MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobispora bispora DSM 43833 chromosome

Total Repeats: 102005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014165	CTG	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296267999
2	NC_014165	GCA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
3	NC_014165	GC	3	6	347	352	0 %	0 %	50 %	50 %	296267999
4	NC_014165	TCC	2	6	355	360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296267999
5	NC_014165	CTG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296267999
6	NC_014165	GGC	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296267999
7	NC_014165	CCGC	2	8	602	609	0 %	0 %	25 %	75 %	296267999
8	NC_014165	CAC	2	6	638	643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296267999
9	NC_014165	CGGCA	2	10	679	688	20 %	0 %	40 %	40 %	296267999
10	NC_014165	GGCCG	2	10	692	701	0 %	0 %	60 %	40 %	296267999
11	NC_014165	CGG	2	6	725	730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296267999
12	NC_014165	GCCG	2	8	790	797	0 %	0 %	50 %	50 %	296267999
13	NC_014165	GTC	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296267999
14	NC_014165	GCCC	2	8	815	822	0 %	0 %	25 %	75 %	296267999
15	NC_014165	CGC	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296267999
16	NC_014165	GTT	2	6	932	937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296267999
17	NC_014165	ACG	2	6	1009	1014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
18	NC_014165	GGA	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296267999
19	NC_014165	TCA	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296267999
20	NC_014165	CG	4	8	1098	1105	0 %	0 %	50 %	50 %	296267999
21	NC_014165	GAC	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
22	NC_014165	AGG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296267999
23	NC_014165	TTC	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296267999
24	NC_014165	AGCA	2	8	1212	1219	50 %	0 %	25 %	25 %	296267999
25	NC_014165	AGC	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
26	NC_014165	GGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296267999
27	NC_014165	GCC	2	6	1316	1321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296267999
28	NC_014165	GAA	2	6	1352	1357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296267999
29	NC_014165	AGG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296267999
30	NC_014165	CGC	2	6	1376	1381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296267999
31	NC_014165	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296267999
32	NC_014165	CGA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
33	NC_014165	GAG	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296267999
34	NC_014165	TCA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296267999
35	NC_014165	CGA	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
36	NC_014165	TCGA	2	8	1602	1609	25 %	25 %	25 %	25 %	296267999
37	NC_014165	CG	3	6	1649	1654	0 %	0 %	50 %	50 %	296267999
38	NC_014165	TCCC	2	8	1695	1702	0 %	25 %	0 %	75 %	296267999
39	NC_014165	CAG	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
40	NC_014165	CGG	2	6	1721	1726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296267999
41	NC_014165	ACCAC	2	10	1732	1741	40 %	0 %	0 %	60 %	296267999
42	NC_014165	GCG	2	6	1784	1789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296267999
43	NC_014165	ACC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296267999
44	NC_014165	AGC	2	6	1831	1836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296267999
45	NC_014165	GC	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	296267999
46	NC_014165	GTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296268000
47	NC_014165	CGTGG	2	10	2428	2437	0 %	20 %	60 %	20 %	296268000
48	NC_014165	GC	3	6	2441	2446	0 %	0 %	50 %	50 %	296268000
49	NC_014165	CGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268000
50	NC_014165	GTG	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268000
51	NC_014165	GTC	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268000
52	NC_014165	GCA	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268000
53	NC_014165	CTC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268000
54	NC_014165	GGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268000
55	NC_014165	GCC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268000
56	NC_014165	GAC	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268000
57	NC_014165	CGC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268000
58	NC_014165	ACCG	2	8	2897	2904	25 %	0 %	25 %	50 %	296268000
59	NC_014165	GGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268000
60	NC_014165	CGG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268000
61	NC_014165	GAT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268000
62	NC_014165	GCG	2	6	3091	3096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268000
63	NC_014165	CAC	3	9	3097	3105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268000
64	NC_014165	GCT	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268000
65	NC_014165	CGCT	2	8	3137	3144	0 %	25 %	25 %	50 %	296268000
66	NC_014165	TCG	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268000
67	NC_014165	TCG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268000
68	NC_014165	CGG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268000
69	NC_014165	GGT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268000
70	NC_014165	GCG	2	6	3288	3293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268000
71	NC_014165	ACC	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268000
72	NC_014165	CTG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268000
73	NC_014165	CAC	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268000
74	NC_014165	CCA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268000
75	NC_014165	ATC	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268000
76	NC_014165	CGGC	2	8	3450	3457	0 %	0 %	50 %	50 %	296268000
77	NC_014165	GAG	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268000
