MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 56163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_014410	TCA	2	6	2618930	2618935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317985
53002	NC_014410	TTCC	2	8	2619081	2619088	0 %	50 %	0 %	50 %	304317986
53003	NC_014410	TCT	2	6	2619111	2619116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304317986
53004	NC_014410	ATC	2	6	2619147	2619152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317986
53005	NC_014410	CTT	2	6	2619154	2619159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304317986
53006	NC_014410	CAT	2	6	2619208	2619213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317986
53007	NC_014410	ACC	2	6	2619239	2619244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304317986
53008	NC_014410	T	7	7	2619272	2619278	0 %	100 %	0 %	0 %	304317986
53009	NC_014410	CTG	2	6	2619295	2619300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317986
53010	NC_014410	TTA	2	6	2619346	2619351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304317986
53011	NC_014410	ATCTT	2	10	2619415	2619424	20 %	60 %	0 %	20 %	304317986
53012	NC_014410	CCGC	2	8	2619459	2619466	0 %	0 %	25 %	75 %	304317986
53013	NC_014410	GTC	2	6	2619542	2619547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317986
53014	NC_014410	CCA	2	6	2619556	2619561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304317986
53015	NC_014410	TTG	2	6	2619568	2619573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304317986
53016	NC_014410	CAG	2	6	2619595	2619600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304317986
53017	NC_014410	CAC	2	6	2619613	2619618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304317986
53018	NC_014410	T	6	6	2619695	2619700	0 %	100 %	0 %	0 %	304317986
53019	NC_014410	TCC	3	9	2619716	2619724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304317986
53020	NC_014410	CAC	2	6	2619787	2619792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304317986
53021	NC_014410	CGT	2	6	2619793	2619798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317986
53022	NC_014410	GCC	2	6	2619809	2619814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304317986
53023	NC_014410	ATG	2	6	2619822	2619827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317986
53024	NC_014410	TTA	2	6	2619889	2619894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304317986
53025	NC_014410	TGT	2	6	2619907	2619912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304317986
53026	NC_014410	CAT	2	6	2619964	2619969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317986
53027	NC_014410	A	6	6	2619980	2619985	100 %	0 %	0 %	0 %	304317986
53028	NC_014410	TCC	2	6	2620037	2620042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304317986
53029	NC_014410	TGA	2	6	2620043	2620048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317986
53030	NC_014410	CCA	2	6	2620077	2620082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304317986
53031	NC_014410	CTT	2	6	2620122	2620127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304317986
53032	NC_014410	TGA	2	6	2620160	2620165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317986
53033	NC_014410	TGAA	2	8	2620177	2620184	50 %	25 %	25 %	0 %	304317986
53034	NC_014410	ATC	2	6	2620333	2620338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317987
53035	NC_014410	CAT	2	6	2620376	2620381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317987
53036	NC_014410	GTG	2	6	2620420	2620425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304317987
53037	NC_014410	CAT	2	6	2620484	2620489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317987
53038	NC_014410	T	6	6	2620588	2620593	0 %	100 %	0 %	0 %	304317987
53039	NC_014410	CTG	2	6	2620630	2620635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317987
53040	NC_014410	GCT	2	6	2620834	2620839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317987
53041	NC_014410	T	6	6	2620885	2620890	0 %	100 %	0 %	0 %	304317987
53042	NC_014410	AAT	2	6	2620898	2620903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304317987
53043	NC_014410	GTT	2	6	2620911	2620916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304317987
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53046	NC_014410	TA	3	6	2621109	2621114	50 %	50 %	0 %	0 %	304317987
53047	NC_014410	TAT	2	6	2621127	2621132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304317987
53048	NC_014410	TGA	2	6	2621240	2621245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317987
53049	NC_014410	CGT	2	6	2621255	2621260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317987
53050	NC_014410	AT	3	6	2621305	2621310	50 %	50 %	0 %	0 %	304317987
53051	NC_014410	ACT	2	6	2621362	2621367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317987
53052	NC_014410	CATCT	2	10	2621442	2621451	20 %	40 %	0 %	40 %	304317987
53053	NC_014410	TGA	2	6	2621481	2621486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317987
53054	NC_014410	GA	3	6	2621565	2621570	50 %	0 %	50 %	0 %	304317987
53055	NC_014410	ATC	2	6	2621577	2621582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317987
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53057	NC_014410	GCA	2	6	2621623	2621628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304317987
53058	NC_014410	AAAG	2	8	2621674	2621681	75 %	0 %	25 %	0 %	304317987
53059	NC_014410	TAT	2	6	2621830	2621835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304317988
53060	NC_014410	T	7	7	2621885	2621891	0 %	100 %	0 %	0 %	304317988
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53067	NC_014410	GTA	2	6	2622251	2622256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317988
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53071	NC_014410	TAG	2	6	2622460	2622465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317988
