MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014160	AGG	2	6	236823	236828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4002	NC_014160	GAG	2	6	236833	236838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4003	NC_014160	AGAACT	2	12	236860	236871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296242008
4004	NC_014160	GAGGT	2	10	236898	236907	20 %	20 %	60 %	0 %	296242008
4005	NC_014160	ACG	2	6	236916	236921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4006	NC_014160	GCTC	2	8	236922	236929	0 %	25 %	25 %	50 %	296242008
4007	NC_014160	GGA	2	6	236968	236973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4008	NC_014160	AGG	2	6	236987	236992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4009	NC_014160	GA	3	6	237010	237015	50 %	0 %	50 %	0 %	296242008
4010	NC_014160	AGC	2	6	237035	237040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4011	NC_014160	ACTATT	2	12	237064	237075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296242008
4012	NC_014160	ACT	2	6	237099	237104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4013	NC_014160	GA	3	6	237124	237129	50 %	0 %	50 %	0 %	296242008
4014	NC_014160	CTA	2	6	237138	237143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4015	NC_014160	CTA	2	6	237164	237169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4016	NC_014160	GCT	2	6	237172	237177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242008
4017	NC_014160	GAG	2	6	237178	237183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242008
4018	NC_014160	CT	3	6	237190	237195	0 %	50 %	0 %	50 %	296242008
4019	NC_014160	ACT	2	6	237301	237306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242008
4020	NC_014160	GTG	2	6	237326	237331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242008
4021	NC_014160	C	8	8	237345	237352	0 %	0 %	0 %	100 %	296242008
4022	NC_014160	GA	3	6	237674	237679	50 %	0 %	50 %	0 %	296242009
4023	NC_014160	GAG	2	6	237693	237698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242009
4024	NC_014160	AG	3	6	237705	237710	50 %	0 %	50 %	0 %	296242009
4025	NC_014160	CGG	2	6	237851	237856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242009
4026	NC_014160	C	6	6	237867	237872	0 %	0 %	0 %	100 %	296242009
4027	NC_014160	CGC	2	6	237879	237884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242009
4028	NC_014160	GAGCA	2	10	237912	237921	40 %	0 %	40 %	20 %	296242009
4029	NC_014160	CTC	2	6	239160	239165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242010
4030	NC_014160	AC	4	8	239176	239183	50 %	0 %	0 %	50 %	296242010
4031	NC_014160	GA	4	8	239210	239217	50 %	0 %	50 %	0 %	296242010
4032	NC_014160	GTA	2	6	239250	239255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242010
4033	NC_014160	CCA	2	6	239305	239310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242010
4034	NC_014160	GCG	2	6	239323	239328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242010
4035	NC_014160	ATT	2	6	239334	239339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242010
4036	NC_014160	AT	3	6	239424	239429	50 %	50 %	0 %	0 %	296242010
4037	NC_014160	GGAG	2	8	239444	239451	25 %	0 %	75 %	0 %	296242010
4038	NC_014160	TAA	2	6	239465	239470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242010
4039	NC_014160	ATCC	2	8	239485	239492	25 %	25 %	0 %	50 %	296242010
4040	NC_014160	ATGT	2	8	239553	239560	25 %	50 %	25 %	0 %	296242010
4041	NC_014160	TTA	2	6	239584	239589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242010
4042	NC_014160	ATCT	2	8	239597	239604	25 %	50 %	0 %	25 %	296242010
4043	NC_014160	ACC	2	6	239657	239662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242010
4044	NC_014160	TAA	2	6	239755	239760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242010
4045	NC_014160	AT	3	6	239772	239777	50 %	50 %	0 %	0 %	296242010
4046	NC_014160	GCCG	2	8	239828	239835	0 %	0 %	50 %	50 %	296242010
4047	NC_014160	CA	3	6	239870	239875	50 %	0 %	0 %	50 %	296242010
4048	NC_014160	GAA	2	6	239886	239891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242010
4049	NC_014160	AATC	2	8	239911	239918	50 %	25 %	0 %	25 %	296242010
4050	NC_014160	GAA	2	6	239939	239944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242010
4051	NC_014160	TAGA	2	8	240007	240014	50 %	25 %	25 %	0 %	296242010
4052	NC_014160	GAG	2	6	240051	240056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242010
4053	NC_014160	TTG	2	6	240066	240071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242010
