MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

< Previous12...101102103104105106107108109110111112113Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014410	TTGT	2	8	2779030	2779037	0 %	75 %	25 %	0 %	304318130
56002	NC_014410	CCA	2	6	2779076	2779081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318130
56003	NC_014410	AAT	2	6	2779150	2779155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
56004	NC_014410	TCT	2	6	2779169	2779174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318130
56005	NC_014410	TCC	2	6	2779214	2779219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318130
56006	NC_014410	CCA	2	6	2779226	2779231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318130
56007	NC_014410	TAA	2	6	2779293	2779298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
56008	NC_014410	TAA	2	6	2779315	2779320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
56009	NC_014410	T	6	6	2779370	2779375	0 %	100 %	0 %	0 %	304318131
56010	NC_014410	AATT	2	8	2779377	2779384	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
56011	NC_014410	AAT	2	6	2779446	2779451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318131
56012	NC_014410	ATT	2	6	2779515	2779520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
56013	NC_014410	AT	3	6	2779610	2779615	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
56014	NC_014410	AT	3	6	2779643	2779648	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
56015	NC_014410	TCT	2	6	2779684	2779689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
56016	NC_014410	TAT	2	6	2779701	2779706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
56017	NC_014410	CAT	2	6	2779712	2779717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318131
56018	NC_014410	CTT	2	6	2779761	2779766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
56019	NC_014410	GCACCT	2	12	2779834	2779845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	304318131
56020	NC_014410	TAT	2	6	2779851	2779856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
56021	NC_014410	A	6	6	2779906	2779911	100 %	0 %	0 %	0 %	304318131
56022	NC_014410	ACA	3	9	2779918	2779926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318131
56023	NC_014410	TTC	2	6	2779932	2779937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
56024	NC_014410	T	6	6	2779958	2779963	0 %	100 %	0 %	0 %	304318131
56025	NC_014410	ATTCC	2	10	2779965	2779974	20 %	40 %	0 %	40 %	304318131
56026	NC_014410	AGA	3	9	2779975	2779983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318131
56027	NC_014410	ATA	2	6	2779986	2779991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318131
56028	NC_014410	TTA	2	6	2780051	2780056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
56029	NC_014410	TCTT	2	8	2780071	2780078	0 %	75 %	0 %	25 %	304318131
56030	NC_014410	ATCT	2	8	2780083	2780090	25 %	50 %	0 %	25 %	304318132
56031	NC_014410	AT	3	6	2780120	2780125	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
56032	NC_014410	CAG	2	6	2780126	2780131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
56033	NC_014410	TGCCT	2	10	2780194	2780203	0 %	40 %	20 %	40 %	304318132
56034	NC_014410	ATC	2	6	2780223	2780228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56035	NC_014410	TA	3	6	2780301	2780306	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
56036	NC_014410	TCTGC	2	10	2780333	2780342	0 %	40 %	20 %	40 %	304318132
56037	NC_014410	CAT	2	6	2780345	2780350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56038	NC_014410	AATC	2	8	2780399	2780406	50 %	25 %	0 %	25 %	304318132
56039	NC_014410	T	7	7	2780546	2780552	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
56040	NC_014410	TCA	2	6	2780575	2780580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56041	NC_014410	TCA	2	6	2780710	2780715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56042	NC_014410	TA	3	6	2780727	2780732	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
56043	NC_014410	ATCT	2	8	2780741	2780748	25 %	50 %	0 %	25 %	304318132
56044	NC_014410	CT	3	6	2780760	2780765	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
56045	NC_014410	AGC	2	6	2780781	2780786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
56046	NC_014410	GCA	2	6	2780812	2780817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
56047	NC_014410	ACCTG	2	10	2780845	2780854	20 %	20 %	20 %	40 %	304318132
56048	NC_014410	A	6	6	2780856	2780861	100 %	0 %	0 %	0 %	304318132
56049	NC_014410	TACA	2	8	2781030	2781037	50 %	25 %	0 %	25 %	304318132
56050	NC_014410	TTCC	2	8	2781049	2781056	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
56051	NC_014410	AAC	2	6	2781102	2781107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318132
56052	NC_014410	TCT	2	6	2781112	2781117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318132
56053	NC_014410	CAC	2	6	2781155	2781160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318132
56054	NC_014410	GTG	2	6	2781167	2781172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304318132
