MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 47629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014209	GAA	2	6	602311	602316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544033
12502	NC_014209	A	6	6	602346	602351	100 %	0 %	0 %	0 %	297544033
12503	NC_014209	AATT	2	8	602414	602421	50 %	50 %	0 %	0 %	297544033
12504	NC_014209	A	6	6	602434	602439	100 %	0 %	0 %	0 %	297544033
12505	NC_014209	GAACA	2	10	602630	602639	60 %	0 %	20 %	20 %	297544034
12506	NC_014209	GAT	2	6	602719	602724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544034
12507	NC_014209	TAA	2	6	602745	602750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544034
12508	NC_014209	CATA	2	8	602779	602786	50 %	25 %	0 %	25 %	297544034
12509	NC_014209	TAG	2	6	602822	602827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544034
12510	NC_014209	TTG	2	6	602834	602839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544034
12511	NC_014209	TCC	2	6	602871	602876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297544034
12512	NC_014209	A	6	6	602879	602884	100 %	0 %	0 %	0 %	297544034
12513	NC_014209	G	6	6	602946	602951	0 %	0 %	100 %	0 %	297544034
12514	NC_014209	GGAT	2	8	602958	602965	25 %	25 %	50 %	0 %	297544035
12515	NC_014209	ACA	2	6	603049	603054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544035
12516	NC_014209	AAC	2	6	603093	603098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544035
12517	NC_014209	CAA	2	6	603119	603124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544035
12518	NC_014209	ATA	2	6	603168	603173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544035
12519	NC_014209	AGCTAC	2	12	603238	603249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297544035
12520	NC_014209	TA	3	6	603276	603281	50 %	50 %	0 %	0 %	297544035
12521	NC_014209	GCG	2	6	603308	603313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297544035
12522	NC_014209	CTG	2	6	603348	603353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544035
12523	NC_014209	TATTG	2	10	603376	603385	20 %	60 %	20 %	0 %	297544035
12524	NC_014209	TGC	2	6	603526	603531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544035
12525	NC_014209	AGAT	2	8	603534	603541	50 %	25 %	25 %	0 %	297544035
12526	NC_014209	AT	3	6	603570	603575	50 %	50 %	0 %	0 %	297544035
12527	NC_014209	ATT	2	6	603721	603726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544035
12528	NC_014209	TACAGG	2	12	603745	603756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297544035
12529	NC_014209	CAA	2	6	603759	603764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544035
12530	NC_014209	AT	3	6	603794	603799	50 %	50 %	0 %	0 %	297544035
12531	NC_014209	TTG	2	6	603816	603821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544035
12532	NC_014209	A	6	6	603867	603872	100 %	0 %	0 %	0 %	297544035
12533	NC_014209	GAA	2	6	603944	603949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544035
12534	NC_014209	TGT	2	6	604015	604020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544035
12535	NC_014209	CGA	2	6	604105	604110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544035
12536	NC_014209	AAT	2	6	604136	604141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544035
12537	NC_014209	TAC	2	6	604198	604203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544035
12538	NC_014209	GAA	2	6	604379	604384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544035
12539	NC_014209	ACT	2	6	604405	604410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544035
12540	NC_014209	ATGT	2	8	604415	604422	25 %	50 %	25 %	0 %	297544035
12541	NC_014209	CAG	2	6	604457	604462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544035
12542	NC_014209	ATG	2	6	604472	604477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544035
12543	NC_014209	CAG	2	6	604512	604517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544036
12544	NC_014209	GAA	2	6	604551	604556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544036
12545	NC_014209	ATA	2	6	604581	604586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544036
12546	NC_014209	A	8	8	604618	604625	100 %	0 %	0 %	0 %	297544036
12547	NC_014209	GCA	2	6	604635	604640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544036
12548	NC_014209	AAT	3	9	604641	604649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544036
12549	NC_014209	ATT	2	6	604668	604673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544036
12550	NC_014209	AAG	2	6	604748	604753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544036
12551	NC_014209	A	7	7	604772	604778	100 %	0 %	0 %	0 %	297544036
12552	NC_014209	TAA	2	6	604847	604852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544036