4054	NC_014160	CTA	2	6	240194	240199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242010
4055	NC_014160	GGA	2	6	240279	240284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242010
4056	NC_014160	AG	3	6	240288	240293	50 %	0 %	50 %	0 %	296242010
4057	NC_014160	A	6	6	240313	240318	100 %	0 %	0 %	0 %	296242010
4058	NC_014160	TGT	2	6	240549	240554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242011
4059	NC_014160	CT	3	6	240590	240595	0 %	50 %	0 %	50 %	296242011
4060	NC_014160	TGC	2	6	240634	240639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242011
4061	NC_014160	TTA	2	6	240663	240668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242011
4062	NC_014160	ACAT	2	8	240705	240712	50 %	25 %	0 %	25 %	296242011
4063	NC_014160	TTA	2	6	240783	240788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242011
4064	NC_014160	GGA	2	6	240802	240807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242011
4065	NC_014160	TAC	2	6	240826	240831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242011
4066	NC_014160	GAA	2	6	240868	240873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242011
4067	NC_014160	GGGA	2	8	240879	240886	25 %	0 %	75 %	0 %	296242011
4068	NC_014160	TAT	2	6	240904	240909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242011
4069	NC_014160	ATC	2	6	240912	240917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242011
4070	NC_014160	TTC	2	6	240927	240932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242011
4071	NC_014160	GGA	2	6	240936	240941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242011
4072	NC_014160	ATT	2	6	241025	241030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242011
4073	NC_014160	GCAA	2	8	241064	241071	50 %	0 %	25 %	25 %	296242011
4074	NC_014160	GAA	2	6	241097	241102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242011
4075	NC_014160	GTC	2	6	241136	241141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242011
4076	NC_014160	AGA	2	6	241276	241281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242011
4077	NC_014160	TGA	2	6	241330	241335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242011
4078	NC_014160	TGT	2	6	241336	241341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242011
4079	NC_014160	CGTG	2	8	241447	241454	0 %	25 %	50 %	25 %	296242011
4080	NC_014160	TGAG	2	8	241494	241501	25 %	25 %	50 %	0 %	296242011
4081	NC_014160	CGT	2	6	241558	241563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242011
4082	NC_014160	ACC	2	6	241587	241592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242011
4083	NC_014160	ACT	2	6	241665	241670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242011
4084	NC_014160	AGCT	2	8	241756	241763	25 %	25 %	25 %	25 %	296242011
4085	NC_014160	AG	3	6	241845	241850	50 %	0 %	50 %	0 %	296242011
4086	NC_014160	TGA	2	6	241880	241885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242011
4087	NC_014160	CTT	2	6	241952	241957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242012
4088	NC_014160	TGTC	2	8	242032	242039	0 %	50 %	25 %	25 %	296242012
4089	NC_014160	GAA	2	6	242066	242071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242012
4090	NC_014160	CTT	2	6	242436	242441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242013
4091	NC_014160	ATT	2	6	242444	242449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4092	NC_014160	T	6	6	242448	242453	0 %	100 %	0 %	0 %	296242013
4093	NC_014160	ACT	2	6	242486	242491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242013
4094	NC_014160	TAT	2	6	242503	242508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4095	NC_014160	TGGA	2	8	242569	242576	25 %	25 %	50 %	0 %	296242013
4096	NC_014160	AGT	2	6	242589	242594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242013
4097	NC_014160	ATT	2	6	242600	242605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4098	NC_014160	CT	3	6	242613	242618	0 %	50 %	0 %	50 %	296242013
4099	NC_014160	TAC	2	6	242631	242636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242013
4100	NC_014160	ATC	2	6	242651	242656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242013
4101	NC_014160	TCG	2	6	242676	242681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242013
4102	NC_014160	CAA	2	6	242688	242693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242013
4103	NC_014160	AGC	2	6	242746	242751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242013
4104	NC_014160	TC	4	8	242760	242767	0 %	50 %	0 %	50 %	296242013