78	NC_014165	CCG	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268001
79	NC_014165	CGG	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268001
80	NC_014165	GGT	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268001
81	NC_014165	TCG	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268001
82	NC_014165	CCGG	2	8	3811	3818	0 %	0 %	50 %	50 %	296268001
83	NC_014165	GAC	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268001
84	NC_014165	GCT	2	6	3855	3860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268001
85	NC_014165	CGGC	2	8	3863	3870	0 %	0 %	50 %	50 %	296268001
86	NC_014165	CGG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268001
87	NC_014165	GAC	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268001
88	NC_014165	TCG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268001
89	NC_014165	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268001
90	NC_014165	GCC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268001
91	NC_014165	GGA	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268001
92	NC_014165	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268001
93	NC_014165	CTC	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268001
94	NC_014165	GCGA	2	8	4195	4202	25 %	0 %	50 %	25 %	296268001
95	NC_014165	GCT	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268001
96	NC_014165	GCT	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268001
97	NC_014165	CG	3	6	4285	4290	0 %	0 %	50 %	50 %	296268001
98	NC_014165	GAG	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268001
99	NC_014165	GGA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268001
100	NC_014165	GAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268001
101	NC_014165	CGG	2	6	4485	4490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268001
102	NC_014165	GGCCGA	2	12	4563	4574	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296268001
103	NC_014165	GGGCA	2	10	4815	4824	20 %	0 %	60 %	20 %	296268002
104	NC_014165	CGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
105	NC_014165	GC	3	6	4909	4914	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
106	NC_014165	GGC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
107	NC_014165	GCC	2	6	4951	4956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
108	NC_014165	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268002
109	NC_014165	CGG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
110	NC_014165	GCG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
111	NC_014165	CTC	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268002
112	NC_014165	CG	3	6	5145	5150	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
113	NC_014165	GC	3	6	5168	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
114	NC_014165	TGC	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268002
115	NC_014165	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
116	NC_014165	CGGC	2	8	5237	5244	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
117	NC_014165	GCG	2	6	5245	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
118	NC_014165	CG	3	6	5249	5254	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
119	NC_014165	GGA	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268002
120	NC_014165	CGC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
121	NC_014165	ACGGC	2	10	5339	5348	20 %	0 %	40 %	40 %	296268002
122	NC_014165	CGCTC	2	10	5386	5395	0 %	20 %	20 %	60 %	296268002
123	NC_014165	CGC	2	6	5414	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
124	NC_014165	TCC	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268002
125	NC_014165	CGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
126	NC_014165	GC	3	6	5546	5551	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
127	NC_014165	GCG	2	6	5587	5592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
128	NC_014165	GAC	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268002
129	NC_014165	CTG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268002
130	NC_014165	CG	4	8	5648	5655	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
131	NC_014165	CGC	2	6	5705	5710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268002
132	NC_014165	CTC	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268002
133	NC_014165	CGG	2	6	5732	5737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
134	NC_014165	CGA	2	6	5756	5761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268002
135	NC_014165	CCGGCG	2	12	5786	5797	0 %	0 %	50 %	50 %	296268002
136	NC_014165	TCG	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268002
137	NC_014165	CGG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268002
138	NC_014165	GAC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268002
139	NC_014165	G	6	6	5898	5903	0 %	0 %	100 %	0 %	296268002
140	NC_014165	GCG	2	6	5974	5979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
141	NC_014165	GCC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268003
142	NC_014165	CGCGG	2	10	6033	6042	0 %	0 %	60 %	40 %	296268003
143	NC_014165	GGC	2	6	6047	6052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
144	NC_014165	CGG	2	6	6070	6075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
145	NC_014165	CGG	2	6	6078	6083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
146	NC_014165	GCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268003
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148	NC_014165	CGG	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
149	NC_014165	TCG	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268003
150	NC_014165	CGC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268003
151	NC_014165	CCGG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	296268003
152	NC_014165	TGG	3	9	6269	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268003
153	NC_014165	GCT	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268003
154	NC_014165	CGG	2	6	6334	6339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
