MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014410	TCAT	2	8	618242	618249	25 %	50 %	0 %	25 %	304316118
12002	NC_014410	T	6	6	618342	618347	0 %	100 %	0 %	0 %	304316118
12003	NC_014410	TGCTT	2	10	618395	618404	0 %	60 %	20 %	20 %	304316118
12004	NC_014410	GTC	2	6	618409	618414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316118
12005	NC_014410	GCA	2	6	618467	618472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316118
12006	NC_014410	CCA	2	6	618479	618484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304316118
12007	NC_014410	ATT	2	6	618527	618532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316118
12008	NC_014410	A	6	6	618540	618545	100 %	0 %	0 %	0 %	304316118
12009	NC_014410	TAT	2	6	618562	618567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316118
12010	NC_014410	CTT	2	6	618606	618611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316118
12011	NC_014410	ATA	2	6	618957	618962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316119
12012	NC_014410	GTT	2	6	618971	618976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316119
12013	NC_014410	AATT	2	8	619032	619039	50 %	50 %	0 %	0 %	304316119
12014	NC_014410	TGA	2	6	619048	619053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316119
12015	NC_014410	A	7	7	619063	619069	100 %	0 %	0 %	0 %	304316119
12016	NC_014410	AG	3	6	619102	619107	50 %	0 %	50 %	0 %	304316119
12017	NC_014410	ACA	2	6	619143	619148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316119
12018	NC_014410	GTGG	2	8	619158	619165	0 %	25 %	75 %	0 %	304316119
12019	NC_014410	T	6	6	619168	619173	0 %	100 %	0 %	0 %	304316119
12020	NC_014410	A	6	6	619207	619212	100 %	0 %	0 %	0 %	304316119
12021	NC_014410	TTA	2	6	619277	619282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316119
12022	NC_014410	GAA	2	6	619346	619351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316119
12023	NC_014410	TTA	2	6	619368	619373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316119
12024	NC_014410	A	7	7	619431	619437	100 %	0 %	0 %	0 %	304316119
12025	NC_014410	AGC	2	6	619460	619465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316119
12026	NC_014410	CTG	2	6	619500	619505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316119
12027	NC_014410	TA	4	8	619554	619561	50 %	50 %	0 %	0 %	304316119
12028	NC_014410	AGAT	2	8	619563	619570	50 %	25 %	25 %	0 %	304316119
12029	NC_014410	TAA	2	6	619582	619587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316119
12030	NC_014410	ACA	2	6	619662	619667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316119
12031	NC_014410	TATT	2	8	619678	619685	25 %	75 %	0 %	0 %	304316119
12032	NC_014410	AGA	2	6	619705	619710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316119
12033	NC_014410	AGA	2	6	619729	619734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316119
12034	NC_014410	ATT	2	6	619779	619784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316119
12035	NC_014410	ATG	3	9	619788	619796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316119
12036	NC_014410	T	6	6	619820	619825	0 %	100 %	0 %	0 %	304316119
12037	NC_014410	AGATA	2	10	619897	619906	60 %	20 %	20 %	0 %	304316119
12038	NC_014410	TAA	2	6	619962	619967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316119
12039	NC_014410	TTG	2	6	620043	620048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316120
12040	NC_014410	AAG	2	6	620057	620062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316120
12041	NC_014410	ATT	2	6	620075	620080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316120
12042	NC_014410	TAG	2	6	620130	620135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316120
12043	NC_014410	GTG	2	6	620142	620147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316120
12044	NC_014410	CAA	2	6	620157	620162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316120
12045	NC_014410	AAGA	2	8	620219	620226	75 %	0 %	25 %	0 %	304316120
12046	NC_014410	AGA	2	6	620243	620248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316120
12047	NC_014410	AAG	2	6	620263	620268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316120
12048	NC_014410	AGT	2	6	620278	620283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316120
12049	NC_014410	TTGCTT	2	12	620331	620342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304316120
12050	NC_014410	TA	3	6	620369	620374	50 %	50 %	0 %	0 %	304316120
12051	NC_014410	AGG	2	6	620378	620383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316120
12052	NC_014410	TTG	2	6	620403	620408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316120
12053	NC_014410	TGG	2	6	620449	620454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316120
12054	NC_014410	CGT	2	6	620547	620552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316120
12055	NC_014410	TAT	2	6	620568	620573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316120
12056	NC_014410	CAA	2	6	620581	620586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316120
12057	NC_014410	ACT	2	6	620594	620599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316120
12058	NC_014410	A	7	7	620642	620648	100 %	0 %	0 %	0 %	304316120
12059	NC_014410	GAGAT	2	10	620682	620691	40 %	20 %	40 %	0 %	304316120
