MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014410	GTA	2	6	287142	287147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315810
5502	NC_014410	GAAAGA	2	12	287154	287165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315810
5503	NC_014410	AGA	2	6	287229	287234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315810
5504	NC_014410	GA	3	6	287272	287277	50 %	0 %	50 %	0 %	304315810
5505	NC_014410	TAT	2	6	287279	287284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315810
5506	NC_014410	ATCCG	2	10	287288	287297	20 %	20 %	20 %	40 %	304315810
5507	NC_014410	TCA	2	6	287319	287324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315810
5508	NC_014410	A	6	6	287333	287338	100 %	0 %	0 %	0 %	304315810
5509	NC_014410	ATT	2	6	287437	287442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315810
5510	NC_014410	CTG	2	6	287443	287448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5511	NC_014410	AGC	2	6	287456	287461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5512	NC_014410	CAG	3	9	287490	287498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5513	NC_014410	CTG	2	6	287542	287547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5514	NC_014410	TGG	2	6	287636	287641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315810
5515	NC_014410	CT	3	6	287666	287671	0 %	50 %	0 %	50 %	304315810
5516	NC_014410	GCA	2	6	287709	287714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5517	NC_014410	AGA	2	6	287720	287725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315810
5518	NC_014410	AAG	2	6	287732	287737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315810
5519	NC_014410	GCA	2	6	287757	287762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5520	NC_014410	GGAA	2	8	287836	287843	50 %	0 %	50 %	0 %	304315810
5521	NC_014410	TGA	2	6	287870	287875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315810
5522	NC_014410	TA	4	8	287905	287912	50 %	50 %	0 %	0 %	304315810
5523	NC_014410	GCA	2	6	288045	288050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315810
5524	NC_014410	TTA	2	6	288069	288074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315810
5525	NC_014410	AT	3	6	288085	288090	50 %	50 %	0 %	0 %	304315810
5526	NC_014410	TA	4	8	288154	288161	50 %	50 %	0 %	0 %	304315810
5527	NC_014410	TAC	2	6	288164	288169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315810
5528	NC_014410	ATA	2	6	288189	288194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315810
5529	NC_014410	TTC	2	6	288236	288241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315810
5530	NC_014410	TTC	2	6	288349	288354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315810
5531	NC_014410	AGG	2	6	288454	288459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315810
5532	NC_014410	GAA	2	6	288498	288503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315810
5533	NC_014410	ACAAA	2	10	288517	288526	80 %	0 %	0 %	20 %	304315810
5534	NC_014410	CAA	2	6	288572	288577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315811
5535	NC_014410	ATG	2	6	288605	288610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315811
5536	NC_014410	GCC	2	6	288640	288645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304315811
5537	NC_014410	AGC	2	6	288651	288656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315811
5538	NC_014410	CTG	2	6	288710	288715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315811
5539	NC_014410	A	6	6	288732	288737	100 %	0 %	0 %	0 %	304315811
5540	NC_014410	ATTG	2	8	288741	288748	25 %	50 %	25 %	0 %	304315811
5541	NC_014410	GAG	2	6	288749	288754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315811
5542	NC_014410	TGC	2	6	288768	288773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315811
5543	NC_014410	AAT	2	6	288806	288811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315811
5544	NC_014410	T	7	7	288847	288853	0 %	100 %	0 %	0 %	304315812
5545	NC_014410	T	7	7	288897	288903	0 %	100 %	0 %	0 %	304315812
5546	NC_014410	TGGCTT	2	12	288958	288969	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	304315812
5547	NC_014410	TA	3	6	288990	288995	50 %	50 %	0 %	0 %	304315812
5548	NC_014410	TTTAC	2	10	289006	289015	20 %	60 %	0 %	20 %	304315812
5549	NC_014410	TGC	2	6	289052	289057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315812
5550	NC_014410	AT	3	6	289073	289078	50 %	50 %	0 %	0 %	304315812
5551	NC_014410	TGC	2	6	289139	289144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315812
5552	NC_014410	CAG	2	6	289156	289161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315812
5553	NC_014410	AAC	2	6	289242	289247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315812
5554	NC_014410	TCT	2	6	289284	289289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315812
5555	NC_014410	TCT	2	6	289293	289298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315812
5556	NC_014410	TAG	2	6	289327	289332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315812
5557	NC_014410	TTTCAG	2	12	289387	289398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304315812
5558	NC_014410	TGG	2	6	289452	289457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315812
5559	NC_014410	AG	3	6	289458	289463	50 %	0 %	50 %	0 %	304315812
5560	NC_014410	TAT	2	6	289471	289476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315812
5561	NC_014410	CT	4	8	289477	289484	0 %	50 %	0 %	50 %	304315812
5562	NC_014410	TTTC	2	8	289515	289522	0 %	75 %	0 %	25 %	304315812
5563	NC_014410	GGCT	2	8	289578	289585	0 %	25 %	50 %	25 %	304315812
5564	NC_014410	CTG	2	6	289606	289611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315812
