MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 47629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014209	GGT	2	6	190377	190382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543677
4003	NC_014209	ATA	3	9	190383	190391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543677
4004	NC_014209	ATA	2	6	190443	190448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543678
4005	NC_014209	AAT	2	6	190461	190466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543678
4006	NC_014209	GCA	2	6	190491	190496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543678
4007	NC_014209	AGG	2	6	190511	190516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543678
4008	NC_014209	TGA	2	6	190568	190573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543678
4009	NC_014209	A	6	6	190740	190745	100 %	0 %	0 %	0 %	297543678
4010	NC_014209	TTAA	2	8	190827	190834	50 %	50 %	0 %	0 %	297543678
4011	NC_014209	TGGA	2	8	190921	190928	25 %	25 %	50 %	0 %	297543678
4012	NC_014209	ATA	3	9	190938	190946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543678
4013	NC_014209	GTT	2	6	191010	191015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543678
4014	NC_014209	AAG	2	6	191050	191055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543678
4015	NC_014209	A	7	7	191090	191096	100 %	0 %	0 %	0 %	297543678
4016	NC_014209	TA	3	6	191166	191171	50 %	50 %	0 %	0 %	297543678
4017	NC_014209	A	8	8	191198	191205	100 %	0 %	0 %	0 %	297543678
4018	NC_014209	AGA	2	6	191219	191224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543678
4019	NC_014209	A	6	6	191241	191246	100 %	0 %	0 %	0 %	297543678
4020	NC_014209	A	6	6	191286	191291	100 %	0 %	0 %	0 %	297543678
4021	NC_014209	ATT	2	6	191298	191303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543678
4022	NC_014209	GAA	2	6	191339	191344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543678
4023	NC_014209	TAT	2	6	191432	191437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543678
4024	NC_014209	GCT	2	6	191454	191459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543678
4025	NC_014209	TAT	2	6	191502	191507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543679
4026	NC_014209	TG	3	6	191509	191514	0 %	50 %	50 %	0 %	297543679
4027	NC_014209	GCAAAA	2	12	191561	191572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297543679
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4029	NC_014209	A	6	6	191698	191703	100 %	0 %	0 %	0 %	297543679
4030	NC_014209	AGA	2	6	191722	191727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543679
4031	NC_014209	AATTT	2	10	191732	191741	40 %	60 %	0 %	0 %	297543679
4032	NC_014209	AGA	2	6	191845	191850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543679
4033	NC_014209	TA	3	6	191874	191879	50 %	50 %	0 %	0 %	297543679
4034	NC_014209	AGA	2	6	191935	191940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543679
4035	NC_014209	A	6	6	191951	191956	100 %	0 %	0 %	0 %	297543679
4036	NC_014209	TGG	2	6	191980	191985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543679
4037	NC_014209	AAG	2	6	191997	192002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543679
4038	NC_014209	A	7	7	192007	192013	100 %	0 %	0 %	0 %	297543679
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4041	NC_014209	GCT	2	6	192233	192238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543679
4042	NC_014209	AAT	2	6	192248	192253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543679
4043	NC_014209	GGA	2	6	192272	192277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543679
4044	NC_014209	TGA	2	6	192303	192308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543679
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4048	NC_014209	A	6	6	192447	192452	100 %	0 %	0 %	0 %	297543680
4049	NC_014209	ACA	2	6	192490	192495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543680
4050	NC_014209	TAG	2	6	192549	192554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543680
4051	NC_014209	GA	3	6	192589	192594	50 %	0 %	50 %	0 %	297543680
4052	NC_014209	TGGCAA	2	12	192630	192641	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297543680
4053	NC_014209	A	7	7	192661	192667	100 %	0 %	0 %	0 %	297543680
4054	NC_014209	AAT	2	6	192673	192678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543680
4055	NC_014209	CTG	2	6	192732	192737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543680
4056	NC_014209	ATT	2	6	192795	192800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543680
4057	NC_014209	GTA	2	6	192839	192844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543680
4058	NC_014209	AGG	2	6	192862	192867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543680
4059	NC_014209	TGC	2	6	192877	192882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543680
4060	NC_014209	AAAG	2	8	192896	192903	75 %	0 %	25 %	0 %	297543680
4061	NC_014209	GC	3	6	192906	192911	0 %	0 %	50 %	50 %	297543680
4062	NC_014209	GCT	2	6	192938	192943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543680
4063	NC_014209	AAT	2	6	193080	193085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543680
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4065	NC_014209	TAG	2	6	193207	193212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543681
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4069	NC_014209	GA	3	6	193289	193294	50 %	0 %	50 %	0 %	297543681
4070	NC_014209	GCA	2	6	193371	193376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543681
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4084	NC_014209	AT	3	6	194001	194006	50 %	50 %	0 %	0 %	297543682
4085	NC_014209	GTTG	2	8	194014	194021	0 %	50 %	50 %	0 %	297543682
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4090	NC_014209	CTG	2	6	194167	194172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543682
4091	NC_014209	TGC	2	6	194195	194200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543682
4092	NC_014209	TAC	2	6	194372	194377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543682
4093	NC_014209	CAC	2	6	194442	194447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543682
4094	NC_014209	TGC	2	6	194509	194514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543682
4095	NC_014209	TCC	2	6	194538	194543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543682
4096	NC_014209	ATT	2	6	194565	194570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543682
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4098	NC_014209	A	7	7	194632	194638	100 %	0 %	0 %	0 %	297543682
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4103	NC_014209	AACA	2	8	194878	194885	75 %	0 %	0 %	25 %	297543683
4104	NC_014209	TAC	2	6	194897	194902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543683
4105	NC_014209	TAC	2	6	194972	194977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543683
4106	NC_014209	AGA	2	6	195077	195082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543683
4107	NC_014209	AATCT	2	10	195145	195154	40 %	40 %	0 %	20 %	297543683
4108	NC_014209	AAG	2	6	195160	195165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543683
4109	NC_014209	GAA	2	6	195174	195179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543683
4110	NC_014209	TA	3	6	195220	195225	50 %	50 %	0 %	0 %	297543683
4111	NC_014209	AG	3	6	195232	195237	50 %	0 %	50 %	0 %	297543683
4112	NC_014209	AAT	2	6	195279	195284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543683
4113	NC_014209	A	6	6	195285	195290	100 %	0 %	0 %	0 %	297543683
4114	NC_014209	TTG	2	6	195295	195300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543683
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4119	NC_014209	TGA	2	6	195529	195534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543683
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4121	NC_014209	GA	3	6	195593	195598	50 %	0 %	50 %	0 %	297543683
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4494	NC_014209	A	6	6	212928	212933	100 %	0 %	0 %	0 %	297543702
4495	NC_014209	TAAC	2	8	212934	212941	50 %	25 %	0 %	25 %	297543702
4496	NC_014209	T	6	6	212962	212967	0 %	100 %	0 %	0 %	297543702
4497	NC_014209	CTTAA	2	10	212980	212989	40 %	40 %	0 %	20 %	297543702
4498	NC_014209	TGAT	2	8	213169	213176	25 %	50 %	25 %	0 %	297543703
4499	NC_014209	AGA	2	6	213200	213205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543703
4500	NC_014209	AGA	2	6	213207	213212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543703

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