4105	NC_014160	TTA	2	6	242783	242788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4106	NC_014160	AAC	2	6	242918	242923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242013
4107	NC_014160	ATT	2	6	242924	242929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4108	NC_014160	TCA	3	9	242933	242941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242013
4109	NC_014160	CCTG	2	8	242971	242978	0 %	25 %	25 %	50 %	296242013
4110	NC_014160	T	6	6	243010	243015	0 %	100 %	0 %	0 %	296242013
4111	NC_014160	TCT	2	6	243044	243049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242013
4112	NC_014160	CCATAT	2	12	243157	243168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242013
4113	NC_014160	TCT	2	6	243263	243268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242013
4114	NC_014160	CAG	2	6	243306	243311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242013
4115	NC_014160	TAT	2	6	243340	243345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4116	NC_014160	TGT	2	6	243391	243396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242013
4117	NC_014160	GTAG	2	8	243507	243514	25 %	25 %	50 %	0 %	296242013
4118	NC_014160	TCC	2	6	243638	243643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242013
4119	NC_014160	ATT	2	6	243698	243703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242013
4120	NC_014160	TCC	2	6	243733	243738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242013
4121	NC_014160	TCT	2	6	243850	243855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242014
4122	NC_014160	AG	3	6	243875	243880	50 %	0 %	50 %	0 %	296242014
4123	NC_014160	TTC	2	6	243949	243954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242014
4124	NC_014160	TTG	2	6	244018	244023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242014
4125	NC_014160	GTC	2	6	244127	244132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242014
4126	NC_014160	AAC	2	6	244178	244183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242014
4127	NC_014160	TTGT	2	8	244242	244249	0 %	75 %	25 %	0 %	296242014
4128	NC_014160	TG	3	6	244299	244304	0 %	50 %	50 %	0 %	296242014
4129	NC_014160	ACA	2	6	244335	244340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242014
4130	NC_014160	ACA	2	6	244387	244392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242014
4131	NC_014160	TTC	2	6	244436	244441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242014
4132	NC_014160	CTG	2	6	244543	244548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242014
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4134	NC_014160	GA	3	6	244643	244648	50 %	0 %	50 %	0 %	296242014
4135	NC_014160	GGA	2	6	244847	244852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242014
4136	NC_014160	GCTC	2	8	244865	244872	0 %	25 %	25 %	50 %	296242014
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4143	NC_014160	ATT	2	6	245100	245105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242014
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4152	NC_014160	TTG	2	6	245641	245646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242014
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4159	NC_014160	AGGA	2	8	246169	246176	50 %	0 %	50 %	0 %	296242015
4160	NC_014160	T	6	6	246179	246184	0 %	100 %	0 %	0 %	296242015
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4237	NC_014160	TTC	2	6	250196	250201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242022
4238	NC_014160	T	6	6	250302	250307	0 %	100 %	0 %	0 %	296242022
4239	NC_014160	GAA	2	6	250310	250315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242022
4240	NC_014160	TATT	2	8	250397	250404	25 %	75 %	0 %	0 %	296242022
4241	NC_014160	AGCA	2	8	250405	250412	50 %	0 %	25 %	25 %	296242022
4242	NC_014160	AAG	2	6	250473	250478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242022
4243	NC_014160	GCGAA	2	10	250499	250508	40 %	0 %	40 %	20 %	296242022
4244	NC_014160	ATTGG	2	10	250531	250540	20 %	40 %	40 %	0 %	296242022
4245	NC_014160	GTT	2	6	250645	250650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242022
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4368	NC_014160	TCT	2	6	259221	259226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242030
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4482	NC_014160	AGA	2	6	265039	265044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242036
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4490	NC_014160	AGG	2	6	265410	265415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242036
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