5565	NC_014410	TA	3	6	289686	289691	50 %	50 %	0 %	0 %	304315812
5566	NC_014410	TGC	2	6	289765	289770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315813
5567	NC_014410	TGGA	2	8	289778	289785	25 %	25 %	50 %	0 %	304315813
5568	NC_014410	T	8	8	289792	289799	0 %	100 %	0 %	0 %	304315813
5569	NC_014410	T	6	6	289811	289816	0 %	100 %	0 %	0 %	304315813
5570	NC_014410	TGT	2	6	289835	289840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315813
5571	NC_014410	TAA	2	6	289864	289869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315813
5572	NC_014410	GT	3	6	289939	289944	0 %	50 %	50 %	0 %	304315813
5573	NC_014410	TAA	2	6	289951	289956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315813
5574	NC_014410	AAG	2	6	289977	289982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315813
5575	NC_014410	GGGA	2	8	290006	290013	25 %	0 %	75 %	0 %	304315813
5576	NC_014410	AGA	2	6	290088	290093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315814
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5578	NC_014410	TATG	2	8	290159	290166	25 %	50 %	25 %	0 %	304315814
5579	NC_014410	TGAGAA	2	12	290206	290217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304315814
5580	NC_014410	AAT	2	6	290224	290229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315814
5581	NC_014410	GGC	2	6	290289	290294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315814
5582	NC_014410	AT	3	6	290311	290316	50 %	50 %	0 %	0 %	304315814
5583	NC_014410	AGA	2	6	290341	290346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315814
5584	NC_014410	AAAGA	2	10	290359	290368	80 %	0 %	20 %	0 %	304315814
5585	NC_014410	T	6	6	290435	290440	0 %	100 %	0 %	0 %	304315814
5586	NC_014410	CATC	2	8	290576	290583	25 %	25 %	0 %	50 %	304315814
5587	NC_014410	GGC	2	6	290587	290592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315814
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5589	NC_014410	A	7	7	290684	290690	100 %	0 %	0 %	0 %	304315815
5590	NC_014410	TGAT	2	8	290713	290720	25 %	50 %	25 %	0 %	304315815
5591	NC_014410	GTT	2	6	290760	290765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315815
5592	NC_014410	TCC	2	6	290807	290812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315815
5593	NC_014410	TGC	2	6	290822	290827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5594	NC_014410	GCA	2	6	290844	290849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5595	NC_014410	TG	3	6	290861	290866	0 %	50 %	50 %	0 %	304315815
5596	NC_014410	GCAG	2	8	290937	290944	25 %	0 %	50 %	25 %	304315815
5597	NC_014410	GAG	2	6	291006	291011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315815
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5599	NC_014410	T	6	6	291046	291051	0 %	100 %	0 %	0 %	304315815
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5603	NC_014410	AGG	2	6	291233	291238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315815
5604	NC_014410	TGC	2	6	291263	291268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5605	NC_014410	ATG	2	6	291298	291303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315815
5606	NC_014410	GTG	2	6	291307	291312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315815
5607	NC_014410	GGA	2	6	291336	291341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315815
5608	NC_014410	TTGGTT	2	12	291342	291353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315815
5609	NC_014410	AT	3	6	291355	291360	50 %	50 %	0 %	0 %	304315815
5610	NC_014410	CTT	2	6	291444	291449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315815
5611	NC_014410	GCA	2	6	291469	291474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5612	NC_014410	ATT	2	6	291480	291485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315815
5613	NC_014410	AG	4	8	291494	291501	50 %	0 %	50 %	0 %	304315815
5614	NC_014410	GAG	2	6	291600	291605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315815
5615	NC_014410	T	7	7	291671	291677	0 %	100 %	0 %	0 %	304315815
5616	NC_014410	GCA	2	6	291714	291719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5617	NC_014410	TAG	2	6	291733	291738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315815
5618	NC_014410	CTT	2	6	291882	291887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315815
5619	NC_014410	GCT	2	6	291894	291899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315815
5620	NC_014410	TGGGC	2	10	291921	291930	0 %	20 %	60 %	20 %	304315815
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5622	NC_014410	ATT	2	6	292047	292052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315815
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5991	NC_014410	ATT	2	6	314644	314649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315833
5992	NC_014410	GGC	2	6	314705	314710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315833
5993	NC_014410	GCA	2	6	314720	314725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315833
5994	NC_014410	ATT	2	6	314764	314769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315833
5995	NC_014410	TTCAC	2	10	314793	314802	20 %	40 %	0 %	40 %	304315833
5996	NC_014410	ATA	2	6	314827	314832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315833
5997	NC_014410	ATG	4	12	314839	314850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315833
5998	NC_014410	GTT	2	6	314877	314882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315833
5999	NC_014410	TGATT	2	10	314930	314939	20 %	60 %	20 %	0 %	304315833
6000	NC_014410	TCA	2	6	314955	314960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315833

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