56055	NC_014410	CTA	2	6	2781208	2781213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56056	NC_014410	ATTT	2	8	2781249	2781256	25 %	75 %	0 %	0 %	304318132
56057	NC_014410	T	6	6	2781284	2781289	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
56058	NC_014410	T	6	6	2781330	2781335	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
56059	NC_014410	TCA	2	6	2781368	2781373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56060	NC_014410	TC	3	6	2781387	2781392	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
56061	NC_014410	AAAC	2	8	2781420	2781427	75 %	0 %	0 %	25 %	304318132
56062	NC_014410	ACC	2	6	2781435	2781440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318132
56063	NC_014410	TTC	2	6	2781467	2781472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318132
56064	NC_014410	T	6	6	2781529	2781534	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
56065	NC_014410	TTCAC	2	10	2781547	2781556	20 %	40 %	0 %	40 %	304318132
56066	NC_014410	CAA	2	6	2781575	2781580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318132
56067	NC_014410	T	7	7	2781647	2781653	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
56068	NC_014410	CAG	2	6	2781680	2781685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
56069	NC_014410	C	6	6	2781751	2781756	0 %	0 %	0 %	100 %	304318132
56070	NC_014410	TC	3	6	2781767	2781772	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
56071	NC_014410	CCT	2	6	2781796	2781801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318132
56072	NC_014410	GCT	2	6	2781889	2781894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318132
56073	NC_014410	CAT	2	6	2781929	2781934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
56074	NC_014410	GCA	2	6	2782053	2782058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318133
56075	NC_014410	AAGAC	2	10	2782109	2782118	60 %	0 %	20 %	20 %	304318133
56076	NC_014410	TAA	2	6	2782139	2782144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318133
56077	NC_014410	CTT	2	6	2782243	2782248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318133
56078	NC_014410	GAT	2	6	2782257	2782262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318133
56079	NC_014410	TA	3	6	2782268	2782273	50 %	50 %	0 %	0 %	304318133
56080	NC_014410	TTC	2	6	2782288	2782293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318133
56081	NC_014410	TTTA	2	8	2782331	2782338	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
56082	NC_014410	ATC	2	6	2782358	2782363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56083	NC_014410	CTTC	2	8	2782387	2782394	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
56084	NC_014410	CAAAAA	2	12	2782414	2782425	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304318133
56085	NC_014410	TAA	2	6	2782426	2782431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318133
56086	NC_014410	TTA	2	6	2782440	2782445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318133
56087	NC_014410	CTT	2	6	2782458	2782463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318133
56088	NC_014410	CTA	2	6	2782480	2782485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56089	NC_014410	TCA	2	6	2782488	2782493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56090	NC_014410	CTG	2	6	2782507	2782512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318133
56091	NC_014410	CTC	2	6	2782553	2782558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318133
56092	NC_014410	TAT	2	6	2782559	2782564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318133
56093	NC_014410	AGC	2	6	2782626	2782631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318133
56094	NC_014410	TTA	2	6	2782684	2782689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318133
56095	NC_014410	TCCT	2	8	2782690	2782697	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
56096	NC_014410	TGA	2	6	2782703	2782708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318133
56097	NC_014410	TAA	2	6	2782712	2782717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318133
56098	NC_014410	TCA	2	6	2782719	2782724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56099	NC_014410	T	6	6	2782740	2782745	0 %	100 %	0 %	0 %	304318133
56100	NC_014410	TCA	2	6	2782788	2782793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56101	NC_014410	AT	3	6	2782813	2782818	50 %	50 %	0 %	0 %	304318133
56102	NC_014410	ATTT	2	8	2782853	2782860	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
56103	NC_014410	TATT	2	8	2782896	2782903	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
56104	NC_014410	TTA	2	6	2782924	2782929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318133
56105	NC_014410	TTC	2	6	2782963	2782968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318133
56106	NC_014410	CT	3	6	2782981	2782986	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
56107	NC_014410	T	6	6	2783022	2783027	0 %	100 %	0 %	0 %	304318133
