %	0 %	0 %	0 %	304315583
1069	NC_014410	CAA	2	6	55856	55861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315583
1070	NC_014410	CTA	2	6	55924	55929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315583
1071	NC_014410	TG	3	6	55932	55937	0 %	50 %	50 %	0 %	304315583
1072	NC_014410	GTA	2	6	55956	55961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315583
1073	NC_014410	TGC	2	6	56002	56007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315583
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1075	NC_014410	TAA	3	9	56078	56086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315583
1076	NC_014410	TGG	2	6	56213	56218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315583
1077	NC_014410	TA	3	6	58246	58251	50 %	50 %	0 %	0 %	304315584
1078	NC_014410	T	6	6	58263	58268	0 %	100 %	0 %	0 %	304315584
1079	NC_014410	AT	3	6	58284	58289	50 %	50 %	0 %	0 %	304315584
1080	NC_014410	TAT	2	6	58300	58305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315584
1081	NC_014410	CTTT	2	8	58340	58347	0 %	75 %	0 %	25 %	304315584
1082	NC_014410	TTA	2	6	58369	58374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315584
1083	NC_014410	TA	3	6	58378	58383	50 %	50 %	0 %	0 %	304315584
1084	NC_014410	GAA	2	6	58399	58404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315584
1085	NC_014410	TAC	2	6	58461	58466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315584
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1087	NC_014410	GAA	2	6	58511	58516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315584
1088	NC_014410	AT	3	6	58531	58536	50 %	50 %	0 %	0 %	304315584
1089	NC_014410	TTGG	2	8	58552	58559	0 %	50 %	50 %	0 %	304315584
1090	NC_014410	GAA	2	6	58624	58629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315584
1091	NC_014410	TAG	2	6	58651	58656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315585
1092	NC_014410	GGA	2	6	58662	58667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315585
1093	NC_014410	T	7	7	58808	58814	0 %	100 %	0 %	0 %	304315585
1094	NC_014410	ATG	2	6	58819	58824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315585
1095	NC_014410	TAT	2	6	58835	58840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315585
1096	NC_014410	CTT	2	6	58899	58904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315585
1097	NC_014410	T	6	6	58928	58933	0 %	100 %	0 %	0 %	304315585
1098	NC_014410	TTG	2	6	58954	58959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315585
1099	NC_014410	ATATT	2	10	58982	58991	40 %	60 %	0 %	0 %	304315585
1100	NC_014410	TTA	2	6	59053	59058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315586
1101	NC_014410	ATT	2	6	59060	59065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315586
1102	NC_014410	GCTATC	2	12	59082	59093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304315586
1103	NC_014410	GA	3	6	59107	59112	50 %	0 %	50 %	0 %	304315586
1104	NC_014410	TTC	2	6	59216	59221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315586
1105	NC_014410	CATT	2	8	59278	59285	25 %	50 %	0 %	25 %	304315586
1106	NC_014410	ATC	2	6	59348	59353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315586
1107	NC_014410	ATA	2	6	59419	59424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315586
1108	NC_014410	ATACA	2	10	59451	59460	60 %	20 %	0 %	20 %	304315586
1109	NC_014410	ATGA	2	8	59473	59480	50 %	25 %	25 %	0 %	304315586
1110	NC_014410	ATG	2	6	59516	59521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315586
1111	NC_014410	AAT	2	6	59544	59549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315586
1112	NC_014410	TA	3	6	59635	59640	50 %	50 %	0 %	0 %	304315586
1113	NC_014410	GAT	2	6	59668	59673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315586
1114	NC_014410	TTAC	2	8	59726	59733	25 %	50 %	0 %	25 %	304315586
1115	NC_014410	AGC	2	6	59769	59774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315586
1116	NC_014410	A	6	6	59805	59810	100 %	0 %	0 %	0 %	304315586
1117	NC_014410	GAA	3	9	59893	59901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315586
1118	NC_014410	ATA	2	6	59908	59913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315586
1119	NC_014410	CATA	2	8	59920	59927	50 %	25 %	0 %	25 %	304315586
1120	NC_014410	TGA	2	6	59964	59969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315586
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1122	NC_014410	TGA	2	6	60048	60053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315586
1123	NC_014410	AGA	2	6	60099	60104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315586
1124	NC_014410	ATC	2	6	60148	60153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315586
1125	NC_014410	TAAA	2	8	60170	60177	75 %	25 %	0 %	0 %	304315586
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1127	NC_014410	ATA	2	6	60199	60204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315586
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1134	NC_014410	A	7	7	60459	60465	100 %	0 %	0 %	0 %	304315587
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1141	NC_014410	TATTG	2	10	60838	60847	20 %	60 %	20 %	0 %	304315588
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1243	NC_014410	A	7	7	71195	71201	100 %	0 %	0 %	0 %	304315593
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1245	NC_014410	ATT	2	6	71254	71259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315593
1246	NC_014410	A	6	6	71300	71305	100 %	0 %	0 %	0 %	304315593
1247	NC_014410	TGA	2	6	71424	71429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315593
1248	NC_014410	TA	3	6	71464	71469	50 %	50 %	0 %	0 %	304315593
1249	NC_014410	GAT	2	6	71524	71529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315593
1250	NC_014410	GGC	2	6	71581	71586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315593
1251	NC_014410	GACA	2	8	71696	71703	50 %	0 %	25 %	25 %	304315594
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