MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 39157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014377	GCA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
2	NC_014377	CTT	2	6	185	190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388600
3	NC_014377	CTA	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388600
4	NC_014377	GAC	2	6	219	224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
5	NC_014377	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	302388600
6	NC_014377	CTG	2	6	388	393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388600
7	NC_014377	TCG	2	6	463	468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388600
8	NC_014377	CTT	2	6	542	547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388600
9	NC_014377	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388600
10	NC_014377	GCA	2	6	611	616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
11	NC_014377	TCT	2	6	645	650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388600
12	NC_014377	TTA	2	6	670	675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302388600
13	NC_014377	CGA	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
14	NC_014377	AATA	2	8	711	718	75 %	25 %	0 %	0 %	302388600
15	NC_014377	GAC	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
16	NC_014377	TTC	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388600
17	NC_014377	GAA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388600
18	NC_014377	TCA	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388600
19	NC_014377	GAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388600
20	NC_014377	CGA	2	6	995	1000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388600
21	NC_014377	GGA	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388600
22	NC_014377	CGG	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388600
23	NC_014377	TAC	2	6	1346	1351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388600
24	NC_014377	GAA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388600
25	NC_014377	A	7	7	1431	1437	100 %	0 %	0 %	0 %	302388600
26	NC_014377	GCA	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388601
27	NC_014377	GAA	2	6	1888	1893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388601
28	NC_014377	CCA	2	6	1910	1915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388601
29	NC_014377	AGG	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388601
30	NC_014377	AGT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388601
31	NC_014377	CCG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388601
32	NC_014377	CTT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388601
33	NC_014377	CT	3	6	2309	2314	0 %	50 %	0 %	50 %	302388601
34	NC_014377	GGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388601
35	NC_014377	ATAC	2	8	2341	2348	50 %	25 %	0 %	25 %	302388601
36	NC_014377	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388601
37	NC_014377	TCT	2	6	2366	2371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388601
38	NC_014377	GGT	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388601
39	NC_014377	GC	3	6	2499	2504	0 %	0 %	50 %	50 %	302388601
40	NC_014377	AGGG	2	8	2518	2525	25 %	0 %	75 %	0 %	302388601
41	NC_014377	AAC	2	6	2533	2538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302388601
42	NC_014377	CCGAGA	2	12	2582	2593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388601
43	NC_014377	TGG	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388601
44	NC_014377	TG	3	6	2737	2742	0 %	50 %	50 %	0 %	302388601
45	NC_014377	GAG	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388601
46	NC_014377	ATT	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302388601
47	NC_014377	AAGGC	2	10	2909	2918	40 %	0 %	40 %	20 %	302388602
48	NC_014377	AGG	2	6	2949	2954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388602
49	NC_014377	CCT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388603
50	NC_014377	TGC	2	6	3284	3289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388603
51	NC_014377	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388603
52	NC_014377	T	7	7	3376	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	302388603
53	NC_014377	GAG	3	9	3423	3431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388603
54	NC_014377	TCA	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388603
55	NC_014377	GCT	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388603
56	NC_014377	AAG	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388603
57	NC_014377	TCA	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388603
58	NC_014377	AGC	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388603
59	NC_014377	AG	3	6	3676	3681	50 %	0 %	50 %	0 %	302388603
60	NC_014377	GAGATA	2	12	3688	3699	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302388603
61	NC_014377	GCA	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388603
62	NC_014377	ATCC	2	8	3741	3748	25 %	25 %	0 %	50 %	302388603
63	NC_014377	CTG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388603
64	NC_014377	GGA	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388603
65	NC_014377	ACG	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388603
66	NC_014377	T	8	8	3932	3939	0 %	100 %	0 %	0 %	302388603
67	NC_014377	GAC	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388603
68	NC_014377	AGG	3	9	4003	4011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388603
69	NC_014377	GGA	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388603
70	NC_014377	A	7	7	4090	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	302388603
71	NC_014377	A	6	6	4143	4148	100 %	0 %	0 %	0 %	302388604
72	NC_014377	A	6	6	4150	4155	100 %	0 %	0 %	0 %	302388604
73	NC_014377	A	7	7	4175	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	302388604
74	NC_014377	GAA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388604
75	NC_014377	T	6	6	4274	4279	0 %	100 %	0 %	0 %	302388604
76	NC_014377	CCA	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388604
77	NC_014377	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	302388604
78	NC_014377	A	8	8	4487	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	302388604
79	NC_014377	GGT	2	6	4631	4636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388605
80	NC_014377	ATA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388605
81	NC_014377	GAG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388605
82	NC_014377	GAG	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388605
83	NC_014377	CTC	2	6	4812	4817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388605
84	NC_014377	ACA	2	6	5015	5020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302388606
85	NC_014377	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388606
86	NC_014377	GAC	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388606
87	NC_014377	TGC	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388606
88	NC_014377	GGA	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388606
89	NC_014377	CGG	2	6	5199	5204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388606
90	NC_014377	AGG	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388606
91	NC_014377	AGA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388606
92	NC_014377	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388606
93	NC_014377	GGC	2	6	5610	5615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388606
94	NC_014377	GGAAGT	2	12	5634	5645	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302388606
95	NC_014377	AGG	2	6	5711	5716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388606
96	NC_014377	TGG	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388606
97	NC_014377	CCG	2	6	5843	5848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388606
