MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 47629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_014209	CTA	2	6	1621664	1621669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545047
34002	NC_014209	ATT	2	6	1621687	1621692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545047
34003	NC_014209	ATA	2	6	1621711	1621716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545047
34004	NC_014209	TAA	2	6	1621768	1621773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545047
34005	NC_014209	T	7	7	1621787	1621793	0 %	100 %	0 %	0 %	297545047
34006	NC_014209	CCT	2	6	1621833	1621838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545048
34007	NC_014209	GCC	2	6	1621910	1621915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545048
34008	NC_014209	AAG	2	6	1621989	1621994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545048
34009	NC_014209	TCC	3	9	1622011	1622019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545048
34010	NC_014209	TGC	2	6	1622032	1622037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545048
34011	NC_014209	GTT	2	6	1622044	1622049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545048
34012	NC_014209	ATA	2	6	1622072	1622077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545048
34013	NC_014209	AGA	2	6	1622089	1622094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545048
34014	NC_014209	TCA	2	6	1622208	1622213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545048
34015	NC_014209	CA	3	6	1622231	1622236	50 %	0 %	0 %	50 %	297545048
34016	NC_014209	ACC	2	6	1622326	1622331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545048
34017	NC_014209	CTG	2	6	1622335	1622340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545048
34018	NC_014209	AGC	2	6	1622365	1622370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545048
34019	NC_014209	AAT	2	6	1622395	1622400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545048
34020	NC_014209	AAG	2	6	1622461	1622466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545048
34021	NC_014209	AAT	2	6	1622470	1622475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545048
34022	NC_014209	AAT	2	6	1622483	1622488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545048
34023	NC_014209	ACT	2	6	1622537	1622542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545048
34024	NC_014209	T	6	6	1622573	1622578	0 %	100 %	0 %	0 %	297545048
34025	NC_014209	ATAG	2	8	1622675	1622682	50 %	25 %	25 %	0 %	297545048
34026	NC_014209	CTG	2	6	1622795	1622800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34027	NC_014209	TTTGA	2	10	1622816	1622825	20 %	60 %	20 %	0 %	297545049
34028	NC_014209	ATC	2	6	1622834	1622839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545049
34029	NC_014209	GCT	2	6	1622841	1622846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34030	NC_014209	TAA	2	6	1622872	1622877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545049
34031	NC_014209	CTG	2	6	1622908	1622913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34032	NC_014209	CTT	2	6	1623094	1623099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545049
34033	NC_014209	AGC	2	6	1623128	1623133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34034	NC_014209	AAG	2	6	1623148	1623153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545049
34035	NC_014209	GCTT	2	8	1623207	1623214	0 %	50 %	25 %	25 %	297545049
34036	NC_014209	TA	3	6	1623242	1623247	50 %	50 %	0 %	0 %	297545049
34037	NC_014209	CTTT	2	8	1623352	1623359	0 %	75 %	0 %	25 %	297545049
34038	NC_014209	CCA	2	6	1623399	1623404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545049
34039	NC_014209	CTT	2	6	1623490	1623495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545049
34040	NC_014209	TTAA	2	8	1623504	1623511	50 %	50 %	0 %	0 %	297545049
34041	NC_014209	ATC	2	6	1623512	1623517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545049
34042	NC_014209	CAT	2	6	1623604	1623609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545049
34043	NC_014209	ATC	2	6	1623641	1623646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545049
34044	NC_014209	CAAAC	2	10	1623719	1623728	60 %	0 %	0 %	40 %	297545049
34045	NC_014209	AGC	2	6	1623755	1623760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34046	NC_014209	TTG	2	6	1623807	1623812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545049
34047	NC_014209	TCTGC	2	10	1623817	1623826	0 %	40 %	20 %	40 %	297545049
34048	NC_014209	TTTG	2	8	1623830	1623837	0 %	75 %	25 %	0 %	297545049