155	NC_014165	CGG	2	6	6410	6415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
156	NC_014165	GCG	2	6	6431	6436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268003
157	NC_014165	CG	3	6	6446	6451	0 %	0 %	50 %	50 %	296268003
158	NC_014165	ACG	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
159	NC_014165	CAC	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268004
160	NC_014165	TCG	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268004
161	NC_014165	CGA	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
162	NC_014165	CGG	2	6	7149	7154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268004
163	NC_014165	CGGG	2	8	7173	7180	0 %	0 %	75 %	25 %	296268004
164	NC_014165	CGGC	2	8	7213	7220	0 %	0 %	50 %	50 %	296268004
165	NC_014165	GGC	2	6	7252	7257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268004
166	NC_014165	CGG	2	6	7287	7292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268004
167	NC_014165	GTC	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268004
168	NC_014165	TCGAGG	2	12	7340	7351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296268004
169	NC_014165	GGC	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268004
170	NC_014165	CGA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
171	NC_014165	ACG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
172	NC_014165	CGA	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
173	NC_014165	ACC	3	9	7483	7491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268004
174	NC_014165	CAA	2	6	7539	7544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296268004
175	NC_014165	CGA	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
176	NC_014165	GGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268004
177	NC_014165	ACCT	2	8	7645	7652	25 %	25 %	0 %	50 %	296268004
178	NC_014165	AAG	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296268004
179	NC_014165	GAG	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268004
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181	NC_014165	GAG	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268004
182	NC_014165	CCGCG	2	10	7821	7830	0 %	0 %	40 %	60 %	296268004
183	NC_014165	CG	4	8	7854	7861	0 %	0 %	50 %	50 %	296268004
184	NC_014165	AGC	2	6	7862	7867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
185	NC_014165	AAGG	2	8	7876	7883	50 %	0 %	50 %	0 %	296268004
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194	NC_014165	ATC	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268004
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213	NC_014165	TCC	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268004
214	NC_014165	CGA	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268004
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220	NC_014165	CCG	2	6	9088	9093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268005
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231	NC_014165	CGA	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
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234	NC_014165	TCG	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268005
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243	NC_014165	CTC	2	6	9850	9855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268005
244	NC_014165	GTC	2	6	9908	9913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268005
245	NC_014165	AAC	2	6	9917	9922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296268005
246	NC_014165	GAC	2	6	9946	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
247	NC_014165	TGG	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268005
248	NC_014165	CGT	3	9	10045	10053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268005
249	NC_014165	CCG	2	6	10054	10059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268005
250	NC_014165	GGA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268005
251	NC_014165	GC	3	6	10090	10095	0 %	0 %	50 %	50 %	296268005
252	NC_014165	CGA	2	6	10135	10140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
253	NC_014165	GCT	2	6	10201	10206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268005
254	NC_014165	GCAGGC	2	12	10222	10233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296268005
255	NC_014165	GCA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
256	NC_014165	ACG	2	6	10296	10301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
257	NC_014165	CTCGG	2	10	10337	10346	0 %	20 %	40 %	40 %	296268005
258	NC_014165	GCG	2	6	10357	10362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268005
259	NC_014165	GGA	2	6	10372	10377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268005
260	NC_014165	ATC	2	6	10388	10393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268005
261	NC_014165	CGA	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268005
262	NC_014165	GCG	2	6	10411	10416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268005
263	NC_014165	GAG	2	6	10451	10456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268005
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381	NC_014165	GAA	2	6	15766	15771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296268010
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384	NC_014165	CTA	2	6	15915	15920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268010
385	NC_014165	GCG	2	6	16070	16075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268011
386	NC_014165	CAC	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268011
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388	NC_014165	CGC	2	6	16121	16126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268011
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498	NC_014165	GCG	2	6	20513	20518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268014
499	NC_014165	TCG	2	6	20553	20558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268014
500	NC_014165	GGA	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268014

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