56108	NC_014410	ACC	2	6	2783063	2783068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318133
56109	NC_014410	TCA	2	6	2783119	2783124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56110	NC_014410	TAAA	2	8	2783169	2783176	75 %	25 %	0 %	0 %	304318133
56111	NC_014410	CAG	2	6	2783305	2783310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318133
56112	NC_014410	GCA	2	6	2783319	2783324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318133
56113	NC_014410	ATC	2	6	2783330	2783335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
56114	NC_014410	CTC	2	6	2783471	2783476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318134
56115	NC_014410	TC	3	6	2783534	2783539	0 %	50 %	0 %	50 %	304318134
56116	NC_014410	CATT	2	8	2783545	2783552	25 %	50 %	0 %	25 %	304318134
56117	NC_014410	CTTG	2	8	2783578	2783585	0 %	50 %	25 %	25 %	304318134
56118	NC_014410	T	7	7	2783588	2783594	0 %	100 %	0 %	0 %	304318134
56119	NC_014410	TATTT	2	10	2783597	2783606	20 %	80 %	0 %	0 %	304318134
56120	NC_014410	TCT	2	6	2783623	2783628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318134
56121	NC_014410	CT	4	8	2783627	2783634	0 %	50 %	0 %	50 %	304318134
56122	NC_014410	T	8	8	2783688	2783695	0 %	100 %	0 %	0 %	304318134
56123	NC_014410	TCA	2	6	2783808	2783813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318134
56124	NC_014410	ATATC	2	10	2783814	2783823	40 %	40 %	0 %	20 %	304318134
56125	NC_014410	ATT	2	6	2783847	2783852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318134
56126	NC_014410	TCT	2	6	2783864	2783869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318134
56127	NC_014410	AAT	2	6	2783897	2783902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318134
56128	NC_014410	TAT	2	6	2783957	2783962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318134
56129	NC_014410	TAT	2	6	2784044	2784049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318134
56130	NC_014410	AAG	2	6	2784094	2784099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318135
56131	NC_014410	AT	3	6	2784141	2784146	50 %	50 %	0 %	0 %	304318135
56132	NC_014410	ATA	2	6	2784196	2784201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318135
56133	NC_014410	TCTG	2	8	2784226	2784233	0 %	50 %	25 %	25 %	304318135
56134	NC_014410	ATC	2	6	2784235	2784240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318135
56135	NC_014410	CGT	2	6	2784255	2784260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318135
56136	NC_014410	ATG	2	6	2784326	2784331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318135
56137	NC_014410	TCA	2	6	2784449	2784454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318135
56138	NC_014410	T	6	6	2784489	2784494	0 %	100 %	0 %	0 %	304318135
56139	NC_014410	AAT	2	6	2784597	2784602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318135
56140	NC_014410	CAA	2	6	2784623	2784628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318135
56141	NC_014410	AT	3	6	2784633	2784638	50 %	50 %	0 %	0 %	304318135
56142	NC_014410	TGC	2	6	2784672	2784677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318135
56143	NC_014410	TCC	2	6	2784746	2784751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318136
56144	NC_014410	ATA	2	6	2784760	2784765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318136
56145	NC_014410	T	6	6	2784787	2784792	0 %	100 %	0 %	0 %	304318136
56146	NC_014410	TTA	2	6	2784878	2784883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318136
56147	NC_014410	AT	3	6	2784885	2784890	50 %	50 %	0 %	0 %	304318136
56148	NC_014410	ATT	2	6	2784904	2784909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318136
56149	NC_014410	AGA	2	6	2784926	2784931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318137
56150	NC_014410	CAA	2	6	2784982	2784987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318137
56151	NC_014410	AAT	2	6	2785007	2785012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318137
56152	NC_014410	TAAA	2	8	2785024	2785031	75 %	25 %	0 %	0 %	304318137
56153	NC_014410	T	6	6	2785103	2785108	0 %	100 %	0 %	0 %	304318137
56154	NC_014410	AACC	2	8	2785120	2785127	50 %	0 %	0 %	50 %	304318137
56155	NC_014410	ATT	2	6	2785142	2785147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318137
56156	NC_014410	ACT	2	6	2785217	2785222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318137
56157	NC_014410	CATAT	2	10	2785238	2785247	40 %	40 %	0 %	20 %	304318137
56158	NC_014410	AT	4	8	2785244	2785251	50 %	50 %	0 %	0 %	304318137
56159	NC_014410	A	6	6	2785266	2785271	100 %	0 %	0 %	0 %	304318137
56160	NC_014410	CCTT	2	8	2785285	2785292	0 %	50 %	0 %	50 %	304318138
56161	NC_014410	CTT	3	9	2785322	2785330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318138
56162	NC_014410	TAG	2	6	2785353	2785358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318138
56163	NC_014410	ACT	2	6	2785424	2785429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318138

< Previous12...101102103104105106107108109110111112113Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.