34049	NC_014209	TAC	2	6	1623884	1623889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545049
34050	NC_014209	CTTT	2	8	1623904	1623911	0 %	75 %	0 %	25 %	297545049
34051	NC_014209	TCTG	2	8	1623915	1623922	0 %	50 %	25 %	25 %	297545049
34052	NC_014209	TGA	2	6	1623929	1623934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545049
34053	NC_014209	AGC	2	6	1623974	1623979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545049
34054	NC_014209	GCAAT	2	10	1624006	1624015	40 %	20 %	20 %	20 %	297545049
34055	NC_014209	CTT	2	6	1624028	1624033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545049
34056	NC_014209	GTT	2	6	1624158	1624163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545050
34057	NC_014209	AAT	2	6	1624217	1624222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545050
34058	NC_014209	AGT	2	6	1624266	1624271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545050
34059	NC_014209	TTTA	2	8	1624281	1624288	25 %	75 %	0 %	0 %	297545050
34060	NC_014209	CAACTA	2	12	1624292	1624303	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	297545050
34061	NC_014209	TCA	2	6	1624339	1624344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545050
34062	NC_014209	CAT	2	6	1624455	1624460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545050
34063	NC_014209	ATA	2	6	1624521	1624526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545050
34064	NC_014209	ATT	2	6	1624590	1624595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545050
34065	NC_014209	T	6	6	1624854	1624859	0 %	100 %	0 %	0 %	297545050
34066	NC_014209	CAA	2	6	1624985	1624990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545050
34067	NC_014209	CAAA	2	8	1625021	1625028	75 %	0 %	0 %	25 %	297545050
34068	NC_014209	TCT	2	6	1625044	1625049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545050
34069	NC_014209	ATG	2	6	1625079	1625084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545050
34070	NC_014209	A	6	6	1625085	1625090	100 %	0 %	0 %	0 %	297545050
34071	NC_014209	CAT	2	6	1625099	1625104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545050
34072	NC_014209	AAT	2	6	1625119	1625124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545050
34073	NC_014209	ATT	2	6	1625166	1625171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545050
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34077	NC_014209	TA	3	6	1625342	1625347	50 %	50 %	0 %	0 %	297545050
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34082	NC_014209	TACT	2	8	1625498	1625505	25 %	50 %	0 %	25 %	297545050
34083	NC_014209	CTAT	2	8	1625542	1625549	25 %	50 %	0 %	25 %	297545050
34084	NC_014209	AT	3	6	1625559	1625564	50 %	50 %	0 %	0 %	297545050
34085	NC_014209	ATT	2	6	1625583	1625588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545050
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34088	NC_014209	TCA	2	6	1625672	1625677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545050
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34090	NC_014209	T	6	6	1625921	1625926	0 %	100 %	0 %	0 %	297545051
34091	NC_014209	CTA	2	6	1625931	1625936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545051
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34098	NC_014209	CA	3	6	1626198	1626203	50 %	0 %	0 %	50 %	297545051
34099	NC_014209	TA	3	6	1626237	1626242	50 %	50 %	0 %	0 %	297545051
34100	NC_014209	AT	3	6	1626279	1626284	50 %	50 %	0 %	0 %	297545051
34101	NC_014209	CTT	2	6	1626294	1626299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545051
34102	NC_014209	AT	4	8	1626326	1626333	50 %	50 %	0 %	0 %	297545051
34103	NC_014209	TGC	2	6	1626359	1626364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545051
34104	NC_014209	CAT	2	6	1626429	1626434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545051
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34106	NC_014209	AGCA	2	8	1626466	1626473	50 %	0 %	25 %	25 %	297545051
34107	NC_014209	T	6	6	1626485	1626490	0 %	100 %	0 %	0 %	297545051
34108	NC_014209	CTT	2	6	1626495	1626500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545051
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34110	NC_014209	GTT	2	6	1626594	1626599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545051
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34112	NC_014209	CAT	2	6	1626699	1626704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545051
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34115	NC_014209	CTC	2	6	1626836	1626841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545052
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