98	NC_014377	TCA	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388606
99	NC_014377	AGACGA	2	12	5888	5899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302388606
100	NC_014377	GGT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388606
101	NC_014377	GAA	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388606
102	NC_014377	TCG	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388606
103	NC_014377	GCC	2	6	6016	6021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388606
104	NC_014377	TGG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388606
105	NC_014377	CGG	2	6	6164	6169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388606
106	NC_014377	GAT	2	6	6291	6296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388606
107	NC_014377	GAT	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388606
108	NC_014377	GGTAT	2	10	6454	6463	20 %	40 %	40 %	0 %	302388606
109	NC_014377	C	7	7	6475	6481	0 %	0 %	0 %	100 %	302388606
110	NC_014377	TAC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388606
111	NC_014377	GGC	2	6	6819	6824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388607
112	NC_014377	AGA	2	6	6845	6850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
113	NC_014377	A	6	6	6858	6863	100 %	0 %	0 %	0 %	302388607
114	NC_014377	TA	3	6	6867	6872	50 %	50 %	0 %	0 %	302388607
115	NC_014377	TGAG	2	8	6961	6968	25 %	25 %	50 %	0 %	302388607
116	NC_014377	CCA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388607
117	NC_014377	CGA	2	6	7253	7258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
118	NC_014377	CGG	2	6	7273	7278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388607
119	NC_014377	TGC	2	6	7279	7284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388607
120	NC_014377	ATG	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388607
121	NC_014377	GCC	2	6	7434	7439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388607
122	NC_014377	ATC	2	6	7470	7475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388607
123	NC_014377	TAC	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388607
124	NC_014377	ATA	2	6	7524	7529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388607
125	NC_014377	AGC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
126	NC_014377	CAA	2	6	7607	7612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302388607
127	NC_014377	AC	3	6	7769	7774	50 %	0 %	0 %	50 %	302388607
128	NC_014377	TGG	2	6	7813	7818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388607
129	NC_014377	CAG	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
130	NC_014377	GTG	2	6	7884	7889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388607
131	NC_014377	AAG	2	6	7892	7897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
132	NC_014377	GAA	2	6	7923	7928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
133	NC_014377	ACC	2	6	7966	7971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388607
134	NC_014377	TACC	2	8	8011	8018	25 %	25 %	0 %	50 %	302388607
135	NC_014377	GAA	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
136	NC_014377	AGA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
137	NC_014377	TAC	2	6	8160	8165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388607
138	NC_014377	TAA	2	6	8203	8208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388607
139	NC_014377	CGA	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
140	NC_014377	CGA	2	6	8285	8290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
141	NC_014377	GAA	2	6	8307	8312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388607
142	NC_014377	TAA	2	6	8320	8325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388607
143	NC_014377	ACAT	2	8	8331	8338	50 %	25 %	0 %	25 %	302388607
144	NC_014377	GGC	2	6	8388	8393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388607
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147	NC_014377	CCA	2	6	8452	8457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388607
148	NC_014377	CAC	2	6	8460	8465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388607
149	NC_014377	GTG	2	6	8466	8471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388607
150	NC_014377	TTC	2	6	8475	8480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388607
151	NC_014377	CCT	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388607
152	NC_014377	TGGTGA	2	12	8638	8649	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302388607
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154	NC_014377	TGG	2	6	8761	8766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388607
155	NC_014377	CCGC	2	8	8851	8858	0 %	0 %	25 %	75 %	302388607
156	NC_014377	CGA	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388607
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158	NC_014377	C	6	6	8968	8973	0 %	0 %	0 %	100 %	302388607
159	NC_014377	ATC	2	6	9012	9017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388607
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162	NC_014377	GTG	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388607
163	NC_014377	GAT	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388607
164	NC_014377	ATC	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388607
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168	NC_014377	CGG	2	6	9202	9207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388607
169	NC_014377	CAC	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388608
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173	NC_014377	TCC	2	6	9396	9401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388608
174	NC_014377	CGGA	2	8	9432	9439	25 %	0 %	50 %	25 %	302388608
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176	NC_014377	AATT	2	8	9593	9600	50 %	50 %	0 %	0 %	302388609
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241	NC_014377	GGCG	2	8	12986	12993	0 %	0 %	75 %	25 %	302388613
242	NC_014377	GCT	2	6	13077	13082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388613
243	NC_014377	CTC	2	6	13185	13190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388613
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246	NC_014377	AT	3	6	13261	13266	50 %	50 %	0 %	0 %	302388614
247	NC_014377	TAG	2	6	13313	13318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388614
248	NC_014377	AGT	2	6	13347	13352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388614
249	NC_014377	GGA	2	6	13425	13430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388614
250	NC_014377	TGG	2	6	13436	13441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388614
251	NC_014377	AAG	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388614
252	NC_014377	TGG	2	6	13523	13528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388614
253	NC_014377	TTTAC	2	10	13565	13574	20 %	60 %	0 %	20 %	302388614
254	NC_014377	TGG	2	6	13679	13684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388614
255	NC_014377	G	6	6	13683	13688	0 %	0 %	100 %	0 %	302388614
256	NC_014377	TGC	2	6	13714	13719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388614
257	NC_014377	TGC	2	6	13825	13830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388614
258	NC_014377	ACG	2	6	13844	13849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388614
259	NC_014377	TGC	2	6	13870	13875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388614
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261	NC_014377	GGT	2	6	13947	13952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388614
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386	NC_014377	CGGGA	2	10	21775	21784	20 %	0 %	60 %	20 %	302388623
387	NC_014377	T	6	6	21808	21813	0 %	100 %	0 %	0 %	302388623
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