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53083	NC_014410	AAG	2	6	2622930	2622935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304317989
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53087	NC_014410	ATC	2	6	2623120	2623125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317989
53088	NC_014410	TTTA	2	8	2623134	2623141	25 %	75 %	0 %	0 %	304317989
53089	NC_014410	T	7	7	2623233	2623239	0 %	100 %	0 %	0 %	304317989
53090	NC_014410	ATG	3	9	2623259	2623267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317989
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53103	NC_014410	TC	3	6	2623807	2623812	0 %	50 %	0 %	50 %	304317990
53104	NC_014410	TAAA	2	8	2623840	2623847	75 %	25 %	0 %	0 %	304317990
53105	NC_014410	TA	3	6	2624000	2624005	50 %	50 %	0 %	0 %	304317990
53106	NC_014410	TCA	2	6	2624046	2624051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317990
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53112	NC_014410	TA	3	6	2624364	2624369	50 %	50 %	0 %	0 %	304317990
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53114	NC_014410	TATT	2	8	2624385	2624392	25 %	75 %	0 %	0 %	304317990
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53116	NC_014410	TCATCT	2	12	2624521	2624532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	304317990
53117	NC_014410	CCT	2	6	2624631	2624636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304317990
53118	NC_014410	GTT	2	6	2624666	2624671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304317990
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53226	NC_014410	TAG	2	6	2630294	2630299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304317995
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53233	NC_014410	ATA	2	6	2630552	2630557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304317996
53234	NC_014410	TCA	2	6	2630574	2630579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304317996
53235	NC_014410	GCT	2	6	2630786	2630791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317996
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53237	NC_014410	CTT	2	6	2630915	2630920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304317996
53238	NC_014410	TCCT	2	8	2630955	2630962	0 %	50 %	0 %	50 %	304317996
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53240	NC_014410	CTG	2	6	2631060	2631065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304317996
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53351	NC_014410	AT	3	6	2635398	2635403	50 %	50 %	0 %	0 %	304318000
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53467	NC_014410	CGT	2	6	2640822	2640827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53468	NC_014410	TAC	2	6	2640835	2640840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318007
53469	NC_014410	CTG	2	6	2640855	2640860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53470	NC_014410	TCC	2	6	2640914	2640919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318007
53471	NC_014410	TGT	2	6	2640922	2640927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318007
53472	NC_014410	CGT	2	6	2640978	2640983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53473	NC_014410	CTG	2	6	2641011	2641016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53474	NC_014410	CGT	2	6	2641128	2641133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53475	NC_014410	CTG	2	6	2641161	2641166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53476	NC_014410	GTTG	2	8	2641181	2641188	0 %	50 %	50 %	0 %	304318007
53477	NC_014410	ATT	2	6	2641189	2641194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318007
53478	NC_014410	TGTATT	2	12	2641210	2641221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304318007
53479	NC_014410	ACT	2	6	2641259	2641264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318007
53480	NC_014410	AT	3	6	2641322	2641327	50 %	50 %	0 %	0 %	304318007
53481	NC_014410	ACT	2	6	2641405	2641410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318007
53482	NC_014410	T	6	6	2641418	2641423	0 %	100 %	0 %	0 %	304318007
53483	NC_014410	TAA	2	6	2641429	2641434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318007
53484	NC_014410	TGAT	2	8	2641443	2641450	25 %	50 %	25 %	0 %	304318007
53485	NC_014410	GCT	2	6	2641451	2641456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318007
53486	NC_014410	TCTTG	2	10	2641457	2641466	0 %	60 %	20 %	20 %	304318007
53487	NC_014410	TGT	2	6	2641491	2641496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318007
53488	NC_014410	ATTT	2	8	2641579	2641586	25 %	75 %	0 %	0 %	304318007
53489	NC_014410	ATTT	2	8	2641711	2641718	25 %	75 %	0 %	0 %	304318007
53490	NC_014410	AT	3	6	2641740	2641745	50 %	50 %	0 %	0 %	304318007
53491	NC_014410	ATG	2	6	2641752	2641757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318007
53492	NC_014410	TGTT	2	8	2641758	2641765	0 %	75 %	25 %	0 %	304318007
53493	NC_014410	ATG	2	6	2641773	2641778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318007
53494	NC_014410	CAA	2	6	2641801	2641806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318007
53495	NC_014410	TTTGT	2	10	2641843	2641852	0 %	80 %	20 %	0 %	304318007
53496	NC_014410	CTT	2	6	2642700	2642705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318008
53497	NC_014410	T	6	6	2642726	2642731	0 %	100 %	0 %	0 %	304318008
53498	NC_014410	CTT	2	6	2642748	2642753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318008
53499	NC_014410	AAT	2	6	2642776	2642781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318008
53500	NC_014410	TTC	2	6	2642797	2642802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318008

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