12060	NC_014410	TA	3	6	620733	620738	50 %	50 %	0 %	0 %	304316121
12061	NC_014410	CAG	2	6	620803	620808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316121
12062	NC_014410	TGA	2	6	620942	620947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316121
12063	NC_014410	AAT	2	6	621006	621011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316121
12064	NC_014410	A	6	6	621031	621036	100 %	0 %	0 %	0 %	304316121
12065	NC_014410	ATG	2	6	621111	621116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316121
12066	NC_014410	AGA	2	6	621128	621133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316121
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12068	NC_014410	GTT	2	6	621180	621185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316121
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12070	NC_014410	ATA	2	6	621210	621215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316121
12071	NC_014410	GTT	2	6	621261	621266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316121
12072	NC_014410	GA	4	8	621308	621315	50 %	0 %	50 %	0 %	304316121
12073	NC_014410	CAT	2	6	621320	621325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316121
12074	NC_014410	GAG	2	6	621595	621600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316121
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12077	NC_014410	A	6	6	621707	621712	100 %	0 %	0 %	0 %	304316122
12078	NC_014410	TAA	2	6	621719	621724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316122
12079	NC_014410	AATAAG	2	12	621747	621758	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304316122
12080	NC_014410	TAC	2	6	621830	621835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316122
12081	NC_014410	AGC	2	6	621838	621843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316122
12082	NC_014410	ATG	2	6	621847	621852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316122
12083	NC_014410	ATG	2	6	621868	621873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316122
12084	NC_014410	CAG	2	6	621897	621902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316122
12085	NC_014410	A	6	6	621918	621923	100 %	0 %	0 %	0 %	304316122
12086	NC_014410	GGA	2	6	621981	621986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316122
12087	NC_014410	GA	3	6	621985	621990	50 %	0 %	50 %	0 %	304316122
12088	NC_014410	TGATA	2	10	622049	622058	40 %	40 %	20 %	0 %	304316122
12089	NC_014410	TTG	2	6	622066	622071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316122
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12091	NC_014410	AGCA	2	8	622255	622262	50 %	0 %	25 %	25 %	304316122
12092	NC_014410	AGC	2	6	622303	622308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316122
12093	NC_014410	CAA	2	6	622390	622395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316122
12094	NC_014410	ATC	2	6	622420	622425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316122
12095	NC_014410	CA	3	6	622449	622454	50 %	0 %	0 %	50 %	304316122
12096	NC_014410	AGC	2	6	622466	622471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316122
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12099	NC_014410	TGG	2	6	622532	622537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316122
12100	NC_014410	TGG	3	9	622565	622573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316122
12101	NC_014410	CAG	2	6	622641	622646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316122
12102	NC_014410	A	6	6	622706	622711	100 %	0 %	0 %	0 %	304316122
12103	NC_014410	AGA	2	6	622885	622890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316123
12104	NC_014410	AGC	2	6	622927	622932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316123
12105	NC_014410	GCTT	2	8	622965	622972	0 %	50 %	25 %	25 %	304316123
12106	NC_014410	GGA	2	6	622975	622980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316123
12107	NC_014410	GAA	2	6	622999	623004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316123
12108	NC_014410	ATCA	2	8	623081	623088	50 %	25 %	0 %	25 %	304316123
12109	NC_014410	CT	3	6	623124	623129	0 %	50 %	0 %	50 %	304316123
12110	NC_014410	AAGA	2	8	623158	623165	75 %	0 %	25 %	0 %	304316123
12111	NC_014410	GTA	2	6	623218	623223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316123
12112	NC_014410	ATG	2	6	623234	623239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316123
12113	NC_014410	GTT	2	6	623248	623253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316123
12114	NC_014410	ATA	2	6	623308	623313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316123
12115	NC_014410	ATA	2	6	623417	623422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316123
12116	NC_014410	GA	4	8	623445	623452	50 %	0 %	50 %	0 %	304316123
12117	NC_014410	AGC	2	6	623473	623478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316123
12118	NC_014410	TGC	2	6	623483	623488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316123
12119	NC_014410	CAAA	2	8	623489	623496	75 %	0 %	0 %	25 %	304316123
12120	NC_014410	TGA	2	6	623523	623528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316123
12121	NC_014410	CTG	2	6	623537	623542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316123
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