12553	NC_014209	TGA	2	6	604881	604886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544036
12554	NC_014209	ATA	3	9	604892	604900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544037
12555	NC_014209	A	6	6	604967	604972	100 %	0 %	0 %	0 %	297544037
12556	NC_014209	CAA	2	6	604992	604997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544037
12557	NC_014209	AGA	2	6	605001	605006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544037
12558	NC_014209	A	6	6	605033	605038	100 %	0 %	0 %	0 %	297544037
12559	NC_014209	AGA	2	6	605043	605048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544037
12560	NC_014209	A	6	6	605184	605189	100 %	0 %	0 %	0 %	297544037
12561	NC_014209	A	6	6	605198	605203	100 %	0 %	0 %	0 %	297544037
12562	NC_014209	CTG	2	6	605240	605245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544037
12563	NC_014209	A	6	6	605252	605257	100 %	0 %	0 %	0 %	297544037
12564	NC_014209	TA	3	6	605299	605304	50 %	50 %	0 %	0 %	297544037
12565	NC_014209	T	6	6	605337	605342	0 %	100 %	0 %	0 %	297544037
12566	NC_014209	TTA	2	6	605401	605406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544038
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12569	NC_014209	T	6	6	605473	605478	0 %	100 %	0 %	0 %	297544038
12570	NC_014209	TTC	2	6	605501	605506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544038
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12572	NC_014209	GCG	2	6	605535	605540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297544038
12573	NC_014209	TTC	2	6	605615	605620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544038
12574	NC_014209	TGCT	2	8	605636	605643	0 %	50 %	25 %	25 %	297544038
12575	NC_014209	TGT	2	6	605688	605693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544038
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12581	NC_014209	CTA	2	6	605824	605829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544038
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12586	NC_014209	TAGG	2	8	605960	605967	25 %	25 %	50 %	0 %	297544038
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12591	NC_014209	T	6	6	606090	606095	0 %	100 %	0 %	0 %	297544038
12592	NC_014209	CTT	2	6	606160	606165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544038
12593	NC_014209	TTC	2	6	606194	606199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544038
12594	NC_014209	ACT	2	6	606210	606215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544038
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12596	NC_014209	ATA	2	6	606292	606297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544038
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12600	NC_014209	GAA	2	6	606464	606469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544038
12601	NC_014209	TTA	2	6	606499	606504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544038
12602	NC_014209	ATT	2	6	606513	606518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544038
12603	NC_014209	T	6	6	606541	606546	0 %	100 %	0 %	0 %	297544038
12604	NC_014209	GAA	2	6	606558	606563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544038
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12608	NC_014209	CATTGT	2	12	606631	606642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297544038
12609	NC_014209	CTTC	2	8	606651	606658	0 %	50 %	0 %	50 %	297544038
12610	NC_014209	AG	3	6	606665	606670	50 %	0 %	50 %	0 %	297544038
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12619	NC_014209	TGG	2	6	607174	607179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297544038
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12990	NC_014209	TTGGTT	2	12	625972	625983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544056
12991	NC_014209	TTC	2	6	625996	626001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544056
12992	NC_014209	CGA	2	6	626005	626010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544056
12993	NC_014209	TCC	2	6	626024	626029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297544056
12994	NC_014209	TCG	2	6	626033	626038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544056
12995	NC_014209	CCT	2	6	626053	626058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297544056
12996	NC_014209	GGTTG	2	10	626106	626115	0 %	40 %	60 %	0 %	297544056
12997	NC_014209	ATT	2	6	626138	626143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544056
12998	NC_014209	GTTT	2	8	626183	626190	0 %	75 %	25 %	0 %	297544056
12999	NC_014209	T	8	8	626188	626195	0 %	100 %	0 %	0 %	297544056
13000	NC_014209	TTG	2	6	626205	626210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297544056

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